在Linux中，管道使用竖线符号 | 表示，它位于两个命令之间。管道的基本语法如下：
在Linux系统中，管道（Pipeline）是一种强大的工具，它允许将一个命令的输出作为另一个命令的输入。通过管道，我们可以将多个命令串联在一起，实现数据的流动和处理。本文将详细介绍如何在Linux中使用管道将命令的输出传递给其他命令，并提供一些常见的使用示例。
下面罗列的这些基本命令，很有用，对于查询线上线下问题都非常有用的，不妨学习一下哈。
如果要在 Linux 系统上查找文件，find 命令可以轻松实现。您可以使用“查找”按名称、部分名称、日期、修改时间、大小等搜索文件。如果您知道文件位于哪个目录中，则可以在 find 命令中指定该目录。如果没有，您可以从根 （/） 目录开始搜索整个 Linux 系统。这篇wikiHow文章将教你如何在Linux中使用find命令来查找任何文件，从你下载的文件到配置文件
还有一种像Linux一样直接修改R中的相当于Linux中的.bashrc/环境文件一样的R的环境文件.Rprofile即可
正则表达式，又称规则表达式（regularexpression，RE）通过一些特殊字符的排列用于查找、替换、删除符合某个模式(规则)的文本，是一种文本文件字符串处理的标准依据（一定要与通配符区分开，通配符主要用于文件管理）。很多工具命令以及软件都支持正则表达式，例如前面介绍的vim、grep以及后续要介绍的sed、awk等。许多程序设计语言也都支持利用正则表达式进行字符串操作，例如在Perl语言中就内建了一个功能强大的正则表达式引擎。因此，正则表达式对于处理文本数据非常重要。
在Linux系统中，进程间的同步和通信是一个复杂而关键的话题。为了维护系统资源的正确访问和分配，Linux提供了多种同步机制，其中锁机制是其中之一。然而，当多个进程试图同时访问同一资源时，可能会出现死锁或竞争条件。为了有效地诊断和解决这些问题，Linux提供了lslocks命令，该命令可以显示系统上的活动锁信息，帮助系统管理员和开发者深入了解系统资源的使用情况。
win10这个商业巨头微软的最新之作，以流氓行径著称，尤其是它的自动更新最受诟病。用户无权选择是否下载和安装更新。你选择不更新，他就在后台下载，下次开机自动安装。何况，这些更新有的没必要，有的装上反而起副作用。我之前就被装上的更新弄坏网卡驱动，重装一次系统；去年3月大范围爆发的更新bug，导致众多用户USB驱动坏掉，又重装一次系统。再后来，我知道了更新的危害，就每天手动删除那些更新安装包，结果有一次它后台下载吃掉我3GB流量。看来，强行阻止win10自动更新已成必要。
之前写的AutoBan 1.0脚本在写好后的很长一段时间里都没什么人来爆破我的8022端口，以至于我觉得这种情况将一直持续下去。直到昨天晚上0点的时候，那时候我正在看奥运会回放，苏炳添的9.83创造了历史让我振奋不已，振奋之余 我向往常一样查看了一下frp的日志文件，让我吃惊的事情发生了。
话说孔乙己时常混迹于磁共振基础班，处理功能数据算是得心应手了。虽然时常拖欠学费，但不出几月，定然还上，从粉板上拭去了孔乙己的名字。因此，DTI班第一天，当他悄悄溜进来的时候，掌柜并未在意。 彼时，寿镜
计算PRS值时有两个关键点，第一个是SNP位点的筛选，在上述公式中，Pt表示的是GWAS结果中P值的阈值，挑选P值小于该阈值的SNP位点进行PRS的计算；第二个是SNP位点对表型效应的度量，这里用β表示，可以是OR值或者回归系数beta值。
随着 SonarQube[1] 上的项目越来越多，我们希望能够对这些项目按照一定的指标进行筛选，比如：
上一篇博客，介绍了Linux 抓取网页的实例，其中在抓取google play国外网页时，需要用到代理服务器
目前，一个上市的药物平均需要花费20-30亿美元，并且需要10年左右的研发时间。大部分经费都花费在了昂贵且耗时的湿实验部分，初始Hits阳性率太低以及（临床前）阶段的高损耗率。使用基于结构的虚拟筛选，Hits质量随着筛选化合物的数量而提高。尽管存在大量的化合物数据库，但是缺乏有效的灵活的方式使用计算机集群进行大规模的SBDD的手段。本文介绍VirtualFlow，这是一个高度自动化的开源平台，可以有效的准备化合物库并进行超大规模的虚拟筛选。VirtualFlow能够使用各种强大对接程序。本文准备了目前已知的最大的免费使用的配体库，配体库包含了超过14亿个可商业购买的分子。VirtualFlow可以探索广阔的化学空间，并可以准确的识别与目标蛋白具有高亲和力的分子。
Wireshark的作者Gerald Combs，于1998年由于在校项目需求而开发，早期名为Ethereal。Wireshark是世界上最重要和最广泛使用的网络协议分析仪。
Gene Set Enrichment Analysis (GSEA/基因集富集分析), 是一种生物信息学的计算方法，用于确定是否存在这样一个“基因集”，能在两个生物学状态中显示出显著的一致性的差异。表达谱数据里的基因数目众多，我们需要对基因进行功能注释，看哪些基因是属于同一通路，以及该通路的上调、下调情况，这就是富集分析了。
