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使用R语言读取PUBMED存入MYSQL数据库

最近,在科研狗网站看到了一个有趣的项目,使用R语言读取pubmed存入mysql数据库,之前报名没有报上,还是决心要跟着做一下,无奈R语言水平比较渣渣,只能复制别人的代码来用,悲剧的是,原代码复制过来还是报错...原代码参考自R科研作图学习小组组长:木萱小主的作业: http://group.keyangou.com/RGraph/topic/952 这个项目的难点在于要用R语言和MySQL数据库,两者都是初学...首先这个任务的准备工作是安装数据库和phpmyadmin(当然这只是一个选项,还有好多的图形数据库管理软件,据说大牛都是命令行操作的),这个不表。...主要步骤就是第一,用你要查询的关键词或条件获得pubmed-id,标题和摘要,然后格式化一下,放入数据库。...这里还要补充一下,如果边数据库次数太多而没有关闭会报错,有个哥们定义的函数很有用,一起放这。

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    使用Django获取Oracle TOP SQL数据并存入MySQL数据库

    新建MySQL表存放监控数据 我们日常在运维Oracle数据库时有很多指标需要考虑 这里我挑选了一些日常检查的项目 物理读:oracle_diskreads 逻辑读:oracle_buffergets...编写自定义命令获取指标并存入数据库 如何创建自定义命令请参考: http://www.zhaibibei.cn/oms/3.1/ 2.1 主体程序 这里我们用oracle_topsql_mysql.py.../save方法保存到MySQL数据库中 ---- 一些注意事项 由于我有9i的库,所以统一抓取hash_value 各个函数的内容请自行查看源代码,很容易理解 由于出现过负数的情况所以采用了abs函数...可以看出数据库的信息已经保存在MySQL数据库中了 ---- 4....>>/home/oms/mysite/crontab.log 2>&1 源代码位置 源码会在后续放出 ---- 好了,这节介绍了如何利用自定义命令获取Oracle数据库的性能指标并保存在MySQL

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    bs4爬虫实战三:获取电影信息并存入mysql数据库

    获取页面的过程 在页面的下方单击"下一页",发现URL变成了http://dianying.2345.com/list/----2018---2.html....format(item.moviename, item.moviescore, item.moviestarring))                 self.log.info('电影名为:《{}》已成功存入文件...mylog.warn(u"I'm warn 中文测试")     mylog.error(u"I'm error 中文测试")     mylog.critical(u"I'm critical 中文测试") 如果想要存入...mysql数据库,需要先把数据库,表和表结构创建好,还需要知道库名,ip地址,端口,账号和密码 mysql上面的操作,准备工作 mysql> create database bs4DB; Query OK...  on bs4DB.* to "savemysql"@'%';  # 授权savemysql只能操作bs4DB数据库 Query OK, 0 rows affected (0.00 sec) mysql

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    Python解析excel文件并存入sqlite数据库

    最近由于工作上的需求 需要使用Python解析excel文件并存入sqlite 就此做个总结 功能: 1.数据库设计 建立数据库 2.Python解析excel文件 3.Python读取文件名并解析...4.将解析的数据存储入库 一 建立数据库 根据需求建立数据库,建立了两个表,并保证了可以将数据存储到已有的数据库中,代码如下: import sqlite3 def createDataBase():...选取了Python自带的sqlite数据库 相对简单 在此不做太多介绍 如果大家对Python操作sqlite有疑惑的话 个人推荐菜鸟教程~   下面是解析excel文件并存入数据库,其中包含了判断单元格内容...print "Successful for'%s'--------" % (filename) cn.commit() 整合上述功能: def importData(path): # 数据库...print "Wrong Parameters" else: path = sys.argv[1] importData(path) 这就是解析excel文件并存入

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    将Oracle已使用过索引存入MySQL

    上个专题提到了如何利用Python操作Oracle数据库并监控想要的指标 这个专题讲述如何讲这些监控数据保存在MySQL中为日后所用 ---- 上节讲到如何利用Python获取Oracle已使用过的索引名称...,这节讲如何将他们存入MySQL数据库中 环境设置 Linux系统为 Centos 6.8 Python环境为 Python 3.6 MySQL版本 MySQL 5.7 (GA) 连接Oracle...模块:cx_Oracle 连接MySQL模块:PyMySQL ---- 将上节获取Oracle索引的脚本增加存入MySQL数据库片段 脚本名称依然为:checkindex.py 思路为先获取索引信息,...再遍历每个索引,针对不在MySQL数据库存入MySQL数据库中 经过一段时间的运行即可知道哪些索引未被使用过 ?...---- 全部代码请查看我的Github主页 https://github.com/bsbforever/wechat_oms ---- 运行结果 运行完脚本后我们查看MySQL数据库,应该可以看到表里应该有数据

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