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    -02- DOE实验设计步骤

    1.1 基于OFAT的传统实验设计: 每次实验只考虑一个参数的影响,其它参数都是固定不变的 只适用于简单工艺过程,因为它不考虑因素间的相互影响 效率低下 不能找到真正的最优值(区间) 1.2 基于...DoE的现代实验设计: 一次可以考虑多个参数影响(并行分析) 考虑不同因素间的相互影响 通过最少的实验次数获得尽可能多的信息 能更好的找到系统的最优区间 1.3 DOE和OFAT的比较 在应用上,...步骤 2.1陈述实际的问题和实验的目的 表述自己课题的难点以及实验的可行性 2.2因果链分析,提取重要的因子 了解筛选或表征研究的主要作用和相互作用,每个因子的两个级别,可最大程度地减少工作量并最大化信息.... 2.3选择Y的响应变量 选择Y的响应变量,对因子进行重要性排序; 2.4陈述因子和水平 对每个因子进行水平的设计; 2.5选择DOE实验设计 进行实验的设计 2.6实施实验以及收集数据 进行实验之前要进行...,测量系统误差的分析,确定是否稳定; 进行实验并统计数据; 2.7分析实验结果 进行分析和实验设计 2.8结论和计划 进行结果和计划

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    你的pcr为什么定量不出来?

    最近有很多同学私聊小编说,刚进入实验室开始科研,但qPCR结果却总是不理想,实验一直停滞不前,非常的苦恼。...记得我刚进实验室的时候,为了验证目标lncRNA在癌和癌旁的组织中有没有差异,闷着头做了两个月的qPCR。那么什么是qPCR呢,为什么有的同学结果总是不理想呢?...相对定量:基因的表达差异,耐药研究... qPCR实验方法的选择 大家在查阅别人的实验文章时应该不难发现,目前实验室里常用的几种方法有SYBR Green I法、水解探针法(TaqMan法)等等。...图上这抹神秘的绿色就是它啦~(原理和具体的实验步骤相信大家肯定比我还熟悉,就不在这里赘述啦,挑重点的叨叨一下) ?...(图片来自网络) 有个私信我的同学问,为什么自己明明是按照步骤来的,上机以后却总显示未检出呢,我觉得可能跟童鞋们的实验习惯有关系。

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    核酸提取干货 - MedChemExpress

    著有 “玄学” 之称的分子生物学,师兄师姐说小 M 要做的都是 “升级打怪入门级” 的实验,然而,实验记录本上清晰地罗列着自己整理的堪称完美的 (假装看懂的 Steps) 实验流程,可是完美的流程下,总是充斥着不丝滑的操作...提取步骤核酸提取主要包括细胞裂解、核酸吸附、杂质漂洗和核酸洗脱四步。那具体到实验中,我们该选择哪种提取方法呢?这就要看个人的实验设计方案及实验组的经费情况啦!...纯化的病毒 DNA/RNA 可用于 PCR、RT-PCR、qPCR实验。...RNA 提取后续试验主要包括 PCR、RT-PCR、qPCR、cDNA 文库构建等,RNA 没提好,后面的实验问题也是连贯性的,一个不小心可就都 game over 了。...即我们需要明确下一步的实验,如果是 PCR,其实验本身对 RNA 的质量要求没有那么高,而 qPCR 对 RNA 的要求相对又高点,但如果要做 cDNA 文库构建,其对 RNA 的要求就很高了,因此 RNA

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    一文读懂:PCR,qPCR,Real-time PCR,RT-PCR和RT-qPCR

    PCR——实验室必备实验,从基因鉴定到信号通路验证,几乎每周都要做那么几次。...通过一系列精心设计的反应步骤,PCR可以在短时间内将微量的DNA片段扩增到足够数量,用于后续的研究和检测。...PCR的过程大致可分为高温变性、低温退火、适温延伸三个基本反应步骤。...(2)实时荧光定量反转录PCR(Real-time RT-PCR,RT-qPCR) 实时荧光定量反转录PCR(Real-time RT-PCR,RT-qPCR)是qPCR和RT-PCR的组合,所以RT-qPCR...PCR主要用于DNA序列的扩增和检测;qPCR可以实时定量检测DNA或cDNA的含量;RT-PCR主要用于RNA分子的扩增和检测;而RT-qPCR则结合了RT-PCR和qPCR的技术,可以对RNA分子进行定量分析

