在经历了第一次做·RNA-seq的摸爬滚打之后,我大概对RNA-seq的流程和要使用的软件有了一些了解,并知道了它们的用法,于是便做了第二次的RNA-seq,然后想做一个总结笔记 1.原始数据下载软件Aspera Aspera用于下载sra原始数据 将Aspera connect安装在Linux上 代码如下
最近在从活动数据库进行异机克隆时碰到了ORA-17629,ORA-17627,ORA-12154的错误,起初以为是一个Bug呢。Oracle Bug着实太多了,已经成了习惯性思维了。汗!错误提示是无法连接到连接到远程数据库,连接字符串无法解析。咦,配置了从auxiliary DB到target DB的tnsnames,且都是连通的阿......
我们在编写网络程序时,通常需要连接其他服务端(如微服务之间的通信),这时就需要通过调用 connect 函数来连接服务端。但我们发现 connect 函数并没有提供超时的设置,而在 Linux 系统中,connect 的默认超时时间为75秒。所以,在连接不上服务端的情况下,我们需要等待75秒,这对我们不能接受的。
在 socket 是阻塞模式下 connect 函数会一直到有明确的结果才会返回(或连接成功或连接失败),如果服务器地址“较远”,连接速度比较慢,connect 函数在连接过程中可能会导致程序阻塞在 connect 函数处好一会儿(如两三秒之久),虽然这一般也不会对依赖于网络通信的程序造成什么影响,但在实际项目中,我们一般倾向使用所谓的异步的 connect 技术,或者叫非阻塞的 connect。这个流程一般有如下步骤:
Aspera是一项突破性传输协议,充分利用现有的 WAN 基础设施和通用硬件,传输速度比 FTP 和 HTTP 快达数百倍。
Ivanti Connect Secure 为远程和移动用户提供了一个无缝的、具有成本效益的 SSL VPN 解决方案,使他们能随时随地从任何可上网的设备访问企业资源。
我们通常用wget或curl下载文件,然而由于 NCBI 和 EBI 网站都在国外,有时候下载速度非常慢,如果文件特别大,就可能非常难受甚至是不可能完全的任务了,这时可用 aspera 进行高速下载。
笔者一直觉得如果能知道从应用到框架再到操作系统的每一处代码,是一件Exciting的事情。 今天笔者就来从Linux源码的角度看下Client端的Socket在进行Connect的时候到底做了哪些事情。由于篇幅原因,关于Server端的Accept源码讲解留给下一篇博客。 (基于Linux 3.10内核)
对于那些想要在Ubuntu中安装Notepad++文本编辑器的用户,尽管已经有一个名为Notepadqq的Linux替代品,但现在可以使用Wine运行的Notepad++ snap包。
下载方式一:FTP下载https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR347/SRR3474721/
记录一下最近在Debian 12 测试版(testing)及Kali Linux 2023.3遇到的KDE Connect 无使用问题,具体表现为KDE Connect 无法检测网络上的任何设备,无法工作,无法使用。
Aspera下载: http://downloads.asperasoft.com/connect2/。
paramiko是用python语言写的一个模块,遵循SSH2协议,支持以加密和认证的方式,进行远程服务器的连接。
无论你用任何语言或者是网络库,你都可以设置网络操作的超时时间,特别是connect,read,write的超时时间。
I’m getting the following error installing drupal 7:
一、用select实现的并发服务器,能达到的并发数,受两方面限制 1、一个进程能打开的最大文件描述符限制。这可以通过调整内核参数。可以通过ulimit -n来调整或者使用setrlimit函数设置,
一、结论 提出这个问题说明对网络编程的一些基础原理未搞明白,先说下结论: 一个 socket 是否设置为阻塞模式,只会影响到 connect/accept/send/recv 等四个 socket API 函数,不会影响到 select/poll/epoll_wait 函数,后三个函数的超时或者阻塞时间是由其函数自身参数控制的。 二、原理分析 下面详细的解释,为了方便解释,在这之前我们先明确几个基础概念: connfd:创建 socket,主动发起连接的一端(客户端),该端调用 connect 函数主动发起
