一、sam/bam 文件介绍 SAM 文件格式(Sequence Alignment Map Format)是高通量测序分析当中最重要的文件格式之一。...page=SAM 二、利用 stools 处理 Sam 文件 比对得到 sam 之后,一般无法直接使用,绝大部分的软件都需要使用 bam 格式。...能够处理 sam 格式的软件有很多,例如 samtools,bamtools,picardtools 等。...sam/bam 文件处理 samtools 顾名思义,是处理 sam 格式的工具合集。
fasta pic1 图片 fastq pic2 图片 gff pic3,4 图片 图片 gtf pic5,6 图片 图片 按列隔开 column -t | l...
接到需求要在Linux环境下将amr转换为mp3,windows下直接使用第三方jar包封装的exe方法即可,但不支持Linux,上网爬完资料说是用ffmpeg加上amr插件可以实现,根据教程尝试了一下.../configure make make install #amr支持 wget http://downloads.sourceforge.net/project/opencore-amr.../opencore-amr/opencore-amr-0.1.3.tar.gz tar -xzvf opencore-amr-0.1.3.tar.gz cd opencore-amr-0.1.3...ldconfig 3.使用方法 ffmpeg -i 1.mp3 -ac 1 -ar 8000 1.amr #MP3转换AMR ffmpeg -i 1.amr 1.mp3....0 (0x00002ab7c100b000) libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x00002ab7c1125000) /lib64/ld-linux-x86
RIFF file format RIFF全称为资源互换文件格式(Resources Interchange File Format),是Windows下大部分多媒体文件遵循的一种文件结构。...---- WAV WAV 是Microsoft开发的一种音频文件格式,它符合上面提到的RIFF文件格式标准,可以看作是RIFF文件的一个具体实例。...头部的SIZE为固定的44, 通常对WAV音频进行处理时,会直接写死这个头部的Offset。 排查一次WAV处理中的杂音情况 但是在实际处理的过程中,遇到了下面这样的WAV HEADER。...channels, bitNum); //删除临时文件 new File(tempOutPcmPath).delete(); } 参考 RIFF和WAVE音频文件格式...WAV文件格式详解 wav文件格式分析与详解
概述 WAV文件格式是Microsoft的RIFF规范的一个子集,用于存储多媒体文件。...如果对此概念不是很了解,可以查看此文章: Linux音频驱动-声音采集过程 .ByteRate: 每秒所需的字节数。
第二层标签也可以有多个标签(允许重复),此时第二层标签作为Excel的WorkSheet,第三层标签及其嵌套作为一行数据) # # 由于openpyxl默认为Excel的xlsx格式,所以本脚本的所有Excel文件格式都为...我遇到有报错: running bdist_wheel running build running build_py creating build creating build/lib.linux-x86..._64-3.5 copying pytinyxml2.py -> build/lib.linux-x86_64-3.5 running build_ext building '_pytinyxml2...第二层标签也可以有多个标签(允许重复),此时第二层标签作为Excel的WorkSheet,第三层标签及其嵌套作为一行数据) # # 由于openpyxl默认为Excel的xlsx格式,所以本脚本的所有Excel文件格式都为...= os.path.join(root, name) target = basename + "1" + ".xml" print("处理
正文 处理原始scRNA-seq数据 3.3 文件格式 3.3.1 FastQC FastQ是您将遇到的最原始形式的scRNASeq数据。...FastQ文件的格式如下: >ReadID READ SEQUENCE + SEQUENCING QUALITY SCORES 3.3.2 BAM BAM文件格式以标准且有效的方式存储比对过的...当/如果要量化内含子reads时,您可能还需要更改gtf文件以处理内含子中的重复元素。任何脚本语言甚至“awk”或一些文本编辑器都可以用来相对有效地完成这项任务,但它们超出了本课程的范围。
