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2
回答
在
python
中将层次聚类的结果绘制在数据矩阵的顶部
、
、
、
、
在
Python
中,如何将
树状
图
绘制在值矩阵的顶部,并适当地重新排序以反映聚类?下面是一个示例: 我使用scipy.cluster.dendrogram制作
树状
图
,并对数据矩阵执行分层聚类。那么,我如何将数据绘制为矩阵,其中行已被重新排序,以反映在特定阈值下切割
树状
图
所导致的聚类,并使
树状
图
与矩阵一起绘制?我知道如何在scipy中绘制
树状
图
,但不知道如何绘制数据的强度矩阵,并在其旁边使用正确的标尺。
浏览 5
提问于2010-06-06
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3
回答
python
中基于基因表达矩阵的层次聚类
、
、
、
、
我如何在
Python
中进行分层聚类(在本例中是针对基因表达数据),以显示基因表达值矩阵和
树状
图
?我的意思是像下面这样的例子: 如何在
Python
中使用numpy/scipy或其他工具执行此操作?编辑:很多人建议使用聚类包,但我仍然不确定如何绘制上面在
Python
中链接的图像。例如,我如何使用Matplotlib将
树状
图<
浏览 0
提问于2010-06-05
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3
回答
聚类热
图
(带
树状
图
)/
Python
、
、
、
、
我正试图用
Python
巧妙地创建一个集群热
图
(带有
树状
图
)。他们在他们的网站上做的不是很好的扩展,我已经找到了各种各样的解决方案,但大多数是在R或JavaScript。我正在尝试创建一个热
图
,其中只包含来自热图左侧的
树状
图
,显示跨y轴的集群(从分层聚类)。一个非常好看的例子就是这个例子:。我的目的是创建这样的东西,但只有左边的
树状
图
。如果有人能用
Python
实现这样的东西,我会非常感激的! 让数据是X = np.ra
浏览 15
提问于2021-03-09
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2
回答
大型数据集的Scipy误差树形
图
绘制
、
、
、
但我需要把
树状
图形象化。当我使用
树状
图
方法时,它可以很好地处理5-6k用户向量。但我的数据集包含16k个用户向量。当我为16k用户运行它时,
树状
图
函数抛出以下错误: File "/home/enthought/lib/
python
2.7/site-packages/scipy/cluster/hierarchy.py", line 2333, in _dendrogram_calculat
浏览 0
提问于2012-04-18
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2
回答
Python
+ Matplotlib:多层次
树状
图
?
、
、
、
我最近从看到了这个
树状
图
(有两个层次结构,有色的,规整的
树状
图
)。 palette="Set3",border.col="#FFFFFF") 我想知道如何用
Python
我搜索了一下,但是没有找到任何多层次的
树状
图例子。
浏览 0
提问于2018-06-12
得票数 7
4
回答
在
python
中手动绘制
树状
图
、
、
我使用
python
库"
python
- graph“来表示图形。现在,在我的计算的每一步(算法是迭代的),我必须绘制
树状
图
的一部分。实际上,该算法是分裂的,因为从原始
图
开始计算聚类。现在,我不知道用什么来绘制
树状
图
(有人建议使用PIL,但我正在寻找简单的东西,我不知道如何使用PIL)……你能给我一些建议,并告诉我如何用它来进行绘图吗?注意:我读了其他问题,但似乎所有问题都使用了自动计算集群的方法……这不是我想要的:我需要手动绘制
树状
图<
浏览 5
提问于2011-06-26
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1
回答
从海上簇图中提取
树状
图
、
、
、
给出了以下示例,它来自:import pandas as pdurl = 'https://
python
-graph-gallery.comurl)del df.index.namesns.clustermap(df) 问:如
浏览 0
提问于2018-10-21
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1
回答
层次聚类算法中的
树状
图
分析
、
、
、
我正在使用
python
执行分层聚类。distance_sort='descending', plt.show()output = cluster.fit_predict(dataset)array([0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1]) 这两类与
树状
图中的不同我目前从
树状
图中手动注意到类的索引。
浏览 12
提问于2021-09-15
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1
回答
如何使用
Python
可视化锦标赛托架?
