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每次我在RStudio中打开一个新会话时，都会收到错误消息：
Error: C stack usage 7953936 is too close to the limit
根据对发布的和类似问题的建议，我尝试在终端中使用ulimit命令，但得到了以下错误。
Isabels-MacBook-Pro ~ % ulimit -s
8176
Isabels-MacBook-Pro ~ % R --slave -e 'Cstack_info()["size"]'
Error: C stack usage 7954496 is too close to the lim
浏览 7提问于2022-03-28得票数 4
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当我安装一个新版本的R，我的定制.Rprofile没有加载。R开始使用新版本及其相应的.Rprofile。
是否有一种方法仍然使用定制的，而不管在R版本的任何更新？后续的问题是，一个R包能加载不同的.Rprofile吗？
浏览 4提问于2016-04-20得票数 1
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在我的电脑里：
在/etc/R Renviron和Rprofile.site，Renviron.site中有三个文件，我在任何地方都找不到Rprofile。这是一种适当的状态吗？
beetwen Rprofile，Renviron和Rprofile.site，Renviron.site有什么区别？
浏览 5提问于2013-04-13得票数 17
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我正在为一个实验笔记本写一个R包。一个函数用一些Rmd文件创建一个新的目录，用file.edit打开这些文件，并将当前的工作目录切换到新的目录。如果我还可以更改RStudio的“文件”窗格来显示函数代码中的新文件夹，那就太好了。这个是可能的吗？我已经看过rstudioapi包了。它做了类似的事情(例如viewer函数)，但我找不到在文件导航窗格中更改路径的方法。
浏览 0提问于2015-05-02得票数 8
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现在这是第一个，但是当我调用基R时，它总是在启动时提供以下错误消息：
错误:计算嵌套得太深:无限递归/选项(expressions=)？
--它不是RStudio错误，因为它弹出在cmd R.中--这不是新版本4.0.0错误，因为我从我信任的3.6.3开始经历了这个错误-- 4.0.0是我试图看看新版本的干净安装是否会消失的尝试。我确实重新启动了计算机。
我查找了错误信息，它们都与函数相关，这些函数实际上是调用循环的，或者类似的--不知道为什么在启动时会弹出这个错误。环境也没有很大的变化。安装了一些不相关的程序(例如，网络摄像头程序)。
有什么指示吗？这真是令人费解。我在Windo
浏览 1提问于2020-05-12得票数 0
在Mac下，对于一般的默认情况，通常我启动终端并使用ls -al检查.bash_profile的可用性，然后使用nano .bash_profile向其添加必要的全局缺省值。但是对于R和Rstudio，如果我想用命令Sys.setlocale(category = "LC_ALL", locale = "zh_cn.utf-8")设置汉字输入的全局默认值。我使用以下命令获取R_HOME
R.home()
1“/图书馆/框架/R.框架/资源”
然后，我将命令Sys.setlocale(category = "LC_ALL", locale =
浏览 1提问于2017-04-24得票数 1
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我正在旋转一个rstudio服务器实例，我需要R的工作目录成为一个特定的目录。我还希望右下角的文件窗格指向同一个目录。有办法这样做吗？目前，它从运行该程序的用户的主目录中运行。我尝试过--server-working-dir标志，但它似乎不起作用。下面是我使用的命令：
/usr/lib/rstudio-server/bin/rserver \
--server-daemonize=0 \
--server-user=user \
--server
浏览 0提问于2018-07-27得票数 3
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每次我重新启动RStudio时，它都要求我重新加载之前加载到工作区中的所有包。我似乎不知道问题出在哪里，RStudio在关闭项目时会保存这些项目。
如何确保在打开项目时RStudio重新加载必要的包？
浏览 1提问于2013-01-09得票数 15
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我想我对我的系统路径造成了一些破坏，现在我无法在RStudio中编织。我有最新版本的R和RStudio。
下面是我的工作
Sys.getenv()
产出：
__CF_USER_TEXT_ENCODING 0x20C97408:0x0:0x0
Apple_PubSub_Socket_Render /private/tmp/com.apple.launchd.g6i2lhsTBr/Render