FFmpeg内置了aac音频格式,在《FFmpeg开发实战:从零基础到短视频上线》一书的“5.2.2 Linux环境集成mp3lame”又介绍了如何给FFmpeg集成mp3格式,常见的音频文件除了这两种之外...因此要先安装编译这三个库,再让FFmpeg开启ogg和amr支持,在Linux环境的操作过程包含四个步骤:安装libogg、安装libvorbis、安装opencore-amr、重新编译FFmpeg,分别说明如下...make install3、安装opencore-amropencore-amr是AMR音频的编解码库,支持对AMR-NB和AMR-WB格式的音频进行编解码,它的安装步骤说明如下。...tar zxvf opencore-amr-0.1.6.tar.gzcd opencore-amr-0.1.6(2)进入解压后的opencore-amr目录,运行下面命令配置opencore-amr。....FFmpeg的Linux环境完整编译过程参见《FFmpeg开发实战:从零基础到短视频上线》一书的“1.2.3 自行编译与安装FFmpeg”,详细的启用步骤说明如下。
3GP是一种类似MP4文件格式,广泛应用于手机视频的一种文件格式,3GP是MP4格式的一种简化版本,减少了储存空间和较低的频宽需求。....amr 格式的苹果这边也是无法播放的。 mpeg_4 输出格式的文件苹果这边也是无法播放的。...Snip20161207_2.png 安卓方不做处理,iOS端 Wav 转 amr 给安卓使用,把安卓的amr 转化为 wav 给自己使用 由于安卓那边的录音默认的保存格式就是 amr,而苹果这边也可以把音频文件输出为...wav格式进行保存,所有只要 iOS端 Wav文件 转 amr 格式给安卓使用,把安卓的amr 文件转化为 wav格式 给自己使用即可解决iOS与Android的音频文件互通问题。...关于wav和amr 格式互转,可以参考这个dome,喜欢请 star一下
可选格式 ios android做音频相关的开发时可选用的格式有 mp3,speex,aac,amr,ilbc 已知应用 amr:微信 evemote speex:米聊 文件格式大小 mp3>aac>...amr/ilbc>speex 各个格式简介 amr:生成格式相对较小,Android原生支持,ios可用第三方库进行编码解码 speex:生成文件最小,Android、ios均需要用第三方库进行编码解码...,支持声音的降噪等处理 aac:生成文件相对较大,Android,ios均支持,声音质量较好,比mp3文件小 ilbc:生成文件较小,ios 4.3以上支持,Android早期不支持可用第三方库 mp3...:相比文件最大,比较流行的格式 个人推荐 相比下来,我还是比较推荐用amr格式,网上的教程多,又不像speex一样需要双方都编码解码,生成的文件也较小,比较适合做语音通话
Linux_生物信息学常见文件格式• fastafasta:一种基于文本用于表示核酸序列或多肽序列的格式。
语音识别仅支持以下格式 :pcm(不压缩)、wav(不压缩,pcm编码)、amr(有损压缩格式);8k/16k 采样率 16bit 位深的单声道。即: pcm wav amr 格式三选一。...16bits // 256 kb/s = 32KB/s = 32B/ms ffmpeg 使用说明 简介 ffmpeg 的一个功能是转换不同的音频格式,其它简介请至http://ffmpeg.org/ linux...版本:http://www.ffmpeg.org/download.html#build-linux linux 静态编译版本:https://www.johnvansickle.com/ffmpeg...AMR-NB (Adaptive Multi-Rate NarrowBand) DEA.L. amr_wb AMR-WB (Adaptive Multi-Rate...音频 :全称是:Adaptive Multi-Rate,自适应多速率,是一种音频编码文件格式,专用于有效地压缩语音频率。
步骤5:语音文件准备 目前,百度语音识别支持pcm、wav、amr三种语音文件格式(实际wav和amr都会在云端被转换成pcm),录音文件时长不超过60s,文件大小不超过10MB。...我们可以自己录制一段语音,利用format factory等软件转成上述三种文件格式,但后面测试效果不是太好,会报错提示语音质量不高,这点可能是百度语音需要持续改进的地方。...可利用官方提供的测试文件,具体下载位置为http://ai.baidu.com/docs#/ASR-API/top ,在其中找到“16k采样率pcm文件样例下载”、“16k 采样率wav文件样例下载”、“ 16k采样率amr...在“SDK下载”页面中,虽然提供了“语音REST API示例代码”,但里面目前只提供了bash-shell、java、linux-c、php等语言的代码,并没有提供python代码。...'pcm', 16000, { 'dev_pid': '1536',}) 其中,client.asr()函数第一位是文件地址,我们用的样本是“16k采样率pcm文件样例下载”的样本;第二位是样本文件格式
