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Linux服务器里面安装GISTIC软件

五六年前我就写过GISTIC软件安装及使用教程,不过那个时候针对的还是SNP6.0这样的拷贝数芯片。...GISTIC软件的使用有两个难点,一是在linux下面安装matlab工作环境,二是如何制作输入文件。...c 安装MCR_Installer 因为GISTIC软件是一个MATLAB程序,在Linux环境下运行需要MCR_Installer。matlab毕竟是收费软件,而且是有界面的。...但是考虑到大多研究者用不起matlab,或者不会用,所以就用linux系统里面安装matlab运行环境来解决这个问题,我们仍然可以把人家写的matlab程序,在linux命令行下面,当做一个脚本来运行!...cd MCR_Installer unzip MCRInstaller.zip chmod 744 installer_input.txt 因为是Linux,所以使用安静模式安装软件,没有鼠标点点点的交互动画过程啦

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linux 软件安装

创建小环境:-n 指定小环境的名字 rna,并指定环境的python版本为python=3 conda create -y -n rna python=3 创建小环境成功后会出现3个done 图片 三、安装软件...图片 1.安装软件的方法: 图片 安装 conda install 出现三个done 显示安装完成 图片 2.安装特定版本 图片 3.特殊情况 图片 4.查看conda 环境中已经安装软件...conda list #基本用法 conda list fast #查看符合正则表达式的软件 conda list -n rna #查看指定环境的软件 5.删除软件 conda remove conda remove -n rna #删除指定环境里的软件 6.常用命令 图片 7.安装软件的另一种方式:用yml文件安装 • 导出当前环境: conda env export...envname > env.yml • 导入环境: conda env create -n envname --file env.yml 8.mamba 安装软件更加丝滑 #安装mamba conda

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    LINUX 安装软件

    1.4 安装软件的方法RPM(红帽软件包管理器)RPM有点像Windows系统中的控制面板,会建立统一的数据库,详细记录软件信息并能够自动分析依赖关系。...Yum软件仓库便是为了进一步降低软件安装难度和复杂度而设计的技术。Yum软件仓库可以根据用户的要求分析出所需软件包及其相关的依赖关系,然后自动从服务器下载软件包并安装到系统。...yum info 软件包名称查看软件包信息yum install 软件包名称安装软件包yum reinstall 软件包名称重新安装软件包yum update 软件包名称升级软件包yum remove...软件包名称移除软件包yum clean all清除所有仓库缓存yum check-update检查可更新的软件包yum grouplist查看系统中已经安装软件包组yum groupinstall 软件包组安装指定的软件包组...初始化进程作为Linux系统启动后的第一个正式服务,它需要完成Linux系统中相关的初始化工作,为用户提供合适的工作环境。同学们可以将初始化进程粗犷地理解成从我们按下开机键到看见系统桌面的这个过程。

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    Linux基础软件-软件安装

    讲的那些东西都算是系统自带的,但是Linux作为一个服务器操作系统,肯定是要安装运行软件来满足我们的业务需要,本章基础软件部分,将从下面几个部分来讲解: Linux基础软件-软件安装(本章节) Linux...基础软件-yum(一) Linux基础软件-yum(二) Linux基础软件-ntp Linux基础软件-chrony Linux基础软件-dns(一) Linux基础软件-dns(二) Linux基础软件...-nfs Linux基础软件-lvm Linux基础软件-Selinux&库文件&swap 前面的操作都是基于默认自带的软件,而且我们讲过很多命令,默认最小安装的情况下,都是不自带的,都需要额外安装,那我们应该如何安装这些软件呢...如果你想更新所有的软件包,只要输入 yum update即可。 无论是安装,升级,都必须是基于服务器仓库里面有这个软件才可以的,如果没有则无法安装或升级的。...这里实际上还衍生出来另外2个问题,我怎么知道我去哪里下载包(本地配置xxx.repo配置),服务器里面有些啥(yum源)。

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    linux服务器搭建之路1-安装各种软件

    由于实验室需要,准备配置新的服务器,之前一直使用windows比较多,linux比较少,于是开始重新学习linux各种环境的搭建. 1....系统选择 在选择使用centos和ubuntu上,参考了一下网上的建议,大多认为服务器上还是centos比较好一点,再加上以前实验室也是暗中的centos,所以选择安装centos. 2. centos...(EPEL (Extra Packages for Enterprise Linux)是基于Fedora的一个项目,为“红帽系”的操作系统提供额外的软件包,适用于RHEL、CentOS和Scientific...Linux.) (3).接下来去搜狗输入法Linux官网下载deb版本的软件包,注意是32bit还是64bit: (4).安装dpkg包,切换为root用户: yum -y install dpkg...,重新安装驱动,提示 anable to load the kernel module ‘nvidia.ko’ 安装命令为如下便可解决 sh NVIDIA-Linux-x86_64-390.87.run

