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RNAseq方法

背景 当前 RNAseq 主要研究的是 mRNA,由于一次转录过程中,mRNA 只占很少一部分(约 4~5%),需要采用特殊的方式将 mRNA 从总 RNA 中分离出来。...短链非编码 RNAs(如 miRNA)既无法用 oligo-dT 方法富集,因此对其研究需要特定的分离方法,一般是切胶或磁珠分选后直接连接接头 (sequential RNA ligation,通常构建出来都是链特异性文库...三、链特异性 链特异性转录组测序(strand-specific RNA-seq)是指转录组测序过程中文库构建采用的链特异性方式。...此方式可以保留转录组测序时转录本的方向信息,即可以确定转录本是来源于基因组上面的正义链还是反义链。 目前构建链特异性文库的方法有多种,其中用的最普遍的即是 dUTP 方法。...具体流程如下: 链特异性文库 四、小RNA 五、spike-in 内参 RNA 的 spike-in 一种绝对定量的方法,在原有的 RNAseq 文库中加入已知量的

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    Linux SVN 命令详解

    本文主要是说明linuxsvn命令的使用方法,同时记录自己在使用中遇到的一些疑惑。...注意:这里一般是下载自己需要的,或者有权限的所有目录,以便以后自己在相应目录下做修改,以及内容的提交 2、往版本中添加新的文件 svn add file 例如: #添加test.php svn add...svn update #将版本中的文件test.php还原到版本200 svn update -r 200 test.php #更新,于版本同步。...help `svn help ci 13、版本下的文件和目录列表 svn list path 显示path目录下的所有属于版本的文件和目录 简写:svn ls 14、创建纳入版本控制下的新目录 svn...但是它不会恢复被删除的目录 16、代码URL变更 svn switch (sw): 更新工作副本至不同的URL。

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    反向工程(自动大杀器)

    通俗理解:基于XCode开发的应用,无需数据安装脚本,连接字符串指向哪一台哪一种数据,系统就自动在上面表!...正式定义:基于实体类的表结构信息,在连接字符串指定的目标数据上自动执行表、添删改字段、创建索引等操作,支持各种数据! 应用系统首次启动完成的时候,也是自动并初始化完成的时候。...自始至终,我们没有编写SQL脚本,没有去数据创建数据表。 代码写完就跑起来,测试通过就部署到正式。...首次连接数据时,名指定School报错,因为根本就不存在这个。 因此,XCode切换到系统,开始创建数据School,并创建数据表和索引。...这里完全是MySql语法,不同于上面的SQLite表语句。 感兴趣的同学,还可以试试Oracle和SqlServer等数据。 正向工程 正向工程就是从数据读取表结构信息,生成模型信息。

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    Entity Framework——建模

    1数据初始化策略选择 三种初始化策略: 1)CreateDatabaseIfNotExists:默认的策略。如果数据不存在,那么就创建数据。...但是如果数据已存在,而且实体发生了变化,就会出现异常。 2)DropCreateDatabaseIfModelChanges:模型改变时,原来的数据会被删除,自动重新创建一个新的数据。...3)DropCreateDatabaseAlways:每次运行都会删除原来的数据,然后重新生成数据。...4)Null:在Codefirst模式下,当实体结构改变时,运行程序不会自动生成表,改变实体结构与改变表结构互不影响, 前三种策略无法应对的问题是:分别改变实体模型和数据表结构。...解决办法: 采用第四种初始化策略,初次使用codefirst方式创建好数据以后,不使用任何数据初始化策略,即给Database.SetInitializer传null。

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    粗聊Mysql——你会表么?

    本文中说到的“”,并非单纯的一个,或是一张表,而是你建好的和表在项目的运营中,是否能应付各种事件,下面我说说几个我在项目中遇到的问题以及处理的方法,算是一个小小的心得,给大家分享下。...比如现在有2张表,一张新闻栏目表,一张新闻表,现在两张表需要进行关联,我想大多数人的做法肯定是在新闻表里一个新闻栏目id,然后把新闻栏目表里的主键ID(自增)写到这个字段里,通过这样进行两表关联。   ...这样就会造成一种情况,如果那天对数据进行优化,把主键进行了重新排序(暂时没有找到mysql优化软件会优化主键,但是可以通过代码删除主键,然后从新建立自增主键来实现主键重新排序),那就彻底杯具了,栏目和文章完全对不上号了...所以我建议两表之间关联不用主键,而是单独一个编号的字段,我们这里可以用mysql的uuid()函数做为编号,相关文献可以参考《UUID做主键好还是不好》,只所以一张表要2个主键,一个物理主键(自增id...所以我建议,既然定义为varchar,就代表不会涉及到计算,何不干脆定义一个通用的长度,比如varchar(50),如果真要限制长度,用程序去判断,不要让数据来限制,不然用户输了一长串,结果mysql

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    MySQL 系列教程之(五)DDL 操作:

    MySQL 数据 创建数据 使用root登录后,可以使用 create database if not exists user default charset utf8 创建数据,该命令的作用:...如果数据不存在则创建,存在则不创建。...创建RUNOOB数据,并设定编码集为utf8 删除数据有风险,动手需谨慎 drop database 名; MySQL 数据表 创建MySQL数据表需要以下信息: 表名 表字段名 定义每个表字段...public/img/pic.jpg' )engine=innodb default charset=utf8; 实例解析: 如果你不想字段为 NULL 可以设置字段的属性为 NOT NULL, 在操作数据时如果输入该字段的数据为...查看表结构 desc stu; 查看表语句 show create table stu\G 修改表结构 格式: alter table 表名 action(更改选项); 添加字段: 添加字段:alter

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    Linux系统安装SVN服务端结合内网穿透实现远程访问本地svn资料

    SVN安装在局域网内的话,想要远程访问资料或者代码将会受到限制,为了能从公共网络访问内网SVN资料,[cpolar](cpolar官网-安全的内网穿透工具 | 无需公网ip | 远程访问 | 搭建网站...Ubuntu安装SVN服务 命令行输入安装命令: sudo apt install subversion 查看svn版本,出现版本信息表示安装成功: svnserve --version 创建版本,执行如下系列命令...cd /opt sudo mkdir svn cd svn sudo mkdir repository 创建好后输入以下命令创建仓库 sudo svnadmin create /opt/svn/repository...启动svn服务 输入以下命令启动svn sudo svnserve -d -r /opt/svn/ 4....内网穿透 上面我们在本地Ubuntu虚拟机安装了svn服务端,但目前只能在局域网络下访问,如离开了局域网将无法连接svn

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    Linux 下使用 SVN 服务

    可省略段名中的版本名。若省略版本名,则该版本路径权限段对所有版本中相同路径的访问控制都有效。...root --password 123456 停止 svn 服务 killall svnserve 一台svn服务器上同时运行多个版本有2种方案: 在SVN服务器上创建多个版本,同时运行多个svnserve...现在/data/svn_data下建立多个repo1,repo2等多个版本, 分别配置各自信息 单版本起动 svnserve -d -r /data/svn_data/repo1。...访问地址则是127.0.0.1/ 多版本起动 svnserve -d -r /data/svn_data/ (推荐此种用法)启动到父目录的等级更加方便。...总结 SVN管理员可以通过这3个配置文件设置 SVN 服务的用户名口令以及对版本路径的访问权限。这些配置文件保存后就立即生效,不需要重启svnserve服务。

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