，并不是由后缀决定，后缀只是起到提示作用 本节课的函数总结： read.csv("x.csv")读取csv文件 read.table("x.txt")读取txt文件 write.csv(x,file="...x.csv") 导出csv文件 write.table(x,file="x.txt")导出txt文件 2R语言特有的文件格式 R.data 保存的是变量，不是表格文件，支持保存多个文件 save（x,file...="x.R.data") 保存Rdata load("x.Rdata")加载 R.data 3默认参数不适用读取文件所导致的隐形错误 （1）读取txt文件，没有正确识别列名 修改办法 read.table...=1,check.names=F) （3）数据框不允许重复的行名 如果读取失败需要先去重复，在来设置行名 （4）有时数据中有一些缺失值，文件读取失败 解决办法：read.table("x.txt",header...这个错误可以用一些函数来避免掉 read.delim("x.txt") data.table::fread("x.txt",data.table=F)
fasta pic1 图片 fastq pic2 图片 gff pic3，4 图片 图片 gtf pic5，6 图片 图片 按列隔开 column -t | l...
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 1. 根据网上查阅的读取方法 import pickle file=open("....dataset-cornell-length10-filter1-vocabSize40000.pkl","rb") data=pickle.load(file) print(data) file.close() 在这里，注意在读取的使用的是...”rb”,也就是二进制文件格式，而”r”是普通格式的读取 用print输出结果显示是这样的 。。。。。。。...dataset-cornell-length10-filter1-vocabSize40000.pkl","rb") data=pickle.load(file) pprint.pprint(data) file.close() 好吧，读取的方式是一样的...，但是显示出来的是不一样的，看看显示 图片 明显这个才是我们可以的认识的，恩，就是这样 版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点仅代表作者本人。
概述 WAV文件格式是Microsoft的RIFF规范的一个子集，用于存储多媒体文件。...RIFF Chunk 根据RIFF的格式，可以抽象出RIFF chunk的结构体: struct RIFF_CHUNK { char ChunkID[4]; //'R','I','F','F'...根据Format chunk的格式，可以抽象出Format Chunk的数据结构: struct FORMAT_CHUNK { char FmtID[4]; //'f','m','t'...如果对此概念不是很了解，可以查看此文章: Linux音频驱动-声音采集过程 .ByteRate: 每秒所需的字节数。...将此值转化为MB位单位: 44.2MB，可以验证上述使用mediainfo的信息。 "57 41 56 45" 对应的Ascii码字符为"WAVE"。
// readAnyDatabase可以读取所有的database吗？ // 01 问题背景 今天在线上环境中，发现了一个有意思的小问题。这个问题是权限相关的。...实例，并查询bbb的这个集合，结果如下： [root@ ~]# /data1/yazhou5/mongodb/mongodb-linux-4.0.4/bin/mongo --port=45011 -u...admin数据库下面，有readAnydatabase的权限，所以即使不在aaa数据库下面，也可以直接读取aaa数据库下面的bbb集合。...如果我们使用这个账号去读取local数据库中的oplog.rs这个集合的时候，会发现下面的问题： testInit:PRIMARY> db.oplog.rs.find() Error: error: {...从官方文档描述不难看出，在3.4版本之前，这个用户可以访问local库和config库，而在3.4版本的MongoDB中进行了改造，后续版本不再能够访问local库和config库中的表，只能访问除这两个库之外的其他业务库和系统库
