qiime2中OTU表和树文件不匹配的问题
今天帮师姐做alpha多样性,突然报错如下
这个报错的意思指的是OTU表和树文件不匹配,某些OTU名在树文件里不存在,可能是树文件在生成时低质量的OTU被过滤掉了,所以无法做alpha多样性的分析。Google搜索了一下,qiime2论坛里有个娃娃和我一样的情况
这是帖子的原网址
https://forum.qiime2.org/t/beta-diversity-fails-without-filtering-feature-table/65
从中找到的解决办法:
官方网址:https://docs.qiime2.org/2018.4/plugins/available/phylogeny/filter-table/
代码
代码示例
马上就是端午节了哎,今天还和室友小聚了一下,哈哈开心。
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