一、sam/bam 文件介绍 SAM 文件格式（Sequence Alignment Map Format）是高通量测序分析当中最重要的文件格式之一。...page=SAM 二、利用 stools 处理 Sam 文件 比对得到 sam 之后，一般无法直接使用，绝大部分的软件都需要使用 bam 格式。...能够处理 sam 格式的软件有很多，例如 samtools，bamtools，picardtools 等。...sam/bam 文件处理 samtools 顾名思义，是处理 sam 格式的工具合集。
fasta pic1 图片 fastq pic2 图片 gff pic3，4 图片 图片 gtf pic5，6 图片 图片 按列隔开 column -t | l...
接到需求要在Linux环境下将amr转换为mp3，windows下直接使用第三方jar包封装的exe方法即可，但不支持Linux，上网爬完资料说是用ffmpeg加上amr插件可以实现，根据教程尝试了一下.../configure make make install #amr支持 wget http://downloads.sourceforge.net/project/opencore-amr.../opencore-amr/opencore-amr-0.1.3.tar.gz tar -xzvf opencore-amr-0.1.3.tar.gz cd opencore-amr-0.1.3...ldconfig 3.使用方法 ffmpeg -i 1.mp3 -ac 1 -ar 8000 1.amr #MP3转换AMR ffmpeg -i 1.amr 1.mp3....0 (0x00002ab7c100b000) libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x00002ab7c1125000) /lib64/ld-linux-x86
RIFF file format RIFF全称为资源互换文件格式（Resources Interchange File Format），是Windows下大部分多媒体文件遵循的一种文件结构。...---- WAV WAV 是Microsoft开发的一种音频文件格式，它符合上面提到的RIFF文件格式标准，可以看作是RIFF文件的一个具体实例。...头部的SIZE为固定的44, 通常对WAV音频进行处理时，会直接写死这个头部的Offset。 排查一次WAV处理中的杂音情况 但是在实际处理的过程中，遇到了下面这样的WAV HEADER。...channels, bitNum); //删除临时文件 new File(tempOutPcmPath).delete(); } 参考 RIFF和WAVE音频文件格式...WAV文件格式详解 wav文件格式分析与详解
概述 WAV文件格式是Microsoft的RIFF规范的一个子集，用于存储多媒体文件。...如果对此概念不是很了解，可以查看此文章: Linux音频驱动-声音采集过程 .ByteRate: 每秒所需的字节数。
第二层标签也可以有多个标签（允许重复），此时第二层标签作为Excel的WorkSheet，第三层标签及其嵌套作为一行数据） # # 由于openpyxl默认为Excel的xlsx格式，所以本脚本的所有Excel文件格式都为...我遇到有报错: running bdist_wheel running build running build_py creating build creating build/lib.linux-x86..._64-3.5 copying pytinyxml2.py -> build/lib.linux-x86_64-3.5 running build_ext building '_pytinyxml2...第二层标签也可以有多个标签（允许重复），此时第二层标签作为Excel的WorkSheet，第三层标签及其嵌套作为一行数据） # # 由于openpyxl默认为Excel的xlsx格式，所以本脚本的所有Excel文件格式都为...= os.path.join(root, name) target = basename + "1" + ".xml" print("处理
正文 处理原始scRNA-seq数据 3.3 文件格式 3.3.1 FastQC FastQ是您将遇到的最原始形式的scRNASeq数据。...FastQ文件的格式如下： >ReadID READ SEQUENCE + SEQUENCING QUALITY SCORES 3.3.2 BAM BAM文件格式以标准且有效的方式存储比对过的...当/如果要量化内含子reads时，您可能还需要更改gtf文件以处理内含子中的重复元素。任何脚本语言甚至“awk”或一些文本编辑器都可以用来相对有效地完成这项任务，但它们超出了本课程的范围。
