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资深博导:我以为数据预处理是常识,直到遇到自己的学生

本文将基于 NIR soil 近红外光谱数据,运用 Python 语言进行数据处理,并通过图表直观反映预处理带来的变化。...(数据集:后台回复 [ NIR soil ] 获取 )常用的光谱数据预处理技术包括:MSC(多元散射校正)SNV(标准正规化变换)光谱微分基线校正去趋势一、MSC(多元散射校正)import pandas...基线校正后的光谱(右侧图)颜色和形状:每条绿色的线代表一个样本的校正后的光谱数据,颜色浅且分布较集中。...总结变化:经过基线校正处理后,光谱数据的基线漂移被有效去除,减少了由测量误差和环境因素带来的影响,使得光谱数据更加清晰和稳定。...意义:基线校正处理通过去除光谱数据中的基线漂移,提高了数据的质量和一致性,便于后续的分析和建模。防失联,进免费知识星球交流。

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    婴儿EEG数据的多元模式分析(MVPA):一个实用教程

    这些滤波信号平均运行时间为20 ms,在50 - 500 ms之间进行平滑处理,并进行基线校正。...3 MVPA的实现3.1 编程实现为了让本教程尽可能广泛地普及,我们提供一个双核心分析步骤下面描述的示例实现MATLAB (R2019b)和Python (Python 3)。...在Python实现中,SVC的所有参数都保留为默认值。Matlab实现在调用SVM训练函数时指定了一个线性核。...其次,遵循成人脑磁图数据MVPA的常见做法,在每个通道和试验中对脑电图时期的基线期进行z评分,而不是简单地进行基线校正(这在ERP分析中很典型)。...为了评估这种额外的z评分归一化对分类精度时间序列的影响,我们接下来计算并比较了从z评分和非z评分(即基线校正)数据中获得的分类精度时间序列。

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    GazeR-基于采样点数据的注视位置和瞳孔大小数据分析开源工具包

    对于来自瞳孔测量研究的数据,gazeR包具有读取和合并多个原始瞳孔数据文件的功能,去除缺失值,消除伪迹,眼睛识别和插值,进行基线校正,和合并数据的功能。...在做完降噪后,需要进行基线校正。为了控制由非任务相关(紧张)唤醒状态引起的整体瞳孔大小的变化,通常使用基线校正。...减法基线校正在文献中更为常见,这种做法反映了与基线大小无关的瞳孔反应的线性。...baseline_correction_pupil函数查找每个试验在指定基线期间的中位数瞳孔大小,并在默认情况下执行减法基线校正。...这就产生了每个被试的平均基线校正瞳孔直径,条件和时间窗这么多列数据。如果您想保持原始数据,您可以跳过这一部分。

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    视觉字符串大脑左半球皮层特异化预测学龄前儿童基本字符-声音关联认知能力

    所有电极均根据其最大波幅值进行排序,该值为基线校正后四次谐波(1.2 Hz、2.4 Hz、3.6 Hz、4.8 Hz,所有P值<0.005)的总平均(F/5–4F/5;见材料和方法)。...基于这一结果,在实验1中,用3(实验条件:PF-W,PF-PW,PW-W)×2(半球:O1,O2)水平的重复测量方差分析(ANOVA)来分析基线校正后波幅总和。...(B)具有低水平和较高水平字符认知的儿童对伪字体(PF-letters)中字符的辨别反应(基线校正后)地形图。 (C)偏侧化指数(LI),PF-letters条件下,LI在不同组表现不同。...,用4(实验条件:PF-letters, visual control (VC)-symbols, VC-script,VC-drawings;图4]×2(半球:O1,O2)水平)重复测量方差分析分析基线校正后波幅差异...地形图表示letters, symbols, script, andline drawings的辨别反应,相对于各自的视觉对照刺激(基线校正)。

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    PNAS:基于频率标记EEG分离视觉皮层数值和连续幅度提取的数值神经特征

    基于频谱,研究人员计算了两个指标来确定大脑是否以及如何对五种情况下的偏差频率做出具体响应:基线校正的幅度之和(SBA)和Z分数。SBA以微伏表示,因此可以量化EEG信号内的变化。...研究人员从目标频段(即1.25Hz)中减去20个周围频率频段的平均幅度和后者的20个周围频段(每侧10个,不包括与目标频段紧邻的频段)的平均幅度来计算基线校正后的幅度,这构成了基线幅度。...研究人员类似地计算了感兴趣频率相对于其相邻频率的基线校正的谐波幅度(即向上18次谐波)。然后,研究人员将感兴趣的频率及其谐波所获得的基线校正幅度相加。...3、研究结果 为了测量与每个维度的辨别相对应的神经反应,研究人员将目标频率(1.25 Hz)及其18次谐波(即响应显著的最高谐波)的基线校正幅度相加,不包括基频的谐波(如先前研究中的10Hz和20Hz)...计算每个参与者和每个条件的基线校正幅度(SBA)总和,然后在组级别上求平均值。研究人员发现,在组级别上,三个视觉维度(总面积、凸包和数值)的最大比率,对偏差刺激有明显的反应(图2)。

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    PythonPython 包 ① ( Python 包引入 | Python 包概念 | Python 包结构 | 创建 Python 包 | 导入 Python 包 )

    一、Python 包简介 1、Python 包引入 之前 介绍了 Python 模块 , 每个 Python 源码文件 , 都可以定义为一个 Python 模块 ; 如果 定义的 Python 源码模块很多..., 有几百上千个 , 则会出现管理繁琐 , 混乱的问题 ; 这里引入 新的代码结构 " Python 包 " ; 2、Python 包概念 Python 包 概念 : 包是 Python 模块 Module...的扩展 , 将若干 相关的 Module 模块 组织起来 形成一个 Python 包 , 可以更好地 组织 和 管理 Python 代码 ; 在 Python 包中 可以 定义 变量 / 函数 / 类..., 可以 更好地 组织 和 管理 Python 代码 ; 除了 自定义 Python 包之外 , Python 还提供了 Python 标准库 和 其他人编写的第三方 Python 包 来扩展 Python...包 右键点击 PyCharm 中的 Python 工程根目录 , 选择 " New / Python Package " 选项 , 输入 Python 包名称 , 然后点击回车 , 创建 Python

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