linux常用于读取文件内容指令主要有以下七种： cat,tac,nl,more,less,head,tail cat 文件名 –将文件内容显示在屏幕上 cat -n 文件名 –将文件内容显示在屏幕上...，并显示行号 cat -b 文件名 –将文件内容显示在屏幕上，并显示行号，但是不显示空白行行号 tac则是和cat反过来的（名字都是反过来的） tac 文件名 –将文件内容显示在屏幕上，但是是从最后一行开始往前显示...ten [root@localhost tmp]# tac readfile.txt seven eghit nine ten four five six two three One tac和cat显示的顺序是相反的...-w 4 readfile.txt 1 one 2 two three 3 four five six 4 seven eghit nine ten 可以执行翻页操作的读取文件内容指令...tail文件名 –显示文件头十行 tail -n x 文件名 –显示文件头x行，如果x前面有+号，则显示除前面x-1行外的所有行 如果想要看第十一行到第二十行，可以结合管道流来实现 两种方式
因为课题处理30年的降雨和蒸发的遥感资料（.NC格式），而想要在Arcgis中处理要求的是raster格式的，所以需要批量转化为tif文件，所以在此分享自己改编之后的代码，可以简洁明了的实现这个过程：...我所参考和借鉴的文章的链接如下： 《 MATLAB读取.nc文件》 《matlab批量处理nc文件》 《Matlab读取气象驱动数据.nc格式的数据》 感谢他们的分享 版本：MATLAB_2018b...二者代码的区别及要点如下： 1.在读入文件时可以预先用NASA提供的Panoply读一下NC文件看看各个变量的名字、大小写以及维度，比如第二个代码中变成了二维的’LON’、‘LAT’和’monthly_ET...如果没有Panoply也可以用以下代码： % 显示结构 ncdisp(ncFilePath);%显示nc文件的所有结构，以便大概了解里面的内容 ncdisp(ncFilePath,'evap');%显示指定变量的内容...后记： 写博客的初衷是分享经验，同时是算是自己对思路和代码的整理，方便日后处理数据，应该可以帮到很多人。 版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点仅代表作者本人。
读取命令行的输入 读取命令行的输入，如下List-1所示: List-1 mjduan@dmj:/tmp$ more read.sh echo -n "Enter your name:" read...password:" pwd echo "Your password:$pwd" echo后面的-n表示不换行，不然光标就不会停在name后面 read后面加上一个-p，这样read命令可以显示提示...，且将结果存在变量email中，如下List-2 加上一个-s就是读取密码，这种不会将输入的文本显示出来....read.sh Enter your name:mjduan Hello mjduan Enter your email:126@mail.com Your email:126@mail.com 读取文件的内容.../bin/bash count=1 //赋值语句，不加空格 cat test | while read line //cat 命令的输出作为read命令的输入,read读到的值放在line中 do
问答 问：Linux的中断可以嵌套吗？ 答：以前是可以嵌套的，现在不可以！...历史 早前的Linux内核版本，中断分为两种： 快中断，申请的时候带IRQF_DISABLED标记，在IRQ HANDLER里面不允许新的中断进来; 慢中断，申请的时候不带IRQF_DISABLED标记...老的Linux内核中，如果一个中断服务程序不想被别的中断打断，我们能看到这样的代码： request_irq(FLOPPY_IRQ, floppy_interrupt,\ - IRQF_DISABLED...也就是说，从这个commit开始，实际Linux已经不再支持中断的嵌套, 也没有快慢中断的概念了，IRQF_DISABLED标记也作废了。...Linux内核会在如下2个时候重新开启CPSR对IRQ的响应： 从IRQ HANDLER返回中断底半部的SOFTIRQ 从IRQ HANDLER返回一个线程上下文 从1大家可以看出，SOFTIRQ里面是可以响应中断的
这一节我们先掌握如何读取头部信息和程序表头，我们先看ELF文件的大致结构： ? ELF文件格式最重要的就是所谓的段，特别是其中的代码段和数据段。对应上图就是.text,.data两个段。...每个段都对应一个段表来描述，而若干隔断会组成一个整体，它对应一个program,而后者则由program header table来指向，讲解ELF数据结构最为详细的就是网址如下，有心的朋友可以认真阅读...： https://man7.org/linux/man-pages/man5/elf.5.html 我们本次要解读ELF文件的两个部分，一个是其文件头。...文件头描述了ELF文件很多重要信息，例如它运行的平台，支持的CPU类型等。使用命令行readelf -h 可以读取指定ELF文件的头部信息，如下图所示： ?...深刻掌握ELF文件结构及其加载原理是实现Linux上二进制劫持的基础，其过程很烦琐，同时又涉及到很多平常用不上的关于硬件和体系结构的知识，能否啃得下这些枯燥的知识点，决定了一个人是否有毅力和决心在技术之路上走的足够远并且最终能脱颖而出
