这个专题分享点日常运维中用到的Python脚本 在做数据库迁移后，我们可能需要知道我们的表，索引，存储过程等对象是否迁移成功 这时可以用如下脚本来进行检查 ---- 环境准备 操作系统: Windows
序列比对和序列特征分析总目录 多序列比对的软件很多，具体可参考https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/ 另外还有http://www.bioinformatics.utep.edu.../BIMER/tools/msa.html https://www.expasy.org/genomics/sequence_alignment 工具很多，以下为推荐的在线版本工具： - DNA多序列比对...- 蛋白质多序列比对推荐 Clustal Omega....image.png Alignment进行比对：Alignment--Do complete alignment，结果如下 ?
因为这款HKROnline SyncNavigator 软件是目前为止，国内做的最好的数据库同步软件，傻瓜式同步数据库，只需要你设置好来源数据库和目标数据库的账号和密码，一键开启，后台自动同步，断点续传...并且还支持异构数据库，也可以同步部分表或者部分字段，都可以进行更为精准的设置操作。...SyncNavigator 数据酷同步工具 做数据同步时所支持的数据库类型： 支持sqlserver 2000-2014所有版本，全兼容，和MYsql 4.x 、MYsql 5.x 、MYsql 6.x...来源数据库和目标数据库可以版本不同，比如：来源数据库是sqlserver 2012 目标数据库是mysql 5.5 ，都是可以的， SyncNavigator 支持跨数据库版本，无缝传输数据。...只需要能连接上数据库， SyncNavigator 可以安装在第三方电脑上，来源数据库和目标数据库电脑上可以不用安装程序。
1.概要 在日常的工作当中我们经常会遇到阅读大量代码，如果大量的代码中出现问题需要回滚那么这个时候就需要比对出当前的修改和之前的修改有什么区别。...如果我们人工的去逐行比对会非常费眼睛，且非常的耗时还容易出错。 1.1BeyondCompare 这里推荐一款文件比对工具BeyondCompare....官网：https://www.beyondcomparepro.com/download 优点：是一款文件对比相对来说比较专业的工具。 缺点：收费，寻找破解版比较复杂耗时。...那么有没有简单且好安装下载的工具呢？接下来看看详细内容。 2.详细内容 TortoiseSVN TortoiseSVN这个工具相信大家并不陌生，就是一个代码版本的管理器。...这个工具中其实也包含了文件比对功能，那么如何使用它呢？ 官网下载：https://tortoisesvn.net/ 这里下载和安装就不演示了基本每个开发者的电脑大概率都会有。
MYSQL数据库同步工具 MYSQL数据库同步工具 功能 说明 配图 MYSQL数据库同步工具 GIT地址：https://gitee.com/michlee/mysql-sync 因开发需要，经常要同步...MYSQL数据库结构及部分基础数据到其他生产服务器。...所以写了这个同步工具。可以一次性把需要同步的表结构同步到需要同步的其他服务器（单个/多个都可以）。 用这个工具先创建同步配置，根据不同的同步需求，创建不同的同步配置。...功能 目前仅针对Mysql数据库 1.表结构同步 (支持1对多数据库配置：新表/单表/多表/全表 (备注:多配置全表同步速度会慢一点。..."mysqlType": "5", "charSet": "utf8" } ] 可以配置自动执行代码-程序启动完成自动执行一次（ExecuteTask.java） 备注： 表结构比对借鉴于
官方社区版免费工具 MySQL Workbench MySql 官方社区版下载： MySQL Community Downloads MySQL Yum Repository MySQL APT...Repository MySQL SUSE Repository MySQL Community Server MySQL Cluster MySQL Router MySQL Shell MySQL...Workbench MySQL Installer for Windows MySQL for Visual Studio C API (libmysqlclient) Connector/C++...Connector/J Connector/NET Connector/Node.js Connector/ODBC Connector/Python MySQL Native Driver for...PHP MySQL Benchmark Tool Time zone description tables Download Archives 发布者：全栈程序员栈长，转载请注明出处：https:/
STAR是一款RNA_seq数据专用的比对软件，比对速度非常快，最大的优势是灵敏度高，GATK推荐采用STAR比对，然后进行下游的SNP分析。...在构建索引时，还支持加入intron的区间信息，通过sjdbFileChrStartEnd指定对应的文件，多个文件用逗号分隔，这种格式的文件是由STAR比对产生的，通常用于2-pass比对模式。...，STAR官方更推荐使用2-pass比对模式，即比对两次，有以下两种方式 multi-sample 2-pass 第一次比对和上述的用法一致，比对完之后，每个样本会产生一个intron的区间文件SJ.out.tab...; 在第二次比对之前，重新构建一次基因组的索引，添加所有样本的SJ.out.tab文件，然后利用新的基因组索引重新比对。...per-sample 2-pass 对于单个样本，在比对时直接添加--twopassMode Basic参数，软件会自动进行两次比对，将第一次比对的SJ.out.tab加入到索引，然后重新比对。
