audiotools = { 'sunos5': Filter('/usr/bin/audioplay'), # os.popen().write() 'linux2':...# startfile or system 'win32': Cmdline('start %s') } videotools = { 'linux2...zaurus pda 'win32': Winstart(), # avoid DOS pop up } imagetools = { 'linux2...Cmdline('zimager %s'), # zaurus pda 'win32': Winstart(), } texttools = { 'linux2...# poss .txt.gz maintype, subtype = contenttype.split('/', 1) # 'image/jpeg' if maintype
attemptsLeft <- attemptsLeft-1 Sys.sleep(5) } else attemptsLeft <- 0 } gzFile <- grep(".txt.gz...Linux(2019更新版)》 把R的知识点路线图搞定,如下: 了解常量和变量概念 加减乘除等运算(计算器) 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子) 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表) 文件读取和写出...简单统计可视化 无限量函数学习 Linux的6个阶段也跨越过去 ,一般来说,每个阶段都需要至少一天以上的学习: 第1阶段:把linux系统玩得跟Windows或者MacOS那样的桌面操作系统一样顺畅,...第3阶段:元字符,通配符及shell中的各种扩展,从此linux操作不再神秘! 第4阶段:高级目录管理:软硬链接,绝对路径和相对路径,环境变量。 第5阶段:任务提交及批处理,脚本编写解放你的双手。...第6阶段:软件安装及conda管理,让linux系统实用性放飞自我。
acc=GSE135337 一共是八个样品,7例膀胱癌患者的7个原发肿瘤样本和1个癌旁组织样本的单细胞mRNA谱,提供的是txt.gz格式的压缩文件,直接下载后存放到对应的文件夹即可。...GSM4751268_BC7_gene_cell_exprs_table.txt.gz 11.1 Mb GSM5329919_BCN_gene_cell_exprs_table.xls.gz 11.4 Mb 对于txt.gz...file.path( dir ,pro),data.table = F) ct[1:4,1:4] rownames(ct)=ct[,1] colnames(ct) = paste(gsub('.txt.gz
file.path( dir ,pro),data.table = F) ct[1:4,1:4] rownames(ct)=ct[,1] colnames(ct) = paste(gsub('.txt.gz...file.path( dir ,pro),data.table = F) ct[1:4,1:4] rownames(ct)=ct[,1] colnames(ct) = paste(gsub('.txt.gz...比较简单,接下来就针对前面的表达量列表去循环使用这个函数即可,如下所示: lapply(samples,function(pro){ # pro=samples[1] pro=gsub('.txt.gz
acc=GSE139506 一共是十个样品,提供的是txt.gz格式的压缩文件 #samples GSM4142623 CONTROL GSM4142624 DAY1 GSM4142625 DAY2 GSM4142626...2_dge.txt.gz 10.6 Mb GSM4142631_DAY14_1_dge.txt.gz 11.2 Mb GSM4142632_DAY14_2_dge.txt.gz 10.1 Mb 对于txt.gz...file.path( dir ,pro),data.table = F) ct[1:4,1:4] rownames(ct)=ct[,1] colnames(ct) = paste(gsub('.txt.gz
as.data.frame(sce@assays$RNA$counts[1:10, 1:2]) head(sce@meta.data, 10) table(sce@meta.data$orig.ident) txt.gz...以及csv.gz格式 txt.gz以及csv.gz格式读取方法差不太多,所以就放到一类下面啦。...参考推文:使用Seurat的v5来读取多个不是10x标准文件的单细胞项目 txt.gz格式 dir='.
Patient #3-scRNA GSM4089154 Patient #4-scRNA GSM4711414 Patient #5-scRNA GSM4711415 Patient #6-scRNA 提供了txt.gz...file.path( dir ,pro),data.table = F) ct[1:4,1:4] rownames(ct)=ct[,1] colnames(ct) = paste(gsub('.txt.gz
ApoE KO 22 weeks WD GSM4705605 ZsGreen1- ApoE KO 22 weeks WD 作者给出来的数据是matrix.txt.gz的数据格式,下载需要的数据,然后按照txt.gz...,1] ct=ct[,-1] sce=CreateSeuratObject(counts = ct , project = gsub('.txt.gz
首先自己去下载公共数据集GSE182434的两个txt.gz文件,存放在data文件夹里面,然后复制粘贴下面的代码,如下所示: rm(list=ls()) options(stringsAsFactors...,"Lag3","Tigit","Cd244","Entpd1","Cd101","Cd38","Zap70","Nfatc1") # 抑制性受体 学徒作业 去下载公共数据集GSE182434的两个txt.gz
