r与python差异比较大的一个地方就是，python的机器学习算法集中程度比较高，比如sklearn，就集成了很多的算法，而R语言更多时候需要一个包一个包去了解，比较费时费力，对于python转过来的朋友非常不友好...，抽空整理了工作中常用的R包如下： 常用检验函数： ?...算法的决策树 C50包C5.0函数，基于C5.0算法的决策树 e1071包naiveBayes函数，贝叶斯分类器算法 klaR包NaiveBayes函数，贝叶斯分类器算分 MASS包lda函数，线性判别分析...zoo 时间序列数据的预处理 统计及预处理： 常用的包 Base R, nlme aov, anova 方差分析 density 密度分析 t.test, prop.test, anova, aov:...最后剩下常用的就是读入和写出了： RODBC 连接ODBC数据库接口 jsonlite 读写json文件 yaml 读写yaml文件 rmakdown写文档 knitr自动文档生成 一般业务中使用比较多的就是上面这些了，当然R里面有很多冷门的包
出版社送了一本书（R语言）给我，就是这个《R语言实战》第三版，它已经是R语言领域的“老兵”了，几乎是人手一本。 新鲜出炉的第三版，更新也很大，全面拥抱了ggplot体系。...高效开发R包 什么情况下我们需要开发R包呢 开发R包（也称为R库）是一种有效的方法，可以用来组织、共享和重用你的R代码。...软件开发：如果你正在开发一个复杂的软件应用，那么将你的代码组织成一个或多个R包可以帮助你管理你的代码的复杂性。R包提供了一种结构，可以帮助你组织你的函数、数据和文档。...借助Rstudio这样的软件工具开发R包是最方便的 RStudio是一个非常强大的工具，可以帮助你更容易地开发R包。...在开发过程中，你可能还需要添加测试，处理依赖关系，以及其他更高级的任务。但是，这些基本步骤应该能帮助你开始开发你的第一个R包。
今天继续学习R语言基础的R包使用，以R包：dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”)...#务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号 部分人可能会因为镜像的问题失败，解决方法https://mp.weixin.qq.com.../s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw 03 R包及数据准备 install.packages("dplyr") library(dplyr) test R语言基础，你应该能够入门R了，渐渐的也要自己去学会看帮助文档，去搜报错，还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗？ ?...+命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档 如果你能独立处理这些问题，那么恭喜你，你的R应该没问题啦！ 应该没问题了！！！！吧？
R包开发 创建R包基本流程： 开发工具：devtools 运行调试 + usethis 创建修改 基本流程： create_package 创建一个R包 use_r()写函数,插入roxygen注释和...；test()进行测试 check对整个包进行检查 use_readme_rmd()和build_readme()生成readme文件 开发工具： install.packages("devtools"...) -> R/*.R -> 添加R函数脚本(合并因子) usethis::use_r("fbind") fbind <- function(a, b) { factor(c(as.character...: use_package() -> `DESCRIPTION`文件添加 `Imports::forcats` use_package("forcats") R包readme说明文件：use_readme_rmd...dplyr调出 创建包：usethis::create_package(path) 工作路径最好是源码包的top-level 参考： R packages 2nd edition cheatsheet
PART1 开篇前言 本期R语言教程，暂定分为两大部分：第一部分为“R语言快速入门和数据处理”，第二部分为“R语言可视化及绘图”。...关于R和RStudio安装在这里就不再介绍了，网上有很多相关内容，如果安装过程有困难可以后台私信我。 PS.本次内容为R包安装及初识向量。 ? PART2 R包安装 问：什么是R包？...答：包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合。它们提供了种类繁多的默认函数和数据集。...（对于刚接触R的同学来说可能看起来比较抽象，但是没关系，我们会在后续的学习中慢慢了解R包的概念） 1.R包安装：第一次安装一个包，使用命令install.packages()即可。...中 2.R包载入：安装完成后，想要调用这个包中的命令、数据等信息，就需要先载入这个包，需要用到的命令为library()。
其实在本次做作业的过程中，我还犯了一个错，我把filter记错了，本来是取行的我记成取列的了，导致我的一些尝试一直报错，但是（重点来了！），老师真的一眼就看出来...
