如何获取目标基因的转录因子（上）一文中我们以人类基因组为例，从ensemble网站下载了基因组中基因位置信息矩阵GRCh38.gene.bed和基因组中转录因子结合位点信息矩阵GRCh38.TFmotif_binding.bed）
对于零基础转行或者打算找一份初级测试的工作同学来说，linux属于必学必会内容，而且面试必问。
在安装目录，有一个名为metal的可执行文件，该程序用法很简单，只需要编写一个配置文件，然后执行即可，所以关键在于配置文件的编写。在软件的安装目录，有一个名为example的文件夹，提供了两个示例，其中的metal.txt就是配置文件。
1、统计出/etc/passwd文件中其默认shell为非/sbin/nologin的用户个数，并将用户都显示出来
Linux 文本处理三剑客grep、sed、awk，这三个命令在工作和面试过程中出现的频率非常高，有时候很复杂的需求，一条简单的命令就可以实现，今天就先学习一下最强大的awk。
下载地址：http://www.uzzf.com/soft/78115.html 下载后直接解压，无需安装，
Windows系统中批量ping地址时我们长用PingInfoView工具，简单方便实用；而linux中想批量pingIP地址，就得使用脚本了，这里小编和大家分享一个ping脚本。
grep(global regular expression print，全局正则表达式输出)是一个搜索工具。
我们一般使用随机数生成器的时候，都认为随机数生成器（Pseudo Random Number Generator， PRNG）是一个黑盒：
1， 创建mysqld数据库的管理用户： 要把root用户设置为管理员，我们应该运行下面的命令； [root@linuxsir01 root]# mysqladmin -u root password 123456 一般情况下，mysqladmin所在目录已经加到$PATH中，如果该命令没有找到，查看软件包安装是否正确，确保Mysql-server和Mysql-client两个软件包都已经安装成功，然后可以rpm -qf Mysql-client查看该命令安装到那个目录中，将该目录加到$PATH
最近开始学习R语言，把学习笔记和小伙伴们分享一下吧，欢迎一起交流 R 起源： R是S语言的一种实现。S语言是由 AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析、作图的解释型语言。最初S语言的实
Linux 系统中所有的硬件设备都是通过文件的方式来表现和使用的，我们将这些文件称为设备文件，硬盘对应的设备文件一般被称为块设备文件。
扩展结构： 'BEGIN{script} {script} END{script}'
还有一种像Linux一样直接修改R中的相当于Linux中的.bashrc/环境文件一样的R的环境文件.Rprofile即可
awk同sed命令类似，只不过sed擅长取行，awk命令擅长取列。（根据了解awk是一种语言，不过我们只关注他处理文本的功能，用的好的话几乎可以取代excel）
二进制数据中，比如一个字节的数据，它的十进制为228，二进制就为11100100，如图5.11，
这里仅仅是针对一个数据集，就是r包airway并且通过assay函数拿到其表达矩阵。
前言 这两天自己挽起袖子处理日志，终于把AWK给入门了。其实AWK的基本使用，学起来也就半天的时间，之前总是靠同事代劳，惰性呀。 此文仅为菜鸟入门，运维们请勿围观。 下面是被处理的日志的示例，不那么标准，但不标准的日志正是标准的情况。 [2015-08-20 10:00:55.600] - [192.168.0.73/192.168.0.75:1080 com.vip.xxx.MyService_2.0 0 106046 100346 90ms 110ms] 基本语句 最基本的语句，以空格做分割，提取所
数组这种数据结构，应该在绝大多数语言都有实现，使用起来直接使用下标就可以获取想要的数据，在编程过程中几乎是必不可少的。
find /path -type f -exec rm -f {} ; 删除指定文件
笔者在读研刚开始的时候，偶尔看面经，有这样一个问题：只用2GB内存在20亿个整数中找到出现次数最多的数，当时的我一脸懵逼，怎么去思考，20亿个数？What The Fuck! 但是，看完今天的文章，你或许就会觉得原来也不过如此啊！其核心就是哈希函数和哈希表的应用！
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x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。
目录 Linux 三剑客之awk 简介 应用场景 awk执行流程图 awk生命周期 awk内置（预定义）变量 行与列描述 取行 取列 awk中的函数 条件的分类 awk正则详细： 普通正则和awk正则区别 范围表达式 逻辑表达式 算术表达式 特殊模式BEGIN{}和END{} awk数组 awk 的 判断、循环 if循环 循环 总体练习 易错点： Linux 三剑客之awk 简介 awk主要是用来格式化文本，也有人称awk是一种语言，类似 C，awk 是三剑客的老大，利剑出鞘，必会不同凡响。 应
将图片看成类型为uint8的像素矩阵，因此我们可以将两个像素矩阵进行加减乘除等一些列运算，这也被称为像素运算，像素运算包括两种：
变量可以分为很多种，如连续变量、分类变量等。当数据集中包含了分类变量和连续变量时，我们想了解连续变量是怎样随着不同的分类变量水平变化而变化，这时散点图中则会出现大量重叠，而箱式图则可以更清晰的展示这类数据。
