下载FCS文件 前面我们介绍了流式细胞术数据文件标准,FCS文件类型 ,来龙去脉。...根据链接 http://flowrepository.org/id/FR-FCM-Z2B3 ,可下载到全部的FCS文件。...我这里演示其中5个文件,如下: 3.6M Nov 6 10:20 WT-UnRx 3-G2_CD45pos.fcs 13M Nov 6 10:27 WT-UnRx-1_CD45pos.fcs...读取FCS文件 只需要把全部的下载成功的FCS文件统一存放在一个文件夹,比如 paper_fcs文件夹,然后使用read.flowSet函数即可读取,示例代码如下: rm(list = ls()) require...) fs1 samp <- read.flowSet(files = fs1,path = p1) samp 熟悉read.flowSet函数产生的对象 使用read.flowSet函数全部的FCS文件后
重定向方式读写文件 #include #define LOCAL int main() { #ifdef LOCAL freopen("input.txt","r",...stdin); //使得scanf从文件input.txt读入 //r只读,如果文件不存在,出错 freopen("output.txt","w",stdout); //...使得printf写入文件output.txt //w只写,如果文件不存在,建立新文件 #endif //只有定义了符号LOCAL,才编译2条freopen语句。...); for(int i=0;i<5;i++) printf("%d\n",i); printf("%d\n",j); return 0; } 非重定向方式读写文件
sed -i ‘s/abc/xxx/g’ file abc修改前的字符串 xxx是修改后的字符串 file是要被修改的文件 例如: 我有一个文件是map_server #!...shutdown.sh cd $MAPSERVER_HOME 我要修改这个DIRECTORY变量的值 使用如下命令: sed -i ‘s/xxxxxx/mapserver5.0/g’ map_server 在打开该文件
安装 Bash 如果你在使用 Linux,你可能已经有了 Bash。如果没有,你可以在你的软件仓库里找到它。...命令来将一个文件读入,这个行为称为 “sourcing”,英文原意为“一次性(试)采购”、“寻找供应商”、“获得”等,考虑到 Bash 的语境和发音,我建议可以翻译为“援引”,或有不当,供大家讨论参考...先用管道把它传送到一个合适的解析器是用 Bash 读取数据的常用方法。例如, 假设 include.sh 是一个配置文件, 它的键和值对用一个等号(=)分开....你可以用 awk 甚至 cut 来获取值: #!.../stream.sh 42 用 Bash 将数据写入文件 无论你是要存储用户用你的应用创建的数据,还是仅仅是关于用户在应用中做了什么的元数据(例如,游戏保存或最近播放的歌曲),都有很多很好的理由来存储数据供以后使用
在python中使用Json Import json .json文件的读入 with open(filePath,'r')as f: data = json.load(f) data是字典类型...可以通过for k,v in data.items()来遍历字典 .json文件的写入 首先存放为.json类型的文件一般是k-v类型的,一般是先打包成字典写入 jsFile = json.dumps...函数1dumps(dict):将python字典json化,接收参数为字典类型 函数2sort_keys:设置是否排序字典 函数3dump():对文件对象的处理 函数4 loads(str)解析json...的字符串 函数5 load() from StringIO import StringIO io = StringIO() #创建文件流对象 json.dump(['cynthia istesting...'], io) #把 json编码数据导向到此文件对象 io.getvalue() #取得文件流对象的内容 from StringIO import StringIO io = StringIO(
在后续布局布线时,工具要依次读入静态区的网表文件(RM为黑盒子)、每个RP对应的RM的网表文件,这样才能形成完整的网表文件。...那么一旦静态区的网表文件和动态区的RM的网表文件准备好之后,如何读入以便Vivado后续执行布局布线?这里我们给出三种可行方法。...添加顶层和各个RP对应的dcp add_files top.dcp add_files rp1_rm1.dcp add_files rp2_rm1.dcp 接下来要通过属性SCOPED_TO_CELLS确保上一步读入的...dcp文件与顶层dcp中的RM的对应关系是正确的。...方法2:直接读入网表文件 该方法适用于网表由第三方综合工具提供。需要用到命令read_edif。