FFmpeg内置了aac音频格式，在《FFmpeg开发实战：从零基础到短视频上线》一书的“5.2.2 Linux环境集成mp3lame”又介绍了如何给FFmpeg集成mp3格式，常见的音频文件除了这两种之外...因此要先安装编译这三个库，再让FFmpeg开启ogg和amr支持，在Linux环境的操作过程包含四个步骤：安装libogg、安装libvorbis、安装opencore-amr、重新编译FFmpeg，分别说明如下...make install3、安装opencore-amropencore-amr是AMR音频的编解码库，支持对AMR-NB和AMR-WB格式的音频进行编解码，它的安装步骤说明如下。...tar zxvf opencore-amr-0.1.6.tar.gzcd opencore-amr-0.1.6（2）进入解压后的opencore-amr目录，运行下面命令配置opencore-amr。....FFmpeg的Linux环境完整编译过程参见《FFmpeg开发实战：从零基础到短视频上线》一书的“1.2.3 自行编译与安装FFmpeg”，详细的启用步骤说明如下。
3GP是一种类似MP4文件格式,广泛应用于手机视频的一种文件格式，3GP是MP4格式的一种简化版本，减少了储存空间和较低的频宽需求。....amr 格式的苹果这边也是无法播放的。 mpeg_4 输出格式的文件苹果这边也是无法播放的。...Snip20161207_2.png 安卓方不做处理，iOS端 Wav 转 amr 给安卓使用，把安卓的amr 转化为 wav 给自己使用 由于安卓那边的录音默认的保存格式就是 amr，而苹果这边也可以把音频文件输出为...wav格式进行保存，所有只要 iOS端 Wav文件 转 amr 格式给安卓使用，把安卓的amr 文件转化为 wav格式 给自己使用即可解决iOS与Android的音频文件互通问题。...关于wav和amr 格式互转，可以参考这个dome,喜欢请 star一下
可选格式 ios android做音频相关的开发时可选用的格式有 mp3,speex,aac,amr,ilbc 已知应用 amr:微信 evemote speex:米聊 文件格式大小 mp3>aac>...amr/ilbc>speex 各个格式简介 amr：生成格式相对较小，Android原生支持，ios可用第三方库进行编码解码 speex：生成文件最小，Android、ios均需要用第三方库进行编码解码...，支持声音的降噪等处理 aac：生成文件相对较大，Android，ios均支持，声音质量较好，比mp3文件小 ilbc：生成文件较小，ios 4.3以上支持，Android早期不支持可用第三方库 mp3...：相比文件最大，比较流行的格式 个人推荐 相比下来，我还是比较推荐用amr格式，网上的教程多，又不像speex一样需要双方都编码解码，生成的文件也较小，比较适合做语音通话
Linux_生物信息学常见文件格式• fastafasta：一种基于文本用于表示核酸序列或多肽序列的格式。
语音识别仅支持以下格式 ：pcm（不压缩）、wav（不压缩，pcm编码）、amr（有损压缩格式）；8k/16k 采样率 16bit 位深的单声道。即： pcm wav amr 格式三选一。...16bits // 256 kb/s = 32KB/s = 32B/ms ffmpeg 使用说明 简介 ffmpeg 的一个功能是转换不同的音频格式，其它简介请至http://ffmpeg.org/ linux...版本：http://www.ffmpeg.org/download.html#build-linux linux 静态编译版本：https://www.johnvansickle.com/ffmpeg...AMR-NB (Adaptive Multi-Rate NarrowBand) DEA.L. amr_wb AMR-WB (Adaptive Multi-Rate...音频 ：全称是：Adaptive Multi-Rate，自适应多速率，是一种音频编码文件格式，专用于有效地压缩语音频率。
步骤5：语音文件准备 目前，百度语音识别支持pcm、wav、amr三种语音文件格式（实际wav和amr都会在云端被转换成pcm），录音文件时长不超过60s，文件大小不超过10MB。...我们可以自己录制一段语音，利用format factory等软件转成上述三种文件格式，但后面测试效果不是太好，会报错提示语音质量不高，这点可能是百度语音需要持续改进的地方。...可利用官方提供的测试文件，具体下载位置为http://ai.baidu.com/docs#/ASR-API/top ，在其中找到“16k采样率pcm文件样例下载”、“16k 采样率wav文件样例下载”、“ 16k采样率amr...在“SDK下载”页面中，虽然提供了“语音REST API示例代码”，但里面目前只提供了bash-shell、java、linux-c、php等语言的代码，并没有提供python代码。...'pcm', 16000, { 'dev_pid': '1536',}) 其中，client.asr()函数第一位是文件地址，我们用的样本是“16k采样率pcm文件样例下载”的样本；第二位是样本文件格式
