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    基因的可变剪切_如何确认发现了可变剪切

    什么是基因的可变剪切?...有些基因的前体mRNA(pre-mRNA)通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点)产生不同的mRNA剪接异构体,这一过程称为可变剪接(或者选择性剪切)(Alternative Splicing)。...常见的可变剪切可以分成6类: 1、外显子跳跃(Exon Skipping) 2、内含子保留(Intron Retention) 3、5’端可变剪接(Alternative 5′ splice Site)...可变剪切是调节基因表达和产生蛋白组多样性的重要原因,是导致真核生物基因与蛋白质数量差异效果的主要原因。...可变剪切预测软件 使用Cufflinks软件,与基因原有的剪接模型进行比较,对Mapped Data中的跨内含子Reads,进行新可变剪接事件(Alternative Splicing Events)预测

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    利用Python实现多重剪切

    该程序要做的事情如下: 识别命令行参数; 什么时候保存剪切板内容? 什么时候删除剪切板内容? 如何呈现剪切板内容?全部呈现还是按照关键字呈现? 如何清空剪切板? 清空剪切板后在粘贴,会看到什么内容?...python3 # mcb.pyw - 程序的名称,用来保存和加载多重剪切板 # 导入用到的模块 import shelve, pyperclip, sys # 初始化 shelf 文件 mcb. mcbShelf...= shelve.open('mcb') # 获取命令行参数 command = sys.argv[1].lower() # TODO: 保存剪切板内容,并为每次复制的内容设置一个关键字. # TODO...: 列出所有关键字. # TODO: 删除某个关键字,并清除该关键字对应的内容. # TODO: 删除所有关键字,清空剪切板. # TODO: 根据命令行参数,显示某关键字对应的内容. mcbShelf.close...() 下面依次补充每个步骤的命令 保存剪切板内容,并为每次复制的内容设置一个关键字 if command == 'save': mcbShelf[sys.argv[2]] = pyperclip.paste

    1.6K20

    Android使用剪切板传递数据

    在Activity之间传递数据还可以利用一些技巧,不管windows还是Linux操作系统,都会支持一种叫剪切板的技术,也就是某一个程序将一些数据复制到剪切板上,然后其他的任何程序都可以从剪切板中获取数据...使用剪切板会用到,ClipboardManager对象,这个对用剪切板会用到,ClipboardManager象用来操作剪切板,但是没有提供public的构造函数(单例模式),需要使用Activity.getSystemService...使用cm.getPrimaryClip()方法获取剪切板的ClipData数据对象,cd。 通过cd.getItemAt(0)获取到传递进来的数据。...存入数据:获取ClipboardManager,并对通过Base64类对MyData对象进行序列化,再存入剪切板中。...,剪切板为Android系统管理的,所以在一个地方存入的数据,在这个Android设备上任何应用都可以访问的到,但是正是因为此设备访问的都是同一个剪切板,可能会导致当前程序存入的数据,在使用前被其他程序覆盖掉了

    1.5K10

    弹性厚板的剪切锁定(shear locking)

    Kirchhoff 薄板理论忽略了剪切变形, 即γzx = 0, γzy = 0。但对于厚板来说,不考虑剪切变形会产生较大的误差。下面结合厚板理论作简要分析。...(一) 弹性厚板理论 如图所示,同Timoshenko beam理论一样,实际的横向剪应力在板厚度方向的分布并不均匀,而变形假定横向剪应变在厚度方向为常量,因此在剪应力计算时引入剪切修正系数k,用以考虑应力分布的不均匀性...一般取k=5/6 (二) 厚板的剪切锁定(shear locking) 现在以4节点矩形单元为例,来简要说明剪切锁定现象。 缩减积分方法可以克服这一问题。...比如建立8节点矩形单元时,弯曲刚度矩阵采用3x3高斯积分,而剪切刚度矩阵采用2x2高斯积分。

    1.7K50

    生信中的可变剪切噪起来

    此外,还有很多方法可用于识别可变剪切。 很多方法识别可变剪切均是基于剪切图谱(splice graph)。...上中图是对可变剪切矩阵的箱线图可视化结果,可用于直观比较不同肿瘤类型中某种可变剪切类型的差异。...可变剪切图谱的应用与解读:下图是基于右上角选中基因(如FBLN2),构建的可变剪切图谱。...根据可变剪切矩阵,可以知道该基因发生的是外显子11跳过事件,而该剪切图谱就是阐释为什么发生的是外显子11跳过事件,而不是其他类型的可变剪切事件。...3.3 可变剪切事件与剪切因子表达的相关性分析 可绘制剪切因子表达与可变剪切事件PSI相关性的汇总圈图(上方的A图,绿色的连线表示为负相关,红色的连线表示正相关),也可绘制单个剪切因子表达与可变剪切事件

    5.1K50
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