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    Linux软件安装

    而在Linux安装软件难度高于Windows、Android、ios和windows phone下软件安装。下面我就详细讲解Linux下如何安装软件。...Linux软件安装大概可以分为如下几种: 1....源码安装 3.2 二进制安装 Linux下二进制格式的软件是指事先已经在各种平台编译安装好相关软件,然后压缩打包,在安装时只需解压或者执行安装可执行文件即可。...应用yum的好处 自动解决软件包依赖关系 方便的软件包升级 yum的缺点: 需要联网,从远程YUM源服务器上自动下载相关的软件(包括依赖的软件),然后安装到本地磁盘中。...、授权许可、安装需求、安装注意事项、安装方式等等,由于linux各个版本的差异,以及安装环境的不同,软件安装方式也不尽相同,所以在安装软件前,一定要事先阅读这个README文件,确保安装的正确性。

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    Linux软件安装(三)

    软件安装 1.1 软件安装方式 在Linux系统中,安装软件的方式主要有四种,这四种安装方式的特点如下: 安装方式 特点 二进制发布包安装 软件已经针对具体平台编译打包发布,只要解压,修改配置即可 rpm...(安装过程需要联网) 源码编译安装 软件以源码工程的形式发布,需要自己编译打包 1.2 安装JDK 上述我们介绍了Linux系统软件安装的四种形式,接下来我们就通过第一种(二进制发布包)形式来安装JDK...RPM:全称为 Red-Hat Package Manager,RPM软件包管理器,是红帽Linux用于管理和安装软件的工具。...lrzsz lrzsz 是用于在Linux系统中文件上传下载的软件。...基于RPM包管理,能够从指定的服务器自动下载RPM包并且安装,可以自动处理依赖关系,并且一次安装所有依赖的软件包,无须繁琐地一次次下载、安装安装lrzsz的步骤如下: 1).

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    Linux基础(软件安装

    Linux中,安装软件通常有三种途径:既可以使用安装包,也可以借助于APT,还可以从源码安装。他们各有特点,操作方式也不尽相同。...Linux下的软件既可以是软件安装包,就像windows一样,也可以是源码包。...而对于安装包而言,不同的Linux发行版所使用的格式不一样,比如RedHat使用的是yum格式安装包,Ubuntu则使用deb格式 以Ubuntu为例,安装软件的第一种方法,就是搜索并找到所需要的deb...但是这种办法一般不推荐使用,因为Linux软件一般都只包含最精简的代码,不会包含所依赖的库或者其他函数接口程序,这就导致我们直接安装deb包时常常会发现系统缺少它所依赖的其他库或者服务,不得已需要先安装它们...然而,有时我们需要研究、改造软件源码,在Linux世界中绝大多数的软件都遵循GPL开源条款,我们可以获取源代码并编译他们,例如我们获取了jpeg库的源码,在源码顶层目录中编译安装的三部曲如下: .

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    linux安装软件

    业界的软件标准安装有三步:configure,make,make install,下面是它们的定义: ./configure是用来检测你的安装平台的目标特征的。...make install是用来安装的,它也从Makefile中读取指令,安装到指定的位置。 建议在configure阶段指定好安装目录,比如..../configure --prefix=/usr/bin/gdb-7.10,意思是将gdb软件安装到/usr/bin/gdb-7.10下面,如果后续要卸载,可以使用make uninstall或者直接将.../usr/bin/gdb-7.10删除即可;同时如果其他机器也需要该软件,只要简单拷贝过去改下环境配置就可以用,而无需再次安装。...注意:要安装到指定位置必须执行make install命令 安装到自定义的目录后,如果需要系统在任意目录都能识别该命令,则需要在PATH环境变量中添加该路径。

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    Linux 系统上安装服务器管理软件Cockpit