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    基于文本表示推断化学反应的实验步骤

    如大规模采用通用化自动合成平台需要借助激活程序来为独特的化学反应创建特定的执行步骤,即从人工智能模型提出的化学方程式开始,确保在实验室条件下中反应所需的一系列步骤能够成功执行。...2.方法 预测任务 作者将推断实验步骤的任务定义为从化学方程式开始预测操作步骤。预测任务与单步反应的步骤有关,如果是多步合成,则是对每个单步反应分别进行实验步骤的预测。...数据 作者从头构建了一个包含化学方程式和相关实验步骤的化学反应步骤数据集。...因此,作者将Smiles2Actions模型看作为化学合成来编写代码,借助人工智能技术推断实验步骤将减少传统实验室中的试错量。...在模型给出预测的实验操作顺序后,实际合成之前总是需要验证其安全性,但人工智能很快就会达到这样的水平,即在不需要人工干预的情况下,预测的实验步骤也是可用于生产的,并可直接用于在实验室条件下驱动自动化硬件或减少传统实验室中的试错量

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    没想到一个在线qPCR工具这么火爆,再写个文字教程吧~

    ---- 为何要做qPCR在线分析工具? ---- 站长最近在整理实验数据,每次整理到qPCR数据的时候就很崩溃。...一般qPCR的结果都是机器自动生成的,配合机器自带的软件生成一个Bar图,然而这个Bar图,没有统计信息,更没有好看的配色。 想得到好看的图并加上统计信息,后期自己的处理是必不可少的。...站长之前的处理步骤是,Copy原始的Ct值到Excel表中,用一些公式和函数得到结果,之后再用Prism 7去做图。 上面这个步骤是的确是可用的,并且也能够被大部分人接受。...所以就想着把之前Excel处理qPCR数据的流程用R语言重新编译,用ggplot2对数据进行可视化,再用shiny进行交互与展示。...上面这个表格是例子数据,在公众号回复qPCR就可以获得。 注意以下几点: 1、Group不要修改,位置和名称都不要修改。Group下面列出对照组和处理组的名字,在网页上填写对照组的名字即可。

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    在线功能富集分析与qPCR引物设计

    这次主要介绍在线功能富集分析与qPCR引物设计。其中在线功能富集分析可利用本人所在课题组开发的agriGO和PlantGSEA在线分析工具,分别进行GO富集分析和基因集富集分析。 ? ?...2 qPCR引物设计 ? 目前有很多软件和在线工具可以进行引物设计。了解引物设计的原理和一些注意事项是设计好的引物的前提条件。常见的有ChIP-qPCRqPCR引物设计。...针对qPCR引物设计,对引物的要求有: 设计引物尽量靠近3'端(保证扩增效率)尽量跨越内含子(检测基因组污染)引物长度最好在18-22bp产物长度保证在80-200bp间,最长可300bp两条引物...qPCR引物特异性验证 通过以上三种方法设计的引物,可利用NCBI blast辅助进行qPCR引物特异性验证。

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    数据分析:RT-qPCR分析及R语言绘图

    这种方法的基本步骤如下:标准曲线的构建:首先,需要通过一系列已知浓度的标准品(通常是目标基因的克隆DNA)进行PCR扩增,以获得一系列的Ct值(阈值循环数,即PCR扩增过程中荧光信号首次超过阈值的循环次数...样本的Ct值测定:接下来,对实验样本进行qRT-PCR,记录目标基因的Ct值。相对定量计算:利用标准曲线,根据样本的Ct值计算出样本中目标基因的相对浓度。...数据归一化:由于qRT-PCR可能会受到实验操作和样本制备的影响,因此需要使用一个或多个内参基因(通常是表达水平相对稳定的基因)来归一化数据,以消除这些潜在的变异。...GAPDH" # 内参基因名字 # control_group="6H NC" # 对照组 # grp=c("6H M1") # 实验组排序...CT_delta_delta <- with(dat_double_delta, CT_delta - Delta_CT_control_mean) # step4: 基于对照组检测基因的平均Δ值,计算实验组的

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    实验知识-230910

    3.TBS缓冲液是生物学中常使用的等渗缓冲盐溶液,主要用于免疫组化和原位杂交,酶联免疫等实验中,清洗免疫印迹实验中非特异性结合的抗体等。...可应用于Western Blot实验中洗去膜上非特异性结合的抗体等试剂,以及免疫荧光、免疫组化等实验中封闭液的配制、一抗或二抗的配制、一抗或二抗孵育后的洗涤等,以降低背景,增强信噪比。...操作步骤包括用一半体积的 TEB 洗涤细胞核,然后在0.2 N HCl中重悬沉淀,密度为每毫升 4 x 10 7 个细胞核,最后在 4℃ 下用酸法提取组蛋白过夜。...8.定量逆转录PCR(quantitative reverse transcription PCR, RT-qPCR)是应用于以RNA作为起始材料的PCR实验中的一种实验方法。...随后,以cDNA为模板进行qPCR反应。RT-qPCR已被用于多种分子生物学的应用中,其中包括基因表达分析、RNA干扰验证、微阵列验证、病原体检测、基因测试和疾病研究。9.

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