-o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/mplutils.ogcc -pthread -fno-strict-aliasing -g -O2 -DNDEBUG-o build/temp.linux-x86_64-2.7/C
浏览 2提问于2013-11-27得票数 2
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yaml=5.3.1-1 git=1:2.25.1-1ubuntu3
RUN wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-py38_4.8.3-Linux-x86_64.sh && chmod +x Miniconda3-py38_4.8.3-Linux-x86_64.sh && ./Miniconda3-py38_4.8.3-Linux-x86_64.sh -b && cp &#x
浏览 0提问于2020-09-01得票数 0
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我的目录/home/owner/anaconda3/envs/qiime2-2019.1中有qiime2程序。在Linux终端，我运行source activate /home/owner/anaconda3/envs/qiime2-2019.1来启动这个程序。我试着在R中以system('source activate /home/owner/anaconda3/envs&
浏览 0提问于2019-04-26得票数 1
我一直试图用命令在Linux上安装QIIME2并得到以下错误消息：
- qiime2The following specifications were
浏览 8提问于2022-10-12得票数 0
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init.py"，第46行，除了TypeError，err：^ SyntaxError:无效语法
echo $PYTHONPATH吐出：
/home/daniel/qiime_sof
浏览 1提问于2014-10-09得票数 1
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(qiime)user@server:~$ pip install qiimeCollecting qiime-default-reference<0.2.0,>=0.1.2(from qiime)Collecting pandas>=0.13.1 (from qiime)
Collecting=1.4.2,&g
浏览 1提问于2015-11-19得票数 1
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我试图在QIIME2 virtual machine中运行以下命令，安装在macbook上，但代码不起作用下面是链接：
我对unix/linux和qiime都很陌生。
浏览 6提问于2017-11-22得票数 0
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, provenance)
File "/opt/conda/envs/qiime2-2018.8/lib/python3.5/site-packages/qiime2/sdk/action.py"我尝试了几种方法:在QIIME2环境中，在容器中，但不在QIIME2环境中，在Dockerfile中添加ENV TMPDIR="/cutom_tmp"/，然后重新构建
浏览 19提问于2018-10-26得票数 0
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嘿嘿，system2("macqiime")某些程序不能通过R通过system2()调用吗？这与普通的终端shell是一样的，只不过默认的python是不同的(/macqiime/bin/python)，并且在您的路径中还有其他与QIIME相关的东西。(请注意，我主要感兴趣的是使用QIIME调用R Markdown中的eng
浏览 2提问于2015-11-28得票数 1
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@qiime-190-virtual-box:~/Documents/circos-0.69/bin$ perl -MCPAN -e 'install GD'qiime@qiime-190-virtual-box:~/Documents/circo
浏览 3提问于2016-01-27得票数 3
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我在Python上安装Pycogent1.5.3模块时遇到了问题。
运行安装运行生成运行build_py运行build_ext构建'cogent.align._compare‘扩展错误:
浏览 1提问于2014-02-26得票数 2
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debian@debian:~$ echo $PYTHONPATH debian@debian:~$ python [GCC 4.7.2] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license"feedparser-5.1.3-py
浏览 4提问于2013-04-29得票数 64
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有一系列的步骤，每一步都会调用一个python脚本。每一步都接受一个文本文件作为输入，并在用户决定的文件夹中生成一个输出文本文件。命令示例：
python /software/qiime-1.4.0-release/bin/check_id_map.py -m /home/qiime/sample/Fasting_Map.txt-o /home/qiime/sample/mapping_output -v
浏览 14提问于2012-07-31得票数 2
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使用nohup执行虚拟环境
、、、、
source activate qiime2-2019.1 但是我不能使用nohup执行我的虚拟环境，当我关闭服务器的提示符时，我的命令abort ...nohup: cannot execute command &#
浏览 34提问于2020-09-25得票数 0
使用qiime生成的biom文件转化成txt文档后，在R中导入otu_table后，使用Tax4Fun进行预测时报错，如下图：请问这个问题怎么解决。谢谢
浏览 991提问于2019-01-08
64bit) [xxuser@xxlinux ~]$ /root/Canopy/canopy Traceback (most recent call last): File "/home/xxuser/qiime_software但是我是Python和Linux新手，我想在修改任何引导文件、路径等之前知道我在做什么。更多信息(看到我应该在编辑中更新新的信息到原始问题。(这是新的。)其中一项评论：导入os.pathos.path
来自&#
浏览 3提问于2015-01-21得票数 2
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在官方qiime2网站上使用给定的yaml文件将最新的yaml版本安装到conda环境中时。安装会产生一个与genomeinfodbdata包有关的错误。
浏览 8提问于2022-11-15得票数 0
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我正在尝试重新格式化一个文本文件，以便可以将其上传到管道(QIIME2) -我测试了.txt文件的前几行(但它是用制表符分隔的)，转换成功。我在Linux上运行这个程序，数据本身是来自粗体数据库的序列信息(如果其他人在尝试将其转换为适合QIIME2的格式时遇到类似的问题)。
浏览 28提问于2019-05-22得票数 0
==2.0.3=py27_0 - defaults/linux-64::mkl==11.3.3=0 - defaults/linux-64::libgfortran==3.0.0=1
- defaults/linux-64:libstdcxx-
浏览 16提问于2022-08-31得票数 1
我要把头发扯出来，希望有人能帮我。我有一个snakemake管道，我用两个conda env和-use-conda运行它，当作为一个独立的管道运行时，它工作得很好。“'conda‘命令在$PATH中不可用。”module load anacondashell.prefix("source $HOME/.bashrc; source /e
浏览 0提问于2018-04-05得票数 5
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