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Linux服务器里面安装GISTIC软件

GISTIC软件的使用有两个难点,一是在linux下面安装matlab工作环境,二是如何制作输入文件。...c 安装MCR_Installer 因为GISTIC软件是一个MATLAB程序,在Linux环境下运行需要MCR_Installer。matlab毕竟是收费软件,而且是有界面的。...但是考虑到大多研究者用不起matlab,或者不会用,所以就用linux系统里面安装matlab运行环境来解决这个问题,我们仍然可以把人家写的matlab程序,在linux命令行下面,当做一个脚本来运行!...cd MCR_Installer unzip MCRInstaller.zip chmod 744 installer_input.txt 因为是Linux,所以使用安静模式安装软件,没有鼠标点点点的交互动画过程啦...如果想知道这个GISTIC软件结果图表文件的生物学含义,或者TCGA数据库的CNV文件的GISTIC软件运行方式,我们大约一个星期后继续在生信技能树写教程哈!

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Linux服务器远程软件选择XShell还是PuTTY

在运维Linux服务器进行安装脚本软件的时候,选择SSH客户端软件到底用哪一款比较合适。...那对于XShell和PuTTY软件,都是不错的软件。前者虽然有付费版本,但是对于我们个人来说,免费版本也是够用的,同时管理管理四台服务器对于一般用途是足够用的,个人也不建议购买付费版本。...PuTTY软件也是老牌的SSH客户端软件,算是比较早的软件之一,不过这款软件常年UI界面一直没有改变过,个人不是太喜欢他的软件界面。...同时,PuTTY SSH软件只有同时打开一个服务器,如果有多个服务器的话需要打开多个窗口,这样使得我们管理比较混乱。...图片 这里,我们还是推荐选择XShell客户端软件,理由有以下几个: 1、界面UI体验好 我个人选择XSHELL软件的原因还在于UI界面比价好,这样用起来比较舒服。

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    linux服务器搭建之路1-安装各种软件

    由于实验室需要,准备配置新的服务器,之前一直使用windows比较多,linux比较少,于是开始重新学习linux各种环境的搭建. 1....系统选择 在选择使用centos和ubuntu上,参考了一下网上的建议,大多认为服务器上还是centos比较好一点,再加上以前实验室也是暗中的centos,所以选择安装centos. 2. centos...locationNum=8&fps=1 rdesktop -a 16 x.x.x.x:3389 -u username -p password -f win服务器配置 开启远程访问 取消防火墙拦截...(EPEL (Extra Packages for Enterprise Linux)是基于Fedora的一个项目,为“红帽系”的操作系统提供额外的软件包,适用于RHEL、CentOS和Scientific...Linux.) (3).接下来去搜狗输入法Linux官网下载deb版本的软件包,注意是32bit还是64bit: (4).安装dpkg包,切换为root用户: yum -y install dpkg

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    Linux下常见的代理服务器软件介绍

    Linux系统中,代理服务器是我们搭建网络环境和处理网络请求的常用工具。但是,你知道Linux下常见的代理服务器软件有哪些吗?...本文将为你带来对几款常见的Linux代理服务器软件的介绍,帮助你选择适合的代理服务器。...一、Squid(Squid Proxy Server)Squid是一款功能强大的开源代理服务器软件,被广泛应用于Linux系统。...通过本文的介绍,相信你对Linux下常见的代理服务器软件有了更清晰的认识。选择适合的代理服务器软件将有助于提升你的效率。...无论你是个人用户还是企业用户,选择合适的代理服务器软件都是开启代理之旅的重要一步!你们还知道有哪些更好用的软件吗?欢迎评论区留言讨论

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    Linux 系统上安装服务器管理软件Cockpit

    Cockpit 是一个自由开源的服务器管理软件,使得我们可以通过它好看的 Web 前端界面轻松地管理我们的 GNU/Linux 服务器,非常轻量级,Web 界面也非常简单易用。...下面是 Cockpit 在我们的 GNU/Linux 服务器中一些非常棒的功能: 它包含 systemd 服务管理器。 有一个用于故障排除和日志分析的 Journal 日志查看器。...可以轻松地添加和删除用户以及管理多台服务器。 1. 安装 Cockpit 首先,我们需要在我们基于linux服务器上安装Cockpit,大部分发行版的官方软件仓库中都有可用的cockpit安装包。...这篇博文中,我们会在 Fedora 22、CentOS 7、Arch Linux、RHEL 7和ubuntu 18.04中通过它们的官方软件仓库安装 Cockpit。...dnf install cockpit Arch Linux 现在Arch Linux官方软件库中还没有可用的Cockpit,但Arch用户库(Arch User Repository,AUR)有,只需要运行下面的

