我在人类样本上进行了450K Illumina甲基化芯片，并想要寻找连续变量和β之间的关联，并对其他协变量进行了调整。为此，我使用了R中的CpGassoc包。我还想根据重要的CpG站点搜索差异甲基化区域。然而，Champ软件包和其他用于450K DMR分析的软件包中的探头套索函数总是假设需要找到DMR的2组。我没有两组，而是这个连续变量。
浏览 2提问于2015-09-25得票数 0
数据集有两列-一列用于染色体上的位置(数字，整数)，另一列用于甲基化值(也是数字，双精度)，许多甲基化值缺失。这个想法是，距离应该基于染色体上的位置。我还有其他几个功能，但我选择不包括这些功能)。reg.knn <- knnImputation(as.matrix(testp), k=2, meth="median")#Error in rep(1, ncol(dist)) :
浏览 66提问于2016-03-27得票数 3
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我有以下两个矩阵中的甲基化计数数据。2", "group1_3", "group1_4", "group1_5", "group2_1", "group2_2", "group2_3", "group2_4", "group2_5")colnames(<em
浏览 0提问于2016-04-13得票数 0
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我有一个数据矩阵，其中包含100,000行的值，这些值对应于几种细胞类型的甲基化值。我想在集群热图中直观地显示甲基化的变化。为了使数据更易于管理，我正在考虑每10行左右创建一个新的数据矩阵。
浏览 0提问于2013-06-11得票数 0
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我有一个从某些类别的部件组成项目的系统。1：(地点) 2：(材料)墙面(FK=1)Roof (FK=1)Roof (FK=1)Brick (FK=2)<code>H 115</code>Tile(FK=2)<code>H 216</code><code>H 117</code>Wood(FK=2)<code>H 218<//code><code>f 219<//code>
组成这些项目: Wall.Brick、Roof.Wood、W
浏览 5提问于2010-10-09得票数 1
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我有一个数据表，列名为单元格类型(20种细胞类型)，然后是每种细胞类型的23000个基因的行名及其甲基化值(介于0到1之间)。确定甲基化值在以下范围内的基因数目: 0-0.0999，0.1-0.1999，0.2-0.29999等，每种细胞类型的甲基化值为0.9-1。我还想对整个数据表进行类似的分析(即甲基化值在上述范围内的基因数目)。
浏览 1提问于2015-01-09得票数 2
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假设我有一个订购系统，它的表大小约为50,000行，每天增长约100行。另外，如果下了订单，我需要在接下来的30天内存储关于该订单的度量，并每天报告这些指标(即在第2天，该订单有X激活和Y停用)。
DimProducts表，
浏览 3提问于2015-11-03得票数 0
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我有两个数据，一个是病人样本的协变量，另一个是样本的甲基化数据。我需要做t检验来比较按性别划分的甲基化数据。caucasiansample6 p6 1 caucasian甲基化因此，如果我想对前8个样本的甲基化数据和性别进行一系列的t检验，我是否可以指定：t.test(t(methylation[,1:8]) ~ covariates$sex)？
浏览 0提问于2018-10-17得票数 0
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我正在从事这个项目，该项目将自动生成示例MongoDB、schema、分析现有的MySQL数据库和logs。我正在寻求关于以下问题的帮助。请分享你的想法，一些链接或参考。2)空闲MongoDB数据库的设计标准是什么？在设计MongoDB数据库时，我应该记住什么？例如，MongoDB schema对于任何MySQL数据库都会有很大帮助。3) database的去甲基化有多大帮助？
4)是否有任何现有的开源应用/工具可以帮助自动化过程？
浏览 0提问于2014-03-13得票数 0
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从数组中选择多选表单
、、、
我有一个名为pymnt_meth_pref的数据库列，其中包含从多选表单中选择的付款方法的逗号分隔字符串。<td>Payment Methods Used:<br />
浏览 0提问于2012-11-12得票数 0
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Matrix Expr包含每个基因和样本的基因表达；Matrix Methyl包含每个样本的这些基因的甲基化状态。是否有可能同时基于表达和甲基化信息对基因和/或样本进行聚类？
浏览 3提问于2016-05-27得票数 0
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P值效度
、
我已经对DNA甲基化数据进行了统计分析，我已经写好了我的报告，但被我的导师拒绝了，因为他要我在论文中做一些修改。
有一个问题我不能回答，因为我不太理解它与p值的关系。
浏览 0提问于2015-05-06得票数 0
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我有一个包含百分比( DNA甲基化数据)的列的文件。我想绘制分布频率图(可能使用10的柱状图)来显示数据。有没有办法在python中做到这一点。
浏览 2提问于2013-05-25得票数 0
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我已经尝试过了，但是有一些错误我还没有发现： define_method(meth){ instance_variable_set("@#{meth}", self.class.send(meth.pluralize).find{|node| node["id"]==sou
浏览 0提问于2013-01-05得票数 2
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查找多个表中存在的记录
、、、
所以我的桌子看起来：Record (id, name)2, fgt二：1, 3, sub1_三：1, 2, sub1_methz3, 2, sub3_methz
4, 3, sub1_methz
浏览 4提问于2014-05-20得票数 1
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我正在用一种方法来找到甲基化调控的基因。该方法首先计算样品中每个基因甲基化与表达数据之间的相关系数。我应用这个第一个过滤器，我得到了418个基因的子集，其相关系数为显著(小于-0,3)。下一步是找出甲基化和每个基因表达的b样条三次回归系数。
浏览 1提问于2015-06-24得票数 1
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以下是一个例子-
CIMP - CpG岛甲基化表型
问题是，我已经能够使用re.findall('(\(.*?
浏览 2提问于2016-10-17得票数 1
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', 'meth cook is also called Heisenberg', 'meth cook has cancer', 'he is known as the best meth cook', 'Meth Dealer added chili powder to his batch', 'Meth Dealer learned to make the best meth
浏览 1提问于2016-03-03得票数 0
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class Test: def meth1(self): defmeth2(self):，，我的问题是，每当我在课堂上给meth1和meth2打电话的时候。This is from class Test&q
浏览 4提问于2021-05-05得票数 0
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