假如你的Windows电脑有个bam文件,不想传输到linux服务器去使用samtools等命令行工具来探索它,就可以使用R语言!...有成熟的R包可以把bam文件读入R,比如Rsamtools,很简单的代码: library(Rsamtools) bamFile="alignResults.BAM" quickBamFlagSummary...genbioconductor/html/Rsamtools.html bam <- scanBam(bamFile) bam 值得注意的是,这里我虽然不再演示了,但是作为初学者的你,应该是知道 但是把读入的数据变成...关于 grange对象 三年前我在生信菜鸟团博客就多次强调过这个重点了,在R里面处理生物信息学数据是躲不过这个定义的,有点类似于各式各样的生物信息学文件格式,是一个标准。...length GRanges对象还有很多其它类型的操作,非常好玩的,split,shift,resize,flank,reduce,gaps,disjoin,coverage 其它求交集并集和都可以用,
作者Blog:http://blog.csdn.net/net_lover/使用Excel文件做为DC# 作者Blog: http...://blog.csdn.net/net_lover/ 使用Excel文件做为DataGrid的数据源是非常简单的,一旦数据被装载进来,就可以把数据再保存进SQL Server或XML中。...我们只需要简单地使用OLE DB Provider 来访问Excel文件,然后返回DataSet即可。
有时候我们需要使用C++处理bam文件,比如取出read1或者read2等符合特定条件的序列,根据cigar值对序列指定位置的碱基进行统计或者对序列进行处理并输出等,这时我们可以使用htslib库。...htslib可以用来处理SAM, BAM,CRAM 和VCF文件,是samtools、bcftools的核心库。...参考资料 htslib sam.h文件:https://github.com/samtools/htslib/blob/develop/htslib/sam.h htslib sam文件格式说明:https
工具: Linux 方法: 1、首先进入Linux的命令行界面.在目录下创建一个用于测试的文本文件(touch filename).这里就新建了一个test12文本文件.当然这个名字是可以随便取得....2、用”vi test12″命令进入vi命令行模式(vi filename)....如果要想编辑文本文件.必须要转换到插入模式下,也就是按一下键盘上的”i”就可以了.这样就可以编辑文本,删除文本中的内容.按键盘上的上下左右键.来回移动了.就跟在windows 系统中编辑文本一样. 3...6、查找 用”/”加上要查找的内容.例如”/hello”或者是”?hello”也是可以的. 7、替换 「r」:替换光标所在处的字符。 ,按一下”r”然后输入要即可.
我们需要遍历一个文件夹下面的所有 文件名,下面介绍下在Python中使用os.walk(路径)可以遍历某路径下的所有文件夹及文件。 ...具体方法是for , , in os.walk()。。。 ...# write by world77 import os Directory=raw_input("Please enter directory to traversal:") ###提示输入想遍历的文件夹路径...Directory): print root for name in dirs: print "Directory:",name #打印文件夹名... for name in files: print "FileName:",name #打印文件名 嘿嘿,很简单吧,下面来看看效果: [root@localhost
概述 本章节主要介绍关于linux通配符的用法,熟练运用通配符可以提高工作效率并且可以简化一些繁琐的处理步骤。...例:只查询字母文件 ll [a-zA-Z] 例:查询以“.log”结尾且“.log”前只有两个字符的文件且第二个字符是数字 ll?...[0-9].log “^” 表示匹配结果取反的意思,注意这个通配符必须要在[]中使用 例:查询不是以“.log”结尾的文件 ll*[^txt]* “{}” 表示符合括号内包含的多个文件 例:查询‘....log’和“.txt”结尾的文件 ll {*.log,*.txt} 注意: “.”这个符合比较特殊,如果匹配的条件加上了该符合那么说明查询结果文件就包含带“.”的文件 例如前面的“^”的例子,如果我这样查询...[^txt]*”,那么结果就不一样了 删除操作 例如:删除a、b、c和以.txt结尾的文件 rm-f {[abc],*.txt} 总结 当然既然可以查询当然也可以使用通配符匹配的方式进行移动文件,如果需要在存在很多文件的文件夹中移动某些类型的文件那么使用通配符匹配的效率就显而易见了
ranger 是一款独特且非常方便的文件系统导航器,它允许你在 Linux 文件系统中移动,进出子目录,查看文本文件内容,甚至可以在不离开该工具的情况下对文件进行修改。...它提供了一个多级的文件显示,让你很容易看到你在哪里、在文件系统中移动、并选择特定的文件。 要安装 ranger,请使用标准的安装命令(例如,sudo apt install ranger)。...使用右方向键可移动到更深的目录或查看文件内容。 如果你继续按下方向键移动到列表的文件部分,你会注意到第三列将显示文件大小(而不是文件的数量)。...“当前选择”行也会显示当前选择的文件名,而最右边的一列则会尽可能地显示文件内容。...该工具提供了一种非常不同的方式来列出 Linux 系统上的文件并与之交互,一旦你习惯了它的多级的目录和文件列表方式,并使用方向键代替 cd 命令来移动,就可以很轻松地在 Linux 的文件中导航。
