我可以在Linux(OS7)中安装任何版本的Gromacs：$cd grommacs-5.0.7$ccmake$make
然后设置.bashrc
本网页为gromacs提供了安装"Drude“的功能，以及如何通过git为gromacs$git clone git
浏览 2提问于2017-06-22得票数 2
回答已采纳
我正在尝试为我的硕士项目在Linux上安装GROMACS。我已经按照本指南中给出的说明进行了，我已经接近最后一步，运行这行代码：
sudo cmake ..See also "/home/er/Downloads/GromacsDownload/gromacs-2020/build/CMakeFiles/CMakeError.log".这是我第一次使用GROMACS，Linux，并以这种方
浏览 103提问于2021-02-14得票数 0
回答已采纳
我想在我开放的suse 12.3平台上使用gromacs，但是它有问题。/x86_64-suse-linux/bin/ld: /usr/local /gromacs/lib/libgmx.a(pthreads.c.o): undefined reference/x86_64-suse-linux/bin/ld: note: 'pthread_getaffinity_np@@GLIBC_
浏览 1提问于2013-08-26得票数 0
2回答
我刚刚使用以下命令在Ubuntu (16.04)上安装了gromacs (Version5.1.2)：但我不能运行这个程序。usr/bin/gmx我的计算机处理器类型是x86-64.我还尝试从http://www.gromacs.org/Downloads手动安装</
浏览 0提问于2017-02-03得票数 2
因此，我尝试安装gromacs 4.6.3和4.6.5。而且"genbox“程序目前还没有安装。您可以通过键入: sudo apt-get install gromacs来安装它。
所以我就这么做了。我现在拥有的是gromacs 4.5.5。
浏览 0提问于2014-01-14得票数 1
我想在Linux mint上安装g++来使用GROMACS。我输入了以下命令：它成功地安装了g++，但当我将目录改为Downloads来配置和制作cmake和fftw时，它(Downloads)是空的。我曾尝试删除sudo apt-get remove g++并重新安装g++，但显示相同的结果。我不知道它在哪里下载g++。
浏览 4提问于2020-03-10得票数 0
我正在尝试安装gromacs5.0.7，并按照这个链接底部提供的协议：https://www.mpibpc.mpg.de/grubmueller/densityfitting，自动配置安装libccp4后，使用sudo apt install libccp4-dev
我仍然有一个错
浏览 0提问于2019-07-03得票数 1
我在ubuntu15.10中安装了gromacs和vmd，它们工作得很好。但是，在我升级到ubuntu14.04之后，我无法再次安装它们，vmd不可能被提取。在安装gromacs之前，我安装了cmake和FFTW。我可以看到cmake已经安装，但是gromacs并不存在。现在我升级到了ubuntu 16.04，但仍然不能安装它们。
浏览 0提问于2016-04-27得票数 0
回答已采纳
我是Gromacs的初学者，我试着安装5.0.2版本并执行所有步骤，而且我几乎相信在命令pdb2gmx之后已经成功地安装了它。但是又有一天，我打开了终端，在-version命令之后，我遇到了这个错误: gromacs版本是4.6.6！我该怎么办？耽误您时间，实在对不起
浏览 0提问于2014-12-16得票数 0
我有Ubuntu11.10，我从ubuntu软件中心在上面安装了Gromacs，但是我最近安装了Ubuntu12.10，我在存储库中找不到Gromacs仿真软件，有什么评论吗？
浏览 0提问于2013-01-31得票数 1
1回答
当我在GPU上运行Gromacs时，我会得到这个错误:问题在哪里？谢谢Executable: /opt/Gromacs-5.1.4/bin/gmxWorking dir: /home/linux/Downloads/test gmx
浏览 0提问于2018-10-11得票数 0
我首先用conda下载了GROMACS，但发现它不能识别我的GPU。我的系统运行的是ubuntu 19.10和ryzen 3600x & Radeon RX Vega 56。我尝试自己编译gromacs，遵循http://manual.gromacs.org/documentation/2019-rc1/install-guide/index.html上的说明，并使用以下cmake-DGMX_GPU=on -DGMX_USE_OPENCL=on，但我有错误的"hw
浏览 28提问于2020-04-05得票数 0
安装GROMACS-5.1.2时出现问题。该错误说明不支持gpu架构'compute_20‘。我有CUDA9.0、g++4.9.3和GTX1080图形处理器。我现在该怎么做？有什么问题吗？[ 0%] Built target fftwBuild
[ 1%] Building NVCC (Device) object src/gromacs/CMakeFiles/libgromacs.dir/build-gromacs/src/grom
浏览 2提问于2017-11-06得票数 1
我一直试图在Ubuntu14.04上安装一个NVIDIA GTX760，但是我无法从视频卡上获得任何图像，所以我正在使用主板上的vga，我一直在尝试安装.run (nvidia-325)。ppa sudo apt-get update sudo apt-get install nvidia-325从nvidia页面，但它不工作，你知道我如何得到修复这一点，顺便说一下，我应该安装库达
浏览 0提问于2014-05-07得票数 0
回答已采纳
我安装了一个版本的模拟软件Gromacs 2019.4，以使其与外部计算机兼容。大约两周后，我检查了版本(gmx -版本)，现在是版本2020.1 (2020.1-Ubuntu-2020.1-1)。是否需要重新安装以前的版本？如果我这样做，我怎样才能阻止这种情况再次发生？apt-cache policy gromacs的输出是： Installed: 2020.1-1 Version table
浏览 0提问于2021-08-12得票数 1
我刚接触Gromacs (以及一般的蛋白质分析编码，但对基于python的代码有一定的经验)。我正在尝试将从pyDock收到的.ene文件转换为更具可读性的格式(它目前可以打开gmx eneconv -f project.ene-o converted.edrgmx dump -e project.ene -om read.mdpFile 'project.ene' cannot be used by GROMACST
浏览 21提问于2017-07-27得票数 3
我在Windows 7上安装了Ubuntu，也安装了GROMACS软件。位于/usr/local/gromacs/share/top/文件夹中的一个文件存在一些问题。我安装了操作系统，所以我应该拥有更改文件的权限。请帮帮忙。
谢谢..。
浏览 0提问于2013-04-30得票数 1
我想安装Gromacs，并且我遵循了从这个到它告诉我输入以下命令的步骤：
名称@myname：~/下载/gromacs另见"/home/name/Downloads/gromacs-5.1.1/build/CMakeFi
浏览 1提问于2018-03-22得票数 1
我已经在我的主目录下的集群上安装了Gromacs包。当我直接从终端运行Gromacs时，它可以工作；但当我向PBS提交Gromacs作业时，它会引发以下错误：“加载共享库时出错: libblas.so.3:无法打开共享目标文件:没有完成这样的文件或目录”
浏览 1提问于2017-03-10得票数 0
1回答
NVML库路径
、、
我使用cmake (3.5.1)编译了一个软件(GROMACS 2016.3)，带有以下标志：CUDA库8.0是从deb安装的当软件运行时，它会抛出一个警告GROMACS was configured without NVML support ... Recompile with
浏览 7提问于2017-09-20得票数 3
云服务器
ICP备案
实时音视频
云直播
对象存储
腾讯云开发者