在Linux/UNIX系统中，awk是一个功能强大的编辑工具，逐行读取输入文本，并根据指定的匹配模式进行查找，对符合条件的内容进行格式化输出或者过滤处理，可以在无交互的情况下实现相当复杂的文本操作，被广泛应用于Shell脚本，完成各种自动化配置任务。
（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，使用?＋命令
通过 gather ，并设定key（原先的列），与value（原先的数据），并通过 - （原先的行），对数据框进行转换。
例3：ls -ltr 查看当前目录详细列表，按时间顺序逆序排序，最近修改的文件在后面
之前写 datamash 的使用教程 linux 极简统计分析工具 datamash 必看教程，收到了一位读者的私信，内容如上。
Linux 系统安装软件，不管是从性能还是从稳定考虑，优先推荐编译安装的方式都是无可厚非的。不过在编译安装的时候，偶尔会提示缺失一些依赖组件，比如 curl-devel、libevent 等。这时候，要去找相应的编译包或者 rpm 包又要耗费时间！而且，往往当你找到并开始安装的时候，很有可能又有新的依赖组件缺失提示！！郁闷死你。。。 这时候，在线安装功能就可以出马了，比如 Centos 下的 yum、ubuntu 下的 apt-get 等在线安装命令。然而，手头上的服务器绝大部分都是 SUSE 企业版，这玩
（1）R的规范赋值符号是<-，也可以用=代替 （2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行 （3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。 （4）显示工作路径 getwd() （5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。 （6）表格在R语言中称为数据框^_^ （7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。 （8）数据类型（重点只有两个）
ETL是EXTRACT（抽取）、TRANSFORM（转换）、LOAD（加载）的简称，实现数据从多个异构数据源加载到数据库或其他目标地址，是数据仓库建设和维护中的重要一环也是工作量较大的一块。当前知道的ETL工具有informatica, datastage,kettle,ETL Automation,sqoop,SSIS等等。这里我们聊聊kettle的学习吧（如果你有一定的kettle使用，推荐看看Pentaho Kettle解决方案，这里用kettle实践kimball的数据仓库理论）
修改工作目录，cd 和 ls 应该是使用最多的两个命令，尤其是对于 Linux 目录结构不熟的用户。
根据维基百科，远程桌面 是一种“软件或者操作系统特性，它可以让个人电脑上的桌面环境在一个系统（通常是电脑，但是也可以是服务器）上远程运行，但在另一个分开的客户端设备显示”。
继续总结一下linux 的文本处理。包括但不限于awk, sed, paste,split,grep....
首先要导入两个库爬虫库（requests）和json库。Requests库就不多讲了，了解爬虫的观众老爷们都懂用于爬取网络数据，Json库再这个程序的主要作用是解析爬取的json文件，达到提取数据的作用。
版本控制系统是一种帮助软件开发者实现团队合作和历史版本维护的软件，一个版本控制系统应具备以下列出的这几个基本功能：
Linux Shell是一种基本功，由于怪异的语法加之较差的可读性，通常被Python等脚本代替。既然是基本功，那就需要掌握，毕竟学习Shell脚本的过程中，还是能了解到很多Linux系统的内容。
（1）Linux： Ubuntu 16.04 （2）Python: 3.5 （3）Hadoop：3.1.3（4）Spark: 2.4.0（5）Web框架：flask 1.0.3 （6）可视化工具：Echarts （7）开发工具：Visual Studio Code
新手攻略： （1）R的赋值符号不是等号，而是<- （2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行 （3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。 （4）显示工作路径 getwd(
> （7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，可用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。
save(a,file="test.RData")代码报错“object a not found”，说明未找到a数据框，可能时因为未将数据框赋值为a，可运行a<-，右上方环境窗口中出现a即可将a导出。
Docker从17.03版本之后分为CE（Community Edition: 社区版）和EE（Enterprise Edition: 企业版）。相对于社区版本，企业版本强调安全性，但需付费使用。这里我们使用社区版本即可。
1）现在学“表格” 二维：二维有两个：（1）matix 矩阵 —— 二维，只允许一种数据类型。（2）data.frame 数据框—— 二维，每列只允许一种数据类型（列与列之间相不相同都行）。
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