1.函数与参数 （1）形式参数与实际参数 （2）写函数的函数 2.R包（R package）介绍 R包可以理解为是多个函数的打包存放，包含函数、数据、帮助文件、描述文件等。...3.R包都在哪里 （1）CRAN网站 （2）Bioconductor （3）github 4.xxR包怎么安装 从哪里来/怎么安装 不知道从哪里来的？...安装包——加载包——使用包里的函数 ## library（）没有error 是检查是否安装成功的标准 （2）已经安装的 R包，可以用：：快速调用里面的函数 7.常见疑问 （1）提示信息 检查是否有...denied 权限问题：管理员方式重新打开Rstudio，重新运行代码 8.R包如何使用-获取帮助 （1）快速查看函数帮助文档 ？...+函数名称 （2）找R包介绍界面（直接搜） （3）Vignettes ls("package:lima") #列出一个包里都有哪些函数数据 R语言中的符号 解决问题的思维（报错时）
以上就是在R语言中进行文本文件交互的一些基本操作。请注意，这些操作可能会出现错误，例如文件不存在或者没有写入权限等，你需要确保你的代码能够正确处理这些错误。...有规则的文本文件读入 但是绝大部分情况下，我们的文本文件其实是规则的，在R语言中，有许多函数可以用来读取结构化的文本文件，如CSV文件、TSV文件或其他形式的表格数据。...在R中，你可以使用Bioconductor的ShortRead包来读取FASTQ文件，并将其转换为FASTA格式。以下是一个示例： # 首先，你需要安装Bioconductor和ShortRead包。...使用readr包读取大文件：readr包提供了一些函数，如read_csv(), read_tsv()等，这些函数比基础R函数更快，更容易处理大文件。...使用rio包简化文件读写：rio包提供了import()和export()函数，可以自动识别文件类型，简化文件读写操作。 以上就是一些在R语言中操作文件的基本原则和技巧，希望对你有所帮助。
gbm效果和randomForest相近，但是占用内存更少，且支持多核crossValidation运算。
稀疏矩阵在数据稀疏的情况下节省了空间 library(Matrix) m1 <- matrix(0, nrow = 1000, ncol = 1000) m2 ...
基础 R函数和plyr plyr包中一些有用的函数 R程序 参考资料 plyr: The split-apply-combine strategy for R 不再是循环，而是向量操作，这个包的目的是简化...R函数和plyr ?...= ddply(baseball,"year",function(df) colMeans(df[,6:9])) # contrast head(result2) head(result) plyr包中一些有用的函数...merge(baseball, first, by = "id", all.x = TRUE)) system.time(b3 <- join(baseball, first, by = "id")) R程序...length(year))) system.time(tapply(baseball$year,baseball$id,function(x) length(x))) 参考资料 Sean Anderson 的R教程
可以制作动态交互图标，比shiny简单一些。 #Basic Usage library(manipulate) manipulate(plot(1:x), x ...
用 R 基本包 在实际的数据分析中，分析者往往需要花费大量的精力在数据的准备上，将数据转换为分析所需要的形式。遗憾的是，大多数统计学教材很少涉及这一重要问题。整理数据是统计学的任务之一。...我们开始关注 R 中最常用的数据格式——数据框的基本操作。我们将首先使用基本包处理数据框。 先加载 epiDisplay 包里的一个小型数据集 Familydata。...调入搜索路径的数据框和加载的包都会被自动读入 R，并一直存放在内存中直至它们被移出（detach( )）。 使用函数 attach( ) 虽然会在输入代码时带来一些便利，但同时也会带来一些问题。...因此，有些 R 的使用者尽量避免使用函数 attach( )，而使用函数 with( )。...例如《R 语言医学数据分析实战》推荐的做法是： 在开启一个新的分析项目时，首先使用命令 rm(list = ls( )) 从 R 工作环境中清除所有对象； 在分析过程中用函数 detach( ) 将不再需要使用的数据框从搜索路径中移出
Other functions that work with intervals include int_start, int_end, int_flip, i...
