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    生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)

    在生信分析人员如何系统入门R(2019更新版) 里面,我提到过Linux基本上几十年都没有怎么变动过基础知识的,哪怕你现在搜索到十几年前的Linux教学视频,也不会觉得尴尬。而且Linux属于IT工程师必备技能,IT的发展程度远超于我们,再加上各种马哥鸟叔,还有黑马训练营公开30天完整教学视频,按照道理我是没有必要在他们IT专业人士面前班门弄虎的, 毕竟他们随便拿几个偏门知识点就可以问倒我了!不过我们生信技能树的特色是主打生物信息学方向技能建设,而它作为一个典型的教交叉学科,想在此领域成为一个专业靠谱的生信工程师,我们实在是做不到在任何一个非核心知识点投入过多的时间和精力。

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    赛选日志中的数字,进行数字求和shell脚本.sh-shell

    #!/bin/bash fenzujs(){ # 定义一个函数为:fenzujs格式:fenzujs(){ } catfile="22.txt" catip="192.168.146" # 定义ip段 for((i=21; i<=37 ; i++ )) do echo "正在过滤IP:$catip.$i 过滤出来的信息为:" # 打印catip 和循环中的数值 cat $catfile | grep -A 3 "$catip.$i" | grep -v -E "ok=2|changed|TASK" # 查看日志文件,符号 | 管道进行过滤 # grep -A -3 配合内容的后3行的内容,有三行数据 # grep -v 不匹配 -E 多个内容 # grep -5 打印匹配行的前后5行 # grep -C 5 打印匹配行的前后5行 # grep -A 5 打印匹配行的后5行 # grep -B 5 打印匹配行的前5行 zuo=( `cat $catfile | grep -A 3 "$catip.$i" | grep -v -E "ok=2|changed|TASK" | grep "|" | awk -F"|" '{print $1}' | sed "s/\"//g"` ) # 定义zuo数组变量 # awk -F"|" 过滤出来的内容,用 | 这个为间隔符号,print 第1列,sed s///g 将 冒号进行替换为空, 特殊字符转译 \ 冒号为普通字符 echo "IP信息段落中左边数值为:${zuo[*]}" you=( `cat $catfile | grep -A 3 "$catip.$i" | grep -v -E "ok=2|changed|TASK" | grep "|" | awk -F"|" '{print $2}' | sed "s/\"//g"` ) echo "IP信息段落中右边数值为:${you[*]}" calculatezuo=$(echo ${zuo[*]} | sed "s/ /+/g") ; echo "IP: $catip.$i 左边数组:$calculatezuo 总值为:" $[$calculatezuo] calculateyou=$(echo ${you[*]} | sed "s/ /+/g") ; echo "IP: $catip.$i 左边数组:$calculateyou 总值为:" $[$calculateyou] # 定义变量:calculatezuo 为一个执行结果:打印数组,将空格替换为 + 符号,

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    Linux对文件中的特殊字符进行替换

    #!bin/sh # 特殊字符查看表 # https://blog.csdn.net/xfg0218/article/details/80901752 echo "参数说明" echo -e "\t 第一个参数是带有特殊字符的文件,第二个参数是需要生成新文件的名字" echo -e "\t 例如: sh ascllReplace.sh bandConversionFile.log postConversionFile.log" echo # 对输入参数进行校验 if [ ! -n "$1" ];then echo -e "\t 请输入第一个参数...." exit elif [ ! -n "$2" ];then echo -e "\t 请输入第二个参数...." exit elif [ -f $2 ];then echo -e "\t"$2"文件已被占用,请更换输出文件命!" exit fi echo -e "\t 转换开始......" # 特殊字符的集合,28是特殊字符的10进制代码 fs=`echo 28 | awk '{printf("%c", $1)}'` doc1=`echo 17 | awk '{printf("%c", $1)}'` doc2=`echo 18 | awk '{printf("%c", $1)}'` sub=`echo 26 | awk '{printf("%c", $1)}'` nul=`echo 0 | awk '{printf("%c", $1)}'` rs=`echo 30 | awk '{printf("%c", $1)}'` gs=`echo 29 | awk '{printf("%c", $1)}'` etb=`echo 23 | awk '{printf("%c", $1)}'` # 替换开始 sed -e 's/'$fs'//g' -e 's/'$doc1'//g' -e 's/'$doc2'//g' -e 's/'$sub'//g' -e 's/'$nul'//g' -e 's/'$rs'//g' -e 's/'$gs'//g' -e 's/'$etb'//g' $1 >> $2

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