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. | 一种灵活、可解释、精确插补未测量基因表达方法

在这项研究中,证明了使用稀疏回归方法,利用来自最相似样本信息获得了比其他方法更准确预测,同时也提供了一个高度可解释底层模型。...本文提出这种方法一个变体,名为SampleLASSO,在其中对于每一个需要被插补表达样本,一个稀疏回归模型被训练,此模型基于被提供样本被测基因来动态捕获这个表达样本与样本训练集所有其他样本关系...图3 GeneLASSO流程示意图 三、实验结果 3.1 使用阵列数据来插补微阵列数据 本实验评估了使用阵列数据来插补微阵列数据六种插补技术性能 (图4)。...图4使用阵列数据插补方法性能 3.2 使用RNA-seq数据来插补微阵列数据 本实验评估了使用ARCHS4 RNA-seq数据,利用GPL96-570和LINCS基因子集来插补微阵列数据性能 (图...) 根据测量标注基因,填充 (插补) 并有效利用LINCS中基因组规模化学和遗传微扰表达数据

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Java实例教程(下)

Java Break语句Java继续声明Java Labelled Break Statement  Java Labeled继续声明:Java数组到特定位置Java静态方法Java静态字段Java静态块来自阵列特定元素...Java打印数据  来自阵列特定元素Java打印数据Java One阵列位置到另一个位置Java 8流到数组Java字符串到字符串数组Java父类和子类Java BufferedWriter  Java...静态类Java数组到IterableJava链接列表数组链表Java ArraylistJava两个阵列来自另一个Java One构造函数  Java字符串和拆分Java中内部类Java将数组转换为...示例阵列填充示例示例  Java示例扩展数组Java示例数组扩展Java示例阵列比较Java示例比较两个数组Java示例数组比较示例Java示例删除元素  Java示例阵列删除Java示例从另一个数组中删除数组...数据结构创建二叉树Java示例使用Enum和Switch语句Java示例使用Enum-SwitchJava示例使用枚举构造方法Java示例使用For和Foreach循环Java示例Foreach循环

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CMU阵列:3D打印实现对大规模高密度电极阵列定制化

坚固结构使长而窄柄(纵横比在50:1或更高)能够被瞄准到感兴趣区域。用于记录数据32通道设备由突出柄阵列和从单个柄到焊接到Omnetics连接器焊盘路径组成。...打印使设计和布置实现前所未有的灵活性,为了在传统方形阵列上增加15%填充密度,探针可以排列成六边形图案,而在传统阵列中创建六边形阵列图案十分困难。...多种信号多层材料自定义布线 由于高密度探针阵列设计,传统电路布线空间将无法满足,而3D打印提供灵活性为高密度布线提供了一种解决方案。...在任何给定通道上,能够识别通常来自1至3个神经元单个动作电位波形;这一结果与最近开发其他电极相一致,每个部位大约有1至3个神经元,且实现9.1高信噪比记录。...这种制造技术不仅从应用上实现了较大改进,也大大提升了物流效率。探针生产时间由以往几周到如今几个小时。使用这种方法探针成本将大幅降低,这为研究人员和临床医师提供了极大方便。

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CVE-2019-0697:通过DHCP漏洞发现其余两个关键漏洞

在前文中我们已经讨论过关于CVE-2019-0726相关内容。我们知道,有时候在搜索某一个已知漏洞时候便会偶然发现漏洞,有时这种漏洞还不止一个。...准备所有数据以进行日志记录需要大量工作。然而与我们正在讨论漏洞无关,因此我们将跳过这些示例。 这里我们看看这些缓冲区是如何填充填充是选项解析周期一部分。...它使用接收数据填充dhcp_pointers对象中字段,或者如果遇到没有处理程序选项标识符,则记下未知选项。...因此,这些索引值可能超过256,并导致在堆栈上为阵列分配内存之外进行写入。要导致第一个阵列溢出,DHCP服务器发送超过256个选项数据包就足够了。...我们发送以这种方式形成数据包以响应来自DHCP客户端请求,并且在客户端计算机上,我们在相应svchost.exe进程中捕获异常: 正如我们从堆栈跟踪中看到那样,来自我们数据选项标识符覆盖了堆栈

