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1
回答
有没有一个R函数可以返回
比对
过的DNA序列的
比对
分数?
、
、
我想提取
两个
字符串
(DNA序列)并生成
比对
分数。我找到了解密包,但它只允许我生成
比对
,而不是
比对
分数。我也试过使用“生物
字符串
”,但我无法生成分数。 谢谢你的帮忙!
浏览 9
提问于2019-08-30
得票数 0
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2
回答
python如何实现动态规划算法寻找最优匹配子串?
题,譬如现在有一串
字符串
s1=“agtcgtaatgc”,想将另一个
字符串
s2="cgaa"
比对
到s1上,可以看到s2并非完全
比对
到s1上面,其中是有一个错配的。现在我要实现的就是寻找s2
比对
到s1上面的错配最少的位点。
浏览 775
提问于2017-11-27
1
回答
当使用传递给Rust的JavaScript对象时,是否会影响性能?
、
、
在浏览器中使用Rust时,我可以获取JavaScript对象并在Rust中使用它们(例如,使用中的
js
!宏)。 在使用这些对象时,性能是否会受到影响?
浏览 0
提问于2018-07-06
得票数 0
1
回答
根据给定的相似度将大容量文本分组为组
、
、
、
是否有任何gem或库可用于根据给定的类似百分
比对
文本进行分组。以上所有的宝石都有助于发现
两个
字符串
之间的相似之处,但是分组大量的数据需要花费大量的时间。
浏览 5
提问于2017-01-28
得票数 0
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3
回答
对任何类型的序列使用nwalign()
我需要一个用于Matlab的近似
字符串
匹配函数。我通过调用nwalign()发现了生物信息学工具箱中的。唯一的问题是它只对氨基酸序列起作用。因此,当我尝试将
字符串
与数字和其他符号进行比较时,我得到一个错误消息:“
两个
序列都必须是氨基酸。”有没有办法让nwalign()函数接受任何类型的序列,或者有没有另一个matlab函数可以执行近似的
字符串
匹配,而不限于生物信息学?
浏览 1
提问于2011-10-01
得票数 1
1
回答
Python搜索并替换大文件的regex
、
、
在python中使用regex列表搜索和替换1 1GB文件中的一些特殊字符。 for i, j in dic.iteritems(): return text 目前在1 GB的测试文件中性能良好。我想知道
浏览 3
提问于2014-09-17
得票数 0
3
回答
如何从格式化的
字符串
中找到
字符串
模板?
、
、
假设我有一个
字符串
模板,例如,现在我通过格式化这个
字符串
来创建
两个
(或更多)
字符串
,即,=>"This is a 2020-06-05 16:06:30" 现在我不知何故丢失了原来的
字符串
有没有办
浏览 0
提问于2020-06-05
得票数 5
1
回答
在使用AntiXssEncoder.UrlEncode时,使用+代替%20作为空格的最佳方式
我使用AntiXssEncoder.UrlEncode对查询
字符串
参数中的值进行编码。空格被编码为%20,但我想使用加号代替。有没有
比对
结果
字符串
调用.Replace("%20","+")更好的方法呢?
浏览 1
提问于2016-07-01
得票数 0
2
回答
python中更快的相似性聚类
、
、
我收集了几千个
字符串
(DNA序列)。我想通过排除非常相似的序列,将其减少到几百个(确切的数字并不重要)。 我可以通过使用"Levenshtein“模块进行匹配来实现。
浏览 1
提问于2014-02-27
得票数 0
2
回答
运行app时安装NPM软件包
、
我可以在执行Node.
JS
时强制安装npm-package而不是触发错误吗? 它将
比对
每个包运行npm i package更方便。
浏览 8
提问于2016-11-23
得票数 3
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2
回答
在节点缓存的最佳方法
、
、
、
在用于Node.
js
的google文档中,它只推荐,对于其他语言,它有本机memcache。有没有
比对
redis进行外部调用更好的缓存系统?
