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我有一些csv数据，我统计每一项的出现情况，以得到一个表示每个不同项的计数的整数数组。我想使用D3.js v5创建一个树状图，其中每个矩形的大小与这些数字成正比。我见过的树状地图上的所有资源都使用层次结构和树来创建它。是否可以只使用表示区域的数字创建一个非常基本的树状图？
像这样：
浏览 3提问于2021-04-19得票数 0
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我一直在尝试将库中的气泡图、单词云和可缩放的树状图集成到一个html页面中。问题是前两个图表使用的是d3.v3.min.js(v3.3.11)库，而可缩放的treemap是指d3.js库(v2.4.4)。因此，两个版本的交叉引用导致气泡图和树状图都不是rendered.Also，它们都不能在提到的verions.Please帮助上工作。
有没有办法将库文件的引用隔离到我的应用程序中的特定页面。
浏览 0提问于2013-12-10得票数 1
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所以我已经对d3.js做了一段时间的研究，但我不想问这样的问题，因为这是我一直试图完成的一个简单的任务。
我想使用两个列的CSV文件创建一个d3.js树状图。姓名和号码。但是，我在版本4上遇到的所有树状地图都创建了一个层次结构。我不想使用层次结构。我在这附近找不到工作。查看d3.js文档，我相信我还没有找到替代方案。
所以简单地说，我想创建一个d3。树状图使用这些csv数据。我想知道如何构造它，以及如何将它发送到d3.treemap()函数。
如果你能帮我很多，谢谢！
data.csv
content,count
apple,10
oranges,20
strawberry,30
pineap
浏览 4提问于2017-12-14得票数 1
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R和Matlab结构
、、、
我对R知之甚少，但我需要将matlab中的层次聚类所产生的树状图转换为R树状图结构。下表显示了matlab函数中分层聚类产生的树状图；其中第一列和第二列是对象或分支的is，第三列是距离。
有没有办法把这个表(或matlab的树状图)映射成R树状图？
浏览 1提问于2016-01-18得票数 0
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我正在使用QtDesigner的图形用户界面来绘制树状图。我的代码如下，但我不能绘制树状图，我如何修复它？ 树状图图像：
浏览 48提问于2021-02-27得票数 0
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有没有什么相当直接的方法可以把两个树状图“背靠背”放在r中？这两个树状图包含相同的对象，但聚类方式略有不同。我需要强调树状图的不同之处。因此，类似于包所做的事情，但可能涉及较少，以土壤科学为导向？
如果能够对树状图进行线条划分，以最大化对象之间的直线数量(见上文)，这将突出树状图之间的任何差异，这将是很棒的。
有什么想法吗？
浏览 1提问于2012-09-17得票数 9
有没有办法在中添加可缩放的树状图。使用d3.js的回车更新退出模式在RAW中没有意义，因此如果没有此功能，是否可以在RAW.js中添加d3.js可缩放的树状图？
的文档说
这样，D3的输入-更新-退出模式在RAW的图表中没有太多的意义，因为当将选择传递给绘图函数时，选择始终是空的。因为RAW是用来制作非交互式可视化的工具，需要用矢量图形工具来阐述，所以这不应该被看作是一种限制，相反，它是一种简化图表绘图代码的方法。
浏览 2提问于2015-08-13得票数 0
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在Python中，如何将树状图绘制在值矩阵的顶部，并适当地重新排序以反映聚类？下面是一个示例：
我使用scipy.cluster.dendrogram制作树状图，并对数据矩阵执行分层聚类。那么，我如何将数据绘制为矩阵，其中行已被重新排序，以反映在特定阈值下切割树状图所导致的聚类，并使树状图与矩阵一起绘制？我知道如何在scipy中绘制树状图，但不知道如何绘制数据的强度矩阵，并在其旁边使用正确的标尺。
在这方面的任何帮助都将非常感谢。
浏览 5提问于2010-06-06得票数 51
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我正在尝试使用csv文件在d3中创建树状图。然而，颜色比例/颜色编码似乎不适用于树状地图。我试着对矩形的颜色进行硬编码，即使这样也不行。
您可以在下面的链接中查看我的html、js、css和.csv文件。
请告诉我哪里出了问题。
提前谢谢。盖坦贾利
浏览 1提问于2015-08-22得票数 0
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我目前正在试验d3.js的图库树状图。