Linux_生物信息学常见文件格式• fastafasta：一种基于文本用于表示核酸序列或多肽序列的格式。...FASTQ文件中，一个序列通常由四行组成： • 第一行：以 @ 开头，之后为序列的标识符以及描述信息 • 第二行：为序列信息，如 ATCG • 第三行：以 + 开头，之后可以再次加上序列的标识及描述信息...6 score 这一列的值表示对该类型存在性和其坐标的可信度，不是必须的，可以用点“.”代替。 7 strand 链的正向与负向，分别用加号+和减号-表示。...6 score 这一列的值表示对该类型存在性和其坐标的可信度，不是必须的，可以用点“.”代替。 7 strand 链的正向与负向，分别用加号+和减号-表示。“.”表示不需要指定正负链，“?”...表示未知. 8 frame 密码子偏移，可以是0、1或2。仅对编码蛋白质的CDS有效，本列指定下一个密码子开始的位置。
简介 在之前关于 Awk 工具的系列文章中，主要探讨了如何从文件中读取数据。但如果你希望从标准输入（STDIN）中读取数据，又该如何操作呢？...在本文中，将介绍几个示例，展示如何使用 Awk 来过滤其他命令的输出，而不仅仅是读取文件内容。 首先，将以 dir 工具为例，它的功能与 ls 命令类似。...在第一个示例中，将 dir -l 命令的输出作为 Awk 的输入数据，以此来打印出当前目录下文件的所有者用户名、所属组名，以及该用户拥有的文件列表。...tech/{print}' # cat tecmint_deals.txt | awk '$4 ~ /Tech/{print}' 在上面的例子中，使用了值 ~ /pattern/ 比较运算符，但有两个命令可以尝试并提取出非常重要的内容...因此，在使用这种比较运算符时一定要小心，正如上面所看到的，它是区分大小写的。 您可以随时使用另一个命令的输出作为 awk 的输入，而不是从文件中读取输入，这就像在上面的例子中所看到的那样，非常简单。
Binary Interface)接口的一部分，也是Linux的主要可执行文件格式。...本文主要从elf文件的组成构造的角度来进行分析，将elf文件的解析通过一步一步的分析得到里面的信息，同时通过python脚本解析，可以直观的看到文件的信息，通过本文的阅读，将对elf文件格式有着更加深刻的理解...根据定义，elf32的结构体定义，在Linux上可以在/usr/include/elf.h中找到 #define EI_NIDENT (16) typedef struct { unsigned...接下来我们来举个具体的例子来解析Section。比如要读取.text的段。那么首先看一下细节。 ?...，可以查看 http://www.skyfree.org/linux/references/ELF_Format.pdf 这里有一张图值得研究一下： ?
并且保证转换后的文件自己使用，不传播给任何人。 ---- github上找到了一个第三方开源的库，用的第c++开发的。...项目源地址：qmc-decoder 如果不想编译直接下载安装，直接去下载对应的操作系统的release即可，有对应的windows,mac os以及linux的安装包。...如果有的话，可以略过这一步。 用qq音乐下载好音乐。 把从github上项目中下载的可执行文件和下载的音乐包放到一个文件夹下，右键菜单git bash here。 输入执行: ..../decoder *.qmc* && rm -rf *.qmc* && 符号的命令是删除掉qmc文件，如果你还需要保留的话，只需要执行./decoder *.qmc*即可。
也就是说：在一套软件里，只要执行以上扩展的文件（如鼠标双击此类型文件），软件就可以正常运行了。 编写一套软件，涉及内容很多。 ...如编写一套学校管理软件，需要学校的一些数据，那么我们可以把数据文件归类。 以扩展名.dbf或其它指定名称来归类；以扩展名.dll作为链接文件，保证文件之间的运行。...如果要启动此软件，就只要执行扩展名.exe或.com或 .bat就可以了。....com文件和.exe文件的区别： .com文件就是只含一个代码段的指令程序。 .exe文件可包含多个程序段，如：代码段、数据段、堆栈段等。 ....com文件只能作一些简单的DOS指令操作。 .exe文件应用广泛，可作为各类程序的程序文件。 .com文件大小不能超过64K。 .exe文件大小没有限制。