目前 Linux 支持64种信号。信号分为非实时信号(不可靠信号)和实时信号(可靠信号)两种类型,对应于 Linux 的信号值为 1-31 和 34-64。...信号实现原理 接下来我们分析一下Linux对信号处理机制的实现原理。...为了尽快让信号得到处理,Linux把信号处理过程放置在进程从内核态返回到用户态前,也就是在 ret_from_sys_call 处: // arch/i386/kernel/entry.S ENTRY...我们知道,从内核态返回到用户态时,CPU要从内核栈中找到返回到用户态的地址(就是调用系统调用的下一条代码指令地址),Linux为了先让信号处理程序执行,所以就需要把这个返回地址修改为信号处理程序的入口,...Linux的做法就是在用户态栈空间构建一个 Frame(帧)(我也不知道为什么要这样叫),构建这个帧的目的就是为了执行完信号处理程序后返回到内核态,并恢复原来内核栈的内容。
中断处理 - 上半部(硬中断) 由于 APIC中断控制器 有点小复杂,所以本文主要通过 8259A中断控制器 来介绍Linux对中断的处理过程。...鉴于这个原因,Linux把中断处理分为两个部分,上半部 和 下半部,上半部 在前面已经介绍过,接下来就介绍一下 下半部 的执行。...Linux在系统初始化时注册了两种softirq处理函数,分别为 TASKLET_SOFTIRQ 和 HI_SOFTIRQ: void __init softirq_init() { ......Linux通过 __softirq_active 这个字段得知哪种softirq需要执行(只需要把对应位设置为1)。...在Linux内核中有两种tasklet,一种是高优先级tasklet,一种是普通tasklet。
d -b s -a nothing -b nothing ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 当出现双波折线-- shell就会停止处理选项
md5文件:确保下载的文件和公司的文件是否相同 md5验证解题思路:第一列代码和第二列文件分开处理less -NS Data/md5.txt |cut -f 1less -NS Data/md5.txt
需要特别注意的是,在下面的方法中,amrnb和amrwb的安装到make环节会请求3gp的一个网址,一般是请求不到的,可以用crtl+c取消他的进程,并且这两个不需要也是可以转换格式的 接到需求要在Linux...环境下将amr转换为mp3,windows下直接使用第三方jar包封装的exe方法即可,但不支持Linux,上网爬完资料说是用ffmpeg加上amr插件可以实现,根据教程尝试了一下: 1....opencore-amr/opencore-amr-0.1.3.tar.gz tar -xzvf opencore-amr-0.1.3.tar.gz cd opencore-amr-0.1.3 ....其官方网址为:http://www.ffmpeg.org 最后,部分内容参照http://linux.it.Net.cn/e/Linuxit/2014/0828/3980.html 二、使用ffmpeg...转换为2.mp3 三、使用php来执行linux指令ffmpeg 对文件的转换当然不能是自己不停的去服务器里面运行linux指令的,所以我们采用php执行linux指令的办法来处理amr文件 使用exec
无论kill -9还是直接把系统中nanoWatch所对应的进程文件删除,一样会定时重启。
最近在研究异步消息处理, 突然想起linux内核的中断处理, 里面由始至终都贯穿着”重要的事马上做, 不重要的事推后做”的异步处理思想....正在处理同一中断的那个CPU完成一次处理后, 会再次检查”触发”标记, 如果设置, 则再次触发处理过程. 于是, 中断的处理是一个循环过程, 每次循环调用handle_IRQ_event来处理中断....中断处理的这几个阶段中不能调用可能导致睡眠的函数(包括分配内存); 对于第一个问题, 较新的linux内核增加了ksoftirqd内核线程, 如果持续处理的softirq超过一定数量, 则结束中断处理过程...据说在montavista(一种嵌入式实时linux)中, 将内核的中断机制做了修改. (某些中断的)中断处理过程被赋予了task结构, 能够被内核调度. 解决了上述两个问题....工作队列 linux基线版本的内核在解决上述问题上, 提供了workqueue机制.
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