DISPLAY :0
DYLD_FALLBACK_LIBRARY_PATH /Library/Frameworks/R.frame
浏览 4提问于2017-01-30得票数 2
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我是R的新手，目前正在使用.Rprofile处理一些自动化问题。我一直在寻找解决这一问题的正确方法，但几乎没有找到能具体说明我所遇到的困难的信息。如果这是一个天真的问题，请原谅我，我发誓我正在努力做到这一点！
我正在RStudio中设置一个项目。它需要与我的计算机上托管的MySQL数据库进行交互。我没有在每次启动项目时重新输入所有连接信息，而是尝试通过利用特定于项目(在项目的根目录中)的.Rprofile来自动化该过程。
在R中键入以下内容非常有效：
dbxxx <- dbConnect(MySQL(),
user='xxx',
password='x
浏览 0提问于2016-07-12得票数 0
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如何暂时禁用Rprofile。没有重命名文件吗？在启动RStudio时，是否有一种优雅的方式来切换我的Rprofile？
浏览 3提问于2017-10-20得票数 3
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我希望devtools包记住我的名字，电子邮件和其他创建包的首选项。我使用了以下代码来更改选项
options(devtools.desc.author = person(given = "charm", family = "goggles", email = "my@email.com", role = c("cre","aut")))
当我检查选项时
options("devtools.desc.author")设置确实发生了变化。但是，当我在Rstudio中打开一个新项目时，设置将返回到标准设
浏览 1提问于2016-04-24得票数 1
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我有一个相当有趣的问题，我找不到答案。我使用的是RStudio服务器(v.1.4.1717)，并安装了RVersion4.1.0。我尝试用renv来使用项目，到目前为止还不错，尽管偶尔安装库时会遇到问题。
然而，现在我一直收到这样的错误：Error: package ‘xxx’ required by ‘yyy’ could not be found
我试过几件事。我尝试将.libPaths()更改为一个新的位置，每个库都有一个新的安装，但这并没有解决我的问题。我还尝试在项目内部和外部执行此操作(因此，也会重新启用活动和禁用)，但我仍然遇到了相同的问题。举一个例子：
>BiocManag
浏览 13提问于2022-07-29得票数 2
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我在一个数字海洋服务器上安装了免费的rstudio服务器。我把一切都做好了，但是我想定制我的.RProfile。
我跑了：
candidates <- c( Sys.getenv("R_PROFILE"),
file.path(Sys.getenv("R_HOME"), "etc", "Rprofile.site"),
Sys.getenv("R_PROFILE_USER"),
file.path(getwd
浏览 1提问于2016-09-30得票数 0
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我安装了多个版本的R (2.15和3.0.1)，我经常在两者之间切换。我希望确保当我在一个版本中安装一个软件包时，它也会出现在另一个版本中(在可能的情况下)，因此我尝试设置以下系统：
当一个包被安装(在任何版本中)时，写出一个csv文件~/..Rinstalled，其中包含所有已安装包的列表
打开新的R会话时，检查该文件是否存在。
如果文件存在，请将该列表与正在运行的当前版本的R中安装的包进行比较。
尝试安装所有丢失的软件包。
为此，我的.Rprofile中有以下代码：
mirrorSetup <- function() {
cat("Recursiv
浏览 3提问于2013-07-30得票数 2
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我们在运行Rstudio (0.97版)的服务器上安装rstan时遇到了问题。我们使用的是Ubuntu 12.10 ( x86_64-pc-linux-gnu (64位))和R 2.15.1。
我安装了Rcpp_0.10.3和inline_0.3.11。但是，当我运行
options(repos = c(getOption("repos"), rstan = "http://wiki.stan.googlecode.com/git/R"))
install.packages('rstan', type = 'source')
我得
浏览 1提问于2013-06-08得票数 0
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在R中，可以使用以下选项看到错误的行号：
