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沙龙
1
回答
如何根据因素绘制自定义标签到ggnet绘图?
、
以下代码 color = "module", palette = y, alpha = 0.75, size = 1, edge.alpha = 0.3, set.seed(123)) 由于网络的复杂性很高,所以我想在地块上画出唯一的标签,这意味着在属于模块的点集群上添加模块的名称。因此,识别每个模块将更容易。 我用
浏览 8
提问于2022-09-26
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1
回答
图(X)在车辙x <- hclust(y,"ave")后不会返回一个图或任何输出或任何错误。
、
、
我试图按照中给出的指令来构建一个
共表达
网络。第一步是构造一个树状图。这是密码。library(
WGCNA
); #Read in the female liver
浏览 5
提问于2017-04-12
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2
回答
相关
网络分析
R
我在一些客户之间建立了一个关联网络。我使用qgraph来绘制它,现在我想通过定义集群、集线器和中心性来做一些图形分析。有没有其他方法可以做到这一点?
浏览 1
提问于2016-07-18
得票数 1
1
回答
loadNamespace中的库(
WGCNA
)错误
install.packages中的警告: package訴mpute·不可用(适用于R版本3.0.3) (R) loadNamespace中的库(
WGCNA
)错误(j <- i[1L],c(lib.loc
浏览 0
提问于2014-03-30
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1
回答
在R中下载
WGCNA
包时出现安装问题
我正在尝试下载
WGCNA
包,并得到以下错误。我听从了的指示我得到以下特别的“警告在install.packages :安装包‘
WGCNA
’有非零退出状态”。> install.packages("
WGCNA
") Package which is only available in source form, and may need compilationof C/C++/Fortran: ‘
WGC
浏览 5
提问于2019-10-02
得票数 1
0
回答
Mac版R安装
WGCNA
时总报错,看不大明白原因是什么,急求指导,如何处理?
、
> install.packages("
WGCNA
") ‘
WGCNA
’installing the source package ‘
WGCNA
’ 试
浏览 820
提问于2020-05-08
1
回答
统计方法的
WGCNA
共享名称空间
、
我正在使用
WGCNA
包中的一个函数,该包有一个参数corType,它接受要运行的特定相关性的字符串输入。两种主要的相关方法是"pearson“和"bicor”。mode = "function", envir = envir) : 我对生物星做了一些搜索,似乎
WGCNA
一篇老文章建议我做两件事之一: 重新启动R,只在运行函数之前加载
WGCNA
包(这似乎很愚蠢
浏览 0
提问于2019-08-12
得票数 0
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2
回答
如何计算Python中加权邻接矩阵的拓扑重叠测度[TOM]?
、
、
、
、
执行正确实现的R函数来自
WGCNA
()。计算这个(我认为)的公式在中有详细的说明,我相信下面正确地再现了这个公式。是否有人知道如何正确地实现这一点,以使其反映
WGCNA
版本?当我在R中计算这一点时,我使用了以下方法:> df_adj = read.csv("https://pastebin.com/raw/sbAZQsE6for the A_adj# https:
浏览 0
提问于2019-06-13
得票数 8
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2
回答
无法在GO.db中安装BiocManager
、
、
我快速查看了其他帖子,但找不到一个有相同错误的帖子,尽管其中一些看起来有些常见的错误消息,所以如果我错过了之前的一个线程,我很抱歉。> BiocManager::install("GO.db") Bioconductor version 3.8 (BiocManager > 1.30.4), R 3.5.2 (2018-12-20) Installing package(s) 'GO.db' installing the source package ‘
浏览 2
提问于2019-03-22
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1
回答
找不到
WGCNA
函数
我将
WGCNA
应用于遵循这个RNASeq的数据。对于几个函数,它给了我一个错误,即没有找到包函数。corFnc = cor, : 我试图确保包被正确调用,但当我调用它时,出现了以下错误:Error: package or namespace load failed for ‘
WGCNA
’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .lib
浏览 7
提问于2022-05-14
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1
回答
在Case语句中选择语句
我想写一个关于条件的select语句,以防万一。例如,如果(今天是工作日),那么x其他y SELECT WHEN DATEPART(WEEKDAY, EventTime) in (1,7) THEN SELECT count(*) as Eventcount
浏览 5
提问于2020-09-29
得票数 0
1
回答
R无法安装程序包'data.table‘。- mac air
我尝试安装"
WGCNA
",但由于以下错误而失败: Error in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck =withRestarts -> withOneRestart -> doWithOneRestartERROR: lazy loading failed for package ‘
WGCNA
’ * removing ‘/Users/zhaoboao/Libr
浏览 166
提问于2019-10-15
得票数 3
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1
回答
使用Clojure中的可选参数调用java函数
、
、
、
我想使用clojure中的,它有一个带有多个构造函数的表达式Java类: 公
共表达
式(PrimitiveElement...elements){.}公
共表达
式(字符串expressionString,PrimitiveElement...elements) {.}
浏览 1
提问于2018-01-07
得票数 1
1
回答
如何沉默写入终端/文件的特定消息(当通过bash脚本调用“Rscript”时)
、
、
、
然而,我在控制日志文件(或发送到终端)中包含了哪些消息时遇到了问题,并且无法找到任何解决方案来排除一个特定的R包加载消息: 我将尽量保持代码的非特定性,希望能够使代码更容易理解。我还想知道
WGCNA
包是否在thePKG的!require循环的“外部”加载,因为它不受该调用的suppressMessages()的影响。我还尝试在R脚本开始时单独调用
WGCNA
,并在其中添加了一个suppressMessa
浏览 1
提问于2019-03-27
得票数 1
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1
回答
WGCNA
:选择软阈值功率
、
、
、
powers = c(c(1:10), seq(from = 12, to=20, by=2)); 在浏览
WGCNA
时,我遇到了这个我无法理解的代码,有人能解释一下这段代码的含义吗?
浏览 2
提问于2020-02-18
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1
回答
WGCNA
在R中的安装问题
、
、
当我尝试我得到以下特别的“警告在install.packages :安装软件包‘
WGCNA
’有非零退出状态”。redhat-linux-gnu-library/3.6’trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/
WGCNA
=================================
浏览 22
提问于2022-11-22
得票数 1
1
回答
WGCNA
eigengene树状图中的交换分支
、
、
、
、
我正在绘制
WGCNA
软件包中模块的树状图,我想订购/交换分支。我使用plotEigengeneNetworks函数来绘制它,但是不能定义分支的顺序。示例:set.seed(123) ME[,c(1
浏览 2
提问于2015-11-13
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1
回答
在R上安装
WGCNA
包时出现错误消息
、
我正在尝试在R上安装
WGCNA
包,但收到以下错误:> * removing ‘/home/hpc/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/
WGCNA
浏览 0
提问于2018-12-11
得票数 0
1
回答
使用jquery选择选项卡
、
、
Preprocessing</a></li> <li><a data-toggle="tab" href="#
WGCNA
" class="btn btn-info" role="button">
WGCNA
</a></li>
浏览 2
提问于2016-03-24
得票数 2
2
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限制通用表递归
、
WHERE LEVEL <= 2 -- limiting iterations hereCONNECT BY Pid = PRIOR id; 我们使用了递归公
共表达
式表
浏览 0
提问于2019-03-25
得票数 0
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