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vasp-vtst过渡态计算过程

——课题组概况 vasp-vtst计算过渡态 1935年,Eyring,Evans和Polanyi在统计热力学和量子力学的基础上提出了过渡态理论,可以通过基本物性(分子震动频率、质量、核间距等)计算反应速率常数...NEB方法:撒点,弹簧力 CL-NEB方法:其中一个点跑到势能面鞍点,即过渡态 vasp-vtst提供的NEB优化算法(IOPT参数) VASP计算过程 过渡态计算的收敛准则只与力相关,即设置EDIFFG...#通知VASP使用vtst计算; ICAHIN=0 #通知VASP使用vtst计算; IMAGES=7 #之前添加的图像数量N image number; IBRION =3...#specify that VASP does molecular dynamics; POTIM=0 #zero time step so that VASP does...not move the ions; 这里其实是抛弃VASP自带的优化,选用vtst的优化方法; IOPT=1 #LBFGS = Limited-memory Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno

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Python量子力学计算模拟以及数据可视化

VASPy是一个纯Python编写的处理VASP文件数据以及进行数据快速可视化的库,基于OOP的思想提供了操作VASP文件的友好的接口,可以帮助使用者快速编写处理VASP相关文件的脚本,以提升效率。...VASP简介 对于广大做计算化学或者材料模拟的同学肯定听说过VASP的大名或者其科学研究与其息息相关。...VASP的全称是Vienna Ab-initio Simulation Package,是维也纳大学Hafner课题组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟的软件包,目前是材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商业软件之一...(http://www.vasp.at/) VASPy项目简介 VASPy的思想是将VASP相关的文件都视为可操作的对象,通过友好的接口对一个或者多个VASP对象进行快速的操作以提升工作效率。...类可以抽取文件中的晶格结构信息并结合VASP相关的类进行VASP文件的创建,同样可以方便的讲VASP的文件生成相应的用Material Studio可以显示的文件包括讲XDATCAR生成相应的*.arc

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    哪些领域将成为下半年的监管关注重点?

    非法行为者——例如勒索软件攻击者和黑客——可以使用这些服务在不同的区块链之间进行洗钱。此外,通过跨链桥进行跨链的资金很容易受到黑客的攻击。...旅行规则:打击逃避制裁和勒索软件的必要条件2018 年 10 月,FATF 开始呼吁各国将旅行规则(传统金融机构的长期合规要求)应用于 VASP。...第二个是勒索软件。...由于勒索软件攻击者经常在未能实施 FATF 标准的国家的不受监管的交易平台服务中兑现他们的犯罪收益,因此加强旅行规则的实施——理论上——将确保 VASP 收集有关交易对手方的额外信息,这将有助于执法。...该报告还指出,区块链分析是破坏勒索软件的重要方法。根据 FATF 的说法:“区块链工具为成功的执法案件、有针对性的金融制裁和其他破坏勒索软件融资的行动提供了支持和信息。”

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    使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式

    以最常用的量化计算程序高斯为例,与之配套使用的GaussView软件可以很轻松地对振动分析 (freq) 计算结果进行可视化。...与之相关的VMD,是另一款比较流行分子可视化软件。 和其他计算化学程序不同的是,PyMOL以两种方式发行:一为通过薛定谔公司发布的商业版,二为由社区发布的开源版。...4.2 VASP计算单晶硅的振动分析 在对VASP计算的振动分析进行可视化之前,我们需要振动计算后得到的OUTCAR和CONTCAR文件 (见PyVibMS-master/examples/VASP/original-data...在打开PyVibMS插件窗口后,点击Input File这一行中三个点(...)的按钮,然后选定 PyVibMS-master/examples/VASP/Si_OUTCAR.out文件,将文件类型调整为...接着,回到PyVibMS界面后,将文件类型XYZ调成VASP 5.x。因为这个VASP输出文件既包含了PBC盒子的信息,又包含了振动模式的信息,我们勾选 Has PBC 和 Has Vib.