options(show.error.locations = TRUE)
在启动R解释器时，是否默认启用此功能？
浏览 0提问于2017-03-29得票数 3
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大家好，我正在R中工作，试图使用RMarkdown运行一些代码，这是一段似乎给我带来问题的代码片段。 install.packages("car")
install.packages("bestNormalize")
library(readr)
library(dplyr)
library(leaps)
library(MASS)
library(car)
library(plyr)
library(alr4) 这是相当标准的东西。在尝试运行代码时，我收到以下错误。 Error in contrib.url(repos, "source"):
浏览 327提问于2020-09-14得票数 0
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我有目标
public class RProfile extends RealmObject {
@PrimaryKey
@Required
String id;
String title;
String description;
}
和另一个讣告
public class RChatMessage extends RealmObject {
@PrimaryKey
@Required
String id;
String message;
RProfile sender;
浏览 0提问于2018-04-13得票数 4
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我正在试图更改r工作室中的系统区域设置。
我使用了这个代码：
Sys.setlocale("LC_ALL","English")
但是，当我重新启动Rstudio时，它会返回到以前的区域设置
我怎样才能解决这个问题？
浏览 0提问于2021-06-02得票数 0
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3回答
无法安装我创建的软件包
、、、
我一直在为我的个人使用编写大量的代码，最终我意识到我真的应该把这些都包含在一个包中，这样我就可以加载，而不是每次都复制和粘贴它。
我按照下面的教程创建了一个基本包。
据我所知，一切都与实际的创造元素很好。以下是结果的截图：
猫文件夹：
/cat/R文件夹
/cat/man文件夹
当我想运行这一行时，问题就来了：
install("cats")
当我尝试这样做时，我会得到以下错误：
Installing cats
"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/bin/x64/R" --no-site-file --no-envir
浏览 4提问于2017-03-08得票数 2
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使用Ubuntu (16.04)下的Rstudio (1.0.143版)，如果我将system("echo 'Hello world'")添加到我的/usr/lib/R/etc/Rprofile.site文件中，在启动时Rstudio中没有显示Hello消息。
如果我从终端启动R，我就会收到你好世界信息。
R似乎忽略了来自Rprofile.site的Rprofile.site命令(从主目录中的.Rprofile文件中删除)
是否有可能启用系统命令执行，或者是否有充分的理由避免这种行为？
浏览 1提问于2017-07-19得票数 1
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我在我的R配置文件中有一些代码，我发现这些代码干扰了包的安装。例如，我喜欢在处理包时自动加载devtools，所以我有以下内容
if (file.exists("DESCRIPTION")) {
try({suppressMessages(library(devtools))})
}
但是，我发现这会影响包的安装，我会得到类似ERROR: lazy loading failed for package ‘rlang’这样的错误。如果我注释掉了R配置文件中devtools的加载，那么这个包就会毫无错误地安装。
有没有任何方法来检查在包安装过程中是否正在执行.Rprofil
浏览 16提问于2022-09-30得票数 1
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我有一台麦金塔电脑，我正在尝试自动加载软件包，自制函数，并在每次启动R时使用修改的设置。我相信这可以通过一个名为Rprofile.site的文件来完成，并在该文件中创建函数.First和.Last。
一个问题是，我不知道我的R_HOME目录是什么，它是用来做什么的，或者它是否存在。我找到了两个函数，我认为这两个函数都给了我它的位置，但我得到了不同的结果。
这是第一个
> Sys.getenv("R_home")
R_home
""
第二个
> R.home()
[1] "/Library/Frameworks/R.framework
浏览 0提问于2011-03-15得票数 16
