Linux操作系统以其开源、灵活和高度定制的特性而备受欢迎。然而，对于初学者来说，熟悉不同发行版的软件包管理系统可能是一个挑战。本文将介绍在常见的Linux发行版（Ubuntu、CentOS、Alpine）上安装软件包的基本指南，以帮助用户轻松应对软件管理任务。
使用过linux系统的运维应该都有在上面安装过软件包，有时候我们需要查询即将要安装的包有没有在这个系统上已经安装，如果不先查一下，或多或少会出现问题，比如版本不一致等等。
在 Windows 操作系统中安装软件通常是通过已经编译成功的 exe 文件进行操作，但在 Linux 操作系统中情况就比较复杂。由于自由软件及开源社区的蓬勃发展，许多软件制作者是将源代码发布后，由使用者进行源码编译安装，此过程不仅耗时耗力，而且对使用者的技术有一定要求，无形中提高了软件使用的门槛。
像我们日常使用的windows提供的应用商店或者手机提供的应用市场那样，大多数现代的类 Unix 操作系统也都提供了一种中心化的机制用来搜索和安装软件。软件通常存放在存储库中，并通过包的形式对外进行分发。处理包的工作称为包管理。包提供了操作系统的基本组件，以及共享的库、应用程序、服务和文档。这个我们称为软件包管理系统，其除了安装软件外，它还提供了工具来更新已经安装的包。
rpm命令是Red-Hat Package Manager（RPM软件包管理器）的缩写， 该命令用于管理Linux 下软件包的软件。在 Linux 操作系统下，几乎所有的软件均可以通过RPM 进行安装、卸载及管理等操作。
在一开始学习Linux的时候，就发现装个软件怎么这么难，并且有好多个命令。 一会是apt，一会是yum。其实这是由于linux不同的发型版导致的。 他们都是在linux内核的基础上增加了一些常用工具和软件等打包而成,通过销售服务在开源的linux上获得盈利 linux的发行版主要分为以下两类： 一类是使用rpm 方式安装软件的系统，包括Red Hat,Ferdora,SuSE，CentOS等。 一类是dpkg方式安装软件的系统，包括Debian,Ubuntu,B2D等。
输入 uname -a 查看服务器是多少位的（查看过后是x86_64即64-bit） 进入biosoft cd biosoft wget 下载链接https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
Miniconda是最方便快捷的软件下载和管理器，相当于应用商店，大多软件都能搜到，一键安装。日常生信使用小而精的Miniconda即可。学习linux要丢弃之前的图形界面思维
1 最早的软件包 deb deb软件包，debian 首先提出软件包的概念，他的管理机制是将二进制文件、配置文档、man、info等帮助文档合并打包在文件中。 2 RPM redhat package manager rpm命令是RPM软件包的管理工具。rpm原本是Red Hat Linux发行版专门用来管理Linux各项套件的程序，由于它遵循GPL规则且功能强大方便，因而广受欢迎。逐渐受到其他发行版的采用。RPM套件管理方式的出现，让Linux易于安装，升级，间接提升了Linux的适用度。 3 源码
Ansible YUM模块是Ansible中用于管理Red Hat系Linux发行版软件包的强大工具，它具有以下优点：
在Linux环境开发过程中接触ubuntu虚拟机时，在安装软件或者更新软件时apt和apt-get命令使用相对较频繁，下面对这两个命令的用法进行汇总。
[root@maomao365 ~]# dpkg -i maomaoTestPackage.deb
由于最近想自己摸索一些linux下的东西，开始玩起了Linux系统，在安装软件的过程中有诸多的不解和困惑，现在终于搞明白了具体是怎么样的安装步骤和过程，先分享给你们同时也方便自己复习查阅。
相信大家对于linux常用的命令一定都不陌生，但是一些简单，好玩，有趣，虽然可能没有实际作用的命令，你又有了解多少呢？话不多说，本期文章为大家带来15个好玩的linux命令，希望大家能够喜欢！
一种形式是压缩包的形式；例如**.tar.gz，这里面就是**的源码，种形式的软件包的安装需要编译再安装。
在Linux系统中，RPM（Red Hat Package Manager）是一种常用的软件包管理工具，而yum（Yellowdog Updater, Modified）是基于RPM的高级包管理工具。yum命令使得在Linux系统中安装、更新和删除软件包变得更加简单和方便。本文将详细介绍如何使用yum命令安装RPM软件包。
