文章的故事是从这句话开始的：prognostic gene signature by generating the differentially expressed mRNAs with P-value less than 0.001 and fold-change values of −2 to 2 between tumor and non-tumor samples in GSE15471, GSE28735, and GSE62452 datasets.
病毒能够侵染细菌，并且巧妙的利用细菌的资源为它所用，可以说是相当的霸道了！简短来说就是病毒就像窃贼一样，能够将自己的基因鸟么悄的整合到细菌基因组上，然后在细菌内大吃二喝疯狂占有资源-利用细菌的元件为自己的基因复制服务。然而细菌也不是逆来顺受的，在其不断的进化过程中建立起一套防盗系统，能够不动声色的把病毒基因从自己的基因组中清除。
Cacti进行服务器监控时，5分钟的高精度数据默认只保留2天的数据记录，也就是说，两天以外的流量，我们就看不到5分钟的数据了。这对于我们现有的业务需求有所冲突，所以找了一些修改RRD保存周期的方法，可以对现有的RRD文件的保存周期进行修改。对于新建的rrd，可以通过 Data Source –> RRAs 中修改对应的 row，这样新建的数据，就默认使用新值。
刘小乐教授的CRISPR-Screen的分析工具除了MAGeCK之外，还有MAGeCK-VISPR 其实从名称看，我一度以为VISPR就只更加侧重于可视化，但当我实操的时候我发现其可以自动生成snakemake文件，实现分析的流程化。
应客户需求并且与王同事商讨，在BJD环境缺少一台备用Cacti监控服务器，需要将原Cacti监控服务器的数据迁移到新的监控主机上去，实现监控数据同步。
虽然它在今年7月就已经被提出，但当时在GitHub上除了“一纸”文档之外就没有任何东西。
本文是对开源监控工具Ganglia使用的RRD数据库的一个简单介绍，此外还有一些有关RRDTool的基本操作。
小洁老师在去除批次效应的探索文件里给出了两种方法，一个是用R包limma中的函数removeBatchEffect(），另一个是R包SVA中的函数ComBat(）。
缺省参数是声明或定义函数时为函数的参数指定一个缺省值。在调用该函数时，如果没有指定实参则采用该形参的缺省值，否则使用指定的实参。如下：
rrdtool（round robin database）工具为环状数据库的存储格式，round robin是一种处理定量数据以及当前元素指针的技术。rrdtool主要用来跟踪对象的变化情况，生成这些变化的走势图，比如业务的访问流量、系统性能、磁盘利用率等趋势图，很多流行监控平台都使用到rrdtool，比较有名的为Cacti、Ganglia、Monitorix等。更多rrdtool介绍见官网http://oss.oetiker.ch/rrdtool/。rrdtool是一个复杂的工具，涉及较多参数概念，本节主要通过Python的rrdtool模块对rrdtool的几个常用方法进行封装，包括create、fetch、graph、info、update等方法，本节对rrdtool的基本知识不展开说明，重点放在Python rrdtool模块的常用方法使用介绍上。
所需安装包:ImageMagick(转换图片格式工具),graphviz(绘制图形工具)
Cacti 默认的数据采集周期是5分钟一次，这对于监控业务繁忙的系统来说似乎过于漫长了，一些突发状况很难在第一时间发现，所以我们需要缩短这个周期。
那么要怎么根据手上的三组数据来获得一个相对可靠的排名来进一步确定要研究的对象呢？排名整合就可以帮助处理这种问题。
引用，是C++中重要的概念，它贯穿着C++的学习。不好好理解引用，接下来的路会不太好走哦！ 不过别担心，看完这一篇问题就不大了。
话说孔乙己时常混迹于磁共振基础班，处理功能数据算是得心应手了。虽然时常拖欠学费，但不出几月，定然还上，从粉板上拭去了孔乙己的名字。因此，DTI班第一天，当他悄悄溜进来的时候，掌柜并未在意。 彼时，寿镜
本文主要讲解linux怎么复制文件到其他文件夹。 在Linux和Unix系统上工作时，复制文件和目录是您每天要执行的最常见任务之一。 cp是一个命令行实用程序，用于复制Unix和Linux系统上的文件和目录。在本文中，我们将解释如何使用cp命令。