knitr可以把r代码嵌入到rmarkdown和latex中，然后编译成html等文档。 html和markdown html极为笨重，md相对简洁，并且可以很容易地转化为html。...r markdown 图片输出到html，使用svg比默认的png效果更好。...```{r bunch_o_figs_svg, fig.height=4, fig.width=8, dev='svg'} n <- 100 x <- rnorm(n) par(mfrow=c(1,2)...```{r kable} n <- 100 x <- rnorm(n) y <- 2*x + rnorm(n) out <- lm(y ~ x) library(knitr) kable(summary...::session_info() ``` make 创造可重复流程时，通常使用GNU-MAKE编译，联合bibtex，latex，r中的内容。
这个包以一种统一的规范更高效地处理数据框。dplyr 包里处理数据框的所有函数的第一个参数都是数据框名。 下面以 MASS 包里的 birthwt 数据集为例，介绍 dplyr 包里常用函数的用法。...select(birthwt, bwt, age, race, smoke) 请注意，MASS 包里有一个同名函数 select( )，如果同时加载了 dplyr 包和 MASS 包，R 会默认使用较后加载的包里的函数...为了避免混淆，我们可以使用符号 :: 特别指明使用某一个包里的函数，例如 dplyr::select( )。之后我们将会对函数 select( ) 作进一步介绍。...与 R/Rstudio 上不同，notebook 这里把它显示成了 A grouped_df: 189 × 10（而非 # A tibble: 189 x 10)，实际它仍然包含 tibble（注意其中的...tibble 是 tidyverse 系列包（包括 dplyr 包）提供的一种类似数据框的格式。
R语言是一个强大的数据分析工具，其强大之处在于有各种各样的R包帮助其实现各种各样的功能。...通常来说，R包的安装主要有四种方法，包括：1）从R语言官网上直接下载相关R包并安装；2）从Bioconductor上下载R包并安装；3）从Github上下载R包并安装；4）手动安装R包。...接下来我将和大家分享R包的具体安装： 1）首先获取下载的R包的名字，比如下载metafor这个R包，可以先在官网（https://www.r-project.org/）上找到这个包，了解一下这个包的详细内容和使用说明...2）如果所要下载的R包不在R语言官网上，那它极有可能在Bioconductor或者Github上，可以先登录Bioconductor官网（http://www.bioconductor.org/）搜索相关...3）接下来便是安装源自Github（https://github.com/）的R包了，它的步骤和安装源自Bioconductor的R包类似，需要先安装devtools包，然后用devtools包里的install_github
调出函数library() require()内置基础包basedatabase：存放数据集utils：工具函数grDevices：绘图相关graphics：R绘图函数stats：与统计相关的函数methods...：一般定义方法和类splinesstats4tcltk试例help(package"R包名称") #查看R包详情信息library(help="R包名称")ls(package:R包名称) #列出包中所有函数...data（package=R包名称）#列出包中包含的所有数据集detach(package:R包名称) #移除R包remove.package(R包名称) #卸载R包R包批量迁移installed.package...() #显示所有已安装R包
R语言安装软件包 1 打开RGui.exe，执行“`install.packages(“software name”)“`，安装成功后会提示“`The downloaded binary packages...are in …“`，给出了程序包存放路径 2 选择程序包，点击“`Install package(s) from local files…“`，选中路径里面下载好的程序包，会出现“`successfully...R是个合作计划，有许多人为之做出了贡献. 用'contributors()'来看合作者的详细情况 用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。...relaimpo"),lib = file.path("path", "to", "library")) Error in find.package(pkgs, lib) : 不存在叫‘relaimpo’这个名字的程辑包...relaimpo"),lib=file.path("path", "to", "library")) Error in find.package(pkgs, lib) : 不存在叫‘relaimpo’这个名字的程辑包
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