今天又有小伙伴微信问我perl模块安装的问题,因为ENSEMBL发布的大多数数据库以及软件都是基于perl的,尤其是分量很重的VEP,所以即使你再如何如何的讨厌perl,也不得不与之打交道。 这种细节问题问我,我当然无法直接给出答案咯。毕竟,我的知识积累都不是靠死记硬背的。所以需要取回过头查看一下我的博客,才意识到,我竟然已经写了7篇教程,关于perl的模块。目录如下: ubuntu服务器解决方案第七讲-perl安装模块 Perl用cpan在linux上面安装模块 Perl及R及python模块碎碎念 pe
linux的发行版非常多,其实本质上差别不大,哪怕是mac的OS应该是也是同样的管理操作模式。以下针对于ubuntu适用,当然ubuntu本身也有版本的区别,目前是16,我下面的操作是在12上进行的。 java1.7.0_03的安装 1、JDK官网上 http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html选择 2、将打开终端,建立目录: Sudo mkdir /usr/lib/java 3、将下载的jdk-7u3-linux-i5
B. 当IIS中的ASP仅用于后台,同时使用人数较少.前台页面主要以HTML静态页面展示,ASP用来做的事情较少,本身对系统的负担很轻
电影里的黑客们聊天不想我们生活中的一样,用QQ、微信的客户端,都是通过命令行来进行聊天交流的,大概是为了提升逼格吧。
Perl 是一种功能丰富的计算机程序语言,运行在超过 100 种计算机平台上,适用广泛,从大型机到便携设备,从快速原型创建到大规模可扩展开发。在生物信息分析领域,Perl 主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析软件开发,系统管理和 pipeline 搭建等工作。这里对 Linux(主要是 CentOS)、Windows 下 Perl 的安装做一个备忘。
下载: http://mirrors.kernel.org/gnu/m4/m4-1.4.13.tar.gz 拷贝到centos系统上,并解压:
circos对于小伙伴们应该都不会陌生,现在应用场景非常的广泛。小编在工作的时候也为了做出惊艳的circos曾大伤脑筋。为了能够让小伙伴们不再做重复性的基础工作,小编系统的整理分享perlcircos 的安装、配置和使用。perl 版本的circos 是Martin Krzywinski在2009年发表在Genome Research 上的一篇题为“Circos: An information aesthetic for comparative genomics”开发的软件。从发表到今天(2019/05/03)引用次数竟高达4296次。很多作图都是非常好看,甚至让人惊艳的。下边小编从官网转过来一些,请大家鉴赏。
Perl5是一种全功能的编程语言。它用于所有类型的生产项目,包括世界各地的商业业务系统。Perlbrew是Perl5的安装和版本切换工具,您可以安装,删除,并在之间切换Perl版本。
图 1. Webmin 配置屏幕 用户也可以使用 Webmin有一个图标用来配置可选的 Usermin 软件包,这个软件包提供了一个基于 Web 的工具,用户可以借助它完成修改密码、管理系统邮件等任务。使用 Usermin 不能访问系统配置文件。Usermin 和 Webmin 都将是免费的产品。 System 窗体可以进行操作系统的总体配置。在这里,您可以配置文件系统、用户、组和系统通常的引导行为。您可以控制系统中运行的服务,通过选择 Bootup 和 Shutdown 图标来决定它们是否自动启动。不过,对那些服务的具体配置是由 Servers 窗体完成的。尤其要注意“Software Package”工具,它可以方便地查看您系统中已经安装的软件包,以及到发行版本升级库和 rpmfind.net 的接口,rpmfind.net 是 Internet 上的一个公用的 RPM 库。 Servers 窗体可以对您可能会在系统中运行的各个服务进行配置。BIND 和 DHCP 工具非常便捷。同时 Samba 工具也很好用,可以为 Windows 和其他客户机配置文件和打印机的共享。SMTP 服务器 Sendmail 以其极复杂的配置文件而出名。Webmin Sendmail 工具同样为您解决了这一问题。
这篇文章中,将会介绍如何利用 Metasploitable 2 上 Unreal IRCd service 存在的漏洞;学习如何对网络服务进行枚举,及如何定义和检索关键信息;分析和使用 msfvenom 来生成 payload 。 为了获取更多关于 Unreal IRCd 的信息,我们还将使用 hexchat IRC 客户端,连接进入到 IRC 频道。 例如:有时我们使用 Nmap 无法获取到具体的版本号时,我们仍可以继续通过当前处理的信息,进行近一步的漏洞评估和发现。在这篇文章中,我们同样将通过,手动
利用转录组数据比对到细胞器参考基因组得到vcf文件,比对工具使用GSNAP或者BWA,检测变异使用GATK或者SAMtools.
