初中几何 设计 钉形标记，医学图像 变得 人人能懂

上图中红色的标记就是“钉形标记”，看起来像钉子，钉尖抵在目标的边缘，指向目标的中心，钉子的长度代表目标的直径。图中M为类圆形的嗜黑素细胞，L为淋巴细胞。

上图是最基本的“钉形标记”，看起来像一枚钉子。它所指示的范围是下图所示的灰色圆形区域：

用初中几何语言讲，这个灰色圆形的直径等于“钉形标记”的长度，圆心位于钉尖方向的延长线上，圆周过钉尖。

好比一个带手柄的放大镜，手柄就是“钉形标记”，想像出来的镜片就是它的目标范围。镜片的直径等于手柄的长度。

例如要标记下图中的一团细胞：

采用下图中的的“钉形标记”即可。然后就可以说“下图中的A是一团炎细胞”，这样即使没有任何医学基础的人也能轻松看懂了。

根据“直径等于“钉形标记”的长度，圆心位于钉尖方向的延长线上，圆周过钉尖”，可以轻易想像出“一团炎细胞”的范围。

反之，如果采用传统的箭头来指示炎细胞团的范围，如下图所示，就不容易识别了，很可能会误认为是离箭头最近的大细胞：

很多顶级科学期刊、图书也存在类似的问题，给读者带来很大困惑，例如下图，摘自世界顶级期刊《Nature Methods》，但其中的箭头和线条究指示多大范围却让人一头雾水。

下面简单介绍一下"tAreaMarker"的使用方法：

一、下载和安装

访问上述网址，下载最新版本的zip压缩文件“tAreaMarker15.zip”，将其中的文件夹“tAreaMarker15”解压到电脑硬盘的任意位置。下述文件都在这个文件夹中。

首次运行需要安装Python和Pillow，方法如下：

1. 双击运行"python-2.6.6.msi"文件，然后跟着提示，点若干次“下一步”，即可将Python安装到电脑上。

2.双击运行"Pillow-2.6.1.win32-py2.6.exe"文件，然后跟着提示，点若干次“下一步”，即可将Pillow安装到电脑上。

如果您的Windows 7 或Windows 10系统提示无法安装上述软件，很可能您的Windows 7 或 Windows 10 系统需要安装“功能性更新补丁”。杀毒软件如“电脑管家”等都有“修复漏洞”功能，可以轻松地将“功能性更新补丁”批量下载并自动安装到您的电脑中。

二、运行tAreaMarker

双击“tAreaMarker15.pyw”，等待几秒钟，就会弹出如下界面：

目前，“tAreaMarker15”为纯英文界面，这是考虑到不同版本的Windows系统下，中文编码存在差异，在我的电脑上正常显示的中文，换了一台电脑就可能是变成无法识别的乱码。所以只好退而求其次，使用纯英文菜单，好在单词并不多，中文翻译如下：

三、画钉形标记

点击"OpenImage"按钮，选择要画标记的图像文件，这里打开附带的示例文件“skin.jpg”，如下图所示：

按下鼠标左键并拖动，可以移动图片。

画“钉形标记”时，首先移动鼠标，使十字光标中心对准目标区域边缘，为了精确，可以配合键盘的上下左右键一个像素一个像素地移动十字光标，见下图：

按下鼠标右键并拖动，就会出现一个如“手持放大镜”的图标，它的“手柄”将形成“钉形标记”，“圆形镜面”代表目标范围。随着鼠标右键的拖动，这个“手持放大镜”是动态的。右键拖动时也可以按键盘上的上下左右键精确地控制十字光标的位置。如下图：

