循环中的重定向 或许你应该在其他脚本中见过下面的这种写法： while read line do … done < file 刚开始看到这种结构时，很难理解< file是如何与循环配合在一起工作的。因为循环内有很多条命令，而我们之前接触的重定向都是为一条命令工作的。这里有一个原则，这个原则掌握好了，这个问题就很简单了： 对循环重定向的输入可适用于循环中的所有需要从标准输入读取数据的命令； 对循环重定向的输出可适用于循环中的所有需要向标准输出写入数据的命令； 当在循环内部显式地使用输入或输出重定向，内部重定向覆盖外部重定向。 上面的while结构中，read命令是需要从标准输入中读取数据的。我们来详细了解一下read命令的用法吧，这个命令是shell脚本中使用频率最高的命令之一。 read 先来看一下read的命令语法： read arg1 arg2 arg3 arg4 … read是一个用来赋值的命令，它需要从标准输入获得值，然后把这些值按位置依次赋值给变量arg1、arg2、arg3、arg4…，输入的时候以空格作为字段分隔符。 read的一个最大特性是可以在脚本中产生交互，因为它从标准输入读取数据。read之所以很常用，一是因为我们经常需要赋值，二是因为它可以交互，三是read能够一次给多个变量赋值。 readhostipnamelinux10.0.0.1licongreadhostipnamelinux10.0.0.1licong read host ip name linux 10.0.0.1 licong echo hosthosthost ip namelinux10.0.0.1licongnamelinux10.0.0.1licongname linux 10.0.0.1 licong 可以看到，linux、10.0.0.1、licong分别被赋值给了变量host、ip和name。再看： readhostiplinux10.0.0.1licongreadhostiplinux10.0.0.1licong read host ip linux 10.0.0.1 licong echo hostlinuxhostlinuxhost linux echo ip10.0.0.1licongip10.0.0.1licongip 10.0.0.1 licong 当我们输入的字段比变量数目多时，最后一个变量的值将不只一个字段，而是所有剩余的内容；当输入字段比变量数少时，多余的变量将是空值，你可以自己试试。现在我们再来看 while read line do … done < file read通过输入重定向，把file的第一行所有的内容赋值给变量line，循环体内的命令一般包含对变量line的处理；然后循环处理file的第二行、第三行。。。一直到file的最后一行。还记得while根据其后的命令退出状态来判断是否执行循环体吗？是的，read命令也有退出状态，当它从文件file中读到内容时，退出状态为0，循环继续惊醒；当read从文件中读完最后一行后，下次便没有内容可读了，此时read的退出状态为非0，所以循环才会退出。 另一种也很常见的用法： command | while read line do … done 如果你还记得管道的用法，这个结构应该不难理解吧。command命令的输出作为read循环的输入，这种结构长用于处理超过一行的输出，当然awk也很擅长做这种事
需要注意的是文件描述符 0 通常是标准输入（STDIN），1 是标准输出（STDOUT），2 是标准错误输出（STDERR）
符号 作用 Linux通配符 * 匹配任意（0个或多个）字符或字符串，包括空字符串 ？ 匹配任意1个字符，有且只有一个字符 [abcd] 匹配abcd中任何一个字符，abcd也可是其他任意不连续字符 [a-z] 匹配中a到z之间的任意一个字符， a到z表示范围，字符前后要连续，-表示范围的意思，也可以用连续数字[1-9] [!abcd] 同[^abcd]，表示不匹配括号里面的任何一个字符，也可为[!a-d] Linux特殊符号
Linux Shell 提供重定向符用于重定向命令的输入和输出，提供管道符用于将一个命令的输出重定向作为另一个命令的输入。
Linux Shell 的自动交互在很多场景下会使用到，比如我们需要批量运行一些需要输入参数进行交互的命令时，此时 Shell 的自动交互就能将我们从重复无聊的手动交互中解放出来。
让学生了解shell的启动过程，shell的功能，shell的命令形式，shell程序的建立和运行,理解管道和重定向，环境变量和系统变量以及变量引用方式。
表3-1 输入重定向中用到的符号及其作用
把多个 Linux 命令适当地组合到一起，使其协同工作，以便更加高效地处理数据。要做到这一点，就必须搞明白命令的输入重定向和输出重定向的原理。
所有程序, 包括shell启动的程序, 都能访问环境变量, 在c中通过system()函数执行的结果可以通过环境变量传递回来
如果文件file1.txt不存在，则上面的命令将创建该文件，否则，它将更改其时间戳。
编写shell脚本时，您可能需要将多行文本或代码块传递给交互式命令，例如tee，cat或sftp。在Bash和其他类似Zsh的shell中，Here document（Heredoc）是一种重定向，允许您将多行输入传递给命令。