Bugzilla 是一个基于 Web 的,开源的,用来记录跟踪缺陷数据库的 bug 跟踪软件。它可以管理软件开发中缺陷的提交(new)、修复(resolve)和关闭(close)等整个生命周期,它允许个人和团队有效地记录下他们产品的一些突出问题。
为了更加方便、快捷的实现某些功能,Perl拥有很多其他的控制结构,这些结构也许不是必需的,但可以使程序更加简洁和具有逻辑性。
关于Th3inspector Th3inspector是一款功能强大的网络侦查信息收集工具,该工具整合了多种信息收集组件,可以帮助广大研究人员在网络侦查活动中完成各种信息收集任务。 值得一提的是,该工具支持在Linux和Windows,甚至是Android操作系统平台上运行。 工具安装 Linux安装 广大研究人员可以使用下列命令将该项目源码克隆至本地: git clone https://github.com/Moham3dRiahi/Th3inspector.git(向右滑动,查看更多)
在实际的渗透测试中,有的时候需要自己创建一个http服务,来辅助我们的渗透测试,往往我们会遇到各种各样不同的环境,所以使用简单的方式在不同环境下创建一个HTTP服务还是非常有用的。下面我们就简单介绍下,在不同环境下使用一句话启动HTTP服务的各种姿势。
这篇文章主要介绍了Linux 安装nginx服务器详细介绍的相关资料,需要的朋友可以参考下
Qt 5.9 之后的安装包与之前相比,不再区分 VS 版本和 MinGW 版本,而是全都整合到了一个安装包中。因此,与之前的安装包相比,体积也是大了不少,以前是 1G 多,现在是 2G 多。
周六群里大佬发了一篇文章,是关于TCP keepalive相关的,其中有一段是关于孤儿连接的,这里引用下
其中网页工具和云平台都不是针对专门的生物信息学工程师设计的,因为并不需要使用者会编程语言,所以使用起来非常简单。下面来一一介绍一下它们:
支持FUSE,相对比较轻量级,对master服务器有单点依赖,用perl编写,性能相对较差,国内用的人比较多,易用,稳定,对小文件很高效。 + 支持文件元信息 + mfsmount 很好用 + 编译依赖少,文档全,默认配置很好 + mfshdd.cfg 加 * 的条目会被转移到其它 chunk server,以便此 chunk server 安全退出 + 不要求 chunk server 使用的文件系统格式以及容量一致 + 开发很活跃 + 可以以非 root 用户身份运行 + 可以在线扩容 + 支持回收站 + 支持快照 - master server 存在单点故障 - master server 很耗内存 测试性能还不错。吞吐量在15MB/秒以上
LAMP是 linux Apache MySQL PHP的简写,即把Apache MySQL PHP 安装在linux系统上,组成一个环境来运行PHP网站。这里的Apache是httpd服务。这些可以安装在一个机器上,也可以安装在多台机器上,但是httpd和PHP安装在一台机器上(php作为httpd的一个模块存在的。 他们两者必须要在一起,才能实现效果)
人活在世上有两大义务,一是好好做人,无愧于人生一世。这一条我还差的很远。另外一条是不能惯着别人的臭毛病,这一条我差的更远。
Nginx 是 C语言 开发,建议在 Linux 上运行,当然,也可以安装 Windows 版本,本篇则使用 CentOS 7 作为安装环境。
nginx是一款非常好用的反向代理服务器,web服务器,很多人都在使用nginx作为网络服务器,要知其然还要知所以然,所以源码安装是一切实践的基础,让我们动手搞起来。
1、特征:能理解分区的概念,知道安装linux系统和常见的数据库、桌面管理器、应用软件等,能做一些基本的配置(如网络、打印机、调制解调器等),参照手边资料依葫画瓢式的安装和配置常见服务(如NFS、HTTP、FTP、TELNET、 SSH、LDAP、NIS、邮件服务、SAMBA、打印服务等),能解决一些基本的简单问题,熟悉一些基本的常见命令,能理解系统的启动过程等等。
Nginx (“engine x”) 是一个高性能的 HTTP和反向代理服务器,也是一个 IMAP/POP3/SMTP 服务器。 正向代理:
LAMP包含了四种东西,就是Linux+Apache(httpd)+MySQL+PHP的一个简写,Linux我们都很熟悉,它通常作为服务器操作系统,Apache则是一个提供Web服务的一个软件,它真正的名称是httpd。MySQL是数据库软件,存储的是一些数据、字符串、用户信息。PHP是一个脚本语言,和shell类似但是比shell复杂,如果接触过C语言的就知道PHP是用C语言开发的,它通常用来做网站,是前几年比较火热的一门语言,但是现在的趋势是向移动端互联网发展,在PC上访问网站的用户少于在手机上访问网站的用户,所以现在PHP的需求也没有以前高了。
3.zlib 库提供了很多种压缩和解压缩的方式, nginx 使用 zlib 对 http 包的内容进行 gzip ,所以需要在 Centos 上安装 zlib 库。
