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2
回答
基因集
富集
分析
r
、
database
、
ontology
、
bioconductor
这使用了Jensen-Shannon距离,并产生了一个排列有序
的
基因列表,我现在想要测试
的
是
GO
的
富集
。该
文件
如下所示:"XLOC_008881" 0.00417099861122699 "XLOC_0089010.0453928603025379 "XLOC_000570" 0.0461264
浏览 3
提问于2013-07-11
得票数 1
1
回答
如何
解决: EnrichR网站不响应?
r
、
package
我遇到了工作中
的
EnrichR,有什么解决方案吗?install.packages("enrichR") dbs <- listEnrichrDbs() dbs <- c("
GO
_Molecular_Function_2015", "
GO
_Cellular_Component_2015", "
GO
_Biological_Process_2
浏览 480
提问于2019-08-20
得票数 1
1
回答
Gseapy:
如何
获得
用于每个途径
的
基因列表
pandas
、
list
、
bioinformatics
、
rna-seq
、
scanpy
我正在用gseapy
富集
酶对一系列基因进行浓缩
分析
。:5000], gene_sets = ['
GO
_Biological_Process,我
如何
获得
完整
的
基因(在图片中非常正确
的
列)用于各个路径?如果我尝试下面的代码,它只会给我已经显示
的
基因。我添加了一些更正,以有一
浏览 4
提问于2022-06-29
得票数 0
回答已采纳
2
回答
我怎样才能把阿弗莱米特里克斯探针转换成基因符号?
r
、
bioinformatics
、
genetic-algorithm
、
genetic-programming
、
sequencing
我已经进行了阿弗莱米特里克斯数据
分析
与橄榄和角膜缘。现在我需要对上调和下调
的
基因进行基因
富集
分析
(在EnrichR上,通过搜索基因符号)。然而,当我
注释
我
的
数据(使用clariomshumantranscriptcluster.db库,因为我100%确信数据属于人类细胞)并为每个探针ID找到相应
的
基因符号时,许多ID都给出了"NA“值。在Affymetrix.com上读到这篇文章后,我非常困惑:“以"TC”开头
的
注释</em
浏览 7
提问于2022-03-24
得票数 0
2
回答
默认情况下,所有
go
程序都启用了
分析
吗?
go
、
profiling
、
profiler
由于导入net/http/pprof包就足以在程序中启用golang,所以我
的
问题是,在默认情况下,是否为所有golang程序启用了
分析
器,而导入包只是公开了度量端点?如果是这样的话,我
如何
禁用
分析
器以消除性能开销?
浏览 12
提问于2022-04-06
得票数 -2
1
回答
排除联接中
的
重复字段
sql
、
postgresql
、
join
、
left-join
我有一个正在
分析
的
数据集。事实证明,它可以很容易地通过人口统计和社区数据来丰富,这极大地改善了
分析
结果。from sample data join community using (fips) 这将使我在输出中
获得
多个zip或fips列,而我
的
分析
引擎无法处理这些列。我不能手动指定每个字段-
富集</e
浏览 2
提问于2013-02-25
得票数 7
回答已采纳
1
回答
使用矩阵进行全局测试路径
分析
r
、
matrix
、
analysis
我有一个包含SAGE计数数据
的
矩阵,我想测试
GO
在路径中
的
富集
。因此,我想在R中使用globaltest。我
的
数据如下所示: KI_1 KI_2 KI_4 KI_5 KI_6 WT_1 WT_2 WT_3 WT_4 WT_6 groups <- c("KI1","KI1","KI
浏览 0
提问于2012-04-20
得票数 0
回答已采纳
2
回答
如何
获得
go
语言功能
的
注释
?
go
如何
获得
go
语言功能
的
注释
?示例:// @annotation2 return ""
如何
得到“@
注释
1”和“@
注释
2”?
浏览 0
提问于2016-05-27
得票数 7
回答已采纳
1
回答
Go
:内存问题
go
、
memory
、
heap-memory
我需要你
的
智慧。我开始调查这个问题。当初级代码检查没有为我提供任何关于泄漏本质
的
线索时,我试图关注我
的
流程是
如何
工作
的
。 我
的
想法很简单:如果我没有删除对某些对象
的
引用,那么我
的
堆应该会不断增长。现在,介绍一下守护进程所做
的
事情。它处理来自某些UDP输入
的</em
浏览 2
提问于2017-03-23
得票数 5
1
回答
在Antlr3中生成自定义JavaDoc
java
、
antlr
、
javadoc
、
antlrworks
我在Antlr 3中为我
的
公司实现了一种语法语言。目前,当代码生成时,没有
注释
。我想编码
注释
,以便自定义
注释
出现。.*/}grammar Example; 我得到了两个Java
文件
: ExampleLexer和ExampleParser。 在ExampleL
浏览 0
提问于2013-02-14
得票数 1
回答已采纳
1
回答
将ggplot
的
y轴按另一个因子排序(不是按字母顺序)R
r
、
ggplot2
、
r-factor
我读了很多关于在ggplot2中对热图
的
y轴进行排序
的
问答,因此我觉得写另一个热图很糟糕,但我似乎无法实现我想要
的
。(这可能是因为我是R
的
新手,刚刚开始掌握R
的
术语和工作原理。)提前感谢您
的
帮助!我正在尝试生成一个用于基因
富集
分析
的
热图。我
的
数据以以下形式导入为.csv
文件
:Gene Category Description Variable1 Variable2 Variable3。因此,每一行都
浏览 0
提问于2013-06-08
得票数 0
回答已采纳
2
回答
如何
在包中显示S4函数
的
源代码?