当“圆形镜面”与所要的目标范围一致时，如上图，松开鼠标右键，双击鼠标左键，“手持放大镜”就会化作一个“钉形标记”，如下图所示：

当然，如果您觉得“手持放大镜”没有准确代表目标范围，就不要双击，而是在图像的任意位置单击鼠标右键，“手持放大镜”就消失了，不会化作“钉形标记”。

四、写字母

点软件界面左侧的"Write"选项，进入 写字母 状态：

在图像中按下鼠标右键并拖动，就会看到有字母跟随十字光标一起移动，如下图：

继续移动光标，直到字母到达所需位置，如下图：

松开鼠标右键，原地双击鼠标左键，字母就会固定在现在位置，不再随鼠标移动，如下图：

点软件界面左上角的"SaveImage"按钮，带有”钉形标记“的图片会就被保存在与原图相同的目录下，文件名以”_marked.tif“结尾，并不会覆盖原图。

如果想写另一个字母，例如”B“，只需将软件界面左侧下部的"text"下方的空格里填入”B“，如下图所示：

然后在图像中按下鼠标右键并拖动即可。与前文标记”A“的方法一样。

五、删除标记

点击软件界面左侧的"Erase"选项，进入 删除标记 状态：

在需要删除的标记或字母附近按下鼠标右键并拖动，十字光标会拉出一个矩形框，继续拖动鼠标右键，直到矩形框将需要删除的内容包围。如下图所示：

如果一次没成功，可以松开鼠标右键，换个合适的地方重新按下鼠标右键并拖动，直到矩形框将需要删除的内容包围。

松开鼠标右键，原地双击鼠标左键，被框住的标记、字母就会消失，而图像不会受损，如下图所示：

如果一个矩形框不能框住所有要删除的内容也没关系，可以反复上述操作，每次删一点，直到所要删除的内容全部删干净为止。

每次双击鼠标左键之前，注意需要保留的标记、字母不要被矩形框住，哪怕只是一小部分。

六、标记复杂形状

除了圆形区域，其它形状的区域也能标记吗？能！

如下图C、D、E所示，钉形标记可以加尾巴。

如下图H、I、J所示，钉形标记的尾巴可以表示标记范围的延伸。

对比下图E、J区别在于：拐弯后的尾巴如果直接指向字母如E，则尾巴仅仅起到连接钉形标记与相应字母的作用。拐弯后的尾巴如果没有直接指向字母如J，则尾巴的方向表示标记范围延伸方向。

对比下图H、I：不带尾巴且不带字母的钉形标记，如I中间没有字母的钉形标记，也表示向两侧沿伸。下图J最下面的两个钉形标记也属于这种情况。

如下图F所示，有两个钉帽的钉形标记表示目标直径为从钉尖到最远钉帽长度的两倍，同理，更大的范围也可以使用三个、四个、五个钉帽，从而，避免了画更大的钉形标记。

画多个钉帽的钉形标记如上图中的F，只需滚动鼠标轮，"N times" （直径放大倍数）下方框中的数字会相应增减，然后按本文第三节的方法画钉形标记即可。

画带尾巴的钉形标记也很方便，只需在本文第三节的方法之后将十字光标移到尾巴拐点双击鼠标左键，再移动到下一个拐点或尾巴末端，再双击鼠标左键即可。

画向两侧延伸的尾巴，如上图J中右下角带尾巴的钉形标记，只要先如上文，画向上延伸的尾巴。然后点左侧的 "Line Marker" （画线形标记），十字光标置于尾巴的分叉点，按下鼠标右键，如第三节，拖动鼠标，出现“手持放大镜”，继续拖动鼠标至“放大镜手柄”为所需尾巴的一段，双击鼠标左键。亦可如上文，依次移动十字光标到尾巴的各个拐点双击鼠标左键，直到画完整个尾巴。

详细画法见压缩包中的 tAreaMarker015usage.doc

七、钉形标记的应用

下图以皮肤组织切片为例：A角质层、B表皮、C真表皮交界（没有钉帽表示厚度忽略不计）、D毛囊、E毛囊、F皮脂腺与毛囊、G皮脂腺、H小汗腺、I汗管、J炎细胞团、K表皮基底层

八、“钉形标记”的简介与参考文献

欢迎您在文章、图书、幻灯、网络中使用“钉形标记”！

欢迎引用我介绍“钉形标记”的文章：

CHEN Guang. & GUO Chun-Fang. T-Area-Marker for Scientific Images. ChinaXiv:201804.00001

或：CHEN Guang. & GUO Chun-Fang. T-Area-Marker for Scientific Images. ChinaXiv.org\abs\201804.00001

或：CHEN Guang. & GUO Chun-Fang. T-Area-Marker for Scientific Images. https://sourceforge.net/projects/tareamarker/files/tAreaMarker15.zip

为了让读者了解“钉形标记”的原理，您可以用中英文分别如下简要介绍：

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