背景 使用服务器的R语言，安装poppr包过程中，报错： In file included from vendor/cigraph/src/community/optimal_modularity.c...failed for package ‘igraph’ 其中主要是Rglpk包安装不上，原因是找不到共享的依赖。...解决方案 1.安装Glpk到用户目录，用于R依赖 cd ~ wget http://ftp.gnu.org/gnu/glpk/glpk-4.54.tar.gz tar xfzv glpk-4.54.tar.gz...R安装是使用conda安装的，所以我先激活了环境。...R CMD INSTALL Rglpk 安装完，Rglpk则可以正常使用，依赖于Rglpk的其他R包也可以正常安装了。 写在最后：有时间我们会努力更新的。
问题 你想安装和使用一个 R 包。...如果想要将所有已安装的软件包更新为可用的最新版本，使用以下命令： update.packages() 如果你在 Linux 系统上使用 R ，管理员可能已经在系统上安装了一些 R 包，由于普通用户没有更改权限...其他 导入包也可以使用require()函数。下表显示了 R 包安装相关的命令及描述。...R包 remove.packages 移除一系列已安装的R包 installed.packages 将已经安装的R包更新到最新版本 setRepositories 设定当前的R包的资源库列表 通过命令行安装...R 包 R CMD INSTALL aplpack_1.1.1.tgz # 安装aplpack包 从其他资源库安装 R 包 devtools 包提供了从其他流行的 Git 资源库或其他 URL 上安装
2、作用：实现特定的功能，你需要什么功能，安装相应的R包就行。说人话就是使用智能手机，需要使用微信与人聊天，你就按照微信APP，需要上腾讯视频看电视剧，你就安装腾讯视频APP。...3、在哪可以找R包： （1）官方网站CRAN网站下载，使用“install.packages（）”函数来安装 （2）Bioconductor网站下载，主要是生物生信相关的...R包，使用 “BiocManager::install()来安装 （3）github网站，是R包作者写的，没有经过审核，使用”devtools::install_github...几乎不使用，使用时需要写明R包的作者，就是指明选择谁写的R包。...说人话，智能手机安装的腾讯视频，只要你不卸载，就一直在你的手机里，需要看电视剧是打开APP，看完电视了你退出APP，再次看电视时还需要再次打开APP。所有“加载”R包就相当于打开APP。
关于R和RStudio安装在这里就不再介绍了，网上有很多相关内容，如果安装过程有困难可以后台私信我。 PS.本次内容为R包安装及初识向量。 ? PART2 R包安装 问：什么是R包？...答：包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合。它们提供了种类繁多的默认函数和数据集。...（对于刚接触R的同学来说可能看起来比较抽象，但是没关系，我们会在后续的学习中慢慢了解R包的概念） 1.R包安装：第一次安装一个包，使用命令install.packages()即可。...#示例：安装ggplot2包 install.packages('ggplot2') install.packages("ggplot2") 值得注意的一点是，包的名称需要放在单引号''或者双引号""...中 2.R包载入：安装完成后，想要调用这个包中的命令、数据等信息，就需要先载入这个包，需要用到的命令为library()。
说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网，凡是需要通过CRAN下载的R包，都可以通过install.packages("pkg_name")来安装。 2....Github 部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上，便可通过其Github进行安装，通过devtools::install_github("用户名/pkg_name")安装。...安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...源码安装 在这里也许能找到你需要的R包历史版本。
简介 平常在各种R语言群里，总会遇到关于安装R包的问题，例如：搭载在github上的R包，由于网速（外网）原因而无法下载该怎么办？...这里小编分享下平常逼不得已才使用的“下三滥”方法——直接下载包，通过本地安装。 网上好多解决方案都是基于R gui的，但现实中使用Rstudio这个IDE会更多些。...接下来以gmm包在Rstudio下安装为例： 教程 使用bing搜索该包，找到相应网站[1]。 关键词：R包名称+R，或者可以再加上CRAN。 ?...搜索技巧：R包名称+R 找到Downloads板块，下载对应的压缩包 这里以mac为例 ?...这个方法对一些有很多依赖包的包可能会很头疼，就怕安装完成，他还说你有其他包没安装，那你只能“将错就错”了！
tidyverse安装失败，install.packages('tidyverse') 错误原因大概是其中有个依赖包xml2安装不上，解决办法是yum install libxml2-devel，这样就可以安装...xml2了，也可以安装tidyverse了
