samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具软件，能够对比对文件进行二进制查看、格式转换、排序及合并等，结合sam格式中的flag、tag等信息，还可以完成比对结果的统计汇总，是处理sam和bam...---- 1.下载安装包 http://www.htslib.org/download/ 2....安装依赖 yum install bzip2-devel ncurses-libs ncurses-devel xz-devel zlib-devel 3.编译安装 tar xvf samtools-1.9...samtools常用命令详解 1. view view命令的主要功能是：将sam文件转换成bam文件；然后对bam文件进行各种操作，比如数据的排序(不属于本命令的功能)和提取(这些操作是对bam文件进行的
文章目录 20个linux常用命令 1. ls：列出文件list 2. cd：切换目录change directory 3. cp：复制copy 4. mv：移动move 5. rm：移除，删除remove...20个linux常用命令 1. ls：列出文件list List列出当前路径下的文件与文件夹。
Linux(UNIX)命令的格式命令[选项][参数]1.命令：告诉Linux(UNIX)做什么2.选项：说明命令运行的方式，以“-”字符开始3.参数：说明命令影响的是什么简单常用的命令：whoami ~...列出目前登陆Linux系统所使用的用户名who am i ~ 除了用户名，还显示登陆的终端、当前的日期和时间以及所使用的计算机的IP地址who ~ 显示的内容与who am i 命令相同，但还包括了系统上工作的其他用户...cal ~ 显示某月的日历cal 8 2008：列出2008年8月的日历clear ~ 清除终端窗口中的显示su ~ 从一个用户切换到另一个用户 例如：$ su -rootpass ~ 修改用户的密码及查看密码的状态器
1 Lua安装 首先我们准备一个linux虚拟机来安装Lua，在linux系统中按照如下步骤进行安装： curl -R -O http://www.lua.org/ftp/lua-5.3.5.tar.gz...tar xf lua-5.3.5.tar.gz cd lua-5.3.5 make linux test 出现如下界面，表示安装成功： 版本查看：lua -v 我们可以发现，Lua版本还是原来系统自带的版本
安装windows版本mysql只是为本地代码调试，不建议用于生产。觉得步骤麻烦也可以直接下载集成环境（如xampp），一键安装即可用。...之前本地测试都用一键安装，今天换个方法玩玩，安装步骤如下： mysql安装 直接下载归档压缩包即可，解压到你的目录，可不用下载.msi格式的： 下载地址：https://downloads.mysql.com...winx64 [mysql] # 设置mysql客户端默认字符集 default-character-set=utf8 [mysqld] #设置33060端口 port = 33060 # 设置mysql的安装目录...方法二： 选中目录”data“，然后按住ctrl+shift右击”在此处打开命令窗口“ 执行初始化：mysqld --initialize-insecure --user=mysql 再执行安装
本节课我们来学习下linux下的软件安装，以及apache nginx mysql php vsftpd的安装 linux软件常用安装有两种，一种是安装包 centos yum rpm，一种是源码编译...rpm –i php.rpm rpm –ivh php.rpm rpm –Uvh php.rpm 升级最新安装 rpm参数 参数说明 -i 安装软件 ...-t 测试安装，不是真的安装 -p 显示安装进度 -f 忽略任何错误 -U 升级安装 -v 检测套件是否正确安装...-h或--hash：套件安装时列出标记； 2.卸载 rpm –e php 三、源码安装卸载 1.编译安装 wget php.zip unizp php.zip cd.../configure make && make install 2.卸载 cd php make clean; make uninstall; 四、安装常用服务器软件 1.安装php
[更详细的操作请参阅man page,和账号管理篇] 3.查看命令 ls -l 显示文件列表 ls -al -a显示所有档案及目录(ls内定将档案名或目录名称开头为...在其文件名称后紧跟与它连接的文件路径及名称 file 命令通过探测文件内容判断文件类型 4.建立文件和目录 touch 1.txt cat > 2.txt (用定向符创建文件，填写内容后，按...rpm包安装: rpm -ivh xxx.rpm 安装rpm包 rpm -qa --last | less 根据安装日期显示已经安装的包 rpm -qa |grep mysql...-i 查询系统是否安装mysql包(-i,忽略大小写) rpm -e 删除安装的软件包 rpm -e mysql* --nodpes 强制删除相关的软件包 rpm...注:源码包安装，一般先将文件解压，安装过程大致上面几步，具体说明一般见解压后目录里的(INSTALL,READEME说明.)
