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    使用UniMoVib+PyVibMS显示其他量化程序振动分析结果

    1. 前言 在之前的《使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式》一文中,笔者介绍了PyVibMS插件的基本使用方法。目前对于量子化学程序计算的分子体系,PyVibMS已经可以原生支持高斯、ORCA、xtb和Q-Chem四款主流软件。然而对于CFOUR、MOLPRO、BDF等较少使用的量子化学程序计算的振动分析的结果,PyVibMS支持通过先载入XYZ坐标文件、再载入mode文本文件的方式进行振动可视化。其中,mode文本文件的准备可能需要用户有一定的脚本编写水平。 本文介绍一种不需要用户编写脚本制作mode文件就可以对非主流量子化学程序计算得到的振动分析结果进行可视化的方法。此方法的基本原理是先利用UniMoVib程序读取量子化学计算程序给出的Hessian矩阵信息,然后生成可以让PyVibMS读取的统一格式的XYZ和mode文件,最后将这两个文件载入PyVibMS即可。 UniMoVib是一款可以从近30种量子化学计算程序中读取Hessian、坐标等数据计算谐振频率和(可选)红外强度的Fortran程序。可以将它理解成一个加强版的freqchk程序。目前UniMoVib的代码、手册和例子文件在GitHub上托管:

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