——荀子 这篇文章讲述的是R语言中关于向量与矩阵的相关知识。希望这篇R语言文章对您有所帮助!...0 x2 1 3 5 7 9 2、cbind() # 按列组合矩阵 > cbind(x1,x2) x1 x2 [1,] 2 1 [2,] 4 3 [...1、matrix()函数 创建矩阵用matrix()函数 > a1 <- c(1:12) # 创建一个三行四列的矩阵 > matrix(a1,3,4) [,1] [,2] [...,3] [,4] [1,] 1 4 7 10 [2,] 2 5 8 11 [3,] 3 6 9 12 # 创建一个四行三列的矩阵,如果不设置...2] [,3] [1,] 1 2 3 [2,] 4 5 6 [3,] 7 8 9 [4,] 10 11 12 2、t()函数 实现矩阵的转置
三个a分别对应了k1,12个随机数中的前三个值,那条线是三个值的中位数(不是平均值哦)3.向量、数据框、矩阵、列表#先简单介绍下这些名字吧。# 1.向量是组成数据框以及矩阵的基本单位。...3.1 数据框来源# (1)用代码新建# (2)由已有数据转换或处理得到# (3)读取表格文件# (4)R语言内置数据3.1.1 新建和读取数据框df1 <- data.frame(gene = paste0...#数据框可以由不同数据类型的向量组成,但矩阵不行。...','r2','r3','r4')colnames(df1)[2] = 'CHANGE' 3.1.6 两个数据框的链接#随便建两个数据框test1 <- data.frame(name = c('jimmy...8m[,1]## [1] 1 2 3m[2,3]## [1] 8m[2:3,1:2]## [,1] [,2]## [1,] 2 5## [2,] 3 63.2.2 矩阵转置和转换
一、r语言基础图片二、数据类型数据类型:数值型(numeric),字符型(character,必须加" "or' '),逻辑型(TRUE FALSE NA存在但未知)null 不存在判断数据类型的函数class...2)数据类型的判断与转换is族函数判断图片as族函数实现数据类型转换图片3)数据类型转换的优先顺序字符型 > 数值型 > 逻辑型三、数据结构数据框约等于表格 每一列只能有一种数据类型数据框单独一列是向量...,视为一个整体向量里只有一种数据类型,但是可以有重复值向量<数据框<矩阵<列表1.向量的生成#(1)用 c() 结合到一起c(2,5,6,2,9) c("a","f","md","b")#(2)连续的数字用冒号...x = c(1,3,5,1)y = c(3,2,5,6)#(1)比较运算,生成等长的逻辑向量x == y y == x#(2)数学计算x + y#(3)连接paste(x,y,sep=",")#当两个向量长度不一致...:中括号里是由x的下标组成的向量按条件挑选某个向量中两种类型的子集x为向量 y为条件x[x%in%y]5.修改向量中的某个/某些元素:取子集+赋值#改一个元素x[4] <- 40x#改多个元素x[c(1,5
向量在R语言中,向量(Vector)是相同基本类型元素组成的序列,相当于一维数组。2.1....向量生成(1) 用 c() 结合到一起c(2,5,6,2,9) c("a","f","md","b")[1] 2 5 6 2 9[1] "a" "f" "md" "b" (2) 连续的数字用冒号“:...6 2[1] 0.000000 1.098612 1.609438 0.000000[1] 1.000000 1.732051 2.236068 1.000000(3) 根据某条件进行判断,生成逻辑型向量...有没有发生循环补齐:有没有一长一短,且返回结果和长的向量相等!!!...#按照位置:中括号里是由x的下标组成的向量----2.5.修改向量中的某个/某些元素:取子集+赋值修改一个元素xx[4] <- 40x[1] 8 9 10 11 12[1] 8 9 10 40