如图所示，当你使用 man man 指令时，也就是你要查看man 手册的内容时，会有这几行代码，前面红框框起来的是 man 手册的编号，在未指定编号的情况下，系统默认按编号顺序查找手册，当然你也可以指定手册编号查找，因为一些指令可能与一些函数同名，但它们在不同编号的手册里，这个时候不指定编号查找，可能就找不到你想要的内容。
特殊符号| #管道符，或者（正则）> #输出重定向>> #输出追加重定向< #输入重定向<< #追加输入重定向~ #当前用户家目录`` $() #引用命令被执行后的结果$ #以。。。结尾（正则）^ #以。。。开头（正则）* #匹配全部字符，通配符？ #任意一个字符，通配符# #注释& #让程序或脚本切换到后台执行&& #并且 同时成立[] #表示一个范围（正则，通配符）{} #产生
linux中，每个进程都有三个特殊的文件描述指针：标准输入（文件描述指针为0），标准输出（文件描述指针为1），标准错误输出（文件描述指针为2）。
在输入命令前就已经存在的“[root@linuxprobe～]# 当前登录用户名为root，简要的主机名是linuxprobe，所在目录是～ #表示管理员身份（如果是$则表示普通用户，相应的权限也会小一些）
静态链接器以一组可重定向目标文件为输入, 生成一个完全链接的可执行目标文件作为输出. 链接器主要完成两个任务:
函数可以让我们将一个复杂功能划分成若干模块，让程序结构更加清晰，代码重复利用率更高。
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15.1 理解输入和输出 现在知道两种显示脚本输出的方法 1）在显示器屏幕上显示 2）将输出文件重定向到文件中 15.1.1 标准文件描述符 Linux系统将每个对象当做文件处理。这包括输入和数出进程。 Linux用文件描述符来标识每个文件对象。 它是一个非负整数，可以唯一标识会话中打开的文件。 每个进程一次最多可以有九个文件描述符 bash shell保留的前3个文件描述符（0、 1、 2） 1.STDIN 标准输入（0） STDIN文件代表shell的标准输入。 对终端界面来说，标准输入是键盘。 she
Linux 系统主要分为 内核(kernel) 和 外壳(shell)，普通用户是无法接触到内核的，因此实际在进行操作时是在和外壳程序打交道，在 shell 外壳之上存在 命令行解释器(bash)，负责接收并执行用户输入的指令，本文模拟实现的就是一个 简易版命令行解释器
@TOC07_Linux基础-计划任务-备份脚本-变量定义和使用---一. 计划任务主要内容：周期性的计划任务crontab==/var/spool/cron/ 统一存放计划任务的目录====/var/log/cron日志文件====/etc/cron cron.daily/ cron.hourly/ cron.monthly/ cron.weekly/ crontab的顺风车==/etc/crontab==crontab -l====crontab -e==crontab ==-u cali== -ecr
vim调试，/{匹配字符}可以查找相应的位置，N往后查找下一个，shift+N往前。
你是否经常有在终端下通过一些实用程序进行工作的需求呢，比如：Git 等。但是由于这些终端程序默认并不支持 Socks 5 代理或 HTTP 代理
hup是hang up的缩写，是挂断、挂起的意思，而顾名思义，nohup就是不挂断、不挂起的意思。在 Unix 的早期版本中，每个终端都会通过modem和系统通讯。当用户 logout 时，modem就会挂断（hang up）。并且，当modem和系统断开连接时，就会给系统发送hangup信号来通知其关闭该终端打开的所有进程。 而nohup命令的用途就是让该终端提交的命令忽略该hangup信号，从而能够在系统中继续执行。
非常多的朋友在看我们公众号过往转录组，WES,等流程分享的时候发现很难理解我们的代码，其实就是缺乏shell脚本知识，那么这篇教程你就不容错过。 内容 使用多个命令 创建脚本文件 显示消息 使用变量 输入输出重定向 管道 数学运算 退出脚本 一个脚本例子 bed=exon_probe.hg38.gene.bedfor bam in /home/project/*.bamdofile=$(basename $bam )sample=${file%%.*}echo $sampleexport total_re
在这之前，我们先来总结一下常用的命令注入绕过方法，还是挺有意思的，会对 Linux 指令更加熟练（下面有些 Linux 命令只在 bash 下有效，在 zsh 里面可能会不行）
shell既是类Unix操作系统的命令解析器，用于解释执行用户输入的一连串命令，它类似于DOS下的command和后来Windows的cmd.exe。同时shell也是一种程序设计语言。作为命令解释型的脚本语言，它交互式解释和执行用户输入的命令或者自动地解释和执行预先设定好的一连串的命令；作为程序设计语言，它预定义了各种环境变量，保留了一些关键字以及一些特殊字符的含义，并提供了许多在高级语言中才具有的控制结构，包括循环和分支判断。
双引号""、单引号''、反引号 的区别
在shell脚本中，#表示注释，编写好的shell脚本可以通过“./脚本名”的方式执行脚本，但是需要文件本身具有x权限，还可以通过内部命令“source”或者“.”来加载文件中的源代码执行，“source”可简写为“sh”。