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    Linux笔记【002】| 远程登录服务器软件:MobXterm与FileZilla

    一.登录服务器软件——MobXterm 在实际开发或者计算的时候可以使用一些第三方的工具对远程的服务器进行控制。...目前常用的Linux远程登录工具有:putty、xshell、secureCRT等等。我推荐使用MobXterm。secureCRT其实也是一款很强大的终端工具,但是,它毕竟是收费软件。...需要注意的是,要用MobaXterm等软件登录虚拟机的话,事先得开机。 自己的服务器的话指定root用户名登录,也可以是普通用户名,后面学习了后就知道怎么回事了。...在Linux中ssh协议的应用最典型的就是我们可以使用终端去连接Linux,这个终端它使用的协议就是ssh协议。这里不深入介绍。 ?...会提示输入密码,密码正确的话,软件会提示,是否保存密码,保存密码,以后就不需要再输入,不保存,以后每次都要输入密码。 ? 这样我们就登录成功啦。 ? 我们在左侧菜单栏就会有不同的服务器列表。 ?

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    Linux服务器离线安装Mysql等软件的最佳方法

    由于特殊的专用网络环境和安全策略等方面的原因,服务器往往无法访问互联网,这时我们还需要在服务器上安装软件,比如mysql、httpd。 那么如何选择安装方式最合适呢?..._64-glibc23.tar.g 2、解压内容到/usr/local/mysql tar -zxvf mysql-5.1.73-linux-x86_64-glibc23.tar.gz mkdir -...p /usr/local/mysql mv mysql-5.1.73-linux-x86_64-glibc23/* /usr/local/mysql 3、创建用户mysql和组mysql,并修改目录属于...可采用另一种思路:在可联网机器上通过yum或apt包管理工具,下载好软件相关的所有依赖rpm包,然后拿着这些包copy到离线服务器上安装rpm包即可。...5、创建镜像仓库离线安装软件 基于方案四的基础上,将通过yum下载下来的rpm包做成一个仓库,将仓库copy离线服务器上,配置源为这个仓库,直接yum install命令就装上了。

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    Linux基础软件-软件安装

    讲的那些东西都算是系统自带的,但是Linux作为一个服务器操作系统,肯定是要安装运行软件来满足我们的业务需要,本章基础软件部分,将从下面几个部分来讲解: Linux基础软件-软件安装(本章节) Linux...基础软件-yum(一) Linux基础软件-yum(二) Linux基础软件-ntp Linux基础软件-chrony Linux基础软件-dns(一) Linux基础软件-dns(二) Linux基础软件...-nfs Linux基础软件-lvm Linux基础软件-Selinux&库文件&swap 前面的操作都是基于默认自带的软件,而且我们讲过很多命令,默认最小安装的情况下,都是不自带的,都需要额外安装,那我们应该如何安装这些软件呢...如果你想更新所有的软件包,只要输入 yum update即可。 无论是安装,升级,都必须是基于服务器仓库里面有这个软件才可以的,如果没有则无法安装或升级的。...这里实际上还衍生出来另外2个问题,我怎么知道我去哪里下载包(本地配置xxx.repo配置),服务器里面有些啥(yum源)。

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    新勒索软件RedAlert来袭!已有Windows、Linux服务器中招

    根据BleepingComputer消息,一种名为RedAlert的新勒索软件对企业网络进行攻击,目前已经有Windows和Linux VMWare ESXi系统中招。...△RedAlert / N13V 勒索软件命令行选项 Linux 加密器是针对 VMware ESXi 服务器而创建的,其命令行选项允许勒索者在加密文件之前关闭任何正在运行的虚拟机。...DEBUG TESTS -h      Show this message 当使用 ' -w' 参数运行勒索软件时,Linux 加密器将使用以下 esxcli 命令关闭所有正在运行的 VMware ESXi...△使用 RedAlert 在 Linux 中加密文件 在每个文件夹中,该勒索软件还将创建一个名为HOW_TO_RESTORE的自定义勒索说明,其中包含对被盗数据的描述和专门针对受害者的TOR赎金支付网站的链接...虽然新的 N13V/RedAlert 勒索软件操作没有出现大范围的勒索活动,但由于其先进的功能和对 Linux 和 Windows 的即时支持,我们是肯定需要密切关注它。 精彩推荐

