简介 平常在各种R语言群里,总会遇到关于安装R包的问题,例如:搭载在github上的R包,由于网速(外网)原因而无法下载该怎么办?...这里小编分享下平常逼不得已才使用的“下三滥”方法——直接下载包,通过本地安装。 网上好多解决方案都是基于R gui的,但现实中使用Rstudio这个IDE会更多些。...接下来以gmm包在Rstudio下安装为例: 教程 使用bing搜索该包,找到相应网站[1]。 关键词:R包名称+R,或者可以再加上CRAN。 ?...搜索技巧:R包名称+R 找到Downloads板块,下载对应的压缩包 这里以mac为例 ?...这个方法对一些有很多依赖包的包可能会很头疼,就怕安装完成,他还说你有其他包没安装,那你只能“将错就错”了!
有的时候,包怎么都无法安装,可能是因为受制于网络,如github;也可能是某些玄学问题,只好将R 的源文件下载下来,自行本地安装。...中进行安装,使用本地的源码文件。...) [1] "facets-master.zip" [2] "pctGCdata-master.zip" R中安装本地包: install.packages("...0facets-master/.Rb' Warning message: In install.packages("facets-master.zip", repos = NULL, type = "source") : 安装程序包...library/facets’ Warning message: In install.packages("facets-master", repos = NULL, type = "source") : 安装程序包
背景 使用服务器的R语言,安装poppr包过程中,报错: In file included from vendor/cigraph/src/community/optimal_modularity.c...failed for package ‘igraph’ 其中主要是Rglpk包安装不上,原因是找不到共享的依赖。...解决方案 1.安装Glpk到用户目录,用于R依赖 cd ~ wget http://ftp.gnu.org/gnu/glpk/glpk-4.54.tar.gz tar xfzv glpk-4.54.tar.gz...R安装是使用conda安装的,所以我先激活了环境。...R CMD INSTALL Rglpk 安装完,Rglpk则可以正常使用,依赖于Rglpk的其他R包也可以正常安装了。 写在最后:有时间我们会努力更新的。
这几天米老鼠频繁收到小伙伴关于安装不上TwoSampleMR包的问题,我后来查看了一下,应该是网络连接的问题。我后来尝试下载TwoSampleMR包后本地安装,成功解决。...修改前: 修改后: 第三步 手动安装R包,这里R包的安装顺序很重要。安装前必须要先安装好devtools这个包 1....接下来安装MRPRESSO包: devtools::install_local('./MRPRESSO.zip') 3....最后,安装TwoSampleMR包: devtools::install_local('./TwoSampleMR.zip') 4....安装完毕后加载TwoSampleMR包: library(TwoSampleMR) 结果如下图所示,说明安装成功: 安装时千万别更新其他包!!!
问题 你想安装和使用一个 R 包。...如果想要将所有已安装的软件包更新为可用的最新版本,使用以下命令: update.packages() 如果你在 Linux 系统上使用 R ,管理员可能已经在系统上安装了一些 R 包,由于普通用户没有更改权限...,显示所有已安装的包中具有新版本的包 new.packages 返回一个矩阵,包含所有已安装的新包 download.packages 下载一系列R包到本地目录 install.packages 从资源库下载安装一系列...R包 remove.packages 移除一系列已安装的R包 installed.packages 将已经安装的R包更新到最新版本 setRepositories 设定当前的R包的资源库列表 通过命令行安装...R 包 R CMD INSTALL aplpack_1.1.1.tgz # 安装aplpack包 从其他资源库安装 R 包 devtools 包提供了从其他流行的 Git 资源库或其他 URL 上安装
2、作用:实现特定的功能,你需要什么功能,安装相应的R包就行。说人话就是使用智能手机,需要使用微信与人聊天,你就按照微信APP,需要上腾讯视频看电视剧,你就安装腾讯视频APP。...3、在哪可以找R包: (1)官方网站CRAN网站下载,使用“install.packages()”函数来安装 (2)Bioconductor网站下载,主要是生物生信相关的...R包,使用 “BiocManager::install()来安装 (3)github网站,是R包作者写的,没有经过审核,使用”devtools::install_github...几乎不使用,使用时需要写明R包的作者,就是指明选择谁写的R包。...说人话,智能手机安装的腾讯视频,只要你不卸载,就一直在你的手机里,需要看电视剧是打开APP,看完电视了你退出APP,再次看电视时还需要再次打开APP。所有“加载”R包就相当于打开APP。
关于R和RStudio安装在这里就不再介绍了,网上有很多相关内容,如果安装过程有困难可以后台私信我。 PS.本次内容为R包安装及初识向量。 ? PART2 R包安装 问:什么是R包?...答:包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合。它们提供了种类繁多的默认函数和数据集。...(对于刚接触R的同学来说可能看起来比较抽象,但是没关系,我们会在后续的学习中慢慢了解R包的概念) 1.R包安装:第一次安装一个包,使用命令install.packages()即可。...#示例:安装ggplot2包 install.packages('ggplot2') install.packages("ggplot2") 值得注意的一点是,包的名称需要放在单引号''或者双引号""...中 2.R包载入:安装完成后,想要调用这个包中的命令、数据等信息,就需要先载入这个包,需要用到的命令为library()。
说实话,自从之前好好学习了一下入门的R以后,一直没有用过R,很多东西都忘了,还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网,凡是需要通过CRAN下载的R包,都可以通过install.packages("pkg_name")来安装。 2....Github 部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上,便可通过其Github进行安装,通过devtools::install_github("用户名/pkg_name")安装。...安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时,就需要考虑安装某个特定版本的R包了,这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...源码安装 在这里也许能找到你需要的R包历史版本。
下载需要的包,一般为zip、tar.gz等的压缩包,解压后,打开命令行,进入解压目录,使用python setup.py...install命令安装。
mvn install:install-file -DgroupId=包名 -DartifactId=项目名 -Dversion=版本号 -Dpackaging=jar -Dfile...=jar文件所在路径 1,本地D盘中有个jar,例如:D:\QRCode.jar 2,cmd 中执行mvn install 命令 格式为: mvn install:install-file