今天学习的是linux环境下的软件安装，因为花花老师的教程特别棒，所以操作上基本没出现特别难的地方。
在这篇文章的结尾介绍了共享文件，但是还有一些问题。前文已经说了不能让该共享文件在任何一个用户的家目录里，只要不在这里，其他位置能在(最好是root进行创建)。问题就是，如果多人共享文件的话，那怎么才能让别人没有办法进去，防止别人妨碍用户之间的文件共享，实现指定人员的允许访问呢？
运行 ：bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
1.进入https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
conda相当于是windows系统下的一个应用商店，可以在这个里面下载你想下载的软件，因为在Linux系统中下载软件要通过软件的官网源码安装，这个方式非常的慢而且下载好之后还有配置环境，有些软件是国外开发下载也相当不容易，于是我们使用conda这个“应用商店”就非常方便了
小二是公司新来的实习生，之前面试的过程中对答如流，所以我非常看好他。第一天，我给他了一台新电脑，要他先在本地搭建个 Java 开发环境。
pacman -S package_name # 安装软件 pacman -S extra/package_name # 安装不同仓库中的版本 pacman -Syyu # 升级整个系统，y 是更新数据库，yy 是强制更新，u 是升级软件 pacman -Ss string # 在包数据库中查询软件 pacman -Si package_name # 显示软件的详细信息 pacman -Sc # 清除软件缓存，即 /var/cache/pacman/pkg 目录下的文件 pacman -R package_name # 删除单个软件 pacman -Rs package_name # 删除指定软件及其没有被其他已安装软件使用的依赖关系 pacman -Qs string # 查询已安装的软件包 pacman -Qi package_name # 查询本地安装包的详细信息 pacman -Ql package_name # 获取已安装软件所包含的文件的列表 pacman -U package.tar.zx # 从本地文件安装 pactree package_name # 显示软件的依赖树 yay -S 包名 # 卸载软件 yay -Ss 关键字 # 根据关键字搜索软件包 yay -Rns 包名 # 卸载软件 yay -G 包名 # 可以只下载aur包而不构建
在Linux 操作系统中，有一个系统软件包，它的功能类似于Windows里面的“添加/删除程序”，但是功能又比“添加/删除程序”强很多，它就是 Red Hat Package Manager(简称RPM)。此工具包最先是由Red Hat公司推出的，后来被其他Linux开发商所借用。由于它为Linux使用者省去了很多时间，所以被广泛应用于在Linux下安装、删除软件。下面就 给大家介绍一下它的具体使用方法。
RPM的全称是：Red Hat Package Manager，是RPM软件包管理器。在Linux系统中对应命令是rpm，我们看到名称中含有Red Hat，也就说明主要是在Red Hat发行版中使用的，除此之外还包括和Red Hat最亲近的CentOS，以及其他一些主流发行版：SuSE、Fedora等。
dpkg命令是Debian Linux系统用来安装、创建和管理软件包的实用工具。 语法 dpkg(选项)(参数) 选项 -i：安装软件包； -r：删除软件包； -P：删除软件包的同时删除其配置文件； -L：显示于软件包关联的文件； -l：显示已安装软件包列表； --unpack：解开软件包； -c：显示软件包内文件列表； --confiugre：配置软件包。 参数 Deb软件包：指定要操作的.deb软件包。 实例 dpkg -i package.deb #安装包 dpkg -r package #删除包
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
：就是进行不同项目（转录组，基因组组装等等）分析的时候，需要不同的软件和同一软件的不同版本，需要进行conda环境分开互不干扰。
包管理系统除了安装软件外，它还提供了工具来更新已经安装的包。包存储库有助于确保你的系统中使用的代码是经过审查的，并且软件的安装版本已经得到了开发人员和包维护人员的认可。
apt 是一个命令行实用程序，用于在 Ubuntu ， Debian 和相关 Linux 发行版上安装，更新，删除和管理 deb 包。它是 apt-get 和 apt-cache 工具的最常用命令和选项的组合。