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    Linux软件管理

    Linux 软件管理 1、软件管理简介 Redhat和Centos中软件管理是依靠软件包管理器(RPM)来实现的。...RPM(Redhat Package Manager)软件包管理器提供了在linux操作系统中安装,升级,卸载软件(程序)的方法,并提供对系统中所有软件(程序)状态信息的查询;除了这些功能外,RPM软件包管理器还提供了制作软件包的功能...2.2 软件包管理器的核心功能 制作软件包 安装软件 卸载软件 升级软件 查询软件 校验软件 3、软件包简介 3.1 软件包组成 软件包的组成清单 文件清单 安装或卸载的运行脚本 数据库(公共) 程序包名称及版本...6.1 系统发行版本的光盘 linux的ISO镜像文件自带了非常多的RPM安装包,且这些软件版本是最适合当前linux系统的。...############# [100%] [root@zsl ~]# rpm -qa | grep wget wget-1.19.5-10.el8.x86_64 升级注意事项 不要对内核做升级操作 Linux

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    linux 软件安装

    创建小环境:-n 指定小环境的名字 rna,并指定环境的python版本为python=3 conda create -y -n rna python=3 创建小环境成功后会出现3个done 图片 三、安装软件...图片 1.安装软件的方法: 图片 安装 conda install 出现三个done 显示安装完成 图片 2.安装特定版本 图片 3.特殊情况 图片 4.查看conda 环境中已经安装的软件...conda list #基本用法 conda list fast #查看符合正则表达式的软件 conda list -n rna #查看指定环境的软件 5.删除软件 conda remove conda remove -n rna #删除指定环境里的软件 6.常用命令 图片 7.安装软件的另一种方式:用yml文件安装 • 导出当前环境: conda env export...envname > env.yml • 导入环境: conda env create -n envname --file env.yml 8.mamba 安装软件更加丝滑 #安装mamba conda

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    LINUX 安装软件

    Yum软件仓库便是为了进一步降低软件安装难度和复杂度而设计的技术。Yum软件仓库可以根据用户的要求分析出所需软件包及其相关的依赖关系,然后自动从服务器下载软件包并安装到系统。...yum info 软件包名称查看软件包信息yum install 软件包名称安装软件包yum reinstall 软件包名称重新安装软件包yum update 软件包名称升级软件包yum remove...1.5 系统初始化进程Linux系统的开机过程是这样的,即先从BIOS开始,然后进入Boot Loader,再加载系统内核,然后内核进行初始化,最后启动初始化进程。...初始化进程作为Linux系统启动后的第一个正式服务,它需要完成Linux系统中相关的初始化工作,为用户提供合适的工作环境。同学们可以将初始化进程粗犷地理解成从我们按下开机键到看见系统桌面的这个过程。...Linux系统在启动时要进行大量的初始化工作,比如挂载文件系统和交换分区、启动各类进程服务等,这些都可以看作是一个一个的单元(unit),systemd用目标(target)代替了System V init

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    Linux 软件管理

    在线安装 yum是rpm包管理器的前端工具,所有软件包放到官方服务器上,当进行域名在线安装时,可以自动解决依赖性问题。...name 容器说明 mirrorlist 镜像站点 baseurl yum源服务器的地址 enabled 此容器是否生效,不写或者enabled=1 是生效 enabled=0不生效 gpgcheck...yum -y install 软件包 安装软件过程中出现依赖安装的时候 Linux系统会暂停提示y或n,则-y 含义是回答全部问题为是 yum -y install nginx 已加载插件:fastestmirror...’ – 从特定的软件包库安装特定的软件 用处:该命令用于从特定的软件包库安装特定的软件(本例中我们将使用命令从软件包库 epel 中安装 phpmyadmin 软件包) 命令:# dnf –enablerepo...但在我看来,正因如此,所以 DNF 包管理器不会太受那些经验老道的 Linux 系统管理者的欢迎。举例如下: 在 DNF 中没有 –skip-broken 命令,并且没有替代命令供选择。