放入应用程序的WEB-INF/lib目录，将spy.properties放入WEB-INF/classes目录(也就是工程的src下面) 3、修改spy.properties realdriver =com.mysql.jdbc.Driver...修改hibernate.cfg.xml，修改connection.driver_class的值为com.p6spy.engine.spy.P6SpyDriver 9、如果spy.log里出现 你的程序的数据库驱动名称...修改spy.properties，把realdriver 改为项目里使用的JDBC驱动名，如 realdriver=com.mysql.jdbc.Driver，其他的realdriver全部用#注释掉,
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君 SQLyog管理工具 MySQL 管理工具 通过SQLyog连接MySQL 使用SQlyog工具创建数据库 MySQL 管理工具 除了使用命令行来操作...MySQL 数据库之外，还可以使用图形化管理工具来管理数据。...SQLyog 是一款简洁高效，功能强大的MySQL 数据库管理工具。使用SQLyog 可以快速直观地让用户完成对数据库的操作。...通过SQLyog连接MySQL 启动MySQL服务后，通过SQLyog 工具就可以实现MySQL数据库的连接。以下介绍其登录过程。...通过工具向导操作数据库虽然方便直观，但不利于对数据库的批量操作，试想如果创建10个数据库，与使用工具向导相比执行SQL语句会更加高效。因此，熟练编写SQL语句也是程序员的必备的技能。
, ) mysql_cursor = mydb.cursor() # 获取当前最小 最大的id，用于后续的循环比对 get_min_max_sql = 'SELECT min(id),max(id)...记录差异行数量 diff_count = 0 while stop_id < max_id + configs.step: # 加一个步长进去，防止因为step过大，导致有遗漏的id # 拼接出比对的...stop_id = stop_id + configs.step stop_time = time.time() time_dur = stop_time - start_time print(f"比对...' mysql_port = '3306' mysql_user = 'dts' mysql_pass = 'dts' mysql_db = 'sbtest' mysql_tb = 'sbtest1'...运行效果 走公网流量情况下，9k记录，在不同step下的耗时比对： step = 100 18.5s step = 500 5s step = 1000 3.7s step = 2000
多序列比对结果可以存储为很多格式（Multiple sequence alignments can be stored in a large variety of formats.）...GCATATAT #ccsA3 ATGATATTTT CAACTTTAGA GCATATAT #ccsA4 ATGATATTTT CAACTTTAGA GCATATAT 不同的比对软件会输出不一样的比对格式...；比对后分析用到的软件对输入格式的要求也不一样。...这里推荐 ALTER http://www.sing-group.org/ALTER/ 来完成比对格式转化的任务。...小工具对应的论文 ALTER: program-oriented conversion of DNA and protein alignments 期刊 Nucleic Acids Research 2010
MySQL数据库界面化工具 - Navicat的常用功能 本文关键字：MySQL、数据库、界面化工具、Navicat、常用功能 本文使用的工具版本为：Navicat Premium 15，文中提到的功能在旧版中同样支持...DBMS与界面化工具的关系 我们所使用的数据库管理系统，或者称之为数据库软件，如：MySQL、Oracle、SQLServer，在安装以后，都是以系统服务的方式存在的，并不像我们其他的安装程序一样，用的时候直接打开某个...MySQL与Navicat的关系 MySQL是目前主流使用的数据库之一，也是最具代表性的关系型数据库之一，占用资源少，效率和性能方便表现的也不错，通常使用在中小型项目中，也可以用于搭建数据库集群。...类似Navicat的工具有很多，如：MySQL Workbench（官方工具）、DataGrip（Jetbrains家族中强大的界面化数据库工具）、SQLyog（免费的MySQL数据库管理工具）。...我们点击MySQL来新建一个MySQL数据库的连接，这里要注意：如果我们要连接高版本的数据库，那么我们的Navicat版本不能过旧，因为连接数据库需要驱动，很多界面化工具的驱动都是内置的，并不能像DataGrip
前言 在 0.7 版本之前，在单机模式时 nacos 使用嵌入式数据库实现数据的存储，不方便观察数据存储的基本情况。...0.7 版本后增加了支持 mysql 数据源能力，具体的操作步骤： nacos配置mysql nacos 支持配置多个数据库，通过 db.num 和 db.url.index的配置来控制。...nacos 配置 mysql 数据库只需如下三点即可完成： 安装数据库，版本要求：5.6.5+ 初始化mysql数据库，数据库初始化文件：nacos-mysql.sql 修改conf/application.properties...文件，增加支持mysql数据源配置（目前只支持mysql），添加mysql数据源的url、用户名和密码。...# db mysql spring.datasource.platform=mysql db.num=1 db.url.0=jdbc:mysql://11.162.196.16:3306/nacos_devtest