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我注意到，当我重新启动R会话时，我设置的所有options()都丢失了。
有没有一种方法可以让选项在会话中保持不变？最好是在工作区中，因为我希望这些选项是针对每个项目的，而不是全局的。
options(myoption=1)
getOption("myoption") # 1
a <- 42
## close & save workspace
## start R again
getOption("myoption") # NULL, options not restored
a # 42, so workspace was restored bu
浏览 0提问于2016-11-01得票数 1
2回答
使R项目自动打开特定脚本
、、、
我在团队中工作，我们主要使用R，我非常习惯在Rstudio中使用R项目，这是我喜欢的，因为当我打开它们时，我所有的脚本和所有的东西都在正确的位置。但是，当团队的另一名成员打开我的一个项目时，它会加载值和数据，但不会打开R脚本(可以通过windows explorer物理地单击项目，而不是使用R中右上角的菜单)。我想在.Rprofile中可以做一些事情，但是我没有找到任何命令来物理地打开脚本，我尝试了
file.edit("./Main.R")
但它没有打开任何东西。它刚刚给了我一个信息：
错误:找不到函数"file.edit“
一如既往，谢谢你的帮助！
**编
浏览 2提问于2014-10-20得票数 8
4回答
如何在R中自动加载软件包？
、、、、
你能给我推荐一种在R中自动加载软件包的方法吗？我的意思是，我想在R中启动一个会话，而不需要多次使用library('package name')。假设我下载了下一次启动R时要使用的所有包。
浏览 1提问于2012-04-24得票数 65
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我以前在我的dbConnect中有一个.First语句，在.Rprofile中有一个dbDisconnect语句，在.Last中有一个dbDisconnect语句。我不再需要这些，所以我从.Rprofile中删除了它们，但是由于dbDisconnect语句，当我退出时R会挂起。我可以和q(runLast=F)一起辞职。
> q()
Error in .Last() : could not find function "dbDisconnect"
我在根中放了一个空的.Rprofile，但是仍然会出现这个错误。我有默认的Rprofile.site。
这是什么原因？有解决办法
浏览 11提问于2016-07-22得票数 1
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我希望更改我的.Rprofile文件，以便自动加载magrittr包。
在堆栈溢出的线程之后，我创建了一个没有“.txt”后缀的文本文件，并将其保存在我的主目录中。
这个文件的内容很简单
library("magrittr")
但是，当我退出R并再次启动错误消息时
Error: 1:8: unexpected input
1: library(�
^
显示在窗口的第一行。当我在.Rprofile文件中有测试代码时，会收到类似的消息，例如
print("hello")
其中，错误消息读取
Error: 1:6: unexpected inpu
浏览 3提问于2016-07-18得票数 3
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我有一个名为"R installation info“的项目和一个名为"Project Packages”的子目录。
我正在尝试配置R的方式，当我安装一个新的包时，它将被安装到“项目包”中。
此外，当我与该项目进行R会话时，我希望在RStudio的Packages文件夹中只看到安装在“项目包”中的包。
我在项目目录中创建了一个Rprofile文件，并在其中放入了以下行：
.libPaths = paste0(getwd(),"/","Project Packages")
Sys.setenv(R_LIBS_USER = paste0(getwd(
浏览 5提问于2017-12-17得票数 2
我尝试过许多不同的配置，只是没有时间继续查看示例。我看到了这个线程，并希望它能得到答案。问题可能是因为我正在开发一个Windows系统，而这篇文章似乎指的是Mac。我有一个R项目，在相同的工作目录中，我尝试添加".Rprofile.txt“文件。我尝试了以下语法："Rprofile“、"RProfile”、".Rprofile“和".RProfile”。我已经能够使用source()运行该文件，这似乎是可行的。在上面的链接中，它提到需要后面的换行符。我在一个单独的行，在脚本的末尾，在脚本的末尾，用一个空格尝试了这一点。我搞不懂什么细微差别是我没有捡到的。
浏览 0提问于2020-04-28得票数 0
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我问这个问题是出于好奇。我注意到，每当我启动R时，实例都会使用以下错误消息启动
正如您所看到的，R用错误消息"object 'a‘not“引导，这有什么原因吗？
浏览 1提问于2017-03-29得票数 0
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当我试图读取csv文件时，使用
