腾讯云
开发者社区
文档
建议反馈
控制台
登录/注册
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
最新优惠活动
文章/答案/技术大牛
搜索
搜索
关闭
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,
尽在小程序
立即前往
文章
问答
(9999+)
视频
沙龙
1
回答
将HTML可扩展列表转换为表格或csv格式
、
、
、
Pathways and Ontologies Pathways br08901
KEGG
pathway mapsGenes and Proteins Orthologs and modules ko00001
KEGG
Orthology(KO) Genes and Proteins Orthologs and modules ko00002
KEGG</
浏览 8
提问于2014-03-25
得票数 1
回答已采纳
1
回答
If语句和写入文件
、
、
我正在使用
KEGG
下载
基因组数据并将其写入文件。总共有26个文件,其中一些文件包含字典'COMPOUND'。我想将它们分配给CompData,并将它们写入输出文件。'r') as file: line = line.strip()from bioservices.<em
浏览 2
提问于2017-02-18
得票数 1
回答已采纳
1
回答
熊猫无法读取超过216行锯齿状文本文件。
、
我有一个参差不齐的txt文件(每一行的列数不同),并试图在Pandas中读取它。出于某种原因,它能读到前216行,但不能读前217行。>>> df = pd.read_table("test.txt", names = range(2000), nrows = 217) File "<stdin>
浏览 5
提问于2016-10-27
得票数 1
回答已采纳
1
回答
如何从html表单R
下载
文件
、
、
、
当我按下ctrl+s并将此页面保存在我的web浏览器中时 有没有办法以同样的方式从R
下载
?我在努力: download.file("http://www.
kegg
.jp/
kegg
-bin/show_pathway?zma00944+default%3dred+cpd:C01514+cpd:C05903+cpd:C01265+cpd:C01714","form.htm
浏览 3
提问于2014-05-30
得票数 0
回答已采纳
1
回答
打开多个网页,使用wget并合并输出
我有一个文本文件,里面有一堆网页:http://rest.
kegg
.jp/link/pathway/5620我的目标是将这些页面上的所有信息
下载
到一个文本文件中
浏览 2
提问于2014-09-25
得票数 0
回答已采纳
1
回答
如何检索给定
KEGG
化合物的所有ChEBI ID?
、
、
假设我想使用ChEBI将一个
KEGG
映射到一个bioservices ID,我可以这样做:
kegg
_entry=
kegg
_con.parse(
kegg
_con.get('C00033'))这个会回来的 [u'1536
浏览 2
提问于2017-09-01
得票数 0
回答已采纳
1
回答
如何在python中
下载
彩色
KEGG
路径图
、
我有一个酶的列表(EC号,代码中的"df“),我想在
KEGG
路径图中突出显示。我想要制作一个python脚本来自动保存突出显示的映射。到目前为止,我只能手工
下载
urls:import webbrowser def mapping(df, map_list
浏览 6
提问于2021-06-02
得票数 2
回答已采纳
2
回答
如何在Python中将
KEGG
模块(md:)平面文件解析为Pandas DataFrame?(也就是说,逐段阅读文本仅一次)
、
、
、
、
= None
kegg
_ortholog_set = set()
kegg
_pathways = list()
kegg
_reactions = list()
kegg
_compounds = list()
kegg
_compound_set= line
浏览 3
提问于2021-03-18
得票数 0
回答已采纳
2
回答
有没有人知道如何从R中的
KEGG
中检索细胞周期基因的列表?
、
、
我知道如何使用
KEGG
.db从
KEGG
网站上检索特定路径的基因列表,但是我找不到任何软件包可以在R中做同样的事情。我找到的唯一的注释包是
KEGG
.db,它只给出了
KEGG
中可用路径的列表。http://www.
kegg
.jp/
kegg
/docs/keggapi.htmlhttp://rest.
kegg
.jp/
浏览 8
提问于2015-02-25
得票数 1
回答已采纳
2
回答
将列表转换为数据格式
、
可按以下方式安装):biocLite("gageData")library(gageData)
kegg
.sets.ko[1:2] [1] "K00001" "K00002" "K00016" &q
浏览 1
提问于2014-03-24
得票数 0
回答已采纳
2
回答
删除所有模式之间的所有
、
这是我的弦: ko03008:Ribosome biogenesis in eukaryotes"/
kegg
-bin/show_pathway?ko03013+K07936" ko03013:RNA transport"/
kegg
-bin/show_pathway?ko05166+K07936" ko05166:HTLV-I infection"/
kegg
-bin/show_pathway?