Shell简介 Shell 是一个 C 语言编写的脚本语言，它是用户与 Linux 的桥梁，用户输入命令交给 Shell 解释处理Shell 将相应的操作传递给内核（Kernel），内核把处理的结果输出显示到屏幕给用户. Shell分为两类 图形界面 Shell（GUI Shell） GUI为 Unix 或者类 Unix 操作系统构造一个功能完善、操作简单以及界面友好的桌面环境。主流桌面环境有 KDE，Gnome 等。 命令行界面 Shell（CLI Shell） CLI是在用户提示符下键入可
Linux为高级用户提供了一些最好的开源shell，这些用户总是希望为自己的武器库添加新的工具包。这反过来又使许多日常用户很难选择特定的shell。我们冒昧地为Linux用户列出了一些最好的免费开源shell。请仔细阅读本文，找出最适合您的Linux shell。
命令历史 history ！！ 表示执行上一条命令 ！n 表示执行历史中第n条命令 ！字符串 表示执行命令历史中首次出现该字符串的命令 设置别名：alias 取消别名：unalias 通配符 在bash下 * ：匹配0个或多个字符 ？：只匹配一个字符 输入重定向：< 输出重定向：> 追加重定向：>> 错误重定向: 2> 错误追加重定向：2>> 管道符：| 作业控制 job：查看任务 Ctrl+z:暂停任务 fg:恢复暂停的任务 bg:把暂停的任务丢到后台运行
了解Linux怎样处理输入和输出是非常重要的。一旦我们了解其原理以后，我们就可以正确熟练地使用脚本把内容输出到正确的位置。同样我们也可以更好地理解输入重定向和输出重定向。
诶诶欸？不是学Linux么？怎么要讲shell了？shell是啥？啥是shell？
shell：命令解释器，是Linux 系统的用户界面，提供了用户与内核进行交互操作的一种接口，它接收用户输入的命令并把它送入内核去执行。
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23. 产生一个随机数 代码如下: echo $RANDOM 24. 按照模式split 文件 代码如下: csplit server.log /PATTERN/ -n 2 -s {*} -f server_result -b "%02d.log" -z /PATTERN/ 用来匹配某一行，分割过程由此开始 {*} 根据匹配，重复执行分割 -s 静默模式 -n 分割后文件名后缀中，数字的个数 -f 分割后的文件名前缀 -b 指定后缀格式 25. 获取文件名或者扩展名 代码如下: var=ha
在这一篇中，我们介绍了一点关于输入输出重定向和管道的基础知识，本篇将继续重定向的话题。 在开始前，先说一说shell中的引用。
④！$：引用前一个命令的最后一个参数；与其相同的命令还有：按住[Esc]后松开按[.]
* 任意个任意字符 ? 任意一个字符 # 注释字符 \ 脱义字符 | 管道符 find /etc/ -type f -name “*conf” -exec cat {} >> 1.txt \; //在
共4个文件，服务端一个UpdateServer.conf配置文件和一个UpdateServer脚本，客户端一个UpdateClinet.conf配置文件和一个UpdateClient脚本。 配置文件里主要写一些路径变量，文件名变量，IP地址变量，涉及路径最好用绝对路径。配置文件用来给用户提供修改程序执行环境和相关输入信息。
字符范围： 指定字符串1或字符串2的内容时，只能使用单字符或字符串范围或列表。 [a-z] a-z内的字符组成的字符串。 [A-Z] A-Z内的字符组成的字符串。 [0-9] 数字串。 \octal 一个三位的八进制数，对应有效的ASCII字符。 [On] 表示字符O重复出现指定次数n。因此[O2]匹配OO的字符串。
对shell有一定了解的人都知道，管道和重定向是 Linux 中非常实用的 IPC 机制。在shell中，我们通常使用符合‘|’来表示管道，符号‘>’和‘<’表示重定向。那么管道和重定向的真实含义（定义）又是什么呢？
重定向是计算机技术中非常底层的概念和操作。它指的是将程序中涉及到的变量名与变量在计算机内存中的位置关联起来。当在代码中执行类似x=1;的语句时，编译器需要通过重定向信息找到变量x对应的内存位置，然后将数值1写入该内存，因此重定向既跟程序的加载链接有关，又与编译原理有关，因此对计算机体系结构不了解，或只关注上层应用开发，对底层技术理解不多的同学对它进行掌握就会有些困难。
相信大家平时都会有需要复制粘贴数据的时候，如果是打开文件进行复制粘贴，就不可避免的需要较多的鼠标与键盘的操作，就会比较繁琐。那么有没有可以省掉这些繁琐操作的复制粘贴的方法呢? 答案是肯定的，那就是重定
小编最近在研究Linux下的脚本编写，其中很多环节涉及到和多个命令组合使用，如：自动输入系统密码等；而在Linux下最常用的就是管道和重定向。
如果你在使用 Linux，你可能已经有了 Bash。如果没有，你可以在你的软件仓库里找到它。
想了解Linux编程，shell脚本是绕不开的关键知识点，原计划写一个整篇来分享shell的来龙去脉，但知识点过于繁杂，先分享一下学习shell的准备工作，数据流重定向、管道符、环境变量配置文件的加载，有助于知识更好的理解、再实际生产中的运用。
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