NCBI是一个生物信息学和生物序列数据库。It用户界面是英文的。我正在规划一个网站，显示从这个网站与非英文描述的数据。我需要连接NCBI爆炸数据库，并在那里进行搜索，然后将结果传输到我网站的爆炸框中。
浏览 5提问于2013-01-23得票数 1
NCBI是一个遗传学和生物学的综合数据库，但我们中的许多人都喜欢使用我们语言中的数据库，而不是其他语言。我正在设计一个网站，该网站必须搜索NCBI数据，并在此数据中进行搜索，但不显示NCBI中的数据结果，并返回数据结果到我的网站，这有一个波斯语接口。我该怎么做呢？我的意思是，我如何使用NCBI数据库搜索引擎，并在我的网站上显示搜索结果？谢谢
浏览 1提问于2013-05-07得票数 1
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Itag_annotatie.objects.get(Gen_ID=ids) #no Itag info found try: except: pass
writer.writerow([Itag.Gen_ID, Itag.Solyc, Ncbi.defname, Loci.L
浏览 1提问于2012-10-01得票数 0
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我在试图对本地nt数据库使用blast v2.12时出错。我从ftp服务器上下载了两次nt，认为它第一次损坏了，但这并没有改变任何事情。6 qseqid sacc stitle ssciname nident qlen" -num_alignments 10000 -query QUERY > OUT.csvError: NCBIC++ Exception:
T0 "/build/ncbi-blast+-S1iyIZ/ncbi-blast+-2.9
浏览 34提问于2021-12-15得票数 0
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我从NCBI standalone BLAST开始我的项目，并使用-outfmt 17选项。对我来说，格式化是非常有用的。但是，我不得不更改为Biopython，现在我正在使用qblast将我的序列与NCBI NT数据库进行比对。我是否可以保存/转换qblast XML，其格式可与NCBI BLAST独立-outfmt 17格式相媲美？干杯，菲利普
浏览 6提问于2016-08-11得票数 0
2回答
我尝试使用Biopython的NcbiblastxCommandline工具在"nr“数据库中本地运行blastx，但我总是得到以下关于蛋白质数据库搜索路径的错误：>>> nr = "/Users/Priya/Documents/Python/ncbi-blast-2.2.26+/bin/nr.p
浏览 3提问于2012-05-21得票数 3
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当我运行tblastn时，我得到了以下错误消息
T BLAST -query ~/seq.fa -out ~/seq.out -db ~/blast/ncbi-blast-2.2.29+/db/nr -num_alignments 20000 blast数据库错误:在搜索路径~/blast/ncbi-blast-2.2.29+/bin::/directory/path/to/blast/database
浏览 4提问于2014-04-17得票数 0
1回答
我有本地数据库驱动的网站，其中包含一些序列，这是通过他们的GI号码唯一标识。有没有可能直接链接到“NCBI爆炸站点”，给出GI。例如，GI 903049的序列具有以下链接：
我想直接链接到这个网站，而不必去NCBI。谢谢。
浏览 2提问于2012-05-09得票数 0
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根据NCBI服务台回答的问题之一，我们不能“批量下载”PubMed Central。但是，我是否可以使用"NCBI -实用程序“下载PMC数据库中的所有全文文章，使用Efetch，或者至少在Entrez编程实用程序中使用搜索找到所有相应的PMCids？如果是，那怎么做？
浏览 13提问于2017-11-14得票数 6
2回答
tools获得的信息：=======================================================Date: Fri, 29 Jun 2018 10:27:42 GMTNCBI-PHIDServer: Apache
Set-Cookie: ncbi</
浏览 0提问于2018-06-29得票数 9
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ncbi-blast-2.6.0+/LICENSE ncbi-blast-2.6.0+/doc/ ncbi-blast-2.6.0+/bin/
ncbi-blast-2.6.0+/bin/make
浏览 2提问于2017-04-25得票数 15
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这就是他们的样子：
['https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AY348795\n.1?report=fasta', 'https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AY348740\n.1?report=fasta', 'https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AY34874
浏览 2提问于2018-08-09得票数 2
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chromosome_name","start","end"),我知道"entrezgene“对应于NCBI的基因ID，但我想要来自NCBI的基因名称。有没有一种方法可以使用连接到NCBI数据库的biomaRt并检索该信息？
感谢您的支持。
浏览 17提问于2017-07-18得票数 0
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&> PacBio::Data::detail::NCBI2na&)' cannot be declared=(const NCBI2na&) = default;class NCBI2napublic:
static inline constexpr NCBI2nauint8_t raw) { return N
浏览 0提问于2017-10-15得票数 2
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x <- tax_name("Homo sapiens", get = 'family', db = 'ncbi')
db query family
1 ncbi Homo
浏览 8提问于2020-11-14得票数 0
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当前遇到安装所需数据库的问题。内置的kraken2数据库代码：构建-下载-库病毒-db viral_DBrsync错误: clientserver.c(138)中的socket IO错误(代码10)rsync: getaddrinfo: ftp.ncbi.nlm.nih.gov 873:名称解
浏览 25提问于2022-12-01得票数 -2
2回答
/pubmed/31919170https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31919170https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31919170
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
浏览 39提问于2020-03-15得票数 1
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