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你没玩过pygame小游戏开发「马赛逻辑」

今天给大家带来一个很有意思python小游戏开发,文末提供源码,一起学习呀~ 作者简介:Seon塞翁,数据分析从业者,专注用python处理数据、调教excel、开发有趣实用GUI小玩意儿,乐于分享...点击关注|设为星标|干货速递 ---- 游戏简介 马赛逻辑,是一个类似数独和扫雷逻辑小游戏,根据棋盘周围数据提示点亮方格,因外形像马赛克而得名。...根据不同情况进行位移,将阵列传入计数器,并在 1 换 0 时候记录数值。 当传入阵列等于 1 时有两种情况,分别是: ①上位 0; ②上位 1。 根据不同情况记录数值。...~ 笔者采用了有超过 20 年历史游戏制作库 pygame,该游戏库包含了用于制作简单 2D 游戏基本套件,python 及游戏爱好者们已经用它制作了成千上万小游戏,使用 pip 安装即可使用。...因为后期需要在白色背景中添加动态元素,所以将背景绘制放入主循环首位。 在主循环中,通过遍历事件来获取玩家操作,当前仅追踪了一个退出事件。

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前方高能,与“程序崩溃”第一次邂逅!

因为阵列模块学习,是机器人编程第二次能力进阶——数据库能力。(第一次是学会使用变量) 当程序崩溃时候,首先要先思考: 为什么它会崩溃?...阵列长度 上面这个程序会崩溃,是因为, 当我们使用循环索引”功能时,阵列会自动按照“0/1/2/3……”这样顺序读取阵列数据。...万一以后数据是由机器自动填写, 我们不知道有多少个数据,怎么办呢?? 这里我们引入一个概念 “长度” 就像排队,一排只有5个人, 这里“5”个人,代表是一个队伍“长度”。...即,阵列长度值,为5。 有6个人,长度就是6。 我们在阵列运算模块里,有读取“阵列长度”功能存在,并且可以直接使用长度值。 这样一来,问题就解决啦。 只要把长度值设定为循环结束值,即可!...再套上一个“大”循环,让它无限循环下去,屏幕上就会不停地重复显示阵列数据啦! 这两节课重点!

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【科普】什么是TPU?

如果我们不需要做任何其他事情,我们可以非常非常快地进行乘法累加。 如果没有芯片,我们将使用 CPU 或 GPU 来实现。CPU 是一台标量机器,这意味着它一次处理一个指令。...脉动阵列是一种硬件算法,它描述了计算矩阵乘法芯片上单元模式。“Systolic”描述了数据如何在芯片中以波浪形式移动,就像人类心脏跳动。 TPU 中实现脉动阵列版本设计有一些变化。...注意用零填充:这可以确保数据在正确时刻进入数组 每个时钟周期 ,每个单元都会并行执行以下步骤: 乘以我们权重和来自左侧激活。如果左侧没有单元格,则从输入队列中取出。...这里有一些来自谷歌图表,它们提供了更多视觉画面。 流经数组数据动画。相对于本文中其他图像,这个 gif 是转置——顺时针旋转 90 度,然后水平翻转。...升级意味着新一代 TPU 更加灵活——足以让谷歌轻松地将它们布置在他们云上。 其他概念 bfloat16 大多数 CPU/GPU 机器学习计算都是使用 32 位浮点数完成

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让机器人触觉感官更灵敏、稳定、高效,腾讯Robotics X在传感器上火力全开

TPU 中 MWCNTs 填充。...图 I-4 j 放大左后脚,可以看到阵列中八个传感器像素被施加了不同压力。 图 I-4。 除了识别与物体形状相关压力图之外,收集传感器数据还可以帮助识别数据表示模式。...每组数据都是电压 - 时间波形,共包含大约 2500 个数据点。 在分析过程中,研究者使用深度学习方法。通过建立双向长短期记忆模型,对不同气体环境数据进行分析以识别气体。...在此基础上,研究者预测深度学习方法可以用来区分来自腔内具有不同气体成分多个 SWISE 无线信号,这可能实现对 SWISE 传感阵列气体传感和多点运动传感能力。 图 II-4。...柔性电容式触觉传感器:实现传感器 - 软机器人无缝集成 机器人、假肢和其他机器在配备电子皮肤或柔性压力传感器时能够获得感官功能,通过引入设计(如界面微结构)或者将导电填料掺杂到介电层中,此类器件性能得到显著改善

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直观理解深度学习卷积操作,超赞!