、
如何使用
Python
生成像上面这样的锦标赛括号图像?这种图像让我想起了一个
树状
图
(我不确定它是否真的是一个
树状
图
),而且我知道
Python
可以生成非常复杂的
树状
图
,所以我觉得我的简单而规则的结构应该是可能的。我的首要任务是尽可能直截了当地解决问题。在运行
Python
3.7.10的木星笔记本中,我尝试了以下方法: 据我所知,这是使用
Python
2代码时的错误吗?我
浏览 0
提问于2021-06-19
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1
回答
Python
中的iGraph : VertexDendrogram对象和VertexClustering对象之间的关系
、
、
在
Python
语言中使用iGraph的社区检测函数community_fastgreedy(),我获得了一个VertexDendrogram对象,让我们称它为V。然后使用V.as_clustering(),我从
树状
图中获得了一个VertexClustering对象。我知道社区是集群的,所以模块化是最大化的,但我认为
树状
图
对象一直在合并,所以很难在
树状
图上看到社区。 我的问题是: V.as_clustering()的输出如何与
树状
图中社区之间的距离相对应?换句话说,每个社区都有一个代表性的
浏览 2
提问于2013-07-02
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1
回答
如何在R中手动创建heatmap.2的
树状
图
矩阵?
、
bluered)#fig1我想在fig2中创建一个
树状
图
,其中X和Y被手动分组在一起,这样我就可以与fig1比较相关
图
,其中
树状
图
是使用距离计算的。
浏览 8
提问于2014-02-19
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1
回答
R和Matlab结构
、
、
、
我对R知之甚少,但我需要将matlab中的层次聚类所产生的
树状
图
转换为R
树状
图
结构。下表显示了matlab函数中分层聚类产生的
树状
图
;其中第一列和第二列是对象或分支的is,第三列是距离。 有没有办法把这个表(或matlab的
树状
图
)映射成R
树状
图
?
浏览 1
提问于2016-01-18
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1
回答
用于d3.js树可视化的json树形
图
、
、
我正在尝试将枕层次聚类的结果转换为json,以便在这里显示在d3.js中, 下面的代码生成一个有6个分支的
树状
图
。
浏览 2
提问于2013-11-13
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2
回答
库或任何用于绘制
树状
图
的API
我有一个包含一些数据的MySQL数据库,它与JSP页面交互,问题是我必须从数据库中存储的各种文件绘制
树状
图
。
浏览 1
提问于2009-03-11
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1
回答
在
python
中从嵌套字典绘制
树状
图
、
、
、
、
我在用
python
绘制
树状
图
时遇到了问题 我有以下数据: [{ "ro": 66.33, "label/ \ / \ / \ / \ 1 2 4 5 我想不出如何从这个数据集中画出
树状
<
浏览 29
提问于2019-01-13
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1
回答
来自Factorminer Hclust对象不在Pheatmap中聚类
树状
图
、
、
交叉发布:https://www.biostars.org/p/450365/ 我正在尝试使用pheatmap::pheatmap创建一个20行10列的矩阵热
图
。15, cluster_cols = pcahcpc.tree) 运行上面的代码得到了下面的热
图
,
浏览 35
提问于2020-07-19
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1
回答
如何在GUI中绘制DENDROGRAM
、
、
、
、
我正在使用QtDesigner的图形用户界面来绘制
树状
图
。我的代码如下,但我不能绘制
树状
图
,我如何修复它?
树状
图
图像:
浏览 48
提问于2021-02-27
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2
回答
R中的决斗
树状
图
(在r中将
树状
图
背靠背放置)
、
、
、
、
有没有什么相当直接的方法可以把两个
树状
图
“背靠背”放在r中?这两个
树状
图
包含相同的对象,但聚类方式略有不同。我需要强调
树状
图
的不同之处。如果能够对
树状
图
进行线条划分,以最大化对象之间的直线数量(见上文),这将突出
树状
图
之间的任何差异,这将是很棒的。 有什么想法吗?
浏览 1
提问于2012-09-17
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1
回答
通过枕叶
图
给出相似矩阵
、
、
、
我用
Python
计算了一个jaccard相似矩阵。我想聚类的相似性最高至最低,然而,无论我使用什么链接功能,它都会产生相同的
树状
图
!我觉得函数假定我的矩阵是原始数据,但我已经计算了第一个相似矩阵。有没有办法把这个相似矩阵传递到
树状
图上,这样它就能正确地画出
图
来?或者,我必须输出矩阵,简单地用R完成它,通过原始的原始数据是不可能的,因为我正在计算单词的相似性。谢谢你的帮助!show() 如果运行这段代码,您将看到一个完全向后的
树状
图
。无论我使用哪种连接类型,它都会产生相同
浏览 3
提问于2015-03-12
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1
回答
Python
中的TreeMap -垂直和水平
、
、
、
下面有代码,它简单地用
Python
创建
树状
图
。有人可以帮助我只创建
树状
图
或水平的所有垂直矩形使用下面的代码示例。sizes=volume, label=labels, color=color_list, alpha=0.7)plt.show()它应该看起来像水平或垂直堆栈条形
图
。但是在
Python
中使用Treemap创建任何选项。因为我想进一步修改它。下面是建议的外观.所需的水平输出
浏览 0
提问于2020-12-27
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