Linux 文件系统 目录 说明 bin 存放二进制可执行文件 sbin 存放二进制可执行文件,只有 root 才能访问 boot 存放用于系统引导时使用的各种文件 dev 用于存放设备文件 etc...是超级管理员 localhost 表示主机名 ~ 表示当前目录(家目录),其中超级管理员家目录为 /root,普通用户家目录为 /home/chan $ 表示普通用户提示符,# 表示超级管理员提示符 Linux...test.tar.gz 文件搜索命令 locate:在后台数据库搜索文件 updatedb:更新后台数据库 whereis:搜索系统命令所在位置 which:搜索命令所在路径及别名 find:搜索文件或文件夹 用户和组 Linux
Linux文件操作 Linux中,一切皆文件(网络设备除外)。 硬件设备也“是”文件,通过文件来使用设备。 目录(文件夹)也是一种文件。...boot:这里存放的是启动Linux时使用的一些核心文件,包括一些连接文件和镜像文件。...deb:deb是Device(设备)的缩写,该目录下存放的是Linux的外部设备,在Linux中访问设备的方式和访问文件的方式是相同的。...系统会自动识别一些设备,例如U盘、光驱等,当识别后,Linux会把识别的设备挂载到这个目录下。...---- Linux文件的操作方式 文件描述符fd fd是一个大于等于0的整数。 每打开一个文件,就创建一个文件描述符,通过文件描述符来操作文件。
extentions:后缀名,常见的文件后缀名:.txt,.lost,.txt.gz,.tmp,一般的日志文件都是.txt或者.txt.gz,文件被删除后的记录会以.lost命名这种文件命名方式优点是可以一眼看出这是什么类型的文件...的接口更改部分配置策略的接口主动上报的接口其它自定义参数的接口3.4 确定收集管控策略是否允许收集:该配置关闭后,本地不会执行任何收集行为日志存储目录:私有目录固化出一个空间文件命名方式:参照DBMS,进程名_日志类型_前后台@时间戳.txt.gz
min.features = 300,) return(sce) }) names(sceList) library(stringr) # samples=gsub('.txt.gz
为了解决内存紧缺的问题,Linux引入了虚拟内存的概念。为了解决快速存取,引入了缓存机制、交换机制等。...要深入了解Linux内存运行机制,需要知道下面提到的几个方面。 首先,Linux系统会不时地进行页面交换操作,以保持尽可能多的空闲物理内存。...其次,Linux进行页面交换是有条件的,不是所有页面在不用时都交换到虚拟内存中,Linux内核根据“最近最经常使用”算法,仅仅将一些不经常使用的页面文件交换到虚拟内存中。...Linux虽然可以在一段时间内自行恢复,但是恢复后的系统已经基本不可用了。...Linux下可以使用文件系统中的一个常规文件或者一个独立分区作为交换空间。同时Linux允许使用多个交换分区或者交换文件。
linux安装.net 下载.net https://dotnet.microsoft.com/download/thank-you/dotnet-sdk-2.1.4-linux-x64-binaries...下载安装包后执行命令: dotnet-sdk-2.1.302-linux-x64.tar.gz yum install libicu -y cd /root ln -s /data1/soft /data.../soft tar zxvf dotnet-sdk-2.1.302-linux-x64.tar.gz -C /data1/soft/dotnet/ echo 'export DONET_ROOT=$PATH
Linux ESC :wq 和:wq!的区别 Linux ESC:wq 和:wq!...的区别 发布者:IT人在线 | 发表时间:2018-12-4 17:20:43 Linux ESC :wq esc(键退出)->:(符号输入)->wq(保存退出) wq(存盘并退出 write%quite
在 Linux 系统中,网络配置是非常重要的,它涉及到网络接口、IP 地址、子网掩码、网关、DNS 等多个方面。...本文将介绍如何在 Linux 系统中配置网络,包括设置静态 IP 地址、修改主机名、配置 DNS 服务器等内容。...查看网络接口在 Linux 系统中,可以使用 ifconfig 命令来查看当前系统的网络接口信息。...其它的内容这里先暂且不讲,这里先继续根据 在 windows 上搭建一台 Linux,这篇文章的内容来继续写,在这篇文章中,已经将系统搭建完成了,这篇文章主要就是调通网络。...这么一来,我们的网络就配置好了,然后我们可以在 Linux 系统中访问外部网络了。
相信很多在linux平台工作的童鞋, 都很熟悉管道符 '|', 通过它, 我们能够很灵活的将几种不同的命令协同起来完成一件任务.就好像下面的命令: echo 123 | awk '{print $0+123...EAGAIN 如果所有管道写端对应的文件描述符被关闭,则read返回0 如果所有管道读端对应的文件描述符被关闭,则write操作会产生信号SIGPIPE 当要写入的数据量不大于PIPE_BUF时,linux...当要写入的数据量大于PIPE_BUF时,linux将不再保证写入的原子性。
---- O_SYNC 缓存同步 为了保证磁盘系统与缓冲区内容一致,Linux系统提供了sync,fsync,fdatasync三个函数。...---- Linux文件IO流程图 内核中会有一个线程,不断地将高速页缓冲区中的数据写入到物理磁盘中。
shell 对于Linux,有相同的作用,主要是对我们的指令进行解析,解析指令给Linux内核。反馈结果在通过内核运行出结果,通过shell解析给用户。...2.3 Linux中的用户 Linux下有两种用户:超级管理员(root)、普通用户。 超级管理员(root):可以再linux系统下做任何事情,不受权限约束 普通用户:在linux下做有限的事情。...Linux具有组的概念,主要是在多人协作的时候,更好的进行权限管理!...而在Linux中不通过后缀区分文件类型!但并不是说Linux不用后缀。 那通过什么区分呢?即ls -l第一个属性列。 Linux文件类型: -:普通文件。...很简单一个道理,Linux系统不以文件后缀作为区分文件类型的依据,但并不代表gcc不需要,Linux系统 != gcc。
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