说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包的来源 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网，凡是需要通过CRAN下载的R包，都可以通过install.packages("包名")来安装 2....Bioconductor 里面多是跟生信相关的R包，通过BiocManager::install("包名")来安装，今天的例子edgeR和limma都可以通过这种方法安装。 3....部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上，便可以在其Github上安装，通过devtools::install_github("用户名/包名")安装 # 综上 install.packages(...安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。
一般来说就是Windows电脑的中文用户名需要修改电脑系统的环境变量，R包下载等等。...但是今天有一个学员起初是下载R包无法联网，所以失败，根据我们的经验当然是options(download.file.method = 'libcurl')就轻轻松松解决啦，不过这次居然是仅仅是解决了R自带...R包下载问题，使用BiocManager仍然是无法安装R包，如下所示： ?...='libcurl') 果然，现在在Windows电脑里面R语言的安装R包和下载文件就OK啦。...接下来就继续安装R包吧 使用管理员打开R哦，然后就 options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn
R包安装的方式 之前在学习数据挖掘课程的时候，就按照小洁老师教的方法整理过相应的笔记啦，R包安装与使用 那我们先回顾一下，基本的R包安装方法——配置好镜像，然后按照对应的来源安装需要的R包。...) #安装R包 括号里面写入需要安装的包的名字 2...."EnhancedVolcano") #安装需要的R包 3....Github上R包 如果是github上的包，可以采用输入作者名以及R包名字之后使用命令进行安装 安装Github上的包 #使用devtools安装 install.packages('devtools...() #查看已安装的R包 search() #查看已载入的R包 查看已经安装的R包 查看已经载入的R包 R包安装成功的唯一标准：library()没有error——小洁老师
通常来说，R包的安装主要有四种方法，包括：1）从R语言官网上直接下载相关R包并安装；2）从Bioconductor上下载R包并安装；3）从Github上下载R包并安装；4）手动安装R包。...接下来我将和大家分享R包的具体安装： 1）首先获取下载的R包的名字，比如下载metafor这个R包，可以先在官网（https://www.r-project.org/）上找到这个包，了解一下这个包的详细内容和使用说明...，接下来使用： install.packages('metafor') 即可顺利安装该R包。...3）接下来便是安装源自Github（https://github.com/）的R包了，它的步骤和安装源自Bioconductor的R包类似，需要先安装devtools包，然后用devtools包里的install_github...，github中的R包需要在其前面加上该包所在的库名，否则无法进行下载安装。
R语言入门mac——安装【附安装链接】 这里写目录标题 R语言入门mac——安装【附安装链接】 一、总体安装步骤 1 安装R 2下载RStudio 二、R包安装 一、总体安装步骤 1 安装R RStudio...需要R 3.0.1+ 下载链接：https://cran.rstudio.com/ 2下载RStudio 下载链接：https://rstudio.com/products/rstudio/download.../ 二、R包安装 下面展示 r包安装代码 rm(list = ls()) options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https
我们先安装它的依赖包： BiocManager::install(c('sva', 'car', 'genefilter', 'preprocessCore', 'ridge')) 这里 BiocManager...包需要提前安装好，使用 install.packages("BiocManager") 即可。...下载之后进行安装，在 R 控制台运行命令： install.packages("pRRophetic_0.5.tar.gz", repos = NULL, dependencies = TRUE) 测试...安装好之后我们需要测试下包能不能正常使用，这里就跟着文档做个几步看看。...如果读者不会安装 R 包建议看下我在教程里写的有关 R 包安装的内容：https://shixiangwang.gitee.io/geek-r-tutorial/[3]。