输入数据是否落入这个「大致相似区域」,直接决定了数据经过卷积核后输出。这意味着卷积核尺寸直接决定了生成特征时汇合了多少(或几个)输入特征。 这与全连接层完全相反。...一些 padding 操作 [1] Padding 做了一些非常机智办法来解决这个问题:用额外「假」像素(通常值为 0,因此经常使用术语「零填充」)填充边缘。...其他数量滤波器生成都和单滤波器相同:每个滤波器使用不同卷积核集合和具有上述过程标量偏差项来处理输入数据,最终产生一个输出通道。然后将它们连接在一起以产生总输出,其中输出通道数量是过滤器数量。...如果这是任何其他种类数据,例如,APP 安装分类数据,这将会是一场灾难,因为你应用程序安装数量和应用类型是相邻,并不意味着它们有任何与应用安装日期和使用时间一样常见「本地、共享特性」。...来自第二和第三个卷积通道 12 特征可视化。 这里需要注意一个重要事情是经过卷积图像仍然是图像。来自图像左上角阵列像素输出依然位于左上角。

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直观理解深度学习卷积操作,超赞!

输入数据是否落入这个「大致相似区域」,直接决定了数据经过卷积核后输出。这意味着卷积核尺寸直接决定了生成特征时汇合了多少(或几个)输入特征。 这与全连接层完全相反。...一些 padding 操作 [1] Padding 做了一些非常机智办法来解决这个问题:用额外「假」像素(通常值为 0,因此经常使用术语「零填充」)填充边缘。...其他数量滤波器生成都和单滤波器相同:每个滤波器使用不同卷积核集合和具有上述过程标量偏差项来处理输入数据,最终产生一个输出通道。然后将它们连接在一起以产生总输出,其中输出通道数量是过滤器数量。...如果这是任何其他种类数据,例如,APP 安装分类数据,这将会是一场灾难,因为你应用程序安装数量和应用类型是相邻,并不意味着它们有任何与应用安装日期和使用时间一样常见「本地、共享特性」。...这确实很直观:如果经过优化图像完全被边缘填充,这就是过滤器本身所寻找并被激活强有力证据。使用这个,我们可以窥视到学习过滤器,结果是惊人: ?

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直观理解深度学习卷积部分

输入数据是否落入这个「大致相似区域」,直接决定了数据经过卷积核后输出。这意味着卷积核尺寸直接决定了生成特征时汇合了多少(或几个)输入特征。 这与全连接层完全相反。...一些 padding 操作 [1] Padding 做了一些非常机智办法来解决这个问题:用额外「假」像素(通常值为 0,因此经常使用术语「零填充」)填充边缘。...其他数量滤波器生成都和单滤波器相同:每个滤波器使用不同卷积核集合和具有上述过程标量偏差项来处理输入数据,最终产生一个输出通道。然后将它们连接在一起以产生总输出,其中输出通道数量是过滤器数量。...如果这是任何其他种类数据,例如,APP 安装分类数据,这将会是一场灾难,因为你应用程序安装数量和应用类型是相邻,并不意味着它们有任何与应用安装日期和使用时间一样常见「本地、共享特性」。...这确实很直观:如果经过优化图像完全被边缘填充,这就是过滤器本身所寻找并被激活强有力证据。使用这个,我们可以窥视到学习过滤器,结果是惊人: ?

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聊一聊数据存储七个技巧

(5)使用小型闪存阵列实施软件定义存储(SDS) 提高存储性能和数据存储效率另一个选择是使用软件定义存储(SDS)。 这些产品在设备或管理程序上运行,并在各种硬件阵列上提供一组通用存储软件功能。...如果向现有基础架构添加小型闪存阵列,则可以使用SDS自动将最活跃数据集移动到阵列以提高性能,并且作为额外好处简化管理,因为所有存储管理随后变得统一。...(7)购买全闪存或混合阵列 这对于部署现有基于硬盘系统(仍具有使用寿命,在原始保修范围内)数据中心而言是理想,因此用户可以重新部署这些陈旧机械硬盘系统,并使用闪存阵列进行扩展。...但是,在某些时候,用户需要购买一些存储系统。这意味着在全闪存或混合阵列之间进行选择。...一旦完成,还要考虑许多其他存储性能和数据存储效率增强选项,其中包括某些类型闪存存储部署。哪些产品是选用于数据中心最好工作方式,一些IT部门甚至可能甚至不需要升级他们存储系统。