df<-read.csv("Regression_train.csv")
文件大小(17.6 Mb)超过限制(16 Mb)。可以通过"languageserver.link_file_size_limit“选项更改限制。
我该怎么做？
浏览 4提问于2022-09-28得票数 1
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1回答
下面的代码用于在我的.Rprofile中加载一些数据(这是我的项目文件夹中的一个R脚本，当我切换到使用Rstudio的项目时会自动运行)。
data_files <- list.files(pattern="\\.(RData|rda)$")
if("data.rda" %in% data_files) {
attach(what="data.rda",
pos = 2)
cat("The file 'data.rda' was attached to the search path un
浏览 1提问于2015-12-11得票数 2
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1回答
我正在导入一个名为"KernSmooth“的包，希望启动消息不会出现……
在我的描述文件中：
Package: test
Title: Test
Author: Mike
Description: Test
Maintainer: Mike
Depends: R(>= 2.10.0)
Imports: KernSmooth
和我的命名空间文件：
import(KernSmooth)
但是当我加载这个包时，我仍然收到启动消息：
KernSmooth 2.23 loaded
Copyright M. P. Wand 1997-2009
是我不将其导入命名空间并使用
suppressM
浏览 0提问于2014-04-18得票数 8
1回答
我有一个预订项目，在R，并希望切换到Quarto。在预订项目中，我有一个R脚本_common.R (它包括库、各种设置和帮助函数)，以便在呈现每一章之前运行(单独的qmd文件)。
如何在Quarto中实现这样的脚本文件？
我尝试在_quarto.yml中设置：
project:
type: book
pre-render: _common.R
但是这只会在整本书的呈现之前运行一次脚本，而不是在每一章之前。每个章节似乎都是在自己的环境中呈现的，因此_common.R中的所有设置和脚本都不可用。
一个解决办法是包括
```{r echo = FALSE, message=FALSE, wa
浏览 13提问于2022-08-29得票数 6
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我正在尝试安装R的lubridate包，但我总是收到相同的错误消息。环顾四周，它看起来与这样一个事实有关:它有一个函数date()，这个函数也已经存在于base::date()中。但是在测试包的过程中，它调用date()，因此出现了错误。
下面是我得到的结果：
install.packages("lubridate")
Installing package into ‘/home/user/R/i586-pc-linux-gnu-library/3.3’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'https://cran.rstudio
浏览 1提问于2017-08-30得票数 1
2回答
我第一次在我的项目中使用packrat包，我想使用Makefile为不同的目标以特定的顺序运行特定的脚本。然而。我把文件整理成这样：
main_dir/packrat/
main_dir/subproject1/R_scripts_1/Makefile
当我在Makefile中运行R CMD BATCH someRfile.R时，R不是使用packrat库，而是使用默认的用户库，这不是我想要的。是否有任何方法强制所有R进程星组在任何子dir的包鼠dir，只使用包鼠库？
谢谢!
浏览 4提问于2017-11-24得票数 1
1回答
我可以从批处理文件中非交互地运行R脚本，并保存输出。
我可以使用批处理文件打开交互式R会话。
我可以通过执行一个批处理文件打开R并运行一个脚本，然后执行另一个脚本(但是在交互式会话中，脚本中的变量不可用)。
我无法做的是使用批处理文件打开交互式R会话，并在该交互会话中运行脚本。我该怎么做？
关于解决办法：
其目的是使用脚本每天加载和处理一个非常大的数据集，然后在R中的交互会话中使用该脚本，因此使用非交互式会话不是此任务的选项。同样，我知道我可以使用Windows命令提示符运行交互式会话，但出于各种原因，我不想这样做。我要把所有的东西都装进R壳里，以便在那里使用。我意识到任务计划程序对此很有用，
浏览 2提问于2015-10-16得票数 1
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直到最近，我一直使用rpy2将一个R包加载到运行Python内核的朱庇特笔记本中，并使用它从sqlserver数据库读取一些数据。几天前，我开始看到这个错误：
import rpy2.robjects as ro
R[write to console]: Error: cons memory exhausted (limit reached?)