age 是一个简单的、易于使用的工具,允许你用一个密码来加密和解密文件。 文件的保护和敏感文档的安全加密是用户长期以来关心的问题。...它是一个小型且易于使用的工具,允许你用一个密码加密一个文件,并根据需要解密。 安装 age age 可以从众多 Linux 软件库中 安装。...用 age 加密和解密文件 age 可以用公钥或用户自定义密码来加密和解密文件。...用公钥解密 如需解密加密文件,使用 age 命令和 --decrypt 选项: $ age --decrypt -i key.txt -o mypass.tar.gz mypass.tar.gz.age...使用密码加密 不使用公钥的情况下对文件进行加密被称为对称加密。它允许用户设置密码来加密和解密一个文件。
ls |xargs -i tar zcvf {}.tar.gz {} 比如,现在我要将某个目录下的所有文件全部分别压缩,注意是分别压缩。...例: a/ 目录下有三个文件 1.txt ,2.txt ,3.txt 要达到的效果是批量压缩为: 1.txt.tar.gz 2.txt.tar.gz 3.txt.tar.gz 示例: root@
文件的保护和敏感文档的安全加密是用户长期以来关心的问题。...它是一个小型且易于使用的工具,允许你用一个密码加密一个文件,并根据需要解密。 安装 age age 可以从众多 Linux 软件库中 安装。...用 age 加密和解密文件 age 可以用公钥或用户自定义密码来加密和解密文件。...用公钥解密 如需解密加密文件,使用 age 命令和 --decrypt 选项: $ age --decrypt -i key.txt -o mypass.tar.gz mypass.tar.gz.age...使用密码加密 不使用公钥的情况下对文件进行加密被称为对称加密。它允许用户设置密码来加密和解密一个文件。
当你在 Linux 系统上删除一个文件时,它不一定会永远消失,特别是当你最近才刚刚删除了它的时候。...除非你用 shred 等工具把它擦掉,否则数据仍然会放在你的磁盘上 —— 而恢复已删除文件的最佳工具之一 testdisk 可以帮助你拯救它。...有趣的是,它不仅是一个 Linux 工具,而且还适用于 MacOS、Solaris 和 Windows。 文档可在 cgsecurity.org 中找到。...当你用 testdisk 恢复被删除的文件时,你最终会将恢复的文件放在你启动该工具的目录下,而这些文件会属于 root。出于这个原因,我喜欢在 /home/recovery 这样的目录下启动。...Partition Start End Size in sectors > 1 P Linux filesys. data 2048
当你用 testdisk 恢复被删除的文件时,你最终会将恢复的文件放在你启动该工具的目录下,而这些文件会属于 root。出于这个原因,我喜欢在 /home/recovery 这样的目录下启动。...Partition Start End Size in sectors > 1 P Linux filesys. data 2048...如果找不到文件,可以按 /(就像在 vi 中开始搜索时一样),提示你输入文件名或其中的一部分。...在将文件移回原来的位置之前,你可能应该先验证恢复的文件看起来是否正确。确保你也恢复了原来的所有者和组,因为此时文件由 root 拥有。...# References * [用 testdisk 恢复 Linux 上已删除的文件](https://linux.cn/article-12674-1.html) * [TestDisk CN](https
这篇文章给大家介绍了“怎样用scp在 linux 系统之间复制文件”的相关知识,讲解详细,步骤过程清晰,有一定的借鉴学习价值,因此分享给大家做个参考,感兴趣的朋友接下来一起跟随小编看看吧。...linux的scp命令 linux 的 scp 命令 可以 在 linux 之间复制 文件 和 目录; ================== scp 命令 ================== scp...可以在 2个 linux 主机间复制文件; 命令基本格式: scp [可选参数] file_source file_target ====== 从 本地 复制到 远程 ====== * 复制文件: *...,第2个指定了文件名; 第3,4个没有指定用户名,命令执行后需要输入用户名和密码,第3个仅指定了远程的目录,文件名字不变,第4个指定了文件名; * 例子: scp /home/space/music/1.../others/music/ 目录 这篇关于“怎样用scp在 linux 系统之间复制文件”的文章就介绍到这了 免责声明:本站发布的内容(图片、视频和文字)以原创、转载和分享为主,文章观点不代表本网站立场
适用场景 csplit命令用于将一个大文件分割成小的碎片,并且将分割后的每个碎片保存成一个文件,csplit命令–>按照指定的范式来分割文件,保存为xx00,xx01…的文件....拆解文件主要是split和csplit命令,如果说split是按大小来拆分的话,那么csplit则可按匹配来拆分 选项解释 $ csplit -h /[正则表达式]/ #匹配文本样式,比如/SERVER...{*} #表示根据匹配重复执行分割,直到文件尾停止,使用{整数}的形式指定分割执行的次数。 -s #静默模式,不打印其他信息。 -n #指定分割后的文件名后缀的数字个数。比如01、02、03等。...-f #指定分割后的文件名前缀。 -b #指定后缀格式。比如%02d.log,类似于C语言中的printf参数格式。
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