BioGPS数据库：实打实的基因信息“定位器”

不吹不黑，这个网站真心好用。

确定某个拟研究的功能基因的可行性分析，是功能基因研究五部曲的第一步。而在确定某种疾病中具有研究潜能的功能基因时，查文献或通过数据库查询该基因的表达差异，无疑是一种最简单也最省事的方法。

鉴于GeneCards、UCSC等这些耳熟能详的基因信息数据库的使用方法，解螺旋所研发的单元课和优选365课程都已做了详细的介绍，本文就不再一一赘述了。在此，小鱼给大家分享另一个简便快捷查询的基因信息数据库BioGPS，可为大家研究功能基因提供科研灵感。

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BioGPS是一个免费的统筹和查询基因注释的新资源，其基因注释包含了公共资源的信息及诺华研究部门所生成的数据，并具有开放的插件界面和自定义用户界面。

首先，打开BioGPS网站（网址：http://biogps.org/#goto=welcome）后，进入该网站的主页面（见下图）。显而易见，该界面着实简洁明了，确实是快速了解基因信息的不二法宝。

举个栗子，查询基因“PTEN”的详细信息，则可在搜索栏输入基因名称：PTEN，点击Search按钮。

在结果界面中，可看到左侧的PTEN信息列表，可以查询与PTEN相关的蛋白分子；右侧显示了该基因在不同物种中的情况。中间表格的第一行，则为人类PTEN基因的详细信息。

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点击NO.1的序列后，可进入以下基因的详细信息界面：

（1）信息来源数据库（dataset）、探针集（Probeset）以及基因简介（Summary）。其中，信息来源数据库是可以更改的，点击右侧的change Dataset，便会出现有6个数据库和3028个数据文库，大家就可以根据需要自行选择。

（2）基因PTEN在不同物种以及不用组织中的表达量，可通过Zoom来调节柱状图的高度，使观察差异更加明显。

（3）基因PTEN的详细信息（如简称、全称以及不同数据的识别号Accessions）、染色体定位（Genome Location）以及基因功能（GO）、转录本信息、编码蛋白信息以及相关蛋白名称。

点击右侧相应链接可以跳转至相应的数据库界面，这也是该数据库最大优势：即可以在一个程序和界面下呈现各个分散数据库的数据资源，不需要再一个个分门别类去查询。

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然后将结果界面向下拉，还可看到链接到GENE WIKI,详细了解基因的功能介绍以及相关参考文献。

点击页面右上角的current layout，可以调整上面维基百科转换为该基因的KEGG，Pathway等相关信息。

如点击Pathway后，结果界面就会汇总有关PTEN的信号通路查询网站，供大家参考。

如此通过以上操作，就可以快速了解一个基因的大致信息，并很容易就能找到一个关于某基因的研究切入点，想不想试试，赶紧动手吧。