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    软件测试中常用的linux命令_软件测试linux

    linux常用shell命令=命令+选项+参数 find 查找文件/目录 cd (change directory)切换目录 cd #root根目录 cd / #...apt-get install 软件/包 #安装包 apt-get update 软件/包 #更新软件 apt-get remove 软件...aaaaa”,追加到名为tet文档的最后 echo dddd > tet 用字符串“dddd”替换原来tet中所有的文档 ls >> tet 将ls指令显示的内容追加到文档tet中 ps -ef 查看linux...ps -ef | grep www* 查看所有带www的进程 kill -9 进程号 可以关掉对应的进程 kill -15 进程号 等该进程运行完就关闭该进程 apt-get install 软件包名...下载并安装对应的软件包名 useradd daxia 新增一个名为daxia的用户 passwd daxia 设置daxia用户的密码 su daxia 切换到daxia用户 whoami 查看当前用户

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    开源软件实践之linux高性能服务器编程框架和选型

    但是我今天想说的都不是这些,我想说的是更高一层的学习方案,就是通过自己的实践实现一个开源软件,也许这个开源软件没有任何人使用,但是在实现的这个过程中你会学习到很多,因为实现一个真正的开源软件需要使用到很多编程知识和技巧...关于这个开源软件的一切我都会以博客或者wiki的方式记录,包括每一个模块实现的原理,考虑,设计等等,可能还有核心代码的解读,争取做第一个学习型的开源软件。...说了这么多一点儿也没有和标题扯上关系,今天就是为我这个开源软件写的第一个博客,实现一个高性能的网络服务器的第一个就需要选择一个很好的高性能编程框架,今天就分析这个,这个也算自己开始前的准备,学习高性能服务器编程框架...首先对网络服务器组成的基本软件模块做一个简单的说明,如下表: 服务器基本软件模块 模块 单机 集群 I/O处理单元 处理客户端连接,读写网络数据 作为介入服务器,实现负载均衡 逻辑单元 业务进程或者线程...逻辑服务器 网络存储单元 本地数据库,文件或者缓存 数据库服务器 请求队列 各单元之间的同学方式 各服务器之间的永久tcp连接        既然上面提到的第一个模块是IO处理单元,我们就分析和学习一下

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    免费的集群软件_服务器集群软件

    从根本上讲,它通过在集群中使用冗余硬件,当发生一个硬件或软件失效时使备用部件上线,从而达到高可用性的目的。...刀片服务器是体现这一原则的一个突出的例子。同样,正如每个集群资源应该有备份,每个节点的根卷组(root vg)都应该被镜像。...高可用性集群中节点的工作能力应该大于单机工作高峰时所需的能力,以使剩余能力可以用于HACMP的运行,并接管其它服务器。计算能力包括CPU和I/O带宽等。...软件维护或升级(AIX5L,HACMP或应用软件)应该首先在备用节点上实施(在上面提到的备份措施后)。...IBM 的 HACMP 软件首先发布于1991年,如今已经逐步演进到它的第14个版本。已经有超过6万个处于生产状态的HACMP集群运行与全球。它被公认为是强壮的,高度成熟的可用性软件产品。

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    如何在自己Linux服务器上安装Homebrew软件包管理

    Linux是否需要Homebrew 其实,大部分Linux自带有apt、yum等这样优秀的软件包管理系统,是不需要像macOS那样,自己“再造轮子”手动安装一个软件包管理系统。...但是,使用Homebrew还是有些好处,且适合macOS用户到Linux上过渡。如果你是macOS上用户,开始使用腾讯云轻量应用服务器,那么可以试试嗷。...')" 主要和官方的区别是: 官方使用Homebrew官方仓库,脚本配置使用腾讯云软件源 官方可以选择安装到/home下或用户家目录下,脚本配置安装到/home下 [腾讯软件源] 具体使用方法 以腾讯云轻量应用服务器为例...我们使用有sudo权限的非root用户登录服务器,粘贴命令即可: [运行脚本] 之后,你可以选择腾讯云软件源,会开始同步Homebrew,拷贝文件比较大,需要耐心等待: [等待] [下载完成] 按提示,...另外, Linux使用的人不多,加上Linux往往自带有软件包管理库,所以仓库源比较少(现在就没有cask仓库源)。

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