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    【双清论坛】国内计算化学方法与软件开发(Ⅲ)

    本文是国内计算方法与软件开发系列推文的第三部分:药物与材料等相关应用软件。...药物设计与分子对接软件 ● 北京大学来鲁华等开发了基于靶点三维结构的药物设计软件LigBuilder,可以实现基于片段生长和连接的配体分子设计,以及已知分子的优化,并可进行分子的可合成性分析及类药性分析...MOMAP软件支持并行计算、效率高,计算所需的分子基态、激发态信息可利用GAUSSIAN、TURBOMOLE等成熟的量化软件得到。...此软件当前与VASP、CASTEP、Quantum Espresso、GULP、SIESTA、CP2K程序都有接口。 小结 本系列的三篇推文已经推送完成,小编其实只是担任了一个搬运工。...国内很多课题组的方法和软件在自己的领域常常可以处在世界领先地位,但是大部分软件都需要借助国外的软件平台来实现。

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    全球监管新政策下,加密企业如何满足合规要求?

    VASP 能否可以快速、便捷地识别用户地址的风险性,就如同 Web2 的征信报告一样快速获取关键信息?...我们以 FATF(金融行动特别工作组)2021 年 10 月指南为例——这也是目前被广泛采用的监管策略——指南要求所有 VASP(即交易平台)必须制定 AML/CFT 措施。...指南要求所有 VASP(即交易平台)必须制定 AML/CFT 措施。 在履行监管义务中,第一步就是了解客户身份。...多个国家或地区,识别身份证、驾照、护照等多种证件的 ID Check 产品,调用价格仅为其他供应商报价的 30%-50%,同时,ADVANCE.AI 在东南亚多地拥有本地支持团队,灵活运用多种即时沟通软件

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    软件架构」软件架构概述

    软件架构(architecture)是指软件系统的基本结构以及创建这种结构和系统的规程。每个结构都包含软件元素、它们之间的关系以及元素和关系的属性。[1]软件系统的架构是一个隐喻,类似于建筑物的架构。...[3] 软件架构(architecture)是指做出基本的结构选择,一旦实现,改变这些选择的代价是高昂的。软件架构(architecture)选择包括软件设计中可能出现的特定结构选项。...加州大学欧文软件研究所致力于软件架构研究,主要针对架构风格、架构描述语言和动态架构。 IEEE 1471-2000《软件密集型系统体系结构描述推荐规程》是软件体系结构领域的第一个正式标准。...软件架构知识通常是默认的,并保留在涉众的头脑中。软件架构知识管理活动是关于发现、交流和保留知识的活动。由于软件架构设计问题错综复杂且相互依存,设计推理中的知识缺口可能导致不正确的软件架构设计。...IEEE软件专门出版了一期专门讨论敏捷性和体系结构之间的交互的专刊[37]。 软件架构侵蚀 软件架构侵蚀(或称“衰退”)是指在软件系统的实现过程中,在软件系统的计划架构和实际架构之间观察到的差距。

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    软件打包安装软件小记

    最近开发了一个WinForm软件,为了更加高大尚尝试做了个打包安装的包装。...因为以前直接编译,然后交给用户使用,基本也是平平安安的;但后来这样体现不了成熟软件的高大尚,那好吧就弄个一键安装部署的。...这文章的重点来了,我这个WinForm软件自带比较强的后台服务属性,安装后需要进行服务注入和服务启动;所以如果简单的Next,Next,Finish,用户还要操作一大堆工作,那怎么办好呢?...只好在安装时由安装软件进行自动后台安装。首先要面对的是根据安装的目前对Sqllite的数据库地址进行指引,就是说用户选择安装目录后,安装软件会自动修改软件的ini配置文件,指定相关地址,那怎么写呢?...图片最后说一下吧,Setup Factory作为一个老牌的安装打包软件的确不错,它比较四平八稳,但就是没有太多花俏的功能。国产也有很多安装打包的软件功能也不错,但一些花俏的功能就收费了。