CISA发布的勒索软件就绪评估工具确实存在不足，但安全专业人员可以在此基础上进行构建。 在我们经济和日常生活的每个角落，几乎所有类别的网络安全都遭受了破坏。根据Sophos发布的一项调查数据显示，2020年缓解攻击的平均成本高达185万美元。越来越多的网络安全专业人士认为，联邦政府和当地执法部门在监管和保护我们的环境免受网络安全威胁影响方面发挥着重要作用。 在最近一次向公众展示价值的尝试中，美国联邦政府通过网络安全和基础设施安全局（CISA）提供了一款新的“评估”工具。该勒索软件就绪评估（RRA）工具是网络
本文介绍Linux系统中删除文件夹的命令，包括：rmdir 、 rm 。 Linux系统下删除文件夹是一个非常高频的需求，有很多方法可以删除文件夹，比如使用图形界面，或者通过终端删除。本文将介绍在 Linux 命令行下使用命令删除文件夹。
有些爱学习的用户会去操弄linux软件程序，在操作linux的过程中，有时候要删除一个文件夹，往往会提示次此文件非空，没法删除，这对于刚接触的用户来说无疑是一个巨大的困难，为此，小编这就来跟大家分享linux删除文件夹的操作方案。
当程序运行时，变量是保存数据的好方法，但变量、序列以及对象中存储的数据是暂时的，程序结束后就会丢失，如果希望程序结束后数据仍然保持，就需要将数据保存到文件中。Python提供了内置的文件对象，以及对文件、目录进行操作的内置模块，通过这些技术可以很方便地将数据保存到文件（如文本文件等）中。
近日，美国网络安全与基础设施安全局（CISA）发布了一款勒索软件就绪评估（RRA）工具，这是一种新型勒索软件自我评估安全审计工具，是该机构网络安全评估工具（CSET）的新模块。 企业组织可以使用RRA来确定其信息技术（IT）、操作技术（OT）或工业控制系统（ICS）资产遭受勒索软件攻击的程度。 CISA在该工具的维基页面上写道， “勒索软件就绪评估（RRA）将帮助您了解与不断发展的勒索软件威胁相关的网络安全态势。此外，它还提供了一个清晰的改进路径，并包含了一个由基础、中级和高级类别组成的不断演进的问题，旨
虚拟机无桌面的Linux 与 物理机Windows 文件互传有很多种方法，现在先说一种通过共享文件夹的形式，其他方法后续再补充
上一个章节我们已经学会了连接服务器。接下来我们可以试着学习一些基础的命令，以为你 Linux 完全是用键盘控制的。日常会用到的命令其实也不多，大都是用着用着就学会了。虽然都是 Linux 系统，但是基于 Linux 开发的系统不止一种（CentOS、 Ubuntu 、 Debian ），而且命令也不完全一样。我们以下的命令都是以 CentOs7 系统为基础。不要跳着看，上下文有关联的。所有命令都是英文缩写，我会说明每个命令的全拼和翻译。
2、进入该文件夹，一次性创建文件夹/tmpdir1/tmpdir2/tmpdir3/tmpdir4/tmpdir5
随便找一个文件夹(我这里使用的是桌面的GitTest文件夹)，右键点击Git Bash （启动的是Linux输入框）
因为 Linux中一切皆文件，所以在了解了 Linux基础和会使用一些入门级命令之后，接下来的重点便是 Linux文件管理的学习，就像 Java中一切皆对象一样，面向对象是 Java基础的核心和重点。该部分内容学习的重要性就像面向对象在 Java中重要性一样。这次的内容如下。
RRD 数据库简介及操作 最近公司在部署了一套小米开源的监控平台 — open-falcon，有机会认识了 RRD(更多被称作 RRDTool)。好久没 blog 了，今天跟大家分享一下这个数据库。
大家好，我是胖邰。今天是挑战的第11天，真没想到自己能坚持过半，先表扬一下自己。这次文章主要介绍使用chmod的用法。来吧，让我们一起了解下。
在用Linux的时分，有时分要删除一个文件夹，常常会提示次此文件非空，没法删除，这个时候，必需运用rm -rf命令。关于一些小白用户常常在运用Linux命令，会十分当心，以免搞出一些事情，下面小编将教细致教大家如何运用linux命令删除文件夹，需求的请珍藏。