cat命令 tac命令 nl命令 more命令 less命令 head命令 tail命令 Linux-文件操作与目录管理 在Linux中,一切皆文件，复习Linux基础知识过程中总结了常用的文件操作命令.../mnt目录:临时挂载临时存储设备的目录 /opt目录:下载目录，一般是给第三方厂家开发的程序的安装目录，一般用不了 /media目录：用于挂载可移动设备的临时目录。.../etc目录：yum/rpm安装的软件配置文件所在的目录。.../usr目录：安装除操作系统本身外的一些应用程序或组件的目录，一般可以认为是linux系统上安装的应用程序默认都安装在此目录中 3.处理目录常用的命令 命令如下： 命令 功能 ls...列出目录及文件名 cd 切换目录 pwd 显示当前所在的目录 mkdir 创建一个新的目录 rmdir 删除一个空的目录 cp 复制文件或目录 rm 删除文件或目录 mv 移动文件与目录
一、磁盘操作 1. ls命令 “ls”即 list 的缩写，通过 ls 命令可以查看 linux 目录下包含的文件，以及查看文件权限(包括目录、文件夹、文件权限)、查看目录信息等。...常用参数： -a 列出目录所有文件，包含以.开始的隐藏文件 -A 列出除.及..的其它文件 -r 反序排列 -t 以文件修改时间排序 -S 以文件大小排序 -h 以易读大小显示 -l 除了文件名之外...常用参数： -R： 递归处理，将指定目录下的所有文件及子目录一并处理。 -v： 设置文件或目录版本。 -V： 显示指令执行过程。 +： 开启文件或目录的该项属性。...-r 递归删除，主要用于删除目录，可删除指定目录及包含的所有内容，包括所有的子目录和文件。...-d 用于删除目录 应用： 删除任何 .log 文件，删除前逐一询问确认 rm -i *.log 强制删除 abc 子目录及子目录中所有档案删除，删除前不询问 rm -rf abc 7.
(4) tree命令:tree命令用于以树状图的形式列出目录内容及结构，输入该命令后按回车键执行即可。未完待续，下期再见。
现场环境 如果是Linux系统的话，见过最多的是CentOS ，Linux是全命令界面的， 如果是Windows系统的话，一般是Windows server 常见应急问题 大多数应急常见的问题都是挖矿，...或者是被植入菠菜 小部分是中了勒索病毒，如果是勒索病毒的话，看看360、腾讯有没有什么 排查思路及方法 本节将讲解一些基本的流程，以及一些常用的命令。...查看有没有奇怪进程(ps) 命令:ps -aef | grep inetd grep 是搜索命令 inetd 程序是一个Linux守护进程. 图片 6....uniq 命令用于检查及删除文本文件中重复出现的行列，一般与 sort 命令结合使用。 图片 7....检测系统守护进程(ls) 命令:ls /etc/crontab 图片 任务及用户活动排查命令 说明：机器使用过程中难免会留下一些痕迹 1.
(1) touch命令：touch命令用于创建空白文件或设置文件的时间，语法格式为“touch [参数] 文件名称”。
前提条件 在Linux上安装Docker要求内核大于3.1，另外OpenVZ虚拟化不支持Docker 查看Linux内核方法如下： #查看Linux内核版本 uanme -r 使用virt-what查看虚拟化架构...#查看虚拟化架构 virt-what 请先确保您的Linux内核大于3.1，并且不是OpenVZ虚拟化架构，下面开始进行安装Docker CentOS 7安装Docker 先卸载旧版Docker sudo...新建一个文件/etc/docker/daemon.json添加以下内容： { "registry-mirrors": ["http://hub-mirror.c.163.com"] } Docker常用命令...：docker images 删除某个镜像：docker rm 总结 以上只是简单的总结了Docker的安装和常用命令，实际过程中可能遇到其它问题，仅供各位参考，更多说明建议参考Docker...此文部分内容参考了：https://docs.docker.com/install/linux/docker-ce/debian/
开始安装： 1：下载 composer 包： curl -sS https://getcomposer.org/installer | php 复制代码 报错内容： Some settings on your...复制代码 报错的原因是我 php 安装了 suhosin 扩展，解决方法，报错中已给出，就是在 php.ini 文件中添加 suhosin.executor.include.whitelist = phar...复制代码 2：安装 Composer mv composer.phar /usr/local/bin/composer 复制代码 3：查看安装 Composer 是否成功 composer -v 复制代码...安装和更新命令所在的目录是不同的，更新必须在你的应用根目录下面执行 执行 composer dump-autoload 复制代码 报错 解决方式： 核对项目中的供应商文件夹。...composer clearcache 全局更新编辑器以使其平滑 composer global update 然后在项目中重新安装。