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    Linux基础软件-软件安装

    讲的那些东西都算是系统自带的,但是Linux作为一个服务器操作系统,肯定是要安装运行软件来满足我们的业务需要,本章基础软件部分,将从下面几个部分来讲解: Linux基础软件-软件安装(本章节) Linux...基础软件-yum(一) Linux基础软件-yum(二) Linux基础软件-ntp Linux基础软件-chrony Linux基础软件-dns(一) Linux基础软件-dns(二) Linux基础软件...-nfs Linux基础软件-lvm Linux基础软件-Selinux&库文件&swap 前面的操作都是基于默认自带的软件,而且我们讲过很多命令,默认最小安装的情况下,都是不自带的,都需要额外安装,那我们应该如何安装这些软件呢...一般卸载用的基本不用,因为它会卸载一些依赖软件,可能导致其他软件不能正常使用。 升级:输入yum update packagename,其中 packagename 是你想要升级的软件包的名称。...如果你想更新所有的软件包,只要输入 yum update即可。 无论是安装,升级,都必须是基于服务器仓库里面有这个软件才可以的,如果没有则无法安装或升级的。

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    软件测试-开始软件测试

    前言 大家好,我是 Vic,今天给大家带来开始软件测试的概述,希望你们喜欢 软件测试 软件测试的基本概念、方法、常用测试工具的使用 常用测试工具的使用 性能自动化测试工具:jmeter、loadrunner...http://www.51testing.com/html/index.html 开始软件测试 测试一个软件 测试的目的 开发的过程 软件质量的保证 理解软件测试 软件测试的分类 测试的目的 1.测试的目的...:在于发现错误(缺陷),保证整个软件开的质量,但软件的质量不能以软件测试为依据 2.成功的测试:是发现了未曾发现的软件错误(缺陷) 3.好的测试用例:是能有效地发现别的测试用例未发现的软件错误 开发的过程...在软件开发的过程中,我们要明确软件开发的目标以及软件的需求,进行制定各种软件开发过程中的计划,并进行编写文档测试,软件测试,进行有效地测试和修复,然后提交测试完成的软件。...生存周期 定义->计划->实现->稳定化->部署->运行与维护 软件质量的定义 软件质量的定义:满足用户的需求,满足软件测试的需求,保持合理的进度和成本 软件错误的定义 软件错误的定义:没有实现其最终的软件需求

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    采集软件-免费采集软件下载

    怎么用免费采集软件让网站快速收录以及关键词排名,网站优化效果主要取决于各个页面权重高低,各个页面权重汇集在一起,网站优化效果才会更加明显,那么各个页面具体权重取决于哪些因素呢?...我们可以用这款采集软件实现自动采集伪原创发布以及主动推送给搜索引擎,操作简单不需要学习更多专业的技术,只需简单几步就可以轻松采集内容数据,用户只需在采集软件上进行简单的设置,采集软件工具根据用户设置的关键词精准的采集文章...相对于其它采集软件这款采集软件基本不存在什么规则,更不用花费大量时间去学习正则表达或html标签,一分钟即可上手使用只需要输入关键词即可实现采集(采集软件同时还配备了关键词采集功能)。全程自动挂机!...这款采集软件还配置了很多SEO功能,通过软件采集伪原创发布的同时还能提升很多SEO方面的优化。...直接在工具上自动完成SEO的内容优化,目前博主亲测软件是免费的,可以直接下载使用!

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    邹传伟:区块链与利益相关者资本主义

    平台模式 平台模式最好对照软件开源社区理解。在软件开源社区中,志愿者们基于共同爱好和目标聚在一起,并根据各自声誉和专长自发演化出社区秩序。...Linux、Python和R都是软件开源社区的成功案例。但软件开源社区有两点不足。第一,社区规则一般是非正式的,不能确保被有效执行,有时可能造成社区混乱甚至分裂。...Libra开放生态包括指定经销商、虚拟资产服务提供商(VASP)和非托管钱包用户等参与者。...Libra联盟负责Libra项目的开发和治理,对联盟成员、指定经销商和VASP的尽职调查,为Libra生态参与者建立合规标准,实施协议级的合规控制和其他合规控制,以及运行金融情报智能。

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