在Docker文件中，我使用wget下载镜像中的文件。但是当我在docker-compose文件中使用此图像时，容器不包含这些文件...&& cd /blast
浏览 2提问于2017-04-25得票数 15
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我运行这一行代码它无法删除该文件夹，我正在使用它的根电源。我可以检查一下我的Linux命令到底出了什么问题。root@S1ND45:/var/www/html/manga/cac
浏览 4提问于2015-08-29得票数 0
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$BINPATHRUN curl ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-bl
浏览 2提问于2015-12-06得票数 5
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: Linux; Mac:Darwin; Windows: Windows
blast_file = path.join(blast_path, 'blast.tgz')
浏览 9提问于2018-07-24得票数 1
BINPATH
RUN curl ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-bl
浏览 4提问于2016-01-09得票数 2
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找不到文件，但文件存在
、、、、
我在一个服务器上工作，在这个服务器上，用户应该能够对数据库运行蛋白质序列，并且它使用一个名为blastall的可执行文件。服务器生成一个可执行文件，然后使用批处理运行该文件。但是，它似乎没有运行。/usr/bin/env shphp -q /var/www/dbCAN/tools/blast.php -e -w /var/www/dbCAN/data&#x
浏览 3提问于2012-10-23得票数 1
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我正在尝试使用NCBIWWW爆炸核苷酸序列my_query = "TGCGTGCCGTGCAATGTGCGT"blast_result = open("my_blast.xml", "w")
blast_result.write(r
浏览 0提问于2016-11-15得票数 2
<span class="blast" aria-hidden="true" style="opacity: 1;">’</span>
<span class="blast" aria-hidden<span class="blast" aria-hidden="true" style="opacity: 1;">r<&#
浏览 0提问于2018-12-12得票数 0
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首先，我们需要打印形成XML hit_id、hit_len和hit_def的blast结果。前两件事很容易。但是hit.def和def是一样的。如何避免呢？# FUNCTIONS
#execute BLAST, vailabl
浏览 2提问于2014-10-18得票数 0
我正在尝试创建一个电子邮件爆炸机超过10万电子邮件一次使用Laravel框架。我的命令： public function handle() $blastId = $this->argument('blast');
activity()->performedOn($blast)->log('Blast is sending');
f
浏览 13提问于2021-09-20得票数 0
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这意味着，我的输入/输出文件将跨一些规则的临时批处理集进行扩展，然后再合并到一个输入文件中，供以后的规则使用。expand("final_output/{sample}.counts",sample=config["samples"]) ##this final output relates to blast]) input:&qu
浏览 29提问于2020-08-27得票数 2
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我使用Biopython的SeqIO将几个抄本名称存储为键，并将其序列存储为关联值。CTTCATTCTCGTTTAGCGGCTGCTCGTGGAAATTTCGAAAAAATCTGAAACTAG...TGC', SingleLetterAlphabet())}
现在，我想将字典中的序列信息解析为blastblastn -query " + transcript['var_F'] + ".txt" + " -subject " + transcript['var_B
浏览 6提问于2016-11-03得票数 5
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php if($this->template->params->get("blast2", 1) == 1) : ?>class="social_blast" id="social_blast2" t
浏览 3提问于2015-02-22得票数 1
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我有这样的模型结构： has_many :organization_blast_companies belongs_to :organization_blastorganization_blast = OrganizationBla
浏览 3提问于2016-03-01得票数 0
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我已经打开了一个带有blast结果的文件，并将命中结果以fasta格式打印到屏幕上。代码如下所示：blast_records= NCBIXML.parse(result_handle)
blast_record = blast_records.nex
浏览 3提问于2009-11-06得票数 3
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我让代码正常工作，但它使用了很多函数。我想知道我能不能用更少的钱。我尝试将倒计时放在一个for循环中，该循环显示i值，但它似乎不能正常工作。下面是我的代码：{ setTimeout ( "countdown3()", 1000 );function countdown3() document.getE
浏览 1提问于2012-04-05得票数 2
\",\" 947427\",\" 947432\"}"] 编辑： 控制器代码： def update redirect_toend params.require(:blast).permit(:subject, :to, :from_name:subject, value: <e
浏览 21提问于2020-09-11得票数 0
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我正在研究一组生物序列，其中涉及ncbi-blast的使用。在使用python regex处理输出文件时，我需要一些帮助。Sbjct 1Lambda K aα0.317 0.134 0.389 0.792 4.96使用的有效搜索空间
浏览 0提问于2018-03-21得票数 1
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global Blast_endFrame cmds.setParent, Blast_startFrame, Blast_endFrame ) )
def enableCostumFrames(Blast_startFrame, Blast_endFrame, *ar
浏览 0提问于2017-10-09得票数 0
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linux字段和逐列排序
、、、
现在，我是通过使用python脚本的输出并使用sort来实现这一点的。result:
import os
parser = argparse.ArgumentParser(description='
浏览 0提问于2017-08-24得票数 2
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