早在今年伊始,本体技术团队开始了本体版本 EVM 的研发。在已有的三种多虚拟机(NeoVM、Native 和 Wasm)的基础上,增加最具有广泛适用性的 EVM(以太坊虚拟机)。目标是尽可能保持本体和以太坊平台的无缝衔接,带来对开发者与用户高度友好的体验。
本体就是对那些可能相对于某一智能体(agent)或智能体群体而存在的概念和关系的一种描述。
本体与知名代码审计机构慢雾科技合作发布的《本体安全漏洞与威胁情报赏金计划》持续进行中,上报单个有效漏洞奖励最高可达12,000美金,受到大量开发者关注。
近日,本体北斗节点基础设施已集成至专注于 IaaS (Infrastructure as a Service)服务的 Bison Trails 平台。这一战略性整合让企业用户在不需要特殊技术标准和服务水平的前提下,轻松在本体平台上实现测试及部署。
“ 区块链业内传来重磅消息!新一代分布式链网体系“本体网络”的许可链开源项目Ontology Zero入选国家工信部区块链开源项目计划,将助力国家区块链技术与产业发展。 ” 📷 2016年10月,国家工信部中国电子技术标准化研究院联合国内重点企业成立了中国区块链技术和产业发展论坛(CBD-Forum),共同开展区块链技术和应用发展研究工作,同时,CBD-Forum发起建立了一个开放式的社区“分布式应用账本”(DAppLedger)。社区将以成员自主开发的底层平台为基础,逐步建立多平台运营模式,在应用集成过程
试想这样一个场景,一个区块链平台业务迅猛发展,用户数量呈现井喷式增长,很快从百万级达到了千万级,短时间内带来了相关成本的急剧上升。此时此刻,什么样的方式能够继续保持业务体系的高效运转,不必因为复杂的共识和确认流程而阻碍发展步伐?扩容,就成为了企业选择技术解决方案的一条必经之路。
记得在文章CD8+CD28- Treg||我就不信就我一个人觉得现有的细胞群命名有点麻烦和文章单细胞数据科学的十一个重大挑战中,我们提出过传统细胞类型定义的困惑:细胞名称及其相互关系不明。说到底是语义不明,以至于同样的细胞类型在不同的语境下表达方式可能完全不同。这就像基因的命名和功能一样,于是我们开发出了一套本体论(Ontology):GO(Gene Ontology )。不得不说,这是一项革命性的思路,一下子使我们研究基因的功能有了范式,同行之间的交流也方便了许多。
我们在以前的文章中已经介绍了使用大语言模型将非结构化文本转换为知识图谱。但是对于知识图谱的创建是一个很复杂的过程,比如需要对属性增加限制,创建符合特定主题/模式的图谱,并且有时文档非常大,无法作为单个提示处理,所以在切分后的提示中创建的图谱需要前后一致。
选自Google Research 机器之心编译 参与:李亚洲、晏奇、微胖 近日,谷歌开放了一个大规模的音频数据集 AudioSet。该数据集包含了 632 类的音频类别以及 2084320 条人工标记的每段 10 秒长度的声音剪辑片段(包括 527 个标签)。此项研究论文已发表于最近正在新奥尔良举办的 IEEE ICASSP 2017 大会上。论文原文可点击文末「阅读原文」查看。 项目地址:https://github.com/audioset/ontology AudioSet 包含了 632 类的音频
上一期我们详细介绍了 Ontology Layer 2的工作流程。主要包括3个主体部分,Ontology Deposit 到 Layer 2、Layer 2 Withdraw 到 Ontology 以及 Layer 2交易和安全性保证。
上一期我们介绍了本体 Python 智能合约的合约执行 API,本期我们将讨论如何通过 Native API 来进行本体原生合约调用。原生合约调用最典型的功能就是合约转账,这也是整个智能合约最核心的部分。Native API 只有1个 API。用法如下:
语义Web或语义网(Semantic Web)由WWW的创始人Tim Berners-Lee于2000提出[1][2],并于2001《科学美国人》杂志发表论文“ The Semantic Web”[3]。作者在文中这样描述“语义网不是一个独立的网络,而是当前的这个网络的显示的数据的能力将会大大提高,这样语义网建设的进展就将有助于创造出引人注目的全新功能。”
说到本体论,生信的同学估计第一个想到的就是基因本体论 ( Gene Ontology, GO ) 了,而基因本体论其实也是开放生物医学系统注释(Open Biomedical Ontologies (OBO))下的一个分类项目。今天来说另外一个生物科学数据分析和数据管理本体论——EDAM - Bioscientific data analysis ontology。
在上一期的技术视点中,我们介绍了合约原生 API,讲述了如何利用智能合约进行ONT / ONG 转账。本期我们将讨论如何通过 Upgrade API 来进行合约升级。合约升级共有2个 API,分别为 Destroy 和 Migrate。其用法如下:
“在与另一个高速区块链虚拟机 EOS Wasm 的对比评测中,综合执行性能达到 EOS Wasm 两倍以上。”
上周,本体宣布支持 EVM 的测试网正式部署并向全球开发者开放 EVM 兼容公测。同时,与知名代码审计机构慢雾科技合作发布《本体安全漏洞与威胁情报赏金计划》(https://slowmist.io/en/ontology/)正式启动,上报单个有效漏洞奖励最高可达12,000美金。
基因本体论定义与基因功能有关的概念('GO术语'),以及这些功能如何相互关联。随着生物学知识的积累,它不断修改和扩展。GO描述了三个方面的功能:分子功能(基因产物执行的分子水平活动),细胞组分(相对于基因产物执行功能的细胞结构的位置)和生物过程(更大的过程,或通过多种分子活动完成的“生物学课程”)。
为庆祝本体主网发布4周年,我们特地举办了征文大赛。目前已经收到多篇投稿,并从中筛选出符合大赛要求的优质作品。我们将在【本体研究院】陆续发布这些佳作,以供欣赏。当前为大赛第二篇征文。
日前的政策利好将区块链推向了前所未有风口,“把区块链作为核心技术自主创新重要突破口,加快推动区块链技术和产业创新发展”成为了区块链行业最新的工作指示。我们感到十分兴奋,因为我们一直都在正确的道路上持续前行,为这一场区块链技术攻坚战厉兵秣马。
智能合约安全问题一直是区块链技术体系中探讨得比较多的话题之一。无论是以以太坊 EVM 虚拟机为代表的智能合约体系,还是以 EOS WASM 虚拟机为代表的智能合约体系,都或多或少地暴露过不同类型的智能合约漏洞。这些漏洞不仅使得项目方和用户损失惨重,而且也让用户对区块链的安全性产生了质疑。
在前两期的本体技术视点中,我们介绍了跨合约静态调用与动态调用,讲述了如何使用 RegisterAppCall API 与 DynamicAppCall API 跨合约调用其他合约的函数。本期将进入本体 Python 智能合约语法专辑的终极篇,探讨如何使用合约执行引擎 API,即 ExecutionEngine API。它包含了3个 API,用法如下:
Ontop is a Virtual Knowledge Graph system. It exposes the content of arbitrary relational databases as knowledge graphs. These graphs are virtual, which means that data remains in the data sources instead of being moved to another database.(概要:Ontop 是虚拟只是图谱系统,它能把关系型库中的数据映射成知识图谱)
【人工智能头条导读】本文是我们知识图谱系列的第二篇文章,希望人工智能头条为大家准备的文章对大家的学习有更多的帮助。
互联网时代,人类在与自然和社会的交互中生产了异常庞大的数据,这些数据中包含了大量描述自然界和人类社会客观规律有用信息。如何将这些信息有效组织起来,进行结构化的存储,就是知识图谱的内容。
描述逻辑的公理可以用来定义术语,所以称为Terminological Box,简称Tbox
一、介绍1、分子功能(Molecular Function,MF )2、细胞组分(Cellular Component ,CC)3、生物过程(Biological Process ,BP)二、GO术语的构成1、基本要素2、可选要素三、基因本体论中的关系1、关系的描述2、节点的连接3、GO的主要关系四、GO 图(有向无环图)五、GO的动态更新
是系统分析基因功能、基因组 信息数据库,它有助于研究者把基因及表达信息作为一个整体 网络进行研究,以“理解生物系统的高级功能和实用程序资源库”著称。
本系列参考了市面上已知的,几乎全部“知识图谱”相关文章,并总结提炼出一套适合初学者入门的“知识图谱”的知识体系,希望大家能有所收获。
本体主网上线4周年征文大赛已经接近尾声。本篇作为本次大赛的最后一篇佳作,由一位正亲身参与 Web3 构建的专业人士撰写,结合了自己的构建经历,为我们讲述了 Web3 构建的关键要点。
上一期我们介绍了合约升级 API,讲述了如何销毁和迁移智能合约。本期我们讨论如何跨合约静态调用。API 只有一个,用法如下:
本文为系列长文,为便于读者单独阅读每篇博客都对整体项目有个大致理解,每个文章前都大致介绍下完整流程,包括数据集的介绍,数据处理,以及本篇博客相关的内容。
Ontology Wasm 自从上线测试网以来,得到了社区开发人员的极大关注。因为这项技术使得业务逻辑复杂的 dApp 合约上链成本降低,极大丰富 dApp 生态。
· 选择性披露类型的凭证增强了对用户身份隐私的保护,使用户出示凭证更加灵活和方便。