一、rpm包安装方式 1、步骤： a、找到相应的软件包，比如soft.version.rpm，下载到本机某个目录； b、打开一个终端，su -成root用户； c、cd soft.version.rpm所在的目录； d、输入rpm -ivh soft.version.rpm 2、安装： rpm –ivh rpm的软件包名 更多用法： rpm参数 参数说明 -i 安装软件 -t 测试安装，不是真的安装 -p 显示安装进度 -f 忽略任何错误 -U 升级安装 -v 检测套件是否正确安装 这些参数可以同时采用。更多的内容可以参考RPM的命令帮助。 3、卸载： rpm –e 软件名 不过要注意的是，后面使用的是软件名，而不是软件包名。例如，要安装software-1.2.3-1.i386.rpm这个包时，应执行： rpm –ivh software-1.2.3-1.i386.rpm 而当卸载时，则应执行： rpm –e software。 另外，在Linux中还提供了象GnoRPM、kpackage等图形化的RPM工具，使得整个过程会更加简单。 二、deb包安装方式 Debian Linux提供的一个包管理器，它与RPM十分类似。但由于RPM出现得更早，所以在各种版本的Linux都常见到。而debian的包管理器dpkg则只出现在Debina 1、步骤： a、找到相应的软件包，比如soft.version.deb，下载到本机某个目录； b、打开一个终端，su -成root用户； c、cd soft.version.deb所在的目录； d、输入dpkg -i soft.version.deb 2、安装 dpkg –i deb的软件包名 如：dpkg –i software-1.2.3-1.deb 3、卸载 dpkg –e 软件名 如：dpkg –e software 4、查询：查询当前系统安装的软件包： dpkg –l ‘*软件包名*’ 如：dpkg –l '*software*' 三、tar.gz源代码包安装方式 1、步骤： a、找到相应的软件包，比如soft.tar.gz，下载到本机某个目录； b、打开一个终端，su -成root用户； c、cd soft.tar.gz所在的目录； d、tar -xzvf soft.tar.gz //一般会生成一个soft目录 e、cd soft f、./configure g、make h、make install 2、安装： 整个安装过程可以分为以下几步： 1） 取得应用软件：通过下载、购买光盘的方法获得； 2）解压缩文件：一般tar包，都会再做一次压缩，如gzip、bz2等，所以你需要先解压。如果是最常见的gz格式，则可以执行：“tar –xvzf 软件包名”，就可以一步完成解压与解包工作。如果不是，则先用解压软件，再执行“tar –xvf 解压后的tar包”进行解包； 3） 阅读附带的INSTALL文件、README文件； 4） 执行“./configure”命令为编译做好准备； 5） 执行“make”命令进行软件编译； 6） 执行“make install”完成安装； 7） 执行“make clean”删除安装时产生的临时文件。 好了，到此大功告成。我们就可以运行应用程序了。但这时，有的读者就会问，我怎么执行呢？这也是一个Linux特色的问题。其实，一般来说， Linux的应用软件的可执行文件会存放在/usr/local/bin目录下！不过这并不是“放四海皆准”的真理，最可靠的还是看这个软件的 INSTALL和README文件，一般都会有说明。 3、卸载： 通常软件的开发者很少考虑到如何卸载自己的软件，而tar又仅是完成打包的工作，所以并没有提供良好的卸载方法。 那么是不是说就不能够卸载呢！其实也不是，有两个软件能够解决这个问题，那就是Kinstall和Kife，它们是tar包安装、卸载的黄金搭档。 源码包卸载 cd 源代码目录 make clean ./configure （make） make uninstall rm -rf 目录 清理系统： sudo apt-get autoclean sudo apt-get clean sudo apt-get autoremove （或使用ubuntu-tweak清理） 四、tar.bz2源代码包安装方式 1、步骤 1、找到相应的
备注：1）在安装软件时，一般选项 -ivh 一起使用，这样可以看到安装进度与安装信息；
Linux提供了不同的安装软件的方法。您可以使用Ubuntu软件中心从标准Ubuntu软件仓库外部或通过编译源代码安装来自标准Ubuntu软件仓库的软件。但是，如果你需要卸载程序怎么办？