在服务器接口测试中，我们经常会和各种日志打交道。一旦测试时服务端出现了问题，而单凭服务端的日志又不能发现问题原因的时候，往往开发要向我们测试人员询问客户端这边的情况，希望看看我们能不能提供一些有用信息，如错误返回内容，错误发生时间，哪些用例会出现问题等等。这时就需要我们来查找测试时的日志，从中筛选出有用的信息。
之前写 datamash 的使用教程 linux 极简统计分析工具 datamash 必看教程，收到了一位读者的私信，内容如上。
LeDock是苏黎世大学Zhao HongTao在博士期间开发的一款分子对接软件，专为快速准确地将小分子灵活对接到蛋白质而设计。
小编最近在研究Linux下的脚本编写，其中很多环节涉及到和多个命令组合使用，如：自动输入系统密码等；而在Linux下最常用的就是管道和重定向。
在生信分析人员如何系统入门R(2019更新版) 里面，我提到过Linux基本上几十年都没有怎么变动过基础知识的，哪怕你现在搜索到十几年前的Linux教学视频，也不会觉得尴尬。而且Linux属于IT工程师必备技能，IT的发展程度远超于我们，再加上各种马哥鸟叔，还有黑马训练营公开30天完整教学视频，按照道理我是没有必要在他们IT专业人士面前班门弄虎的， 毕竟他们随便拿几个偏门知识点就可以问倒我了！不过我们生信技能树的特色是主打生物信息学方向技能建设，而它作为一个典型的教交叉学科，想在此领域成为一个专业靠谱的生信工程师，我们实在是做不到在任何一个非核心知识点投入过多的时间和精力。
有多种方式可以从网页中提取我们需要的信息，既可以通过正则表达式，也可以使用BeautifulSoup模块。除此之外，xpath表达式也是一种常见用法。
1.在显示方面，使用者可以设定欲显示的格式，格式设定为一个加号后接数个标记，其中常用的标记列表如下：
在前面，介绍了一种进程间的通信方式：使用信号，我们创建通知事件，并通过它引起响应，但传递的信息只是一个信号值。这里将介绍另一种进程间通信的方式——匿名管道，通过它进程间可以交换更多有用的数据。
今天，突然找不到vm 的ip 了，但是可以从网卡状态上看到其 mac 地址，并且确定主机是启动状态，网络状态良好（后来发现因为子网掩码的问题，导致虚拟机和网关之间不通信，从而导致其他网络的主机不能访问，这个是另一个问题了。）
当拿到一条未知序列时，可以直接与 ncbi nt 库或者 nr 库进行 blast 比对，鉴定未知序列。
在Linux世界里，日期与时间不仅是系统运行的脉络，更是众多命令行操作的核心要素。无论是追踪日志、管理备份，还是安排定时任务，对日期和时间的精准操控都是提升工作效率的关键。本期文章将揭示Linux指令中与日期相关的实用技巧和魔法般的组合，助您轻松驾驭时间，让命令行工作如虎添翼。
在安装目录，有一个名为metal的可执行文件，该程序用法很简单，只需要编写一个配置文件，然后执行即可，所以关键在于配置文件的编写。在软件的安装目录，有一个名为example的文件夹，提供了两个示例，其中的metal.txt就是配置文件。
但是接下来大家又想问，同样的想比较两个分组的免疫评分的差异，但是免疫评分的工具太多了，比如有一个2019的综述文章：《Comprehensive evaluation of transcriptome-based cell-type quantification methods for immuno-oncology》比较了常见的免疫细胞比例推断工具的表现，另外一个2018的综述《Quantifying tumor-infiltrating immune cells from transcriptomics data》提到工具更多，起码十几款了。大家也不可能一一研读，下载，测试，使用它。但是又确实看到了大量数据挖掘文章都使用了这些免疫评分信息啊，比如：新鲜出炉（2021年6月）的文章：《Identification of a Ferroptosis- Related LncRNA Signature as a Novel Prognosis Model for Lung Adenocarcinoma》 ，就对比了 ESTIMATE, TIMER, MCP counter, CIBERSORTx,和ssGSEA ，如下所示：
awk、grep和sed被称为linux三剑客，事实上grep和awk我在日常工作中也常用到(sed用的比较少)，可能有些人对awk了解比较少，我先大概介绍下。 很多人以为awk只是一个文本处理工具，实际上他们也是这么用的。但事实上它其实是一门语言，拥有数学运算符、进程控制语句，甚至针对于文本处理封装了很多内置变量和函数，这造就了它强大的文本处理能力。 如果grep只能做到数据的筛选，那awk还能做到数据的处理、分析甚至生成报表，毕竟它是一门完整的编程语言。