Linux、CentOS操作系统下如何删除和重命名文件夹呢？办法如下： 一、Linux、CentOS下重命名文件和文件夹 mv：move 用移动文件命令就可以了，因为linux系统没有专门的重命名命令。 基本格式： 移动文件：mv 文件名 移动目的地文件名 重命名文件：mv 文件名 修改后的文件名 示例：mv oldfilename newfilename （oldfilename为旧文件名，newfilename为新文件名） 二、Linux、CentOS下删除文件和文件夹 通常情况下，删除文件用：rm 文件名。删除文件夹用：rmdir 文件夹名。 但是rmdir不能删除非空的文件夹，那如何删除非空文件夹呢：命令：rm -rf 非空文件夹名； -r 就是向下递归，不管有多少级目录，一并删除。 -f 就是直接强行删除，不作任何提示的意思。 1、删除文件夹命令 rm -rf /var/log/httpd/access 将会删除/var/log/httpd/access目录以及其下所有文件、文件夹 2、删除文件命令 rm -f /var/log/httpd/access.log 将会强制删除/var/log/httpd/access.log这个文件 建议使用前做好备份，好像此命令是不会放到回收站的，删了就再也见不着下面的文件了。
在window中，系统会按照path的设定，去每个PATH定义的目录下搜索可执行文件
参考资料 https://www.bilibili.com/video/av15976434/#page=5 Linux工具快速教程 https://www.cnblogs.com/zengjs/p/3169473.html 文件压缩与解压 linux 查看目录下文件个数 基本指令 ls 统计某文件夹下文件的个数 ls -l |grep "^-"|wc -l 统计某文件夹下目录的个数 ls -l |grep "^ｄ"|wc -l 统计文件夹下文件的个数，包括子文件夹里的 ls -lR|grep "
RRA（Robust Rank Aggregation）是一种对排名进行整合，获得一个综合性排名列表的算法。这个方法最早实在2012年发表在Bioinformatics杂志上。
在linux中删除文件与文件夹我们可以直接使用rm就可以删除了，彻底删除文件或文件夹我们可以使用shred命令来完成，接下来是小编为大家收集的Linux下删除文件命令，希望能帮到大家。
学习这些概念和工具可能看起来很头疼。您希望编写代码，而不是四处摸索配置设置或理解晦涩的控制台命令。但是从长远来看，这些技巧会节省你的时间。忽略错误消息或随意更改配置设置让系统足能够工作，但这也可能会隐藏问题，但不会修复它们。现在花点时间了解这些问题，可以防止它们再次发生。
主机服务器常见的有Linux主机服务器和Windows主机服务器，不同的主机类型，目录结构和功能也不一样。本文图文对比分析Linux主机和Windows主机的目录，让新手知道文件上传到那个文件夹。
Linux 系统大家一定不陌生，学习工作中肯定会和 Linux 打交道。不过谈及 Linux，给人的第一印象可能就是黑乎乎的命令行，乱七八糟的文件夹，甚至安装软件都不知道是怎么安装上去的。
本专栏由小雨ttt创建，致力于分享学习Linux基础知识的过程。本专栏不是机械地介绍Linux指令集，而是包含了作者亲自实践的操作过程，站在一个初学者的角度理解Linux基础知识。
就像我们平时在可视化界面操作一样，我们学会了怎么在文件夹直接切换跳转，接下来我们学习文件、文件夹的相关操作。这里我先抛出一个概念，就是在 Linux 中一切皆为文件（这个不懂没关系）。在 Linux 中目录只是一个特殊的文件，文件后缀有和没有是一样的。因为 Linux 并不识别后缀，只是便于用户区分。但是在 win 中我们是需要识别文件后缀的。
NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step)）、批次效应处理等内容。
# os模块 """ 1、用于操作系统的模块 """ # 引入模块 import os # 打印当前文件路径 print(os.getcwd()) # 切换路径 os.chdir('c:') print(os.getcwd()) os.chdir(r'F:\python笔记\6、模块\3、os模块') # 之前切换到了C盘，先切换回来 # 返回当前路径，相对路径 print(os.curdir) # 返回上层路径,相对路径 print(os.pardir) # 创建文件夹 # 不能递归创
详情请参考 资料（环境） 中《01_开启电脑虚拟化》，《02_安装虚拟机软件》word文档!