目前 Linux 支持64种信号。信号分为非实时信号(不可靠信号)和实时信号（可靠信号）两种类型，对应于 Linux 的信号值为 1-31 和 34-64。...信号实现原理 接下来我们分析一下Linux对信号处理机制的实现原理。...为了尽快让信号得到处理，Linux把信号处理过程放置在进程从内核态返回到用户态前，也就是在 ret_from_sys_call 处： // arch/i386/kernel/entry.S ENTRY...我们知道，从内核态返回到用户态时，CPU要从内核栈中找到返回到用户态的地址（就是调用系统调用的下一条代码指令地址），Linux为了先让信号处理程序执行，所以就需要把这个返回地址修改为信号处理程序的入口，...Linux的做法就是在用户态栈空间构建一个 Frame（帧）（我也不知道为什么要这样叫），构建这个帧的目的就是为了执行完信号处理程序后返回到内核态，并恢复原来内核栈的内容。
中断处理 - 上半部（硬中断） 由于 APIC中断控制器 有点小复杂，所以本文主要通过 8259A中断控制器 来介绍Linux对中断的处理过程。...鉴于这个原因，Linux把中断处理分为两个部分，上半部 和 下半部，上半部 在前面已经介绍过，接下来就介绍一下 下半部 的执行。...Linux在系统初始化时注册了两种softirq处理函数，分别为 TASKLET_SOFTIRQ 和 HI_SOFTIRQ： void __init softirq_init() { ......Linux通过 __softirq_active 这个字段得知哪种softirq需要执行（只需要把对应位设置为1）。...在Linux内核中有两种tasklet，一种是高优先级tasklet，一种是普通tasklet。
d -b s -a nothing -b nothing ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 当出现双波折线-- shell就会停止处理选项
md5文件：确保下载的文件和公司的文件是否相同 md5验证解题思路：第一列代码和第二列文件分开处理less -NS Data/md5.txt |cut -f 1less -NS Data/md5.txt
需要特别注意的是，在下面的方法中，amrnb和amrwb的安装到make环节会请求3gp的一个网址，一般是请求不到的，可以用crtl+c取消他的进程，并且这两个不需要也是可以转换格式的 接到需求要在Linux...环境下将amr转换为mp3，windows下直接使用第三方jar包封装的exe方法即可，但不支持Linux，上网爬完资料说是用ffmpeg加上amr插件可以实现，根据教程尝试了一下： 1....opencore-amr/opencore-amr-0.1.3.tar.gz tar -xzvf opencore-amr-0.1.3.tar.gz cd opencore-amr-0.1.3 ....其官方网址为：http://www.ffmpeg.org 最后，部分内容参照http://linux.it.Net.cn/e/Linuxit/2014/0828/3980.html 二、使用ffmpeg...转换为2.mp3 三、使用php来执行linux指令ffmpeg 对文件的转换当然不能是自己不停的去服务器里面运行linux指令的，所以我们采用php执行linux指令的办法来处理amr文件 使用exec
无论kill -9还是直接把系统中nanoWatch所对应的进程文件删除，一样会定时重启。
最近在研究异步消息处理, 突然想起linux内核的中断处理, 里面由始至终都贯穿着”重要的事马上做, 不重要的事推后做”的异步处理思想....正在处理同一中断的那个CPU完成一次处理后, 会再次检查”触发”标记, 如果设置, 则再次触发处理过程. 于是, 中断的处理是一个循环过程, 每次循环调用handle_IRQ_event来处理中断....中断处理的这几个阶段中不能调用可能导致睡眠的函数(包括分配内存); 对于第一个问题, 较新的linux内核增加了ksoftirqd内核线程, 如果持续处理的softirq超过一定数量, 则结束中断处理过程...据说在montavista(一种嵌入式实时linux)中, 将内核的中断机制做了修改. (某些中断的)中断处理过程被赋予了task结构, 能够被内核调度. 解决了上述两个问题....工作队列 linux基线版本的内核在解决上述问题上, 提供了workqueue机制.
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