现在我想知道我是否能让树状地图把所有的物品都渲染成正方形。我只能让它渲染矩形。我尝试使用.mode("squarify");，但这并不会导致所需的布局。它不会使用所有可用的空间并不重要。我只想让它呈现正方形。
浏览 5提问于2013-01-16得票数 7
我想要绘制一个由行和列组成的海运集群地图。我不想画树状图。
设置row_cluster=False或col_cluster=False会删除树状图，但也会停止群集。
，我如何仍然是二维簇，但抑制树状图？
提供了将树状图线的宽度设置为0的方法。此黑客在海运0.7.1中不起作用。
浏览 7提问于2017-02-23得票数 27
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我正在创建一个闪亮的应用程序，它以谷类数据集为例展示了不同的聚类技术，例如分层聚类和k-means聚类。我使用"factoextra“包中的fviz_dend函数来创建我的树状图。然而，当我这样做时，树状图不会将谷物的名称显示为标签，而是显示数字表示。有没有办法把数值改成标签？我在下面附加了一张使用fviz_dend函数的当前树状图的图片和一张我使用base R中的plot函数创建的树状图的图片。请注意，由plot函数创建的树状图具有我需要的谷物的标签(这是我试图实现的)。 使用fviz_dend创建的树状图： ? ### Code for dendogram using fvi
浏览 709提问于2019-10-16得票数 0
在调用NMF包aheatmap或heatmap.2时，如何使R绘制树状图标度(以便解释每个树状图的高度)和热图？这些树状图显示了规模：，这是执行plot(hclust(...))的默认行为，我想仿真一下，但不确定如何通过heatmap函数来实现。
浏览 0提问于2014-03-17得票数 1
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我有一个人的树状图，这个树状图与一个名字和一个person对象相关。那个person对象有另一个包含更多数据的树状图。我正在尝试读取不统一的数据，并用下面的代码更新树状图：
golfer update = golfers.get(tempName);
course getCourse = courses.get(tempCourse);
tempDiff = (((tempScore - getCourse.rating) * 113) / getCourse.slope);
update.scores.put(tempCalendar, tempDiff);
golfers.put(t
浏览 4提问于2014-01-28得票数 2
我使用recluster包的'recluster.cons‘函数创建了一个树状图。我想知道如何对此函数产生的树状图的分支按组进行着色。
tree <- recluster.cons(sp2, p=1)$cons # sp2 is a presence-absence matrix
plot(tree, direction="downwards")
这是当前的树状图：
浏览 19提问于2020-02-11得票数 0
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我想将我的JSON在D3JS中表示为树状地图。
我正在学习本教程：
我从数据中做了一个JSON，它工作正常，树状图显示出来。现在，我想将这段代码用于我自己的JSON：
使用这个JSON，我的树状图不会出现。原因是什么？
我的代码：
<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<meta charset="utf-8">
<title>Treemap layout</title>
<style>
rect {
fill
浏览 1提问于2019-01-03得票数 1
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我有一个带有叶和节点标签的树状图(class=phylo，使用read.tree读取)。在将其转换为树状图类之后，节点标签不再存在。然而，我想通过在一些节点的顶部显示标签来绘制树状图(即在所选集群的顶部以NODE_1等形式显示)。
有人知道如何将节点标签添加到树状图类并添加到图中吗？类似这样的东西，但不是数字，而是id-s或标签，只有一些选择的节点具有标签。
浏览 2提问于2017-10-20得票数 2
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我正在创建当前Silverlight中存在的一个系统的SAPUI5原型版本。
在当前的Silverlight应用程序中，我们有一个包含数据表、条形图和树状图的页面，这些页面都显示相同数据的不同表示形式。
在SAPUI5中，我成功地复制了数据表和条形图，但无法显示树状图，我所得到的只是未定义的类型错误:在我试图创建树状图的行中，未定义不是函数错误。
var oModel = new sap.ui.model.odata.ODataModel(
"../../../services/PCPVCarlineModelYear.xsodata/",