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详解以太坊虚拟机(EVM)数据存储机制

可以将这种存储视为位于智能合约地址无限长度数据结构数组。存储机制确保存储位置没有冲突,并遵循一组规则。使用这些规则,我们可以解码任何合约状态。解码存储在映射中数据需要知道所使用密钥。...合约数据解码使用RPC调用eth_getStorageAt进行。 插槽位置 变量在智能合约存储阵列位置由代码中出现顺序以及变量大小决定。此位置称为插槽。...请注意,当对数字应用keccack哈希时,数字必须是0填充64位值。 所有解码都是使用以太坊RPC调用eth_getStorageAt执行,在本文中将其表示为GetStorageAt。...也就是说,如果一个元素小于256位,则阵列多个索引将占用存储阵列单个插槽。 图2显示并提供了发生打包说明。当类型长度小于256位时,EVM尝试将其他变量打包到插槽中。...继承 关于继承说明。当智能合约继承其他智能合约时,基本智能合约存储变量将按继承顺序占据存储阵列第一个插槽。子类存储变量将随后出现。

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极具应用潜力ECoG电极:基于PDMS柔性电极,可用于长期体内记录

ECoG电极阵列需要具备类似于体内生物组织机械特性才能稳定使用使用高硬度电极基底材料可能会导致电极周围形成瘢痕组织,从而降低记录性能。...因此,聚二甲基硅氧烷(PDMS)被认为是理想基底材料选择,因为它具有柔韧性、伸展性、光学透明性和生物相容性,并且其杨氏模量明显低于其他常用材料。...与其他基于PDMSECoG电极不同,基于对二甲苯处理过PDMS制备电极可以采用几乎所有的微机电系统(MEMS)工艺,如溅射沉积和平版印刷。...基于PDMSECoG电极阵列制造 基于对二甲基处理PDMSECoG电极阵列制备步骤如图1a所示。 工艺步骤:首先,使用聚(丙烯酸)(PAA)作为牺牲层,以避免在最终装置分离过程中机械伸长。...然而,基于对二甲苯填充PDMS电极也适合长期使用,因为阻抗在长达5个月整个实验期间阻抗始终保持较低。体内实验表明,所开发基于PDMSECoG阵列可以长期记录数月SEPs。

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这家为无人机无人车做雷达公司牛在哪,盖茨竟然连投两轮?

现在,盖茨又向这家公司投入了一笔资金。 这家公司是做什么?首富为何如此看好? 简单来说,他们生产雷达阵列,供无人机和自动驾驶汽车来探测障碍物。...该公司计划使用融资来生产更多MESA阵列,同时在目前40人基础上进一步扩大团队规模——Frankenberg表示,该公司希望不仅能生产传感器阵列,还可以编写更多软件来分析它所收集数据。...2016年11月,Echodyne实现了重大突破,成功测试了一套系统,可以通过在无人机上固定MESA来自动探测和规避其他飞行器和障碍物——即便距离很远、视线模糊、光线很暗,也可以正常使用。...Frankenberg表示,MESA对汽车厂商很有吸引力,因为Echodyne可以在更短距离内为常规雷达或摄像头提供更高分辨率。使用雷达还有利于雨天、雾天和强光天气使用。...监狱和船厂等对安全性要求较高地方以往只要担心闯入者,他们现在还要提防来自天空不速之客。 “你现在还要担心头顶上无人机。”Frankenberg说。

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TPU中指令并行和数据并行

本文主要探讨从架构设计上看,TPU时如何做高性能和高效能设计。高性能来自于并行,因此本文分别讨论了指令并行和数据并行设计方法。...TPU设计中更多其他优化方法和方向。...,但依旧适合在TPU这样偏专用处理器中使用。...,第三层循环在计算阵列中以256并行度进行计算,指令调度;第4-6层循环按向量处理器设计思路进行设计,通过一条指令完成三层循环计算。...这一部分来自于其内核设计,正如之前文章中所描述 采用了INT8数据类型进行计算 采用了脉动阵列优化计算 没有采用缓存,没有分支跳转,预测和数据冲突处理(编译器完成) 而从本文内容可以看出,

