seqlogo图可以直观清晰的反应序列偏好特征，每个位置出现的碱基或氨基酸类型反映了该位置序列的偏好性，每个字母的大小与该碱基在该位置上的出现频率成正相关。
WebLogo是一款经典的motif可视化软件，在很多的文章中都提到了使用该软件绘制motif的sequence logo。作为一个在线工具，其操作简单，易于使用，网址如下
在 EMBL Clustal Omega 比对结果的 Result Summary 标签下有Jalview按钮。这个按钮可以快速启动 Jalview，但这里启动的在线版本功能不完整。完全版的 jalview 可以从 Jalview 官网（http://www.jalview.org）在线启动，或者下载安装到本地。
转录因子（Transcription factor，TF）是一类能够以序列特异性方式结合DNA并对基因转录起关键调控作用的蛋白质，在各种生物过程和疾病发生中起非常关键的作用。鉴定、分类和注释转录因子以及分析转录因子的调控和功能等一直是研究的热点和基础，它们在生物体内形成一套指导基因表达的复杂系统引得众多科学家浓厚的研究兴趣。
我们知道R语言在作图统计方面很是实用，但是在其他游戏开发、网页制作、人工智能等很多方面相对于python是很局限。今天我们来以weblogo为例展示如何在R语言中调用python。
在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点，轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。
R包ggseqlogo 绘制seq logo图和Seq logo 在线绘制工具—Weblogo介绍了如何用R脚本和在线工具绘制seq logo图，用于展现转录因子或修饰酶等结合序列的偏好性。
motif在基因组上结合位点的查找是生信分析中的一项基本技能，在转录因子的chip_seq, m6A_seq等落雨都有广泛应用，之前也写了很多的文章来介绍motif
四个碱基A T C G 犹如一个个字符，它们排列组合形成的基因像一串串代码，在赋予生命个体共性的同时却又不失独特性，吸引着一个个学者前来探索生命的奥秘。并开发了多种工具展示这简单的四个碱基（感兴趣的请戳下面的历史文章）：
ggplot2自从2007年推出以来，成为世界范围内下载最频繁、使用最广泛的R包之一。许多人包括ggplot2的创建人Hadley Wickham将这一成功归功于ggplot2背后的哲学。这个软件包的灵感来源于Leland Wilkinson编写的《图形语法》一书，在此书中将graphs 分解成scales和layers，并将原始数据与表现形式分离开。
简单说， Thymeleaf 是一个跟 Velocity、FreeMarker 类似的模板引擎，它可以完全替代 JSP 。相较与其他的模板引擎，它有如下三个极吸引人的特点：
一般来说，常用的模板引擎有JSP、Velocity、Freemarker、Thymeleaf 。
ggseqlogo是一个motif可视化的R包，可以看做是seqLogo的加强版。除了基本的创建sequence logo的功能，新增了许多自定义的选项，灵活性更强，项目网址如下
在上篇文章springboot(二)：web综合开发中简单介绍了一下thymeleaf，这篇文章将更加全面详细的介绍thymeleaf的使用。thymeleaf 是新一代的模板引擎，在spring4.0中推荐使用thymeleaf来做前端模版引擎。 thymeleaf介绍 简单说， Thymeleaf 是一个跟 Velocity、FreeMarker 类似的模板引擎，它可以完全替代 JSP 。相较与其他的模板引擎，它有如下三个极吸引人的特点： 1.Thymeleaf 在有网络和无网络的环境下皆可运行，即它可
这篇文章将更加全面详细的介绍thymeleaf的使用。thymeleaf 是新一代的模板引擎，在spring4.0中推荐使用thymeleaf来做前端模版引擎。 thymeleaf介绍 简单说， Thymeleaf 是一个跟 Velocity、FreeMarker 类似的模板引擎，它可以完全替代 JSP 。相较与其他的模板引擎，它有如下三个极吸引人的特点： 1.Thymeleaf 在有网络和无网络的环境下皆可运行，即它可以让美工在浏览器查看页面的静态效果，也可以让程序员在服务器查看带数据的动态页面效果。这