浏览 6
提问于2017-08-31
得票数 2
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1
回答
在进行成对序列
比对
时,序列文件的典型大小是多少?
、
、
、
在进行成对序列
比对
时,序列文件的典型大小是多少?我们能把生物体的整个基因组统一起来吗?
浏览 4
提问于2014-04-06
得票数 0
回答已采纳
1
回答
样式组件/ Emotion.
js
是对象样式还是模板样式优先于另一个?
、
样式似乎是支持
比对
象样式更多功能的主要接口。const Button = styled.button`` 在StyledComponent或Emotion.
js
中,css-string (模板)样式
比对
象样式更喜欢
浏览 3
提问于2019-10-13
得票数 2
回答已采纳
8
回答
用jquery将div单击链接到另一个?
、
如果单击div 1,则div 2将被单击(但用户不会单击div 1,只需单击
JS
)。已经有一个庞大的功能附加到div 2当点击,所以我需要链接这
两个
如果有意义的话。希望
比对
大量代码进行排序和尝试添加代码更容易。 有什么帮助吗?
浏览 8
提问于2014-04-10
得票数 0
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1
回答
快速Python短DNA
字符串
比较
、
、
我有一个8个碱基的
字符串
testStr我想把它与绿色的8个碱基
字符串
greenList的列表进行比较。GGCGCATG ACTGAAAT ATGCCCGT ACTGAGTG||||| ||我第一次尝试这样做的中心是创建一个绿色列表,其中包含了greenList中
字符串
的所有可能的hamming距离1变体。但一定有更好的方法.我也知道有大量的
浏览 7
提问于2020-12-11
得票数 0
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1
回答
在angularJS中,如何遍历一个对象中的变量并将它们设置为相同名称的另一个对象的变量?
我觉得这可能涉及
字符串
和forEach语句吗?我对角很陌生,但基本上我想做的是: 我有
两个
对象,其中对象1中的每个变量都在对象2中,但是对象2
比对
象1有更多的变量,我需要将
两个
共享的所有值设置为相等。我的猜测可能是使用forEach遍历对象1,并将其变量的名称设置为
字符串
,然后将Object2.nameOfVariable设置为等于迭代器当前所在的项?
浏览 2
提问于2015-07-15
得票数 0
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1
回答
计算两序列相似性的复杂性
、
、
、
计算
两个
序列之间相似性的最著名算法的计算复杂度是多少(如DNA或蛋白质
比对
/近似
字符串
匹配)?
浏览 1
提问于2013-02-09
得票数 3
4
回答
如何计算文本
字符串
的多序列
比对
、
、
、
、
我正在写一个程序,它必须计算一组
字符串
集的。我正在考虑用Python来做这件事,但如果更实用的话,我可以使用外部软件或其他语言。数据不是特别大,我没有很强的性能要求,我可以容忍近似(即。唯一的问题是
字符串
是常规
字符串
(即,UTF-8
字符串
(可能包含应被视为常规字符的换行符);它们不是DNA序列或蛋白质序列。我可以找到大量的工具和信息,用于生物信息学中的常见情况,具有特定的复杂文件格式和许多我不需要的功能,但出人意料地很难找到用于简单
字符串
情况的软件、库或示例代码。我可能会重新实现解决这个问题的众多算法中的
浏览 1
提问于2011-04-28
得票数 22
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2
回答
在biopython中检索emboss产生的序列
比对
分数
我正在尝试检索
两个
序列的
比对
分数,使用biopython中的emboss进行比较。据我所知,唯一的方法是从emboss生成的输出文本文件中检索它。问题是将有数百个这样的文件需要迭代。有没有一种更简单、更干净的方法来检索
比对
得分,而不是求助于此?这是我使用的代码的主要部分。
浏览 3
提问于2013-08-19
得票数 0
2
回答
决定Pixi.
js
还是Phaser
、
全部:谢谢
浏览 1
提问于2016-07-22
得票数 57
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