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文献翻译

所选实验包含以下数据来自20个不同阵列平台2852个微阵列(附加文件1中图S1)。 Affymetrix制造数组占主导地位,由11种不同数组类型表示总共2475个阵列。...为了避免差异带来强烈偏见合并来自不同阵列平台,我们将这项研究限于每个平台数据独立。...我们根据最常见两种方式使用了简编子集平台:Affymetrix HG-U133A568个阵列,以及来自HG-U133 + 2平台1174阵列。...而样本来自相同研究主要集中在未经调整数据集,此效果已在调整了一个(图1)。同样,我们使用PCA来验证调整研究效果后,数据集中没有性别偏见(附加文件1中图S3)。...讨论 由于注释标准不同,公共基因表达数据分析通常会无法合并大型阵列以进行研究。而这里提供数据主要好处是已使用统一手动注释,从而实现了更全面,更详细信息进行分析。

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【NumPy高级运用】NumPyMatrix与Broadcast高级运用以及IO操作

Matrix高级运用 Matrix函数作用是返回给定大小标识矩阵。 单位矩阵是一个方阵。从左上角到右下角对角线上元素(称为主对角线)均为1,其他所有元素均为0。 !...以下是由6个数字元素组成2行3列矩阵: 转置矩阵 在NumPy中,除了使用NumPy.transpose函数交换数组维度外,还可以使用T属性。。...形状中不足部分通过在前面添加1来填充。 输出阵列形状是输入阵列形状每个维度最大值。...NumPy为数组对象引入了一种简单文件格式:npy。 npy文件用于存储重建阵列所需数据、图形、数据类型和其他信息。...一维阵列秩是1,二维阵列秩为2,依此类推。 在NumPy中,每个线性阵列称为轴,即维度。例如,二维阵列等效于两个一维阵列,第一个一维阵列每个元素都是一维阵列。所以一维数组是NumPy中轴。

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EmguCV 常用函数功能说明「建议收藏」

例如,OpenCV中形态函数以及大部分其他过滤功能都在内部使用复制边框类型,而用户可能需要零边框或边框,填充1“或255”。 CornerHarris,在图像上运行哈里斯边缘检测器。...cvCreateMat,为矩阵和底层数据分配头,并返回一个指向创建矩阵指针。矩阵逐行存储。所有行都对齐4个字节 cvCreateSparseMat,该函数分配一个多维稀疏数组。...cvGetRawData,使用关于数组数据低级信息填写输出变量。所有输出参数都是可选,因此某些指针可能设置为NULL。如果阵列是具有ROI集IplImage,则返回ROI参数。...该功能读取位于pt1和pt2之间所有图像点,包括终点,并将它们存储到缓冲区中。 cvSet2D,将值分配给数组特定元素。 cvSetData,将用户数据分配给数组头。...翻转,以不同3种方式之一翻转阵列(行和列索引为0)。 FloodFill,填充连接组件与给定颜色..

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Biobanks生物银行知多少

之前列过几个可以用来进行基因型填充参考: 中国人 GWAS 填充参考之南医大和女娲参考 在线 snp imputation 网站知多少(三个中国人参考) SNP2HLA HAN.MHC 参考使用[...PheWeb.jp[4] KoGES 韩国基因组和流行病学研究 来自 KoGES(韩国国家生物银行) 76 种表型全基因组关联 日本生物样本库(BBJ)对 32 种表型荟萃分析 使用 SPACox...所有个体均在 Axiom 全基因组 TWB 阵列或 Axiom 全基因组 TWB2.0 阵列上进行基因分型。...然后用 IMPUTE2 软件输入由来自 1000 个基因组第三阶段(n=504)东亚人群和来自台湾生物库(n=1,451)全基因组测序数据组成合并参考小组。...BioBank::v3 (twbiobank.org.tw)[6] 汇总暂时到这里,期待我们国家其他省份和国家级别的 Biobank 数据发布。如有错误,欢迎指正!

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