PART1 开篇前言 本期R语言教程,暂定分为两大部分:第一部分为“R语言快速入门和数据处理”,第二部分为“R语言可视化及绘图”。...关于R和RStudio安装在这里就不再介绍了,网上有很多相关内容,如果安装过程有困难可以后台私信我。 PS.本次内容为R包安装及初识向量。 ? PART2 R包安装 问:什么是R包?...(对于刚接触R的同学来说可能看起来比较抽象,但是没关系,我们会在后续的学习中慢慢了解R包的概念) 1.R包安装:第一次安装一个包,使用命令install.packages()即可。...PART3 初识向量 向量是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。 执行组合功能的函数 c() 可用来创建向量,c为combine的缩写。...1.向量赋值:通过'<-'或者'='将数据赋值给<em>向量</em>。 推荐使用'<-',按住键盘上'Alt'后按'-'可快速打出'<-'。
一、单个向量进行的操作1)赋值:x x x==y...TRUE FALSE> x[x %in% y][1] 3 5#可以取出x、y重复的值ps:区分x==y,x %in% yx==y #位置需要完全对应x %in% y #看看元素在不在,无所谓位置三、向量取子集...1)根据逻辑值图片2)根据位置图片四、向量修改1)改一个元素:现将要修改的元素通过位置取出来,赋值给另一个元素>xx[3] x[1] 4 7 9 32)改多个元素> x
在微博有位朋友问我可达矩阵的计算,于是发了点时间用R语言写出来了。 问题如下: 计算过程: 注意:是矩阵的乘法。
矩阵 矩阵(matrix)是一种特殊的向量,包含两个附加的属性:行数和列数,R生存矩阵按列存储 注意:向量不能看成只有一行或者一列的矩阵,二者不能混为一谈 矩阵的创建 利用matrix()函数 例如 matrix...,会改变元素类型后转变为矩阵 > mydata10 <- matrix(c(2,3,FALSE,TRUE),2,2) #向量中含有逻辑与数值型,逻辑转为数值,2行2列排序 > mydata10...[c("r3","r5"),c("c1","c3")] c1 c3 r3 3 13 r5 5 15 drop处理意外降维 上面矩阵的引用1~5条,从一个矩阵中提取的结果都为向量,如果说,我取一行或者一列返回结果要求是矩阵...,则加入drop=F c1 c2 c3 c4 c5 c6 r6 6 12 18 24 30 36 矩阵相关操作及相关函数 1.转置,函数t() > #首先创建一个矩阵 > mymatrix <-...4 10 16 22 28 34 r5 5 11 17 23 29 35 r6 6 12 18 24 30 36 > #通过t()函数进行转置,返回结果如下 > mymatrix3 <- t(mymatrix
在做表达矩阵的counts值作为RPKM的时候发现的这个知识点细节问题, 因为矩阵需要每一个样本除以它各自的文库大小,然后呢,每个基因又需要除以各自的基因长度。...所以呢,我们的表达矩阵,其实是需要除以两个长度不一的向量,而且方向不一样,一个是按照行来除以,一个是按照列来除以,我最后写的代码是: rpkm <- function(counts, lengths)...{ # 首先对矩阵进行基因长度归一化 # 矩阵除以向量是按照行分开,表达矩阵的行是基因,所以每个基因除以各自的基因长度 rate <- counts / lengths # 然后对矩阵进行文库大小归一化...很明显 counts 是表达矩阵,lengths 是不同基因长度向量,而 colSums(counts) 是不同样本的长度向量。...可以看到,矩阵除以向量,是按行的顺序来的,如果需要列,就得先转置,再转回来。
一、R语言的数据类型 向量(vector) 矩阵(Matrix) 数组(Array) 数据框(Data frame) List 向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。...二、向量 1、概念 2、赋值 使用时,一般都会直接给变量定义,也就是“赋值”。 重复对一个变量赋值,后面一个会覆盖前面一个。...x<- c(1,2,3) #将x定义为由元素1,2,3组成的向量(常用) x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数x x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数...x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次x 3、从向量中提取元素 (1)根据元素位置 x[4] #x第4个元素 x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素 x[2:4]#第2...- a[x,]#第x行 - a[,y]#第y列 - a[y] #也是第y列 - a[a:b]#第a列到第b列 - a[c(a,b)]#第a列和第b列 - a$列名#也可以提取列(优秀写法,支持Tab自动补全哦
