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vasp-vtst过渡态计算过程

——课题组概况 vasp-vtst计算过渡态 1935年,Eyring,Evans和Polanyi在统计热力学和量子力学的基础上提出了过渡态理论,可以通过基本物性(分子震动频率、质量、核间距等)计算反应速率常数...NEB方法:撒点,弹簧力 CL-NEB方法:其中一个点跑到势能面鞍点,即过渡态 vasp-vtst提供的NEB优化算法(IOPT参数) VASP计算过程 过渡态计算的收敛准则只与力相关,即设置EDIFFG...#通知VASP使用vtst计算; ICAHIN=0 #通知VASP使用vtst计算; IMAGES=7 #之前添加的图像数量N image number; IBRION =3...#specify that VASP does molecular dynamics; POTIM=0 #zero time step so that VASP does...not move the ions; 这里其实是抛弃VASP自带的优化,选用vtst的优化方法; IOPT=1 #LBFGS = Limited-memory Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno

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Python量子力学计算模拟以及数据可视化

VASPy是一个纯Python编写的处理VASP文件数据以及进行数据快速可视化的库,基于OOP的思想提供了操作VASP文件的友好的接口,可以帮助使用者快速编写处理VASP相关文件的脚本,以提升效率。...VASP简介 对于广大做计算化学或者材料模拟的同学肯定听说过VASP的大名或者其科学研究与其息息相关。...VASP的全称是Vienna Ab-initio Simulation Package,是维也纳大学Hafner课题组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟的软件包,目前是材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商业软件之一...(http://www.vasp.at/) VASPy项目简介 VASPy的思想是将VASP相关的文件都视为可操作的对象,通过友好的接口对一个或者多个VASP对象进行快速的操作以提升工作效率。...类可以抽取文件中的晶格结构信息并结合VASP相关的类进行VASP文件的创建,同样可以方便的讲VASP的文件生成相应的用Material Studio可以显示的文件包括讲XDATCAR生成相应的*.arc

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    linux软件包管理

    在linux系统中我们经常涉及到软件包的删除和添加,那一起来看下在linux系统中软件包的管理方式都有哪些 rpm软件 yum软件仓库 源码软件 一、rpm软件包 rpm的介绍 前面的课程我们提到过源码包安装需要解决系统环境...版本 每次更新版本号都会改变,用来帮助用户判断软件包新旧的 编译次数 也是帮助用户判断软件包新旧的 适用的系统 在哪个系统上可以安装,CentOS和rhel的多数软件包都是通用的 适用的平台 指的是硬件平台...查询指定的软件包是否安装 -qi 查看指定的软件包的信息,包括开发商,版本,说明 -ql 查看指定软件包中所包含的文件列表 -qc 查看指定软件包的配置文件 -qa 查看本机安装的所有包...dhcp-server -y 安装一组软件包 [root@zutuanxue ~]# yum groupinstall '系统工具' -y 卸载软件包 删除一个软件包...案例:源码安装一个nginx软件 获取软件包 软件包获取的方式有很多,最常见的就是拷贝或者下载这两种方式,拷贝咱们就不说了,因为用的太多了;接下来我给大家说一下如何从网络下载软件包

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    【Linux】DEB软件包

    本文将深入介绍 DEB 软件包的概念、特点以及在 Linux 中的使用。 1. DEB 软件包简介 DEB 软件包是一种二进制软件包,包含了已经编译过的程序、库、配置文件以及其他必需的资源。...DEB 软件包使用 .deb 文件扩展名,其设计旨在简化软件的分发、安装和升级。 2. DEB 软件包的特点 二进制形式: DEB 软件包包含已经编译过的二进制文件,使得安装过程更为高效。...常见 DEB 软件包管理工具 在基于 Debian 的发行版上,用户可以使用以下工具来管理 DEB 软件包: dpkg: 低级别的软件包管理工具,用于安装、卸载和查询软件包。...apt: 高级软件包管理工具,建立在 dpkg 之上,用于处理依赖关系、自动下载和安装软件包。...DEB 软件包的优势 简单管理: DEB 软件包的管理工具提供了简单而强大的软件包管理功能,使用户能够轻松地安装、升级和卸载软件。