浏览 1提问于2013-11-28得票数 1
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基于k的R图上的树状图
、、、、
我使用hclust()对一个基于R中的20,000行x169列数据集的距离矩阵进行聚类。当我将集群对象转换为树状图并绘制出整个树状图时，很难读懂它，因为它太大了，即使我将它输出到相当大的pdf中。
df <- as.data.frame(matrix(abs(rnorm(3380000)), nrow = 20000))
mydist <- vegdist(df)
my.hc <- hclust(mydist, method = "average")
hcd <- as.dendrogram(my.hc)
pdf("hclust_plot.pd
浏览 3提问于2016-01-15得票数 3
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我使用下面的R代码来获得一些数据的热图；热图在列的顶部显示一个树状图，但我宁愿树状图的长度更短，以便在热图的底部留出足够的空间来放置一些长的列标签。有没有办法调整树状图的长度？
<- heatmap.2(t(mully), scale="none", Rowv=F,
col = myCol,
breaks = myBreaks,
dendrogram="row",
margins=c(0.55,8.4), cexRow=0.68, cexCol=0.9, key=FALSE,
labCol =NULL,
trac
浏览 1提问于2012-08-13得票数 1
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我使用dendogram函数从scipy.cluster.hierarchy生成树状图。我创建树状图并用以下方法绘制它：
linkage_matrix = ward(dist)
dendrogram(linkage_matrix, orientation="left", labels=names)
plt.tight_layout()
plt.show()
到现在为止一切都很顺利。我想做的是，更新树叶标签的树状图，并绘制一个新的树状图。我试过两种方法：
使用这里提到的leaf_label_func：
但这不太好用。我得到了一个n不存在的错误，这实际上是真的。函
浏览 0提问于2017-09-05得票数 2
我正在尝试使用heatmap3来可视化我的细菌社区数据。我已经对我的样本进行了聚类，并且有一个来自hclust的树状图，我想用它在热图中排序我的样本，同时也显示树状图。但是，我要放入heatmap3中的数据文件已经崩溃到了属级，所以我以前的结构在heatmap3中并不是立即显现出来的，因此我不希望heatmap3尝试自己进行集群。
我尝试使用我的hclust对象作为一个树状图，并将它传递给Colv，但是无论出于什么原因，我的热图中的样本顺序实际上是随机的，而树状图看起来是正确的。当我提取样本的顺序在我的树状图和重新排序我的输入矩阵根据这个顺序(没有树状图)，我得到可见的聚类。本质上，我想要的是
浏览 5提问于2017-11-29得票数 0
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在R中，我使用标识来探索树状图中簇的具体特性，通过使用“hclust”对象可以很好地工作，但我需要它作为类“树状图”的水平树状图，而不是“hclust”。我已经安装了包密度，它通常应该将标识功能扩展到类树状图的对象和水平树状图( )。对于我的特定数据集，标识用于垂直树状图(类树状图)，而不是水平树状图。我经常遇到的错误是：
Error in rect.dendrogram(x, k = k, x = X$x, cluster = cluster[, k - 1], :
k must be between 2 and 10
请在这里找到一个可复制和简化的例子：
#Install packag
浏览 3提问于2015-09-18得票数 1
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我想在树状图的底部给树状图的节点着色--但是在下面的链接中，最后一个树状图在单独的行中显示节点是彩色的-然而，当它是一个大数据集时，一条线变得非常污浊的，所以每个有色组都有单独的行是可能的吗？
浏览 3提问于2016-12-15得票数 0
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我使用下面的代码来剪切树状图，我遇到的一个特殊问题是，当我剪切树状图时，我不知道如何向nodes.How添加标签，我可以使用R程序来剪切带有标签的树状图吗？
library(Heatplus)
cc=as.dendrogram(hclust(as.dist(mat),method="single"))
cutplot.dendrogram(cc,h=20)
浏览 1提问于2011-08-26得票数 4
