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    生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)

    在生信分析人员如何系统入门R(2019更新版) 里面,我提到过Linux基本上几十年都没有怎么变动过基础知识的,哪怕你现在搜索到十几年前的Linux教学视频,也不会觉得尴尬。而且Linux属于IT工程师必备技能,IT的发展程度远超于我们,再加上各种马哥鸟叔,还有黑马训练营公开30天完整教学视频,按照道理我是没有必要在他们IT专业人士面前班门弄虎的, 毕竟他们随便拿几个偏门知识点就可以问倒我了!不过我们生信技能树的特色是主打生物信息学方向技能建设,而它作为一个典型的教交叉学科,想在此领域成为一个专业靠谱的生信工程师,我们实在是做不到在任何一个非核心知识点投入过多的时间和精力。

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    Linux命令格式

    Linux命令格式: 命令名 [ ] [ ] 注:[]内可选 常用命令: ls——显示当前文件夹下的文件和文件夹 -a 显示所有文件和文件夹 -l 列表显示文件或文件夹 示例:ls -l 、ls -a 、ls -la 、ls -al 、ls /笔记/day01(命令后可加路径)(命令后记得加空格,显示出的文件或文件夹名称前有.的是隐藏文件) pwd——显示当前所在位置 相对路径: 1)文件/文件夹名称 2). 当前文件夹 示例: ls . 、ls .. 、ls ../.. 等 3).. 上一级文件夹 4)~ 用户主目录 绝对路径:文件的绝对路径都是唯一的 cd——切换到用户主目录 示例: cd . 、cd ~ 、cd /文件夹名称等 clear——清除屏幕(记录还在,可向上查阅) mkdir——创建一个或多个文件夹 -p 如果没有文件夹则逐级创建 示例:

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    ubuntu经常使用的命令摘要

    1.df命令 # df -ha 显示所有文件和分区的使用 # df -h /dev/sda1 显示sda1磁盘使用率 # df -T 显示文件系统名称属于每个分区。区的格式类型(比方ext3) 注:h參数表示转换为M。G等人们经常使用的磁盘空间单位显示 2.du命令 # du -h src 显示src文件夹中各个文件(或者文件)所占用的磁盘空间 # du -hs /usr 显示usr文件夹中全部文件的总大小 # du -h test.c 显示test.c文件所占用的磁盘空间 3.dd命令 dd 是 Linux/UNIX 下的一个很实用的命令,作用是用指定大小的块拷贝一个文件,并在拷贝的同一时候进行指定的转换。 # dd if=/dev/hdb | gzip > /root/image.gz 备份/dev/hdb全盘数据。并利用gzip工具进行压缩。保存到指定路径 注:“|”表示管道命令,是指“|”的左边执行结果是其右边的输入条件或者范围。如:history | grep date指从history这条命令执行的结果中显示包括有“date”的命令 # gzip -dc /root/image.gz | dd of=/dev/hdb 将压缩的备份文件恢复到指定盘 # dd if=/dev/fd0 of=disk.img bs=4M 备份软盘。读和写的块大小为4M 4.# uname -a 查看Ubuntu的版本号 5.cat命令 # cat -n test.c 显示整个test.c的内容,并对内容按行编号 6.lsmod命令 # lsmod 显示全部内核载入的模块 # lsmod | grep mptspi 显示内核载入的全部包括mtpspi的模块 7.# lsusb 查看USB设备 8.# cat /proc/cpuinfo 查看cpu的状态 9.# lshw 查看硬件信息 10.# fdisk -l 查看磁盘的信息 # fdisk /dev/sda 对磁盘sda(注意不是sda1,sda1是sda的一个分区)进行操作,包含新建分区。删除分区等,后面的操作按提示选项进行。 11.# free -m 查看当前内存使用情况 12.# ps -A 查看当前系统有哪些进程 13.# kill 进程号 中止一个进程 14.# kill -9 进程号 强制中止一个进程。kill 进程号不成功时能够使用 15.# top 查看当前进程的实时状况 # top -p 786 显示进程号为786的进程的实时执行状况 16.ifconfig命令 # ifconfig 显示网卡相关的信息 # ifconfig eth0 up 打开eth0网卡 # ifconfig eth0 down 关闭eth0网卡 # infonfig eth0 192.168.1.1 设置eth0的IP地址为192.168.1.1 17.启动停止服务命令 # /etc/init.d/服务名 restart/stop/start 重新启动/停止/启动一个服务 18.# whereis 文件名称 高速查找一个文件 19.# find 文件夹 -name 文件名称 在文件夹中查找某个文件名称的文件 find -name ‘*fb*’ 在当前文件夹下查找文件名称中包括”fb”字样的文件 find /usr -name ‘*fb*’ 在/usr文件夹下查找文件名称中包括”fb”字样的文件 20.# tail -n 6 文件名称 假设值的前面有 +(加号)。从文件开头指定的单元数開始将文件写到标准输出。假设值的前面有 -(减号)。则从文件末尾指定的单元数開始将文件写到标准输出。假设值前面没有 +(加号)或 -(减号)。那么从文件末尾指定的单元号開始读取文件。 # tail -n 6 文件名称 == # tail -n -6 文件名称 21.grep命令 # grep ‘test’ d* 显示全部以d开头的文件里包括test的行。

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