运行速度 随着测序价格的下降和数据深入挖掘的需求，测序量越来越大，海量测序reads的比对，要求速度上必须够快。 3....同时由于测序的短序列可能和基因组多个位置存在同源，一条reads会比对到基因组上多个位置。...双端测序技术在一定程度上能够校正多个位置，因为双端reads 来自同一个DNA片段，二者在基因组上的位置不会相距太远，但是仅靠这一点并不能解决所有的同源比对，这就要求比对算法对多个位置进行判断和打分，给出比对结果的可靠性...在比对转录组数据时，就需要考虑跳过剪切位点。 目前mapping的工具有很多，比如bwa, hisat, star等。hisat 是其中速度最快的，是tophat软件的升级版本。...reads比对到基因组上的一个位置，我们称之为一个alignment。
ChaissonLab/LRA 安装直接使用conda conda install -c bioconda lra 参考序列构建索引 lra index -ONT pome_mt_potential.fa 比对
MySQL数据库工具类之——DataTable批量加入数据库(Net版)，MySqlDbHelper通用类希望能对大家有用，代码如下： using MySql.Data.MySqlClient; using...#region 私有变量 private const string defaultConfigKeyName = "MySqlConnection";//连接字符串 Database='数据库...} } return dataset.Tables[0]; } /// /// DataTable批量加入MYSQL...数据库 /// /// /// public
使用Python写了个最基本的表结构比对告警脚本， 目前这个版本只能做到发现表结构存在差异的表。后续考虑再迭代下，看如何把差异的表和列的明细也报出来。...configs.py 内容如下： # MySQL数据源的信息 mysql_source_host = "localhost" mysql_source_port = "3306" mysql_source_user...dest_tb_set): # s1.add(i[0]) # 如果要全部都报出来，用下面这种写法 s1.add(i[0]) print('表结构（只比对了列和索引...，未包括字符集和排序集）检查完成，存在差异的表如下 ---> ', s1) else: print('表结构（只比对了列和索引，未包括字符集和排序集）检查完成，没有发现存在差异的表') stop_time...= time.time() time_dur = stop_time - start_time print(f"耗时 {time_dur} 秒") readme 内容如下： 上面程序里面，我们没有比对表中的字符集和排序集
https://blog.csdn.net/robinson_0612/article/details/84365551 在关系型数据库建表期间，我们需要考虑很多很多的事项。...---+ | Leshami | http://blog.csdn.net/leshami | +---------+------------------------------+ 二、基于无索引情形比对...表上统计信息，mysql统计信息不是很准确，如下图，基于bigint数据类型占用的磁盘你空间与char类型占用磁盘空间等同。...image.png 二、基于索引情形比对 下面为过滤条件列mobile添加索引列，观察性能表现 CREATE INDEX uk_mobile ON tb_char(mobile); CREATE...为了更好比对性能，下面基于索引列进行分组以及聚合运算，可以看出依旧是bigint数据类型性能最佳 image.png 四、最终比对结果及结论 最终完整结果图： image.png
在使用pycharm开发工具连接mysql数据库时提示错误，信息如下： Server returns invalid timezone....Go to ‘Advanced’ tab and set ‘serverTimezone’ property manually 提示信息返回无效的时区，这是由于MySQL默认的时区是UTC时区，比北京时间晚...解决的方法是修改mysql时区的时长，连接上mysql后，操作命令如下： set global time_zone=’+8:00′; 但可能这样设置之后，如果是本地pc电脑安装的mysql，在重启电脑之后这个配置会丢失的...如果这样的话，可以在pycharm连接数据库的配置里进行serverTimezone的设置值为：Asia/Shanghai，这样就可以解决每次都要修改mysql配置的问题了，配置如下图所示： ?...参考：pycharm中连接mysql数据库的步骤详解 总结 到此这篇关于pycharm工具连接mysql数据库失败问题的文章就介绍到这了,更多相关pycharm连接mysql数据库内容请搜索ZaLou.Cn
本期学习MySQL命令行工具和操作 1、MySQL命令行工具 (1)、MySQL MySQL是一个简单的SQL外壳(有GNU readline功能)。它支持交互式和非交互式使用。...要想检查这些文本格式的文件，应使用MySQLBinLog实用工具。 (4)、MySQLDump MySQLDump客户端可用来转储数据库或搜集数据库进行备份或将数据转移到另一个SQL服务器。...(8)、Replace Replace实用工具可以及时更改文件或标准输入中的字符串。它首先使用有限状态机来匹配长的字符串。该工具可以用来交换字符串。...2、MySQL基本操作 (1)、MySQL51 service的停止与启用 net stop mysql51 net start mysql51 (2)、登录MySQL管理工具+创建数据库+显示所有数据库...+删除数据库+推出MySQL管理工具 (3)、增加用户 + 显示用户 + 修改密码 + 删除用户 (4)、进入数据库 + 创建表 + 显示数据库下所有的表 + 显示表的定义 + 向表中插入数据 +
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