我正在尝试使用heatmap.2来绘制具有热图的双树形图。我有两个预制的树状图，我将它们放到了Rowv = dend_row和Colv = dend_col中。问题是树状图也被重新排序了。我从软件包中了解到，在heatmap.2中，如果一个树状图是以Rowv / Colv格式输入的，那么它将被“按原样”使用，即不需要任何重新排序。因此，我确保输入到Rowv / Colv的对象已经是树状图(通过使用as.dendrogram)，树状图仍然重新排序。
env.hc2 <- env %>% dist(method = 'euclidean') %>%
hclust
浏览 1提问于2018-09-25得票数 1
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有没有办法动态设置D3.js簇的高度，使其具有尽可能小的高度(即，在树状图的边缘开始被切断或节点开始重叠之前的最小高度)？
浏览 2提问于2013-02-04得票数 0
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我已经使用heatmap.3生成了这个热图。聚类是基于树状图执行的，但为了演示的目的，我想重新排序节点，以便在维护树状图的同时，使深蓝色位于左侧，深红色位于右侧。我读过关于重新排序的文章: newdendro<-reorder(as.dendrogram(myclust(mydist(heatdata.scaled))),10:1，agglo.FUN=colSums)
但colSums(heatdata.scaled)并未存储在树状图中。如何1)使用colSums(heatdata.scaled)对节点重新排序2)在热图中调用此更新的树状图。3)？
浏览 0提问于2016-05-30得票数 1
2回答
垂直对齐ggplot2图
、、、、
使用上的代码，可以生成双树形图平铺图：
dual_dendogram_tile_plot(as.matrix(USArrests)，main=“美国逮捕”)
问题:将垂直树状图与平铺绘图区对齐。(和/或改进水平树状图的对齐方式)
此问题与以下内容相关：
浏览 5提问于2013-06-29得票数 18
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我正在尝试创建一个网络社区的树状图。下面的示例代码为我提供了所有节点的树状图，但当我使用相对较大的数据集时，我想创建一个只包含社区的树状图，这样我就可以有一个较小的树状图，只包含社区，这是可能的吗？
library(igraph)
set.seed(1)
g001 <- erdos.renyi.game(100, 1/10, directed = FALSE)
fc01 <- fastgreedy.community(g001)
colors <- rainbow(max(membership(fc01)))
plot(g001, vertex.size=2, ve
浏览 2提问于2014-07-13得票数 0
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我正在尝试使用R包树状图创建一个树状图，类似于包中示例中的树状图。
library(treemap)
data(GNI2010)
treemap(GNI2010,
index=c("iso3"),
vSize="population",
vColor="GNI",
type="value")
有没有办法在列中添加额外的标签以显示"CHN，1,35 bln，20%“
浏览 0提问于2015-03-25得票数 2
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标记圆密度树图
、、、
我正在绘制一个组成数据的圆形树状图。使用以下代码：
library(dendextend)
library(circlize)
library(compositions)
data("Hydrochem")
hydro<-Hydrochem
d <- dist(hydro[7:19], method="euclidean")
hc <- hclust(d, method = "average")
dend <- as.dendrogram(hc)
hydro$River <- as.character(hydro
浏览 1提问于2017-09-15得票数 1
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1回答
用密度图修正R中的保存树状图
、、、、
我想在一个树状图中旋转几个组的顺序，并设法用密度图来完成它。但是，当我试图用ggsave保存绘图时，我最终得到了未旋转的原始树状图。有没有办法用ggplot2保存旋转的树状图？我的代码如下：
library(dendroextras)
library(ggplot2)
library(dendextend)
d_copy_n <- colour_clusters(hc_test, k=6, groupLabels = as.roman)
labels(d_copy_n)<-with(nl2[labels(d_copy_n)], C
浏览 3提问于2021-05-21得票数 1