浏览 3
提问于2014-12-05
得票数 1
回答已采纳
1
回答
基于行名字符串的R中的相交表
我以前在没有分类法数据的情况下交叉了这些表:new <- intersect(rownames(
kegg
.f),foi$genefamily)但是我真的很想把分类法列在行的名字里。
浏览 3
提问于2022-03-30
得票数 0
3
回答
如何在perl中检索png文件的高度和宽度属性
、
以下是一个png文件的示例 http://www.
kegg
.jp/
kegg
/pathway/map/map00010.png
浏览 0
提问于2013-09-05
得票数 2
1
回答
数据帧熔解问题与气泡图
、
这是我的数据structure(list(Category = c("
KEGG
Pathway", "
KEGG
Pathway", "
KEGG
Pathway", &q
浏览 10
提问于2021-09-03
得票数 0
回答已采纳
1
回答
如何从与不同数据框架的观测相对应的数据框架中选择观测?
我有一个数据集,其中包括来自
Kegg
的所有代谢物ID的列表,以及从我的样本中发现的代谢物ID的数据集。目标是使用我找到的代谢物is从
Kegg
框架中选择is,并且只选择我找到的is。这看起来很简单,但我的数据不包括实际的分子名称和ID,而
Kegg
数据包含分子名。我需要这些分子的名字来做进一步的研究,找出这个可以节省我的时间。我试过使用过滤器和变异命令。你可以在下面看到我的代码。我们将有两个这样的数据框架:
kegg
_data <- data.frame("ID" = c("C00001&
浏览 0
提问于2019-07-03
得票数 0
回答已采纳
1
回答
为一列重新排序具有两个条件的变量
、
、
这是我的数据"
KEGG
_VALINE_LEUCINE_AND_ISOLEUCINE_DEGRADATION", "
KEGG
_DRUG_METABOLISM_OTHER_ENZYMES", "
KEGG
_ALANINE_ASPARTATE_AND_GLUTAMATE_
浏览 6
提问于2022-04-29
得票数 1
1
回答
如何检索
KEGG
化合物的InChI密钥?
、
、
我想检索给定
KEGG
化合物的InChI表示,但没有找到直接的解决方案。我们可以通过ChEBI这样做: chebi_entry = chebi_con.getCompleteEntity('CHEBI:' + <e
浏览 7
提问于2017-09-01
得票数 0
回答已采纳
2
回答
查找两个文件之间的常见模式
file1:K00002K00006K00025file2:TRINITY_DN42420_c0_g1 KO:K01762TRINITY_DN36387_c0_g2
KEGG
:zma:732811`KO:K00089 TRINITY_DN54650_c4_g1 <e
浏览 0
提问于2016-05-05
得票数 0
回答已采纳
1
回答
从R中的列表中提取路径中的特定路径名和基因
、
我有一个列表的路径和基因(对应于每个途径)存储在一个清单从
kegg
。我想用路径ID提取通路中的基因,我该怎么做呢?我的清单是这样的 [1] "2" "462" "623" "624" "629" "710" "712" "713" "
浏览 0
提问于2016-08-22
得票数 0
1
回答
无需使用任何包即可从
KEGG
获取路径的脚本
我正在创建一个用于文本挖掘的R包,我想在包中添加一个函数,以便从
KEGG
获得路径列表。我能够从wikipathways获取这些路径,但无法从
KEGG
获取。请给我建议,如果没有像NBCI2R这样的包,我如何从
KEGG
获取路径,我想做我自己的功能,所以请帮助我。 谢谢
浏览 6
提问于2013-05-17
得票数 0
点击加载更多
扫码
添加站长 进交流群
领取专属
10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关
资讯
KEGG Brite 数据库
KEGG Disease 数据库
KEGG COMPOUND 数据库
KEGG Genes 数据库
KEGG Glycan 数据库
热门
标签
更多标签
云服务器
ICP备案
对象存储
实时音视频
云直播
活动推荐
运营活动
广告
关闭
领券