在此错误之后，Python内核崩溃，并由木星重新启动。我想了解这个错误，是什么导致了这个错误，以及为什么在相同的代码运行之前没有错误的情况下出现了这个错误。
在r-devel上，这个答案表明，这是一个R错误，它是通过超过最大对象数而产生的：
除此之外
浏览 4提问于2021-06-22得票数 2
2回答
访问全局变量失败
、、、、
我试图在R中实现简单的authentication，以便在修订控制下将凭据存储在源代码之外。我知道使用options()和getOption()的方法，但使用它会迫使我从修订控制中删除项目级别的.Rprofile。我更喜欢使用另一种方法，基于通过R关联Linux用户( .bashrc )的ruser导出凭据的环境变量，然后将这些凭据在特定于项目的.Rprofile中读取到全局变量，如下所示：
CB_API_KEY <<- Sys.getenv("CB_API_KEY")
但是，访问R模块中的此类全局变量的消息"object 'CB_API_KEY‘n
浏览 3提问于2014-02-24得票数 1
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我在云上运行Ubuntu 16.04.3 LTS。当我使用Rscript从命令行运行程序时，一切都按预期进行。但是，当我通过cron使用Rscript运行相同的程序时，似乎没有调用我的.Rprofile文件。我已经写了一个小程序来演示这个问题：
test_cron = function() {
#The next 3 lines are base R.
sink('~/test_cron.out')
on.exit(sink())
cat('The date and time are:', as.character(Sys.tim
浏览 0提问于2017-11-14得票数 1
4回答
当我试图在R Pubs中发布我的作品时，我得到了一个错误：
Error in function (type, msg, asError = TRUE) :
SSL certificate problem, verify that the CA cert is OK. Details:
error:14090086:SSL routines:SSL3_GET_SERVER_CERTIFICATE:certificate verify failed
Calls: rpubsUpload ... <Anonymous> -> .postForm -> .Call -&
浏览 0提问于2014-03-20得票数 12
4回答
我正在努力弄清楚为什么我不能永久地改变我的OSX10.11.3系统上R中使用的CRAN存储库。我遵循了网络上的所有指令，如、和，并将其放入了.Rprofile文件中：
# Change the default repository
local({r <- getOption("repos")
r["CRAN"] <- "https://cran.cnr.berkeley.edu/"
options(repos=r)
})
print(getOption("repos"))
这个片段几乎是直
浏览 8提问于2016-01-30得票数 2
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1回答
我已经在Linux和Windows7上安装了Sweave包和针织器，它在上运行良好，但在Linux中使用rstudio时却失败了。安装pkgs之后，我编写了一个简单的dw.Rnw，如下所示：
\documentclass{article}
\begin{document}
The regression model is as follows
<<echo=TRUE>>=
pop=read.table("pop.txt",header=TRUE)
attach(pop)
lm.sol=lm(y~year)
summary(lm.sol)
@
\e
浏览 4提问于2013-05-30得票数 10
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1回答
我想知道当我打开R或R-studio时如何执行一些预定义的函数？
我知道这听起来很愚蠢，但是我安装了praise包，并且在每次打开R或R studio时都想尝试自动执行praise()，而不是真正地输入praise()。
浏览 3提问于2015-09-25得票数 4
我正在使用knitr构建一个R包vignette。这个过程在R3.0之前有效，但是我还没能在R3.1.1下重新构建这个包。
当我尝试R CMD build时，我得到一条错误消息：
R CMD build Causata
* checking for file ‘Causata/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘Causata’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ...
E
浏览 2提问于2014-10-15得票数 11
1回答
我是R的新手，我刚刚弄明白为什么我的历史记录中没有包含我以前的所有命令。R在每个工作目录中创建一个.Rhistory文件。
我经常更改工作目录，我希望将我过去所有会话的历史记录放在同一个文件中。有没有简单的方法可以做到这一点？
谢谢。(我使用的是Mac OS 10.6，我使用的是Rstudio)
浏览 0提问于2015-10-09得票数 0
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