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如何绘制多d3js可缩放树状图
、、、、
我试图绘制多个d3js可缩放树状图。
我成功地根据这个示例绘制了一个。当我重用绘图函数时，第一个图表显示为空白，就像它需要显示数据一样。
绘图功能是
function drawTreeMap(tree) {
treemap = d3.treemap()
.tile(d3.treemapSquarify.ratio(height / width * 0.69 *(1 + Math.sqrt(5))))
.size([width, height])
.round(false)
浏览 1提问于2019-06-13得票数 3
小部件有能力像d3树映射那样放大和向下钻取吗？
静态的Kendo UI树状图：
可缩放的d3树状图：
浏览 6提问于2017-04-14得票数 0
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下面的树状图有两个层次。我想为顶级节点(节点A和节点B)显示一个图例。使用我使用过的其他类型的图表，图例可以自动生成，或者我可以显式地定义它。对于树状图，它看起来不是自动生成的，如果我显式地定义了一个，它就永远不会显示。是否可以为树状地图显示一个图例？
<style>
#chart {
position: absolute;
border: 1px solid;
top: 100px;
left: 100px;
right: 100px;
bottom: 100px;
浏览 0提问于2019-07-18得票数 3
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我有一个树状图给我的图像。由于它不是很大，我可以“手工”将它构造成一个R对象。
所以我的问题是，当我只有树状图图像时，我如何手动创建一个树状图(或"hclust")对象？
我看到有一个名为"as.dendrogram“的函数，但我找不到如何使用它的示例。
(附言:这篇文章关注的是我在上的问题)
非常感谢，Tal
浏览 2提问于2010-02-22得票数 15
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理解R中的“标度”
、、、
我试图理解R提供的scale的定义。我有数据(mydata)，我想用它来制作一个热图，并且有一个非常强的正斜度。我为scale(mydata)和log(my data)创建了一个带有树状图的热图，两者的树状图是不同的。为什么？缩放我的数据和日志转换我的数据意味着什么？如果我想查看显示数据列之间关系的树状图，那么哪一种方法更合适呢？
谢谢你的帮助！我读过这些定义，但它们在我头上呼啸而过。
浏览 7提问于2013-11-28得票数 79
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我可以很好地创建一个树状地图。我也可以创建一个树状地图，在同一个树状地图中显示主要类别的信息和子类别的信息，但这不是我想要的。 我认为这可以通过分组来完成，但它不是这样工作的。是否有我可以编写的操作来执行此任务？另外，如果可能的话，我需要一些方法来恢复到顶部的树图。 这是我目前所得到的一个例子。 ? 我想要做的是从这个树图开始： ? 然后选择一个Manager： ? 然后，我想要显示该经理下的所有主管，以及每个主管下的项目。我假设这要么是通过对子类别的一些动态更新来完成的，要么是通过应用过滤器将当前的树状图替换为不同的树状图，但我已经很难让它工作了。 ?
浏览 16提问于2019-10-03得票数 0
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我觉得这个问题有非常相似的版本，我在试图解决这个问题的过程中学到了很多，但是有一些(可能是非常基本的)概念我错过了。
这里有三个非常相似的问题/答案非常好：
在迈克·博斯托克的D3 Git：上有一些很棒的东西
现在详细介绍我的情况：
我在Python中使用sklearn聚集聚类进行了一些分析。我正在生成我希望在MatplotLib中看到的树状图：
T=7
T=2
现在，我想将这些树状图和其他一些功能添加到网站中。我用Django建了一个网站。
我已经使用了一些D3 Javascript功能来实现一个动态的交互式树形图，如下所示：
我这样做了，所以它从一个json文件中加载每个分支的
浏览 4提问于2020-12-27得票数 0
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3回答
我正在尝试将R中的分层聚类的结果绘制为树状图，用矩形来标识聚类。
以下代码适用于垂直树状图，但对于水平树状图(horiz=TRUE)，不会绘制矩形。有没有办法对水平树状图也做同样的事情。
library("cluster")
dst <- daisy(iris, metric = c("gower"), stand = FALSE)
hca <- hclust(dst, method = "average")
plot(as.dendrogram(hca), horiz = FALSE)
rect.hclust(hca, k = 3,