一、rpm包安装方式步骤： 1、找到相应的软件包，比如soft.version.rpm，下载到本机某个目录； 2、打开一个终端，su -成root用户； 3、cd soft.version.rpm所在的目录； 4、输入rpm -ivh soft.version.rpm
描述: apt全称是Advanced Packaging Tool是Linux系统下的一款安装包管理工具,可以说是Ubuntu系统下最为重要的命令安装、更新、卸载软件升级系统内核都离不开apt命令。
rpm安装：安装别人编译（可以理解为配置好的一个东西）好的软件包，rpm即Redhat Package Manager，是Redhat的软件包管理方式
Conda 是 linux 系统中最方便快捷的下载器，两个版本：建议安装miniconda版
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 linux 卸载软件命令 Linux provides different methods for installing software. You can install software from the standard Ubuntu software repositories using the Ubuntu Software Center, from outside of the standard Ubuntu software repositor
--第四步（重点），使用miniconda，也就是查看已安装的软件、安装、卸载（生信需要的）软件，我们以fastqc为例，其实安装软件很复杂，甚至有专门的一门课来讲这个，今天这里仅是入门操作。
【友情提示：可以放到家目录的bashrc下，方便以后修改。输入:/home/你的用户名/.bashrc。只不过这种安完以后需要再source ~/.bashrc激活环境变量】
我只需简单的一句话，就可以说完。执行： rpm –ivh rpm的软件包名 更高级的，请见下表： rpm参数 参数说明 -i 安装软件 -t 测试安装，不是真的安装 -p 显示安装进度 -f 忽略任何错误 -U 升级安装 -v 检测套件是否正确安装 这些参数可以同时采用。更多的内容可以参考RPM的命令帮助。
虽然使用源码编译安装可以具有提高速度个性化的定制等优点,但对于 Linux发行商来说,则不容易管理软件包,毕竟不是每个人都会进行源码编译的，如果能够将软件预先在相同的硬体与系统上面编译好在发布的话,不就能够让相同的 Linux 发行版,同时拥有相投的版本了吗,如果再加上简易的安装/移除/管理等机制的话,对于软体控管就会更加简单,大多数现代类 Unix 操作系统都提供了一个集中的软件包管理机制,以帮助用户搜索、安装和管理软件,而软件通常以「包」的形式存储在仓库「repository」中,对软件包的使用和管理被称为包管理,本章我们将介绍 RedHat 系统中为我们提供的解决方案,RPM和YUM包管理机制.
1.创建biosoft（mkdir biosoft），然后进入biosoft（cd biosoft）
Alpine 操作系统是一个面向安全的轻型 Linux 发行版。它不同于通常 Linux 发行版，Alpine 采用了 musl libc 和 busybox 以减小系统的体积和运行时资源消耗，但功能上比 busybox 又完善的多，因此得到开源社区越来越多的青睐。在保持瘦身的同时，Alpine 还提供了自己的包管理工具 apk，可以通过 https://pkgs.alpinelinux.org/packages 网站上查询包信息，也可以直接通过 apk 命令直接查询和安装各种软件。
DEB 软件包是一种二进制软件包，包含了已经编译过的程序、库、配置文件以及其他必需的资源。这种软件包格式最初是为 Debian 发行版设计的，但后来也被许多其他基于 Debian 的 Linux 发行版所采用。DEB 软件包使用 .deb 文件扩展名，其设计旨在简化软件的分发、安装和升级。
在长长的列表里，往下翻（或者用ctrl+f搜索关键词miniconda3-latest）找到：Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh找到之后右键，复制链接地址用wget -c进行下载
在Linux系统中，expect 是一款非常有用的工具，它允许用户自动化与需要用户输入进行交互的程序。本文将深入探讨expect命令的基本语法、使用方法以及一些最佳实践。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
对象存储
实时音视频
即时通信 IM