用R语言很好地封装了,矩阵的各种计算方法,一个函数一行代码,就能完成复杂的矩阵分解等操作。让建模人员可以更专注于模型推理和业务逻辑实现,把复杂的矩阵计算交给R语言来完成。...本文总结了 R 语言用于矩阵的各种计算操作。 1....,满足第二个矩阵的列数和第一个矩阵的行数相等,所以把上面生成的 m0 矩阵( 4 行 5 列)转置为( 5 行 4 列),再用 m1 矩阵( 4 行 5 列),进行矩阵乘法,得到一个 5 行 5 列的结果矩阵...K.matrix(r, c=r) ,返回阶数为 p=r*c 的方阵,对于 r 行 c 列的矩阵 A,计算 A 和 t(A) 的直积。 计算公式: ?..., H.matrices(r, c=r) 使得 r 阶 c 阶的子列表的分量,计算从 r 行和 c 列的单位矩阵的列向量的外积导出的方阵。
今天,小编教大家用R语言绘制常用的多维数据展示图——气泡矩阵图。 首先,我们需要准备输入文件。 ?...如上图所示,准备四列数据,分别为X轴、Y轴、数值(控制气泡大小)和分类(控制气泡颜色,可为字符或数字),以"Tab"为分隔符。...准备好输入文件后,我们就可以打开R画图啦~ ## 导入R包 library("ggplot2") ## 导入数据 data <- read.table("input.txt",header = T,sep...简单几步,气泡矩阵图就画好啦~大家赶快试试吧! 具体细节大家可以搜索ggplot2的相关参数,根据自己的需求调整或者将图片导出为PDF格式,通过Adobe illustrator调整。
-= arcs[0][i]*t; } } return ans; } void getAStart(int arcs[N][N],int n,int ans[N][N])//计算每一行每一列的每个元素所对应的余子式
我们知道,R语言学习,80%的时间都是在清洗数据,而选择合适的数据进行分析和处理也至关重要,如何选择合适的列进行分析,你知道几种方法? 如何优雅高效的选择合适的列,让我们一起来看一下吧。 1....r$> library(learnasreml) r$> data(fm) r$> head(fm) 「我们的目的:」 ❝提取fm的TreeID,Rep,dj,dm,h3,并重命名为:ID,...使用R语言默认的方法:列选择 这一种,当然是简单粗暴的方法,想要哪一列,就把相关的列号提取出来,形成一个向量,进行操作即可。...> names(d1) = c("ID","F1","y1","y2","y3") r$> head(d1) 结果: 「缺点:」 这种方法,需要找到性状所在的列号,然后还要重命名,比较麻烦。...而且,后面如果想要根据列的特征进行提取时(比如以h开头的列,比如属性为数字或者因子的列等等),就不能实现了。 这就要用到tidyverse的函数了,select,rename,都是一等一的良将。
#Vector 向量的三种创建方法,两个参数:类型,长度 > x <- vector("character",length=10) > x1 <- 1:4 > x2 <- c(1,2,3,4) > x3...<- c(TRUE,10,"a") #如果给向量赋值时元素类型不一致,R就会强制转换,将他们变为同一类型 > x4 <- c("a","b","c","d") > #强制转换的函数如下: > as.numeric...> as.character(x4) [1] "a" "b" "c" "d" > class(x1) #查看数据的类型 [1] "integer" > names(x1) <- c(x4) #给向量每一个元素添加名称