今天给大家介绍澳大利亚蒙纳士大学ShuTao Mei等人在Briefings in Bioinformatics 2021上发表的文章“Anthem: a user customised tool for fast and accurate prediction of binding between peptides and HLA class I molecules”。为了提高在预测肽与HLA-I类分子预测任务中的精度，同时兼顾模型的效率，本文使用了多种评分函数进行特征提取，并使用AODE (Aggregating One-Dependence Estimators) 的机器学习方法，对所得的评分特征进行聚合，从而充分利用评分特征对数据进行预测。作者设计并搭建了快速准确预测肽与HLA-I类分子结合的可用户定制型工具Anthem，支持直接预测、用户模型训练和用户模型预测功能，实现了用户定制功能。作者开发的用户友好型的工具框架，支持用户模型的定制化需求，以更好地应对相关数据快速增加而带来的挑战。在实验数据集和独立数据集的评估下，相对于其它工具，Anthem获得了更高的总体相似度和AUC值。
https://seananderson.ca/2013/10/19/reshape/
用我人生中第一张学术墙报开篇。一年前的这张墙报不能展示出当前TBtools的成长状态，但整体感觉还是可以不错（虽然没有获得任何奖项，毕竟参与会议的其他墙报都过分优秀。或许有一天，我们能做出更好的墙报）。
生物信息学领域有许多在线工具和资源，这些工具提供了各种分析和可视化功能，无需用户进行大量的本地安装和配置。而且绝大部分都是大机构开发和维护，知名度比较好的大机构包括：
RNA修饰是很火的领域，前天推出的大神师弟Nature系列一作文章勤能补拙，过目不忘，提高m6A助力好记性？中科院王秀杰/杨运桂合作最新成果阐述了m6A在长期记忆调控方面的重要作用。想获得更好的记忆力，提高m6A的含量吧。
通知：这篇文章有9篇论文速递信息，涉及人脸、目标检测、显著性目标检测和图像分割等方向 往期回顾 TensorFlow.js人脸识别—玩转吃豆豆小游戏 [计算机视觉论文速递] 2018-03-31 YOLOv3：你一定不能错过 Face [1]《Learning to Anonymize Faces for Privacy Preserving Action Detection》 Abstract：人们越来越担心计算机视觉设备通过录制不需要的视频会侵犯用户的隐私。一方面，我们希望相机系统/机器人能够通
基因序列特异性的预测无论是在基因分析领域还是基因调控领域都扮演着重要作用，DNA和RA结合蛋白的特异性模式序列对致病基因的发现也具有指导性作用。
TF: transcription factor转录因子 TFBS: transcription factor binding site转录因子结合位点 TFBS是序列内的location，TF特异结合在这里，这个site有这种特点
首先就是画图工具，我想了一下，程序员经常接触的无非也就是流程图、思维导图、原型图、UML 图、网络拓扑图、组织结构图等等这些。
尤其是对一些产品设计相关的公司机构或团体而言，网络不仅为其设计提供源源不断资源和灵感，而且也为成员之间的沟通协作提供了更大便利。
写在前面：开发过程中，会遇到很多繁杂精细的麻烦问题，虽然知道要去按照步骤解决，但总归耗费大量的时间，那为什么不去寻求一个捷径，本文总结了一些在线工具，遇到问题，打开网页，想要的东西，分分钟就能解决，让开发变得高效，快速，有了这些工具在手，就可以从繁重的工作任务中解脱出来，有大把的时间去王者峡谷散步打野浪一圈了。 一：Atool在线工具： http://www.atool.org/ aTool,工具在线工具,由华中科技大学一位在校女研究生开发的在线工具集合网站,旨在做出最简单方便、最完整干净、最全面完整的工具
常用工具 在线工具 在线工具 开发者工具 在线IDE(coder-server) 腾讯开发者手册 get-pip脚本 各种计算器 镜像站 清华源主页 清华yum源 清华epel源 清华pip源 清华apt源 清华Node源 清华Docker源 Mac软件 gif录制工具：kap 粘贴板工具：Maccy 截图工具：ishot Windows软件 粘贴板：CopyQ 粘贴板：Ditto Linux软件 以web形式共享你的终端：ttyd 将linux命令以HttpServer的形式共享：gott
网络上有许许多多的图片处理软件，还有一些图片在线处理工具。图片在线处理工具和一般的安装制图软件有所区别，一般图像在线处理工具是可以联网使用的，并且不需要下载。众所周知，专业的制图软件，比如photoshop体积非常强大，而且正版软件还需要付费购买，因此对于许多人来说，其实并不需要这个资金投入，所以图片在线处理工具成为了大家的常用选择，图片在线处理工具的用途有哪些呢？
它是一款在线应用，它可以让您直接在浏览器中剪辑音轨。有音频切割机、音频细木工、音频转换器、视频转化器、录像机、录音机、档案提取器、PDF工具等九大部分功能，基本满足了你的日常音频视频处理的需求了。
我们可能会接触到很多的绘图工具,有客户端版本APP,在线绘制的工具版本每个制图工具的功能大同小异,但是可以从用户使用功能是否强大,体验什么流畅来进行比较.