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    Linux软件包管理

    Linux软件包管理Linux系统如果需要安装软件怎么办?...如何安装,大概有以下几种方式1.二级制软件包管理(RPM 、YUM)2.源代码包安装3.脚本安装(Shell或Java脚本)4.Debian系RPM包管理RPM名称软件包: sudo-1.7.2pl-5...】 -qa 【查看所有软包】​-ivh:安装显示安装进度--install--verbose--hash-Uvh:升级软件包--Update;-qpl:列出RPM软件包内的文件信息[Query...Va:校验所有的RPM软件包,查找丢失的文件[View Lost];-e:删除包-a 查询软件包信息-f 查询文件所属软件-p 查询软件包-l 显示软件包中的文件列表-d 显示被标注为文档的文件列表...APT可以自动下载,配置,安装二进制或者源代码格式的软件包,因此简化了Unix系统上管理软件的过程。APT最早被设计成dpkg的前端,用来处理deb格式的软件包

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    【Linux】源代码软件包

    在 Linux 系统中,软件包管理是系统运维中一项关键的任务。除了常见的二进制软件包,还存在一类特殊的软件包类型,即源代码软件包。本文将深入探讨源代码软件包的概念、优势以及在 Linux 中的应用。...什么是源代码软件包? 源代码软件包是一种软件分发形式,其中包含了程序的源代码以及构建和安装所需的其他文件。与二进制软件包不同,源代码软件包需要用户在其系统上进行编译,以生成可执行文件。...源代码软件包的主要组成部分 源代码软件包通常包含以下主要组成部分: 源代码: 包含软件的原始程序代码,用户可以查看和修改。...源代码软件包的优势 源代码软件包相比于二进制软件包具有多方面的优势,这些优势使得源代码软件包在特定情境下成为一种理想的选择。...系统一致性: 使用源代码软件包可能导致系统中存在多个不同版本的相同软件,需要谨慎管理。 结语 源代码软件包为 Linux 系统用户提供了更高程度的灵活性和控制权。

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    openindiana软件包仓库管理

    openindiana使用的软件包管理系统和solaris 11的一样,可以通过查看solaris 11的官方中文文档来了解详情。...openindiana软件包已IPS软件包形式进行分发,映像包管理系统简介如下: 映像包管理系统 Oracle Solaris11 软件以 IPS 软件包的形式分发。...IPS 软件包存储在 IPS 软件包系统信息库中,后者由 IPS 发布者填充。IPS 软件包安装到 Oracle Solaris 11 映像中。...列出、搜索、安装、限制安装、更新和删除软件包。 列出、添加和删除软件包发布者。更改发布者属性,如搜索优先级和粘滞性。设置发布者属性,如签名策略。 将映像更新到新的操作系统发行版。...创建现有 IPS 软件包系统信息库的副本。创建新的软件包系统信息库。 创建并发布软件包。 创建引导环境。 简单操作如下: 1. 查看系统上已有的软件包仓库信息 $ pkg publisher 2.

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    哪些领域将成为下半年的监管关注重点?

    该报告的发布标志着 FATF 于 2019 年首次发布的《加密资产和加密资产服务提供商(VASP)指南》已经经历了三个年头。...所以为了应对 DeFi 日益增加的风险,VASP 和金融机构应确保他们使用区块链分析功能来检测与 DeFi 混币器和跨链桥相关的风险。...作为核心,旅行规则要求 VASP 识别超过一定金额的交易的发起人和受益人,并将信息和数据安全的传输给其 VASP 交易对手。该规则的目的是帮助执法部门发现、调查加密资产领域的洗钱和其他金融犯罪。...FATF 的《最新报告》对未实施“旅行规则”的成员国和 VASP 提出了严厉警告——各国应根据 FATF 标准对 VASP 施加信息和数据共享要求。...跨链 DeFi、非托管钱包、NFT 和旅行规则合规性将是 VASP 合规团队的首要问题。

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    九.Linux软件包管理

    本指南旨在快速地介绍下在多种 Linux 发行版中查找、安装和升级软件包的基础知识,并帮助您将这些内容在多个系统之间进行交叉对比。 包管理系统:简要概述 大多数包系统都是围绕包文件的集合构建的。...APT 这款先进的包管理工具提供了大多数常见的操作命令:搜索存储库、安装软件包及其依赖项,并管理升级。...& make search name=package 通过名字进行搜索 cd /usr/ports && make search key=search_string 搜索评论、描述和依赖 查看某个软件包的信息...在安装软件包之前,我们可以通过仔细阅读包的描述来获得很多有用的信息。...Packages sudo pkg add package.txz sudo pkg add -f package.txz 即使已经安装的包也会重新安装 删除一个或多个已安装的包 由于包管理器知道给定的软件包提供了哪些文件

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