11.1 LAMP架构介绍 LAMP架构介绍 LAMP架构包含了 Linux+Apache(httpd)+MySQL+PHP ,简称LAMP Linux是操作系统,比如centos,Ubuntu都是linux操作系统 Apache提供web服务软件,其真正名字为 httpd,习惯称之为Apache MySQL存储软件,存的是数据、字符串,不是图片 PHP是脚本语言,和shell相似,但比shell复杂,PHP是由 C语言 开发的,通常用于做网站(主要); 目前由于移动网络的影响,PHP现在不怎么受欢迎
Nginx是C语言开发,建议在Linux上运行,当然,也可以安装Windows版本,本篇则使用Linux CentOS 7作为安装环境。
1. Nginx简介 Nginx (发音为[engine x])专为性能优化而开发,其最知名的优点是它的稳定性和低系统资源消耗,以及对并发连接的高处理能力(单台物理服务器可支持30000~50000个并发连接), 是一个高性能的 HTTP 和反向代理服务器,也是一个IMAP/POP3/SMTP 代理服。
MySQL目录概要 MySQL的几个常用安装包:rpm、源码、二进制免编译 cd /usr/local/src //切换到下载源码包的目录 wget http://mirrors.sohu.com/mysql/MySQL-5.6/mysql-5.6.35-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz tar zxvf mysql-5.6.35-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz //解压 mv mysql-5.6.35-linux-glibc2.
Web工作者构建网站就需要用到Nginx Web服务器,可是还有小伙伴不会在Linux上安装Nginx,毕竟我们开发的项目都是要在服务器上运行的,今天就来讲讲如何在CentOS7环境使用源码进行安装Nginx。
Nginx是使用C语言开发的,建议部署在Linux操作系统上,当然也可以安装在Windows操作系统安装Windows版本的Nginx,本文演示在CentOS操作系统上安装源码安装Nginx。
Red Hat Enterprise Linux 8 Beta 现已发布!它的构建考虑了生产稳定性和开发灵活性。关于 RHEL 8 Beta 还有很多话要说,但这里想把重点放在公司宣布的几点上,该公告强调 Red Hat Enterprise Linux 8 Beta 将作为开发者平台。
小编欢乐豆又放出一个珍藏多年的脚本,2749 行的长度,长到已经难以用 GPT 解读啦,不过用起来还是很方便的!这个 perl 脚本用于将 GenBank 格式的文件转换为 GFF3 格式。
随着基因组和宏基因组的测序成本逐渐降低,直接获取环境中微生物的基因组变得越来越容易,大大促进了科学家们对微生物尤其是无法纯培养微生物的了解。当我们通过基因组测序或者宏基因组测序binning获得一个新的基因组时,我们如何判断其处于哪一个系统发育分支?也许搜寻其中的16S序列并与数据库进行比对是个可行的方法,然而宏基因组binning获得的基因组(bins)常常丢失16S序列。本文将介绍两个基于全基因组的系统发育分类工具PhyloPhlAn与GTDB-Tk。
OTRS是一个开源的票证请求系统。它为用户,客户,IT人员,IT服务和任何外部组织提供单点联系。该程序是用Perl编写的,支持各种数据库(MySQL,PostgreSQL等),并且可以与LDAP目录集成。
Qt Creator是一个IDE,就是一个平台,一个开发环境,类似的比如说VS,也可以进行Qt开发,当然VS中的Qt是作为一个插件插入VS平台的。
Qt5.12下载网址: http://download.qt.io/archive/qt/5.12/5.12.2/
卸载旧的epel仓库,重新安装epel仓库,删除冲突软件包,重装rpmconf并执行rpmconf,在交互界面一直输入Y和回车即可
8复制解压目录下面的mysql.server文件到/etc/init.d/mysqld
为了其它相关软件的顺利运行,我们根据教程来设置默认的安装目录及变量环境:Ensembl's VEP , If you don't have VEP installed, then follow this gist.
LAMP架构介绍: MySQL、MariaDB介绍: Community 社区版本 =开源版本 Enterprise 企业版 = 收费版本 GA(Generally Available)
1.安装GCC 安装 nginx 需要先将官网下载的源码进行编译,编译依赖 gcc 环境,如果没有 gcc 环境,则需要安装
CentOS 8操作附带一个定制内核,以确保其完整性和与支持的硬件的兼容性。CentOS 8 Linux中附带的内核版本为4.18。Linux内核包括基本内核本身和许多内核模块。
R:为什么选择我?而不是其他高级语言,比如Python,Java,C,C++....那么多编程语言?
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