1.windows的网上邻居，是通过smb协议来共享信息的，如果需要给访问linux上的共享目录被windows访问到，需要linux有smb协议
在Linux下访问Windows共享文件夹，以下操作以Ubuntu为例，大家可以参考。我在Ubuntu 14.04和16.04都试过了。
含义：列出指定路径下的所有文件/文件夹的名称，以列表的形式并且在显示文档大小的时候以可读性较高的形式显示
在使用 dotnet publish -c release 在 Linux 服务器发布或使用 -r linux-x64 发布看到下面代码
1.df命令 # df -ha 显示所有文件和分区的使用 # df -h /dev/sda1 显示sda1磁盘使用率 # df -T 显示文件系统名称属于每个分区。区的格式类型（比方ext3） 注：h參数表示转换为M。G等人们经常使用的磁盘空间单位显示 2.du命令 # du -h src 显示src文件夹中各个文件（或者文件）所占用的磁盘空间 # du -hs /usr 显示usr文件夹中全部文件的总大小 # du -h test.c 显示test.c文件所占用的磁盘空间 3.dd命令 dd 是 Linux/UNIX 下的一个很实用的命令，作用是用指定大小的块拷贝一个文件，并在拷贝的同一时候进行指定的转换。 # dd if=/dev/hdb | gzip > /root/image.gz 备份/dev/hdb全盘数据。并利用gzip工具进行压缩。保存到指定路径 注：“|”表示管道命令，是指“|”的左边执行结果是其右边的输入条件或者范围。如：history | grep date指从history这条命令执行的结果中显示包括有“date”的命令 # gzip -dc /root/image.gz | dd of=/dev/hdb 将压缩的备份文件恢复到指定盘 # dd if=/dev/fd0 of=disk.img bs=4M 备份软盘。读和写的块大小为4M 4.# uname -a 查看Ubuntu的版本号 5.cat命令 # cat -n test.c 显示整个test.c的内容，并对内容按行编号 6.lsmod命令 # lsmod 显示全部内核载入的模块 # lsmod | grep mptspi 显示内核载入的全部包括mtpspi的模块 7.# lsusb 查看USB设备 8.# cat /proc/cpuinfo 查看cpu的状态 9.# lshw 查看硬件信息 10.# fdisk -l 查看磁盘的信息 # fdisk /dev/sda 对磁盘sda（注意不是sda1，sda1是sda的一个分区）进行操作，包含新建分区。删除分区等，后面的操作按提示选项进行。 11.# free -m 查看当前内存使用情况 12.# ps -A 查看当前系统有哪些进程 13.# kill 进程号 中止一个进程 14.# kill -9 进程号 强制中止一个进程。kill 进程号不成功时能够使用 15.# top 查看当前进程的实时状况 # top -p 786 显示进程号为786的进程的实时执行状况 16.ifconfig命令 # ifconfig 显示网卡相关的信息 # ifconfig eth0 up 打开eth0网卡 # ifconfig eth0 down 关闭eth0网卡 # infonfig eth0 192.168.1.1 设置eth0的IP地址为192.168.1.1 17.启动停止服务命令 # /etc/init.d/服务名 restart/stop/start 重新启动/停止/启动一个服务 18.# whereis 文件名称 高速查找一个文件 19.# find 文件夹 -name 文件名称 在文件夹中查找某个文件名称的文件 find -name ‘*fb*’ 在当前文件夹下查找文件名称中包括”fb”字样的文件 find /usr -name ‘*fb*’ 在/usr文件夹下查找文件名称中包括”fb”字样的文件 20.# tail -n 6 文件名称 假设值的前面有 +（加号）。从文件开头指定的单元数開始将文件写到标准输出。假设值的前面有 -（减号）。则从文件末尾指定的单元数開始将文件写到标准输出。假设值前面没有 +（加号）或 -（减号）。那么从文件末尾指定的单元号開始读取文件。 # tail -n 6 文件名称 == # tail -n -6 文件名称 21.grep命令 # grep ‘test’ d* 显示全部以d开头的文件里包括test的行。
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