    Cockpit 是一个自由开源的服务器管理软件,使得我们可以通过它好看的 Web 前端界面轻松地管理我们的 GNU/Linux 服务器,非常轻量级,Web 界面也非常简单易用。...可以轻松地添加和删除用户以及管理多台服务器。 1. 安装 Cockpit 首先,我们需要在我们基于linux服务器安装Cockpit,大部分发行版的官方软件仓库中都有可用的cockpit安装包。...这篇博文中,我们会在 Fedora 22、CentOS 7、Arch Linux、RHEL 7和ubuntu 18.04中通过它们的官方软件仓库安装 Cockpit。...CentOS / RHEL CentOS 和 RHEL 官方软件库中有可用的 Cockpit,我们只需要用 yum 管理器就可以安装。只需要以 sudo/root 权限运行下面的命令就可以安装它。...yum install cockpit Fedora 22/21 和CentOS一样,Fedora的官方软件库默认也有可用的Cockpit,我们只需要用dnf软件包管理器就可以安装Cockpit。

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    Linux服务器离线安装Mysql等软件的最佳方法

    由于特殊的专用网络环境和安全策略等方面的原因,服务器往往无法访问互联网,这时我们还需要在服务器安装软件,比如mysql、httpd。 那么如何选择安装方式最合适呢?...接下来我就介绍一下我们离线安装软件mysql的方法,以及总结的解决方案。...1、下载软件的RPM包安装 首先,我们会想到直接下载对应RPM包安装,但这种方式你无法了解RPM包之间的依赖关系,往往当你安装rpm包时,可能会提示依赖另一个rpm包,就还需要去下载这个rpm包,回头可能这个...可采用另一种思路:在可联网机器上通过yum或apt包管理工具,下载好软件相关的所有依赖rpm包,然后拿着这些包copy到离线服务器安装rpm包即可。...5、创建镜像仓库离线安装软件 基于方案四的基础上,将通过yum下载下来的rpm包做成一个仓库,将仓库copy离线服务器上,配置源为这个仓库,直接yum install命令就装上了。

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    Linux 软件安装与卸载

    Linux 的世界里,安装和卸载软件是每个使用者都需掌握的基本技能。通过这篇文章,我们将以简明易懂的语言风格,一步步引导你学会如何在 Linux安装和卸载软件。.../configure编译安装:完成配置后,接下来是编译和安装过程:# 编译make# 安装make install源代码编译的方式在 Linux 下,从源代码编译安装是一种很常见的安装方式。...Manager)是 Red Hat 系 Linux 发行版的包管理器,对于基于 RPM 的发行版(如 Fedora、CentOS 等),可以使用 rpm 命令来管理软件包。...yum groupinfo 软件包组查询指定的软件包组信息本文介绍了 Linux 下几种常见的软件安装和卸载方法,包括源代码编译安装、rpm 和 yum。...不同的安装方法有各自的特点和适用场景。理解这些基本的安装步骤和命令,可以帮助你更有效地管理和维护你的 Linux 系统。希望这篇文章能帮助你更好地掌握 Linux 软件安装与卸载。

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    Linux软件管理 - 编译安装

    Linux软件管理 - 编译安装 文本关键字:Linux软件管理、configure、make、make install 一、环境准备 很多软件下载之后是一个源码包,是不能够直接运行的,需要先进行编译安装...其他组件 在进行实际软件安装时,由于软件软件之间可能也会存在依赖和调用关系,如:在源码编写时引入了某个类库,如果我们的系统中没有相关的类库,就会编译失败,这个时候我们只要根据报错信息安装相应的缺失类库即可...-‌-prefix:指定编译安装时的目标路径,相当于自定义软件安装位置 -‌-bindir:指定二进制文件的安装位置 -‌-sbindir:指定超级二进制文件的安装位置 -‌-datadir:指定数据文件的安装位置...在make过后,其实软件已经完成了安装,会在源码解压目录中生成构建完成的文件,如:Nginx软件make后会在obj文件夹中生成如下文件: ? 4....编译安装:make install 执行最后一步:编译安装,根据configure阶段的配置,将已经生成的软件安装到指定的目录中去,可以对可执行文件定义软连接或者添加到环境变量,方便使用。

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    Linux安装软件方法总结

    相比于windows系统,Linux安装程序就比较复杂了,很多需要root用户才能安装。...gcc.gnu.org/,下载自己想要的版本的gcc安装包 上传gcc-4.1.2.tar.gz到Linux服务器任意目录,解压 解压目录执行shell命令configuration 解压目录执行shell...同一个安装包可以在任意版本的Linux进行安装。 缺点是安装的门槛较高,配置复杂,不同软件配置项目不同。安装容易失败。安装成功有时也会对原系统有破坏。...缺点是需要连接公共网络,安装的是指定服务器上的最新版本。...apt-get apt-get是一条linux命令,适用于deb包管理式的操作系统,主要用于自动从互联网的软件仓库中搜索、安装、升级、卸载软件或操作系统。 apt-get install gdb

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