如何防止此代码占用过多内存?希望能为这个项目和将来的参考学习。
Sub Part5()
'Updating the classification columns all the way to the right
'Use a long if statement pulling from labels
Dim LastRow As Integer
Dim LastRowJira As Integer
Dim Temp As String
Dim row_index As String
Dim x As Integer
L
我有两个数据处理程序,它们都有Date。对于每个类型和每个State,dataframe都有重复的日期,因为它是一个累加求和的框架,如下所示:
Date State Type Value
2010-01-01 AK NUC 10
2010-02-01 AK NUC 10
2010-03-01 AK NUC 10
.
.
2010-01-01 CO NUC 2
2010-02-01 CO NUC 2
.
我有一个perl脚本,它比较两个数组,以返回在这两个数组中找到的结果。问题出现了,我相信正则表达式,它在括号[]中遇到连字符(-)。
我得到了以下错误:
Invalid [] range "5-3" in regex; marked by <-- HERE in m/>gi|403163623|ref|XP_003323683.2| leucyl-tRNA synthetase [Puccinia graminis f. sp. tritici CRL 75-3 <-- HERE 6-700-3]
MAQSTPSSIQELMDKKQKEATLDMGGNFTKR
我使用匿名散列将来自两个不同子例程的值传递给一个新的子例程。但是,现在我不能使用传递的变量执行计算。
use warnings;
use strict;
use feature 'say';
use DBI;
use autodie;
use Data::Dumper;
use CGI;
print "Enter sequence";
my $seq = <STDIN>;
chomp $seq;
$len = length $seq;
my $f = nuc($seq);
perc({ len => $len });
sub nuc {
Linux 18安装在英特尔的NUC5i7RYH计算机上。那台PC有一个硬件问题,所以我把三星EVO960SSD移到了一个新的NUC7i7BNK上,但是第二个NUC没有从EVO启动。它在BIOS中确实将其视为一个引导设备,我可以从安装了Linux的Live闪存驱动器启动。如何从EVO启动第二个NUC?
我在文本文件中有以下格式。
-FRFR
YOUAREMYFRIEND
-JKJK
YOUARENOTMYFRIEND
-SSFF
LETUSBEFRIENDS
我想计算行中不以"-“开头的每个字母的频率,这是一个很大的文件,所以我不能直接复制。
有什么我能做的吗
for line in str
if line starts with '-'
then dont count that line
else:
do count the line
total_length = 0
nucleotide = {}
seq_file = open(
我尝试使用以下代码从DNA序列中找出最长的ORF from Bio import Seq
import regex as re
startP = re.compile('ATG')
nuc = input_seq.replace('\n','')
longest = (0,)
for m in startP.finditer(nuc, overlapped=True):
if len(Seq.Seq(nuc)[m.start():].translate(to_stop=True)) > longest[0]:
pr
目前我第一次使用docopt lib,所以我肯定做错了什么。
我的剧本是:
"""prog
Usage:
prog.py (-h | --help)
prog.py (--version)
prog.py -s TAG [-t NB_NUC]
Options:
-h, --help help
--version version
-s TAG Some TAG I want.
-t NB_NUC A number of nuc.
"""
如果我写: python
我想从x突变的DNA / RNA序列中找到所有可能的mutan。
我编写了获得所有突变体1突变的代码,但我不知道如何将其推广到x个突变数。
def generateAllMutan(baseSeq):
base= ["A", "T", "C", "G"]
mutantList = []
for i in range(len(baseSeq)):
for nuc in base:
if nuc != baseSeq[i]:
seqName