r
、
package
、
s4
我使用R中
的
软件包topGO来
分析
基因
的
富集
情况,代码如下:我希望看到并更改RunTest函数和GenTable函数以更改ResultTable,但我不知道
如何
显示该函数使用getAnywhere("Ge
浏览 1
提问于2011-05-09
得票数 36
回答已采纳
1
回答
如何
使用
go
/_test.
go
忽略测试
文件
(
分析
)?
go
、
golint
如何
使用
go
/_test.
go
忽略测试
文件
(
分析
)?看起来像是默认
的
go
/analysis负载测试
文件
。
浏览 71
提问于2021-09-28
得票数 2
1
回答
Word vsto获取包含隐藏字符
的
文档文本
c#
、
ms-word
、
vsto
我正在为Word开发一个文本
分析
vsto插件。因此,我像这样
获得
活动文档
的
文本: Globals.ThisAddin.Apllication.ActiveDocument.Content.Text 之后,我对其进行了
分析
。
分析
返回单词应该
注释
的
位置列表(如字符3-6和字符10 - 13)。 问题是,从3到6
的
注释
似乎在文档中添加了一个字符(即隐藏
的
)。因为Word在第一个
注释
之后所做
的</e
浏览 34
提问于2019-05-09
得票数 2
回答已采纳
1
回答
使用gcc插件获取类
注释
c++
、
gcc
、
annotations
、
gcc-plugins
我正在创建一个,用于
分析
解析后
的
C++
文件
。插件遍历类并生成一些有关它们
的
信息。插件正在工作,这就是我
如何
在课堂上穿行
的
。//Now we know this is a class }我想选择他能
分析
的
类和不能
分析
的
类我
的
第一个想法是添加某种
注释
,当
浏览 6
提问于2015-04-22
得票数 0
回答已采纳
1
回答
如何
以及何时为有界队列通道分配内存?
go
、
memory
、
pprof
我正在使用
Go
的
pprof工具来调查我
的
服务
的
内存使用情况。几乎所有的内存使用都来自一个函数,该函数设置多个有界队列通道。我对pprof在这里告诉我的话有些困惑: $
go
tool pprof ~/pprof/pprof.server.alloc_objects.alloc_space.inuse_objects.inuse_space,第146行负责27.53MB,但这些行正在做同样
的
事情--它们创建具有相同输入类型和相同容量
的
缓冲信道。这是pp
浏览 5
提问于2020-12-22
得票数 4
回答已采纳
1
回答
用proto-gen-
go
-grpc编译protobuf .proto
文件
时出错:当未指定-address时,必须包括-stream-stats-catapult-json
go
、
protocol-buffers
我有proto-gen-
go
-grpc插件程序1.1.0,在编译我
的
.proto
文件
时不断出错: 2021/07/31 21:31:43
分析
错误
分析
标志:当未指定-address时,您必须包括我使用这个命令编译:我已经找到了带有-address和流-stats-catapult-json标志:
的
proto-gen-
go
-grpc模块
的</
浏览 5
提问于2021-07-31
得票数 0
1
回答
剖析
go
程序
go
、
profiling
我试着
分析
我
的
go
库,但是我只能使用以下输出:Total: 884 samples(pprof) top10
浏览 0
提问于2014-06-02
得票数 3
回答已采纳
1
回答
使用纯文本
文件
键入"p“批注
gate
我正在尝试理解GATE是否能够从UTF-8编码
的
纯文本
文件
中提取"p“类型
的
注释
。对于纯文本
文件
,有没有办法做到这一点?
浏览 0
提问于2016-03-22
得票数 0
6
回答
容易阅读Golang汇编输出?
assembly
、
go
我对检查标准
Go
编译器
的
x86汇编输出很感兴趣,以查看我
的
代码是否真的被转换为相当有效
的
汇编代码;希望通过
分析
和检查汇编输出,我可以
获得
关于我应该在哪里/
如何
重写
Go
代码以
获得
最大性能
的
线索。但是当我使用-S标志检查代码时,
Go
显示出一片混乱!我想要两样东西: 有没有办法让
Go
编译器把汇编输出转储到一个
文件
中,而不仅仅是在Terminal?Also,上打
浏览 43
提问于2014-05-22
得票数 35
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