安装R语言的包的方法： 1....自动安装（在线安装） 在R的控制台,输入 install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra install.packages("stepNorm", contriburl...手动安装（离线安装） Windows: 下载package.zip文件 打开R的菜单栏->Packages->“Install package from local zip file…” 选择package.zip...文件 Linux上安装R包（离线安装）: 下载package.tar.gz文件 在Shell终端（注意不是R）输入: sudo R CMD INSTALL package.tar.gz 注意：需要sudo...查看全部安装的R包： .packages(all.available=T) 查看某个安装的R包： library("XML") help(package="XML")
安装 在R或者Rstudio交互界面输入： source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("RTCGAToolbox") Windows下...，如果安装出现问题，请查看依赖包是否完整。...我安装时发现XML包可能需要单独安装。 如果你是Linux系统，而且XML包一直安装不上，请仔细查看错误信息。...有可能是你的系统没有XML和curl配置，导致不能安装XML以及Rcurl包（具体依据错误信息分析）。...安装RTCGA工具包。
（1）R包安装 按需索取，目的不是学会某个具体的R包，而是找所有R包使用的规律。 不需要安装所有的R包，需要哪一个，装哪一个。...例如：install.packages("stringr") 安装后需要加载,加载的时候加不加引号都可以， 两个都是加载，load是加载数据，library是加载R包 library()...#library是判断R包是否安装成功的唯一标准， require() 一次安装，每次打开新的session（交互式会话）都要加载。...")) #安装R包 if(!...R语言版本与R包不符 可能原因4:包过时了 2）是否更新 图片 3）加载A包，报错B包不存在 先安装B包，成功后再安装A包 4）依赖包的版本不够新 图片 更新一个包：重新安装，或先删除再重新安装 更新所有的包
SRPM包 如果我们只想安装 SRPM 包，而不用修改源代码，那么直接使用 rpmbuild 命令即可。...使用 rpmbuild 安装 SRPM 包的命令格式如下： [root@localhost ~]# rpmbuild [选项] 包全名 可使用如下 2 个选项： -rebuild：编译 SRPM 包生成...RPM 二进制包； -recompile：编译 SRPM 包，同时安装。...-5.el6.src.rpm -i 选项用于安装 rpm 包时表示安装，但对于 SRPM 包的安装来说，这里只会将 .src.rpm 包解开后将个文件放置在当前目录下的 rpmbuild 目录中，并不涉及安装操作...以上两种方式都可实现将 SRPM 包编译为 RPM 二进制包，剩下的工作就是使用 RPM 包安装软件，这部分内容已在前面章节中讲过，因此不再赘述。
R语言安装软件包 1 打开RGui.exe，执行“`install.packages(“software name”)“`，安装成功后会提示“`The downloaded binary packages...are in …“`，给出了程序包存放路径 2 选择程序包，点击“`Install package(s) from local files…“`，选中路径里面下载好的程序包，会出现“`successfully...，给出了程序包存放路径 2 选择程序包，点击Install package(s) from local files......R是个合作计划，有许多人为之做出了贡献. 用'contributors()'来看合作者的详细情况 用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。...R-4.1.2/library’中删除程序包 (因为没有指定‘lib’) > remove.packages(c("relaimpo"),lib = file .path("path", "to", "
r语言的包中，集成了众多函数，大大扩展了r的功能且降低了使用难度。本篇文章就来介绍r语言中包的两种安装方式：install.packages和从github安装包。...install.packages() install.packages()是从镜像安装包，在括号中输入包的名称字符串就可以完成包的安装。...通过github安装 一些开发者没有将包上传至镜像，而是在github上开发并分发，此时就需要从github安装相应包。这里提供两种方法。...语句中的 AnomalyDetection为包名，twitter为仓库名。很明显，安装包时还需要知道仓库名，为我们带来了不便。...除上述方法，通过本地安装包也是常用的方法之一。但实际操作中，经常会遇到要安装一个包要先安装很多包的情形，因此本地安装方法有时可操作性较差，因此不在这里详细介绍。
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