前言 处理vcf文件的时候，需要多种切割，正则匹配，如果要自己写其实会比较麻烦，并且每次还得根据vcf文件格式或者需要读取的值不同要修改相应的代码。...因此我写了这个通用的读vcf的类，直接复制粘贴这部分代码就可以方便的用这个类进行vcf文件的读取，过滤，写出等操作。...注意VCF类是个迭代器类，可以用next和for循环来读入每一行的信息 record = gatk.record #这里record存储的是该Record类的地址 查看该record的属性，包括line...，这里在vcf一般是在后面用样本名表示的列） record.CHROM record.line record.ID #其他的属性同理 INFO的读取 这是vcf中INFO的原始表示 CONTQ=28;...', 'OBAMRC': 'false'}] 第一个字典就是tumor的GT，第二个字典就是normal的GT，当然，根据你的样本数量会有多个字典，这里可以按索引取出比如要取出第一个样本的，只需要record.GT
： 通过几行 JavaScript ，就可以读取到电脑/手机上的所有数据，浏览器中的网页可以读取你所有的密码，知道其他程序在干什么，这甚至不需要你写出来的程序是有漏洞的，因为这是一个计算机硬件层面上的漏洞...但是读取内存很慢，CPU 为此要花费很长的时间空闲，只为了等待内存的数据。这显然不是个很好的方案。 所以，人们想，是不是 CPU 可以推测一下需要执行的命令呢？...所以其他程序无法直接读取 “受害者”（红色区域）的数据： 加入我们试图直接访问红色区域肯定是读不到的 ，但是缓存中可能已经存在一些数据，下面我们可以试着用高速缓存来搞点事情。...跨源开放者策略（COOP） 利用 Spectre ，攻击者可以读取到在统一浏览器下任意 Context Group 下的资源。...但是，攻击者随后可以利用 Spectre 之类的漏洞来潜在地读取该内存块。 跨域读取阻止（CORB）可以根据其 MIME 类型防止 balance 内容进入渲染器进程内存中。
本篇文章, 我们简单验证下, 在Linux系统中, 读取目录下的文件, 它的顺序是怎样的....C程序和Python程序, 接下来会使用这2个程序分别验证下在Linux系统中, 读取目录下文件的顺序是怎样的..../lib目录下的jar文件时, 先读取哪个后读取哪个总该有个顺序吧, 它的底层不会像ls命令排序那样的, 那么它的底层是依据什么呢?...我们简单写个Java程序读取当前目录, 看一下Java程序读取的目录中的文件列表是否与上面一致....对应的底层系统调用API是getdents 可以参考 https://man7.org/linux/man-pages/man2/getdents.2.html 或man getdents 查看下相关的介绍
fastq文件中，一个序列通常由四行组成：第一行：以@开头，之后为序列的标识符以及描述信息第二行：为序列信息，如ATCG第三行：以+开头，之后可以再次加上序列的标识及描述信息（保留行）第四行：为碱基质量值...，不是必须的，可以用"."...代替第七列 strand 链的正向与负向，分别用+和-表示第八列 frame 密码子偏移，可以是0、1或2第九列 attributes 属性，一个包含众多属性的列表，格式为“标签=值（tag=value....start 起始位置end 终止位置score .strand 链的正向与负向frame attributes：属性，必须要有以下两个值：gene_id value:表示坐标在基因组上的基因座的唯一的...gene_id与value值用空格分开，如果值为空，表示没有对应的基因transcript_id value：预测的转录本的唯一ID。
Linux有许多处理文本的命令，熟练使用这些命令，会使得文本处理效率比在window下快很多，本文介绍一些使用频率比较高的命令，适用于职场小白学习。 1.查找包含关键字的文件 查找当前目录..../以及子目录下所有文件中包含“192”关键字的文件 find ./ "*.*" | xargs grep -s"192" 2.修改系统时间 设置硬件时间 hwclock --set --date="10.../21/19 09:45" 同步系统时间为硬件时间 hwclock –w 3.批量修改文件 将所有后缀.conf文件中的9443改为8080 sed -i 's/9443/8080/' *.conf...4.使用awk统计日志时间脚本例子 日志1.log每行都形如A&B&C&D&E&Time=256&F&G&H&K， 我们要提取Time=256这列的信息 cat 1.log |awk -F "&" '...逐行读取文件内容 filename是待读取文件 方案一、 #!
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