我们都知道Linux操作系统，一般没有标配桌面窗口。使用 Bash 与操作系统对话。同时，Linux 操作系统，秉持了UNIX操作系统的“一切皆文件”的哲学思想，把各种类型的数据归纳为文件。
原文:https://blog.csdn.net/qq_54219272/article/details/124432402
本文将通过一个经典的 “tensorflow找不到dll” 问题来入手，给大家一个如何找到缺失dll的办法，进而再分享一个windows上排查问题的好工具（因为大多开发者在windows上开发&在linux上部署，windows还是绕不过）。
1.首先说说简历，好多人都问过我，乔哥，进入bat这样的大厂是不是学历都需要211,985 其实，不是的，这次我面试的这个同学就是二本院校出生，我身边认识的 苦逼的码农 和 编程剑谱 的号主都是二本出身，也都拿下了BAT的offer，所以BAT这样的大厂并不是一定要211,985学历。继续说回到这位同学吧，这位同学虽然是二本，但是简历还是通过层层筛选，进入到了面试环节，肯定有一些过人之处。我看了看这位同学的简历，果不其然，还是很有料的。
推荐阅读 微服务： springboot系列教程学习 源码：Javaweb练手项目源码下载 调优：十五篇好文回顾 面试笔试：面试笔试整理系列 玩过Linux的人都会知道，Linux中的命令的确是非常多，但是玩过Linux的人也从来不会因为Linux的命令如此之多而烦恼，因为我们只需要掌握我们最常用的命令就可以了。当然你也可以在使用时去找一下man，他会帮你解决不少的问题。 然而每个人玩Linux的目的都不同，所以他们常用的命令也就差异非常大，而我主要是用Linux进行C/C++和shell程序编写的，所以常
最近接到一个工单：DTLE client 被部署在两个机房，其中只有 DTLE client 可以相互访问，所以希望故障转移时能在对应机房内切换。
git config –global user.email mail@box.com
执行密钥生成命令，基本上是一路回车既可以了，但是需要注意的是：执行命令的过程中是会提示。输入密钥的密码的（如下图中红色箭头处，输入两次相同的，即是又一次确认密码），不需要密码直接回车就行。
操作系统内部本身是非常复杂，存在各种调用关系，本文主要讲解利用 atop+perf 双剑客来加速排障和分析一些常见的负载问题
在文件搜索的战场上，find命令曾是许多Linux用户的首选武器。然而，随着文件系统的日益庞大，其实时搜索的速度逐渐暴露出瓶颈。此时，locate命令如一位速度型选手闪亮登场，以其基于数据库的高效查询方式，轻松秒杀实时搜索，查找速度更是比find命令提升了成百上千倍！
在CTF比赛中，对于流量包的分析取证是一种十分重要的题型。通常这类题目都是会提供一个包含流量数据的pcap文件，选手通过该文件筛选和过滤其中无关的流量信息，根据关键流量信息找出flag或者相关线索,一般flag隐藏在某个数据包里面，或者需要从中提取一个文件出来等等，还有wifi的握手包，需要获取wifi密码等。
当时对很多测试项目都是拿到了loom文件，就可以进行下游 velocyto.R 这个R包进行后续统计可视化啦！准备第二天就讲解velocyto.R 这个R包用法，但是却忘记了，最近看到有小伙伴在该推文下面赞赏200元催更，激起了我的创作动力！
今天，我像往常一样提取基因组的样本，我有一堆样本的ID，需要从所有的基因型的文件中提取出来。
sed 简介 sed是一种流编辑器，以行为单位进行文本处理，可以将数据行进行替换、删除、新增、选取等操作。 sed [options] 'command' file(s) 基本命令 匹配内容 $ sed 'p' /etc/passwd # 每一行输出两次 $ sed -n 'p' /etc/passwd # 每行只出现一次 $ sed -n '/root/p' /etc/passwd root:x:0:0:root:/root:/bin/zsh # 等同于 $ grep 'root' /etc/pas
答：HTTPS 默认端口号为443 ，https，基于HTTP协议，通过SSL或者TLS提供加密数据处理，验证对方身份以及保护数据的完整性
提到ls命令，大家都不陌生，在Linux环境下，其主要作用：列出当前目录下所包含的文件及子目录，如果当前目录下文件过多，则使用命令ls不是很好，因为这输出出来的结果跟你所要查找的文件未能达成一致，第一：需要进行二次过滤查找；第二：文件过多时，终端输出结果较慢；
导出PDF的方式有很多种，之前使用过马克飞象的导出功能，不过只是简单的导出并不能添加目录，因为源文件是markdown编写的，经过筛选后采用了gitbook的方式进行编写文档并且使用gitbook pdf .的方式导出为PDF文件。
现在，要成为一个合格的数据分析师，你说你不会Python，大概率会被江湖人士耻笑。
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