浏览 4提问于2014-06-10得票数 8
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在R中，有一个用树状图生成热图的函数，称为pheatmap::pheatmap。minkowski是pheatmap绘制树状图的距离测量选项之一。但是，如何在函数pheatmap中设置p (明可夫斯基距离的幂)？
谢谢。
浏览 17提问于2017-06-16得票数 0
4回答
使用发布的代码，我创建了一个很好的分层集群：
假设左边的树状图是通过这样的操作创建的
Y = sch.linkage(D, method='average') # D is a distance matrix
cutoff = 0.5*max(Y[:,2])
Z = sch.dendrogram(Y, orientation='right', color_threshold=cutoff)
现在，如何得到每个有色簇成员的索引？可以简化这种情况，忽略顶部的聚类，只关注矩阵左侧的树状图。
此信息应存储在树状图Z存储的变量中。有一个函数应该执行我想要的fcl
浏览 0提问于2011-10-05得票数 19
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我正在处理生态数据(不同硅藻物种在沉积物岩心不同深度的丰度百分比)，并希望将结果与树状图一起绘制，该树状图表示层次聚类分析(CONISS)的结果，我将使用该树状图将岩心划分为生态区。 这是我试图实现的事情类型的一个例子： ? 我已经成功地运行了聚类分析，但正在努力按照我想要的方式绘制树状图。每当我绘制树状图时，它都会按顺序(as shown here)绘制树状图的叶子。但是，我需要从沉积核心顶部按深度绘制树叶，以便在我检查过的每个核心深度都有一片树叶，并且在树状图中有缺失样本的间隙(as shown here)。(请注意，此处没有显示y轴，因为树状图将连接到已包含y轴的图表的其余部分
浏览 77提问于2020-12-09得票数 1
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我把多个树状地图放在他们自己的视窗里。我指定了一定大小的视区，然后将树状图添加到视区中，但是我无法让树状图填充整个视区。
下面是我要做的一个示例代码：
library(treemap)
library(grid)
main_vp <- viewport(x=0.5, y=0.5, width=1, height=1)
pushViewport(main_vp)
coords <- data.frame(X=c(0.2, 0.2, 0.5, 0.5), Y=c(0.2, 0.5, 0.5, 0.2))
for(i in 1:4)
{
size <- 0.5
my_
浏览 1提问于2013-09-17得票数 2
我最近从看到了这个树状图(有两个层次结构，有色的，规整的树状图)。
它是用R ggplot2::treemap制成的，由：
treemap(tmp,index=c("department","aisle"),vSize="n",title="",
palette="Set3",border.col="#FFFFFF")
我想知道如何用Python制作这个情节？
我搜索了一下，但是没有找到任何多层次的树状图例子。
浏览 0提问于2018-06-12得票数 7
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我一直在互联网上寻找徒劳，试图找出如何改变轴背景颜色的Matlab树状图。既然普通的写作方式，
set(ax5,'color',[0.9,0.9,0.98]);
似乎不起作用，我试图连接的轴线，首先绘制轴线与背景颜色，然后叠加树状图。但树状图似乎有一个不透明的背景，于是我写道，
set(ax4,'color','none');
但这似乎也行不通。有任何方法可以访问这个参数吗？谢谢你的帮助。
浏览 4提问于2021-02-11得票数 1
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我正在尝试实现一个径向树状图，类似于下面R中的树状图(参见)。但是，我希望有一个图像，而不是leafs上的文本，例如：
你知道我该怎么做吗？
浏览 0提问于2014-08-10得票数 0
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我有一种感觉，这是一个非常简单的问题，但我想不出来。
我有一小组轨迹，我正在尝试使用scipi hcluster对它们进行聚类。
我在这方面已经取得了成功。
from hcluster import linkage, dendrogram
l = linkage(matrix)
d = dendrogram(l)
show()
然而，我不知道如何将树状图分配的颜色映射回原始轨迹。树状图具有以下关键字'ivl'，'dcoord'，'leaves'，'color_list'，
浏览 5提问于2012-08-28得票数 2
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