一般来说就是Windows电脑的中文用户名需要修改电脑系统的环境变量,R包下载等等。...但是今天有一个学员起初是下载R包无法联网,所以失败,根据我们的经验当然是options(download.file.method = 'libcurl')就轻轻松松解决啦,不过这次居然是仅仅是解决了R自带...R包下载问题,使用BiocManager仍然是无法安装R包,如下所示: ?...='libcurl') 果然,现在在Windows电脑里面R语言的安装R包和下载文件就OK啦。...接下来就继续安装R包吧 使用管理员打开R哦,然后就 options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn
说实话,自从之前好好学习了一下入门的R以后,一直没有用过R,很多东西都忘了,还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包的来源 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网,凡是需要通过CRAN下载的R包,都可以通过install.packages("包名")来安装 2....Bioconductor 里面多是跟生信相关的R包,通过BiocManager::install("包名")来安装,今天的例子edgeR和limma都可以通过这种方法安装。 3....部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上,便可以在其Github上安装,通过devtools::install_github("用户名/包名")安装 # 综上 install.packages(...安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时,就需要考虑安装某个特定版本的R包了,这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。
tidyverse安装失败,install.packages('tidyverse') 错误原因大概是其中有个依赖包xml2安装不上,解决办法是yum install libxml2-devel,这样就可以安装...xml2了,也可以安装tidyverse了
R包安装的方式 之前在学习数据挖掘课程的时候,就按照小洁老师教的方法整理过相应的笔记啦,R包安装与使用 那我们先回顾一下,基本的R包安装方法——配置好镜像,然后按照对应的来源安装需要的R包。...) #安装R包 括号里面写入需要安装的包的名字 2....Github上R包 如果是github上的包,可以采用输入作者名以及R包名字之后使用命令进行安装 安装Github上的包 #使用devtools安装 install.packages('devtools...下载到本地之后再导入Rstudio 根据报错信息中提供的网址,将R包下载到本地,保存在你能方便找到的地方。...() #查看已安装的R包 search() #查看已载入的R包 查看已经安装的R包 查看已经载入的R包 R包安装成功的唯一标准:library()没有error——小洁老师
通常来说,R包的安装主要有四种方法,包括:1)从R语言官网上直接下载相关R包并安装;2)从Bioconductor上下载R包并安装;3)从Github上下载R包并安装;4)手动安装R包。...接下来我将和大家分享R包的具体安装: 1)首先获取下载的R包的名字,比如下载metafor这个R包,可以先在官网(https://www.r-project.org/)上找到这个包,了解一下这个包的详细内容和使用说明...,接下来使用: install.packages('metafor') 即可顺利安装该R包。...3)接下来便是安装源自Github(https://github.com/)的R包了,它的步骤和安装源自Bioconductor的R包类似,需要先安装devtools包,然后用devtools包里的install_github...,github中的R包需要在其前面加上该包所在的库名,否则无法进行下载安装。
R语言入门mac——安装【附安装链接】 这里写目录标题 R语言入门mac——安装【附安装链接】 一、总体安装步骤 1 安装R 2下载RStudio 二、R包安装 一、总体安装步骤 1 安装R RStudio...需要R 3.0.1+ 下载链接:https://cran.rstudio.com/ 2下载RStudio 下载链接:https://rstudio.com/products/rstudio/download.../ 二、R包安装 下面展示 r包安装代码 rm(list = ls()) options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https
网上有各种方法安装pip,针对不同的系统方法还不一样,最后发现还是下面这种方法最简单,直接了当干脆方便,适用于Windows和Linux。...(2)解压安装 解压下载的文件(windows下只用解压工具解压如RAR,Linux下终端输入tar -xf pip-9.0.1.tar.gz,即tar -xf 文件名),进入解压后的文件夹中,调出命令行窗口或者终端...,windows下输入 python setup.py install Linux下输入 sudo python setup.py install 安装成功后测试下,输入 pip -v 搞定!
第一步,从R语言官网,下载package: 以 ‘data.table’为例 如图。...Table of available packages 或Table of available packages sorted by name 找到 data.table 第二步, 下载好包到本地后...然后在R软件选择-程序包-install package from local files,选择下载好的 ‘data.table’文件。
我们先安装它的依赖包: BiocManager::install(c('sva', 'car', 'genefilter', 'preprocessCore', 'ridge')) 这里 BiocManager...包需要提前安装好,使用 install.packages("BiocManager") 即可。...下载之后进行安装,在 R 控制台运行命令: install.packages("pRRophetic_0.5.tar.gz", repos = NULL, dependencies = TRUE) 测试...安装好之后我们需要测试下包能不能正常使用,这里就跟着文档做个几步看看。...如果读者不会安装 R 包建议看下我在教程里写的有关 R 包安装的内容:https://shixiangwang.gitee.io/geek-r-tutorial/[3]。
安装R语言的包的方法: 1....自动安装(在线安装) 在R的控制台,输入 install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra install.packages("stepNorm", contriburl...手动安装(离线安装) Windows: 下载package.zip文件 打开R的菜单栏->Packages->“Install package from local zip file…” 选择package.zip...文件 Linux上安装R包(离线安装): 下载package.tar.gz文件 在Shell终端(注意不是R)输入: sudo R CMD INSTALL package.tar.gz 注意:需要sudo...查看全部安装的R包: .packages(all.available=T) 查看某个安装的R包: library("XML") help(package="XML")
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