笔者一直觉得如果能知道从应用到框架再到操作系统的每一处代码,是一件Exciting的事情。 今天笔者就来从Linux源码的角度看下Client端的Socket在进行Connect的时候到底做了哪些事情。
下面是两种使用paramiko连接到linux服务器的代码 方式一: ssh = paramiko.SSHClient() ssh.set_missing_host_key_policy(paramiko.AutoAddPolicy()) ssh.connect("某IP地址",22,"用户名", "口令") 上面的第二行代码的作用是允许连接不在know_hosts文件中的主机 方式二: t = paramiko.Transport((“主机”,”端口”)) t.connect(username = “用
start with:表示以什么为根节点,不加限制可以写1=1,要以id为123的节点为根节点,就写为start with id =123
MySQL是一种流行的数据库管理系统,而PHP是适用于Web开发的服务器端脚本语言; 与Apache或Nginx HTTP服务器一起,是LAMP ( Linux Apache MySQL / MariaDB PHP )或LEMP ( Linux Nginx MySQL / MariaDB PHP )的不同组件。
第1选择--Aspera Connect 如果aspera connect不能下载,推荐sratoolkit的prefetch功能。尽量不要用wget或curl下载,速度慢,且有时下载不完全
一组的同事找我说,有很多应用不能连接数据库,让我去帮忙看看,一开始以为是process 和session 数不构,去了查了一下,发现远没到设置的数,且主机未发现有性能问题,查看等待事件,全是军空闲类的,这下我就有点朦了,后来查看监听状态,执行lsnrctl status 后出来两行字之后卡在那儿了,没有反应,所以kill掉进程后重启监听,重启后,没有服务注册时正常,过1分种在查看监听状态,还是卡在那儿了,查看监听日志没什么收获,后来查看数据库alter日志,发现如下:
一个字“快”,真正的百兆宽带。下载NCBI原始文件SRA下行速度能够达到100M/s,一般SRA下载一个文件15-20分钟搞定。大大节省时间成本,对于云服务器使用来说,省时就是省钱。
这些年,接触了形形色色的项目,写了不少网络编程的代码,从windows到linux,跌进了不少坑,由于网络编程涉及很多细节和技巧,一直想写篇文章来总结下这方面的心得与经验,希望对来者有一点帮助,那就善莫大焉了。 本文涉及的平台包括windows和linux,下面开始啦。 一、非阻塞的的connect()函数如何编写 我们知道用connect()函数默认是阻塞的,直到三次握手建立之后,或者实在连不上超时返回,期间程序执行流一直阻塞在那里。那么如何利用connect()函数编写非阻塞的连接代码呢? 无论在win
这些年,接触了形形色色的项目,写了不少网络编程的代码,从windows到linux,跌进了不少坑,由于网络编程涉及很多细节和技巧,一直想写篇文章来总结下这方面的心得与经验,希望对来者有一点帮助,那就善莫大焉了。 本文涉及的平台包括windows和linux,下面开始啦。 一、非阻塞的connect()函数如何编写 我们知道用connect()函数默认是阻塞的,直到三次握手建立之后,或者实在连不上超时返回,期间程序执行流一直阻塞在那里。那么如何利用connect()函数编写非阻塞的连接代码呢? 无论在wind
PCRE(Perl Compatible Regular Expressions)是一个 Perl 库,包括 perl 兼容的正则表达式库。nginx rewrite 依赖于 PCRE 库,所以在安装 Tengine 前一定要先安装 PCRE。
msf作为一款强大的漏洞检测工具,如何生成适用于msf的payload以及如何利用是使用msf的关键,今天就主要记录一下常用的payload以及如何使用。生成payload使用的工具是MSFVenom,下面看看他的帮助信息。
随着 Kubernetes 的普及,越来越多的应用被容器化,并部署到 Kubernetes 上。随之而来的问题是当容器中发生错误时,对错误的定位和调试也变得很复杂。当一个工具给你带来便利时,它也可能给你带来另一些麻烦。
在之前的编译nginx的基础上,我们对nginx二进制增加新的模块ngx_http_proxy_connect_module[1]
