在一个图中,我需要叠加三个热图,并希望获得RGB颜色编码,以便第一个热图用红色表示,第二个用绿色表示,第三个用蓝色表示。重叠区域应获得与三个热图的基础值相对应的RGB颜色(例如,如果所有三个热图都具有最大值,则为白色)。
我用下面的函数做到了这一点:
def get_colormap(levels):
assert levels > 0 and levels <= 16, "'levels' needs to be positive and not too high, max is 16"
rgb_colors = [[]]*((le
在Rmarkdown上绘制热图。我想通过单击热图来显示所单击数据的DT。这是可能的与闪亮。有没有可能用Rmarkdown重现这个函数?谢谢 rmarkdown.Rmd ```{r} 库(打印);库(DT);库(闪亮) P <- plot_ly(data=iris,x=~Sepal.Length,y=~Sepal.Width,z=~Petal.Length,type=“热图”,来源=“热图”) P observeEvent(event_data("plotly_click",observeEvent= "heat"),{ X <- event_dat
我需要一些关于在R中用heatmap.2生成热图的建议,我有一个基因表达值矩阵,它有15,616行和27列,用于生成热图。问题是我正在使用的代码是创建热图,但是可视化效果并不好,因为矩阵大小很大。那么,你能给我一些建议,如何从这么大的矩阵中得到一个合适的热图吗?我正在附加用于生成热图和收到的警告的命令。如果有人能帮助我调整尺寸以生成一个合适的热图,那就太好了。
color <- colorpanel(100,low="blue",mid="white",high="red")
heatmap.2(data4,Rowv="none&
我目前正处于从R和ggplot2迁移到seaborn的过程中,因为R正在为我使用的数据量而苦苦挣扎。我目前正在开发一个相当简单的热图,我已经能够在没有太多问题的情况下渲染一般的热图,但我不确定如何调整热图的分类顺序。
在本例中,我的数据具有以下标头:
Sample Position Depth Order
样本是“y轴”范畴,位置是“x轴”范畴。深度是单元格的值。Order是在其他地方计算的元值,但我想使用Order作为y轴的排序值,同时保留Sample作为标签。有没有办法做到这一点?
我已经基于模拟在R中创建了一个热图,并使用image.plot()绘制了它,我还使用contour()添加了轮廓线。我还有一个数据框,其中包含observations in first year和trend size的列,我已经使用基本R plot在热图顶部绘制了这些列。有没有一种简单的方法来计算低于0.5轮廓线和大约0.95轮廓线的点数? ?