通过RDF(S)可以表达一些简单的语义,但在更复杂的场景下,RDF(S)语义表达能力显得太弱,还缺少诸多常用的特征。包括对局部值域的属性定义,类、属性、个体的等价性,不相交类的定义,基数约束,关于属性特征的描述等。因此W3C提出了OWL语言扩展RDF(S),作为语义网上表示本体的推荐语言。
数字化协会理事顾问 广州佰聆数据顾问有限公司解决方案经理 大家好,我是中国数字化协会的理事顾问,郑午。今天与大家浅谈一下-知识图谱。 知识图谱最早是谷歌在2012年推出的一个知识库,谷歌用这个知识库支持它新一代的搜索引擎。简单来说,知识图谱是由一些相互连接的实体,和它们的属性共同构成的。其中每一条知识都可以表示为一个SPO三元组,SPO是英文(Subject, Predicate, Object)的首字母缩写,翻译成中文可以理解为:(实体一,谓词,实体二)。这个谓词定义了实体一与实
全基因组关联研究(GWAS)可以揭示重要的基因型-表型关联,但数据质量和可解释性问题必须得到解决。对于根据现有证据确定目标靶点的药物发现科学家来说,这些问题已不是单一的药物发现研究。作者开发的TIGA(Target Illumination GWAS Analytics)通过对全基因组关联研究(GWAS)中与性状相关的蛋白质编码基因进行评分和排序,促进药物靶点的发现。TIGA可以用相同的基因-性状关联指标对性状进行评分和排序。这一重点应用提供了一种合理的方法,通过该方法,GWAS的发现可以被聚合和过滤,以获得适用的信息,并为药物发现科学家提供可用的证据,为确认药物靶点的优先级,以便于研究。
上一期我们讲到建立于本体主链基础设施上的去中心化资源交换协议通用资源交易协议(Generic Resources Exchange Protocol,GREP)。介绍了约定和术语等基础信息。
Cytoscape可以读取一下格式的文件,这些文件实际是提供了cytoscape和其他一些工具的接口。
知识图谱(KnowledgeGraph)是谷歌在2012年提出的,其旨在实现更智能的搜索引擎,并且于2013年以后开始在学术界和业界普及。目前,随着智能信息服务应用的不断发展,知识图谱已被广泛应用于智能搜索、智能问答、个性化推荐、情报分析、反欺诈等领域。随着知识图谱技术不断发展,现在已不仅仅局限于语义搜索相关应用,还成为了解决抽象知识与底层数据之间语义鸿沟问题的主要方法。
侧重发现模式层等价或相似的类、属性或关系,也成为本体映射(mapping)、本体对齐(alignment)
我们经常在科研文章中看到功能富集分析,包括GO和KEGG富集分析。前面我们也给大家分享过一些GO和KEGG富集分析相关的一些文章
随着AI工具AlphaFold2的问世,已解析了约2亿个蛋白质的结构,几乎覆盖了地球上已知的蛋白质。现如今,蛋白结构解析已变得可行,但大多数可用的蛋白序列缺乏相应的生物学注解。相比于全长的蛋白,其结构域在语义注解方面所受关注却较少。
https://github.com/shijiebei2009/CEC-Corpus
另外,插一个题外话,因为黑粉瞎举报,我们生信技能树已经被取消了半个月的原创标识功能,让我很不爽。
这个系列文章描述了一个单一的语义数据模型来支持物联网和建筑、企业和消费者的数据转换。 这种模型必须简单可扩展, 以便能够在各行业领域之间实现插件化和互操作性。 对于一个目前从事智能硬件的老码农,觉得这些文字具有积极的参考意义。在这第二部分, 尝试确定上层本体在解决元数据挑战中的作用, 以及如何能够提高可伸缩性。
KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系统分析基因功能、基因组 信息数据库,它有助于研究者把基因及表达信息作为一个整体网络进行研究,以“理解生物系统的高级功能和实用程序资源库”著称。
本期我们围绕去中心化身份,带来一篇本体创始人李俊发表在 Coinmarketcap 上的署名文章。以较为通俗易通的方式,分享本体在自主主权身份方面的一些观点。
Gene Ontology分为分子功能,生物过程和细胞组成三个部分。蛋白质或者基因可以通过ID对应或者序列注释的方法找到与之对应的GO号,而GO号可对应到Term,即功能类别或者细胞定位。这也是GO富集的一个基础。
本篇文章接《电影知识图谱问答(一)|爬取豆瓣电影与书籍详细信息》,学习如何利用爬取的数据,构建知识图谱所需的三元组。主要内容包括如何从Json类型的数据,转换成RDF数据,并最终存储到Jena之中,然后利用SPARQL进行查询。
近期,本体技术视点带来了区块链领域的“芝麻信用”——OScore 的细致解读,也介绍了本体的 ONT ID 和信任锚平台 ONT TAG 如何助力币安智能链上的 STO 项目。本期技术视点将围绕本体的去中心化身份框架 ONT ID 展开。
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