1.最近手头有个脚本用于远程批量传输文件的。由于系统本身环境兼容不是很好,所以开始升级配置环境。
但是到了19c都是CDB/PDB的时候,因为连接PDB必须用TNS服务名,突然感觉又非常好用了。尤其对于一些升级为了维护兼容性的情况。
前面我布置了一系列学徒作业, 终于开始陆陆续续收到答案啦!下面的教程来自于7月的数据挖掘学员,对应的题目是:仅提供bam文件的RNA-seq项目重新分析
可以看到,在当前用户vip18的家目录~下,有一个文件叫readme.txt,但是,当前目录下面并没有ls命令所对应的可执行文件。真正的ls命令的可执行文件,其实是在别处,我们用which ls可以查看到ls所在的位置:
# Windows 检查端口 telnet ip port # Linux telnet 检查端口 telnet ip port ## 若报命令不存在时安装 sudo yum install telnet ## 成功 Trying 161.63.104.193... Connected to 161.63.104.193. Escape character is '^]'. ## 端口通但服务没启动 Trying 29.34.5.11... telnet: connect to address 29.34
版本迭代,网上很多解决方法都失效了,在此记录一下。 版本:PHP7.4+MySQL8.0
网络编程中超时时间是一个重要但又容易被忽略的问题,对其的设置需要仔细斟酌。在经历了数次物理机宕机之后,笔者详细的考察了在网络编程(tcp)中的各种超时设置,于是就有了本篇博文。本文大部分讨论的是socket设置为block的情况,即setNonblock(false),仅在最后提及了nonblock socket(本文基于linux 2.6.32-431内核)。
去年 techday 上有幸邀请到了 Go 夜读的大佬杨文,他跟我们分享了开源的主题,深受鼓舞。正好前段时间测试 Kotlin 的官方库 ktor 发现了一个很冷门的问题,于是提了一个 PR。经过了一个月漫长的等待,终于有人 review 并 merge 到 master 分支了,估计下个 release 就可以看到了。
基于 TCP 的网络编程开发分为服务器端和客户端两部分,常见的核心步骤和流程如下:
Android 10以及更低的版本,必须通过 USB 连接后,才可实现同一 WLAN 下无线调试。
Elasticsearch是一个基于Lucene的搜索服务器。它提供了一个分布式多用户能力的全文搜索引擎,基于RESTful web接口。Elasticsearch是用Java开发的,并作为Apache许可条款下的开放源码发布,是当前流行的企业级搜索引擎。它可以快速地储存、搜索和分析海量数据。维基百科、Stack Overflow、Github也都采用它做的搜索。 更多Elasticsearch的相关知识,请阅读官网《Elasticsearch: 权威指南》。
Apache Kafka 是一种分布式数据存储,用于实时处理流数据,它由 Apache Software Foundation 开发,使用 Java 和 Scala 编写,Apache Kafka 用于构建实时流式数据管道和适应数据流的应用程序,特别适用于企业级应用程序和关键任务应用程序,它是最受欢迎的数据流平台之一,被数千家公司用于高性能数据管道、流分析和数据集成。
The number of connections that were aborted because the client died without closing the connection properly.
Linux主机如何远程登录?建议使用ssh工具。使用Ssh连接登录的时候,需要先下载ssh登录客户端,下载安装完成之后可以进行Linux云主远程登录。
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Linux下的Socket通信是一种基于文件的IPC通信,也可以是基于其他设备的IPC通信。它可以在本机内不同进程间实现通信,也可以在实现不同主机之间的通信。
载荷这个东西比较多,这个软件就是根据对应的载荷payload生成对应平台下的后门,所以只有选对payload,再填写正确自己的IP,PORT就可以生成对应语言,对应平台的后门了!!!
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