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iGraph + Plotly创建随机连接

iGraph是一个用于分析和可视化复杂网络的开源库,而Plotly是一个交互式可视化库。它们可以结合使用来创建随机连接的网络图。

随机连接是指网络中的节点之间的连接是随机生成的,没有特定的模式或规则。这种连接方式常用于模拟真实世界中的网络结构,例如社交网络、蛋白质相互作用网络等。

使用iGraph和Plotly创建随机连接的网络图的步骤如下:

  1. 导入所需的库和模块:
代码语言:txt
复制
import igraph as ig
import plotly.graph_objects as go
  1. 创建一个空的图对象:
代码语言:txt
复制
graph = ig.Graph()
  1. 添加节点到图中:
代码语言:txt
复制
num_nodes = 10  # 设置节点数量
graph.add_vertices(num_nodes)
  1. 添加随机连接的边到图中:
代码语言:txt
复制
num_edges = 20  # 设置边的数量
for _ in range(num_edges):
    source = random.randint(0, num_nodes-1)
    target = random.randint(0, num_nodes-1)
    graph.add_edge(source, target)
  1. 使用Plotly绘制网络图:
代码语言:txt
复制
layout = graph.layout("fr")  # 使用Fruchterman-Reingold算法布局节点
x, y = zip(*layout.coords)
edge_trace = go.Scatter(
    x=[],
    y=[],
    line=dict(width=0.5, color='#888'),
    hoverinfo='none',
    mode='lines'
)

for edge in graph.get_edgelist():
    x0, y0 = layout.coords[edge[0]]
    x1, y1 = layout.coords[edge[1]]
    edge_trace['x'] += tuple([x0, x1, None])
    edge_trace['y'] += tuple([y0, y1, None])

node_trace = go.Scatter(
    x=x,
    y=y,
    mode='markers',
    hoverinfo='text',
    marker=dict(
        showscale=False,
        colorscale='YlGnBu',
        reversescale=True,
        color=[],
        size=10,
        colorbar=dict(
            thickness=15,
            title='Node Connections',
            xanchor='left',
            titleside='right'
        ),
        line_width=2
    )
)

fig = go.Figure(data=[edge_trace, node_trace],
               layout=go.Layout(
                   title='Randomly Connected Network',
                   titlefont_size=16,
                   showlegend=False,
                   hovermode='closest',
                   margin=dict(b=20, l=5, r=5, t=40),
                   annotations=[dict(
                       text="",
                       showarrow=False,
                       xref="paper", yref="paper",
                       x=0.005, y=-0.002)],
                   xaxis=dict(showgrid=False, zeroline=False,
                              showticklabels=False),
                   yaxis=dict(showgrid=False, zeroline=False,
                              showticklabels=False))
               )

fig.show()

这样就可以创建一个随机连接的网络图,并使用Plotly进行可视化。你可以根据需要调整节点数量、边的数量以及其他绘图参数来定制你的网络图。

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