——荀子 这篇文章讲述的是R语言中关于向量相关知识。希望这篇R语言文章对您有所帮助!...如果您有想学习的知识或建议,可以给作者留言 一、向量的概念及简单介绍 1、概念 向量,vector,是R中最重要的一个概念,它是构成其他数据结构的基础。...R中的向量概念与数学之间的向量是不同的,类似于数学上的集合的概念,由一个或多个元素所构成。 向量其实是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。 用函数C来创建向量。...其中R内置的函数中,格式为为向量的有: euro rivers stat.abb state.name state.area 2、创建向量和查看向量 1、创建向量 1、创建向量:c(),...超过部分 NA自动补齐 > letters[1:30] [1] "a" "b" "c" "d" "e" "f" "g" "h" "i" "j" "k" "l" "m" "n" "o" "p" "q" "r"
R语言中的常用数据结构,包括向量、矩阵、数组、列表和数据框。关于数据结构的使用,我们将分四篇文章分别介绍每种数据结构的操作方法和代码示例。...为方便大家理解记忆,对每种数据结构的基本操作概括为四大类:创建数据结构往里面添加数据从里面查询数据对里面的数据进行修改这篇文章我们将介绍向量的使用向量向量是R语言中最基本的数据结构,它是由一系列相同类型的元素组成的一维数组...向量的类型可以是数值、字符、逻辑或因子等,但是每个向量只能包含一种数据类型。向量的长度是指它包含的元素个数,可以用length()函数来获取。...创建向量创建向量的一种常用方法是使用c()函数,它可以将多个元素组合成一个向量。...TRUE FALSE访问向量访问向量中的元素可以使用方括号[]和索引号。
至此,我们支持向量机的分类问题转化为了如何寻找最大间隔的优化问题。...我这里不打算讨论具体的算法,因为这些东西完全可以参阅july大神的《支持向量机通俗导论》,我们这里只是介绍遇到问题时的想法,以便分析数据时合理调用R中的函数。...w) 不同的是我们如何选择f,R。...三、libSVM的R接口 有许多介绍SVM的书都有类似的表述“由于理解支持向量机需要掌握一些理论知识,而这对读者来说有一定的难度,建议直接下载LIBSVM使用。”...加入的办法有以下3类,写成最优化问题形式总结如上图: 上图中e为所有元素都为1的列向量,Qij=yiyjK(xi; xj), K(xi; xj) =phi(xi) ∙phi (xj), phi
向量、矩阵和数组 1.0简介 1.1创建一个向量 1.2创建一个矩阵 1.3创建一个稀疏矩阵 1.4选择元素 1.5展示一个矩阵的属性 1.0简介 向量(vector) 矩阵(matrice) 张量(tensor...) 行(row) 列(column) 1.1创建一个向量 import numpy as np vector_row = np.array([1, 2, 3]) vector_column = np.array...([[1], [2], [3]]) 1.2创建一个矩阵 (●’◡’●)通过二维数组来创建一个矩阵 三行两列 import numpy as np matrix = np.array([[1, 2], [...●’◡’●)在向量或矩阵中选择一个或多个元素 #加载库 import numpy as np vector = np.array([1, 2, 3, 4, 5, 6]) # 创建矩阵 matrix =...print('--------') #选取所有行以及第二列 【注意】 print(matrix[:,1:2]) 1.5展示一个矩阵的属性 (●’◡’●)展示一个矩阵的形状、大小和维数 import
R语言中,当我们获取到了基因表达的count矩阵,怎么下载对应的基因长度并将count矩阵转换为FPKM矩阵 **********************************************...count矩阵:适用于差异基因表达分析 FPKM矩阵:适用于绘制heatmap ********************************************** 1....读取count矩阵,每行一个基因,每列一个样本,行名为基因,列名为样本,基因不能作为第一列 示例为生成一个count矩阵: # 创建基因表达数据框 gene_names <- c("TSPAN6", "
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