cd命令，用于切换当前目录，它的参数是要切换到的目录的路径，可以是绝对路径，也可以是相对路径。
]: *** [test] Error 1 make[1]: Leaving directory `/root/redis-3.2.0/src' make: *** [test] Error 2 我们安装一下...编译完成后会在src文件夹中生成redis-server，redis-benchmark，redis-cli 新建一个自己的文件夹，将上面的文件放入其中，并且将redis安装包解压目录下的redis.conf...则安装成功，但是这样子每次运行后不能关闭命令窗口，不然进程就会断掉。.../bin/sh #chkconfig: 2345 80 90 # Simple Redis init.d script conceived to work on Linux systems # as it...redis/redis.conf /etc/redis/6379.conf 执行注册chkconfig --add redis便不会报错了 启动服务service redis start Python 安装
服务器操作系统的优选CentOS Linux安装 安装虚拟机，通过虚拟机安装Linux操作系统 什么是虚拟机 安装虚拟机 至少预留20G内存 将杀毒软件关闭，关闭防火墙。...将这些服务设置为自动启动 打开虚拟机，新建 切换鼠标键盘：Ctrl+Alt Linux系统，超级管理员：root ，安装时设置密码， 安装成功，并登陆成功!...CRT远程连接Linux 鼠标右键： 复制粘贴 文件上传：alt+p 上传窗口 Linux：/root 上传的文件全部被放在了root目录中 常用命令 磁盘管理命令 Linux命令中参数，一般都是无序的...help --version 文件或目录（remove）命令 删除文件或目录 -f或-force 强制删除文件或目录 -r或-R或--recursive 递归处理，将制定目录下的所有文件及子目录一并处理...及执行ps命令的那个时刻进程信息。
前言 使用Linux系统，很有必要熟悉一些常用的命令。本文收集整理一些常用的用于检测服务器的配置和硬件信息的命令，需要时可查阅。...包括：操作系统、CPU、内存、硬盘分区、系统时间、负载、网络相关、进程、用户、开关机、启动等方面，适用于主流Linux操作系统比如centos、ubuntu、debian等 操作系统版本 $ uname...系发行版版本命令 $ cat /etc/redhat-release # 查看 CentOS RedHat 系发行版版本命令 $ cat /etc/os-release # 查看通用 Linux...# 查看硬盘分区以及占用情况命令 $ du -sh [指定路径] # 查看指定路径文件或目录大小命令 $ fdisk -l # 查看硬盘大小，数量，类型命令 查看系统时间负载及相关...ip 情况命令（需要系统安装了 net-tools 工具） $ ip addr show # 功能同上，新的 Linux 发行版已经逐渐用 ip 命令替代 ifconfig 相关功能命令 $
常用命令及作用 pwd # 打印路径 ls # 查看目录 常用参数： -l 查看文件或目录的详细信息 cd...拷贝文件或目录 常用参数： - cat # 查看文件中的内容 rm # 删除 常用参数： -r 将目录及以下之档案亦逐一删除...# 查看硬件设备 mount # 挂载硬件设备 umount # 卸载硬件设备 df # 显示目前在 Linux...# 查看默认仓库 yum clean all # 清除yum缓存 yum list # 查看仓库中所有的包 yum install -y 包名称 # 安装包...yum romove -y 包名称 # 卸载包 rpm -ivh name.rpm # 安装rpm包 ps -axuf # 以树状静态显示进程 top
可以使用push将本地库的代码推送到远程库 2、Git下载及安装 1、下载地址：Git官网 2、安装时除了安装路径以及此页面外其余均保持默认即可 系统建议是选择第二个，第二个意味着我们可以在第三方软件以及...常用命令 1、使用前配置（git config --global xx） git config --global user.name 用户名 git config --global user.email...Git 首次安装必须设置一下用户签名，否则无法提交代码。 想更改这些信息时，可以直接编辑设置文件“～/.gitconfig”。这里设置的姓名和邮箱地址会用在Git的提交日志中。...git init 建议直接从需要操作的目录中进入git bash 设置查看文件夹选项->显示隐藏的文件夹，此时可以在文件夹下看到.git文件夹 注：git bash中的命令是和linux...commit" hello.txt git reflog git是按行维护文件的，修改了其中的一行就会显示一行被修改（把修改之前的删掉，插入修改之后的）: 此时指针指向第二个版本 7、历史版本及版本穿梭
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