很久都没有更新文章了，离日更的梦想越来越远，一来是工作比较忙，二来是近期身体素质较差，没有太多的精力放在钻研技术上，三来是公众号的建立和运营以及进入正式阶段，本着对技术的痴迷和不离不弃的初心，挤出来的时间，还是会总结近期自己所学的知识点，巩固落实才不至于很快的忘记。 今天发现了一个比较厉害的在线网站，简直可以称为程序员的工具箱。工具在手，事半功倍，工作无忧。 tool在线工具,开发人员工具,代码格式化、压缩、加密、解密,下载链接转换,sql工具,正则测试工具,favicon在线制作,ruby工具,中文简繁体
hello，大家好，不知道大家电脑里装了多少软件，内存够不够，反正我是能不装就不装，能在线使用就在线使用，比如office，我就是用石墨文档替代，还有ppt编辑工具，图片海报设计工具，视频剪辑工具等等这些其实也有了很多不错的在线工具，既节约了内存，而且方便好用，何乐不为，今天小白就整理了一波免费的在线工具。
在许多的工作情境当中需要处理一些图片，尤其是在一些公众号，文章编辑或者是网站内容设计上面。现在人们工作时候对于图片图像的需求越来越高，每种不同的图片都有不同的需求，所以很多的原图片是无法使用的，需要经过编辑或者是添加水印才能使用。大家最常使用到的是图片在线处理工具，图片在线处理工具都有什么功能呢？
经历了疫情期间的远程办公，基于Web的协同办公软件（例如飞书，钉钉，腾讯文档等）纷纷成为大部分国内企业的办公必备品。可以看出，目前国内的在线办公协同和文档等工具已经发展得越来越成熟。随着云计算和5G网络的发展，互联网办公工具的 Web 化是必然的趋势。那么对于产品设计团队来说，又有哪些在线设计工具值得体验呢？今天，我们一起来盘点一下国内外8款经典的在线原型工具。
无论是办公室文员还是网站设计人员，通常都需要处理一些文件或者是一些资料，在处理文件和资料的过程当中必不可少的一项技能就是图片处理。图片经过处理之后，可以产生更多的功能和用途，因此掌握纯熟的图片处理编辑的技巧，也是许多办公人员的必备技能。许多人为了方便，在处理图片的时候会选择一些在线工具，那么图片压缩在线处理后怎么保存呢？
在人人都做视频的自媒体时代，高质量的视频封面图是吸引观众点击观看的重要因素之一。而封面图的制作往往需要对人像图片进行抠图处理，将人物或物体从背景中分离出来，再进行封面创意设计。对于不具备专业设计技能不会PS抠图的自媒体工作者来说，寻找简单易用且高效的在线抠图工具就很有必要了。今天小编就推荐给你2024年3款免费在线抠图工具，真正免费好用，特别适合自媒体工作者，建议收藏。
都说一图胜千言，一个IT工程师如果能画的一手好图，无论是在方案选项、还是技术交流，都能快速表达自己的想法，让你的思路更加的直观明了；市面上的制图工具有很多，下面就推荐几款好用且免费的工具，绝对让你分分钟就爱上。
今天分享15款工具合集网站，每个网站功能都很强大。不管你从事哪个行业，都能找到一款适合你的工具合集网站。分享只是一种习惯，认识你才是我真实的目的。
在线代码对比工具是一款免费的在线文本对比工具，无需注册，可以在线对两段文本进行对比，检测/比较两个文本有什么不同的差异，以便修改，常用于程序代码。
随着互联网技术的发展，越来越多的工具可以在线使用，其中在线PS工具也受到了广泛欢迎。它不仅方便快捷，而且功能强大，让许多人在没有安装PS软件的情况下也能够进行图片处理。
好像还没分享过软件工具，今天就集中推荐一波。这些都是我使用频率非常高的在线工具，用好了效率绝对爆棚。另外给一点小提醒：网络工具安全性不能保证。如果你的资料非常重要，建议还是在本地处理。
一项深入的研究发现，80%的互联网用户认为互联网是获取产品和公司信息最可靠的来源。另一项研究也声称，大约85%的互联网用户通常将网上评价看作是个人推荐或朋友的意见来参考。
随着社会经济的发展，我们在日常工作中，需要处理越来越多、并且日益复杂的各种文件。为了提高工作效率，我们需要优秀强大的文件协作工具。
全新UI站长在线工具箱系统源码+全开源版本+支持暗黑模式； 支持高达72种站长工具、开发工具、娱乐工具等功能。 本地调用API、自带免费API接口，是一个多功能性工具程序支持后台管理、上传插件、添加增减删功能。
注明: 本文转自http://www.hollischuang.com/archives/1459. 作为一个Java开发人员，经常要和各种各样的工具打交道，除了我们常用的IDE工具以外，其实还有很多工具是我们在日常开发及学习过程中要经常使用到的。 我会在我的个人博客中单独创建一个常用工具页面，把这些工具的链接放到里面。 Java源代码搜索 Grepcode是一个面向于Java开发人员的网站，在这里你可以通过Java的projects、classes等各种关键字在线查看它对应的源码，知道对应的project
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